Tetrahymena thermophila: TTHERM_00780490
Help
Entry
TTHERM_00780490 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7845033
NCBI-ProteinID:
XP_001026205
TGD:
TTHERM_00780490
UniProt:
I7MJ75
LinkDB
All DBs
AA seq
2044 aa
AA seq
DB search
MKKYQLQIAIASLCLITYTYCEQINILLQNNQVGQVNNYNIQLSSFQDWNSTYQNSFPLS
IQFYFPQEFQNAISNLNIIQNQQTLQYFSSVSGKSYLVEFSIVINSGNCQIWFNNFLNPS
YSGTYIIPISIYDKYQNRQYQNQIQIQQINSNNNIQLYFNNGQQTNIQGTLNLNIQPSIL
LPSDLGISIKLPQYSASKPSMNYVNNPVTCILKQQQGNINLPCVLNAQNLLNITNILTTS
QTTITPLTIQIANVLAPISTQPVVGFNVSLYGQTNGGLIQYENNKSVNASSASNPNSITI
SSSNQNTLNTTSLVVNIKAQTFFSPSYVIIFKLPIDFVVSNFQSQLKGYTQDGRQITLSI
QKDQSILIQSDISVAGDDSKFYFRLDGVQNYQGAYQTSTYFQTIVYSDNTLQYIVCQDLN
SIQYQTLSSQLVINKFSFLPQQVQIVSSYIFQFSMMNSLDATSMISNRITINLPSQVSYT
TNMVSSMLGNGIVSCNNYINFIQFANISASATCEMPSDSVIRIYNFFIQNNNNLAINLKQ
VVNPYSTAQTQNFVIQVEIQKSTNPNWLTVYQNSQNDGTTSIVASSGQISLLKFQGVNNQ
ITFNQNNYLISFSTTSQLIPNSFIDIQFPLDDFLFKQISQSSFSCQFISGQFSSQNSCSL
NIGNIVEINLQSSQSIPSGSVITLMINGIINPRSTRPTGQLNITTLSPTRNIIDTIQTSS
SIGSLSMSIPNTLQIFSVQPQSFLIGDKTMYTFTLQSPVQILSGDVLTINVLELLPQNQQ
SMICSGIQGLPITLSCSQSGTNITLTMQSPIAPNTVIQFTVSNLQNPYSNVISAPLLFCI
YDSQGYIIATSQFSDVAKRGSQIGYDSVIFQQTSVTPDSYKVGQITTYRLNFNLPIPINQ
SQSIIIYLPSDIGINNSNISCYLLFKNLSQNTNTICSYQQANHSILITKFLPISNRRLLS
SGQQYIQKEYSDIQSMNFQQEQRYLSSISTIPINTNLIISLTGIQNKLNNGPFQSNTSSQ
FKVSISNIDSSGKIVELASSIISLAPSYTCSSPCINCQGIDTQCTSCQGSQILLPELSQC
EANCPNNYVRVQSQKYQQQVCLRCLSFESDINCSSCDPYNLNVCTQCVNRYKLIYDQNGT
ARCEEISSDNDPLRDFVYNIEYNLPYISLYILIVSIYCIVRKIFKVKNLILVAVLLSCYS
LIEIIVLIAFIVKICLLQQFLPILLAGLLILVYVVSQYFFAYRFKKSLFKDQGYNLYEPN
YKTVRVVQKLALIFNFKIFLMYRSNFSHIKDIFYIPFSNSQLLLHTIKKGLQICLLLGIA
ILAFDGWVMYYTYNYRNVIIPPFFFIEFAFFHFLIVIMLLLLLIPNKKYSLDIIFDSVNE
NDIKYKSKQLDLKNISSTLIQTKTIQAVDHQNQFQTHSIYMTAKNPTYSSSDIQHISVTR
NNIPRSTTVIHLDNNAKKYGNQQDQSLIQNEQKSNQMIPPINNNRDKKQLPGMGKQIMNK
QESQSFLILNNGLQQNLSNSTPNNQSMNHELFPSNFNSSSELQIQERFQSQAQRSPININ
NHSNSSNIQIQQSESEDEKKLKKINNNYNNQESDQTKSHKSKTIHNIDSNLNRDNYHQQM
ILNNQKLSSDDRSPQSHSPEQVNTGNFEKQSTSVQSQRHQELKTPDKLTKSSSKSLSPKD
LSNQKLTQKEKNLEVQARTIFSPTQLLLNNLEEQKNGMKKSQDIKQQKQFQQIQSSKAQL
DEADIEVDIQDSNIRNLKNQMYASKQHQNNFYNKKQQNRVSQQIQSSQDQTQNNLTEKYT
ESSQEVEENHCLNAQLQSLTKHNNLSQQNNQFISPRVNILQANDITNSYSTPQIGQQMSN
QTSQMQEHANQELQEQQLSNFSKFQDNNQSNNNMNNQSENSPINLKKNQAFDLNKNQPPS
FSQNLNISNGKQNNYQQLYSFNNNRQAKIPSTQYVSSFDKFQMDNNQQQLLSQNNQQPVN
TIQETRNIPIQIQTNQSTPTDQKKNSKIFGNLLHDMLQNPISSVIQSTDSKTSQYFPQEN
ISNY
NT seq
6135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatattaactgtagatagctatcgctagcttgtgtttgattacttatacatat
tgcgaataaatcaatatcttgctttaaaataattaagttggataagttaataattacaat
atatagttaagtagttttcaagactggaatagtacctattaaaattcttttcctttaagc
atctaattttattttccataagagttttaaaatgctatatccaatcttaacatcatttaa
aactaatagacattgcaatatttctcatcagtaagtggaaaaagttatttggttgaattt
tcaatagttataaatagcggtaactgttaaatatggtttaataatttcttaaatccatcc
tattctggcacatacataattccaatatctatctatgataaatattagaatagataatat
cagaatcagatacagatataataaattaattctaataataacatataactgtatttcaat
aatggataacaaaccaacattcaaggtaccttaaatctaaatatttagccatcgattctt
cttccttctgatttgggcatctcaataaagcttccttaatatagtgcttctaaaccatca
atgaattatgttaataaccctgttacttgcatattgaaatagtaatagggtaatatcaat
ctgccatgtgttctaaatgcttaaaacttgttgaacataactaatatacttactacttct
taaactactataactccattaaccatctaaattgcaaacgtgcttgcacctatatctact
taacctgtagtaggatttaatgtatctttatacggctaaacaaacggaggtttgattcaa
tacgaaaataacaaatcagtaaatgcgtcatctgcaagcaatccaaattcaataactata
agctcttctaattagaatactttaaatacaactagtttagtagttaacattaaagcataa
acatttttttctccatcttatgttattatatttaagcttccaatagactttgtagtatca
aacttttaaagttaactcaaaggatatacacaagatggaagataaataacactttcaatt
caaaaagattaatccatacttatttaatcagatataagcgtagctggagatgattctaag
ttttattttaggctagatggtgtctaaaattactaaggagcttattaaacttctacctac
ttctaaacaatagtgtattctgataatactttacaatacatagtttgctaagatctcaac
agtattcaatactaaacactctcaagctagcttgtaattaataagtttagttttttgcca
taataggtttagattgtgagttcatacattttttaatttagcatgatgaattctctagat
gctacaagtatgatttcaaaccgtattactattaatcttcctagctaagtaagttacaca
acaaatatggtaagctctatgcttggaaatggaattgttagttgtaataactatataaat
ttcatttaatttgctaacatttctgcttcagcaacttgtgaaatgccttctgattctgtt
attagaatttataactttttcatttaaaataacaacaatttagcaataaacttgaaataa
gtagttaatccttactctacagcccaaactcagaatttcgtcatataagtagaaatttaa
aagagtactaacccaaattggctaactgtgtattaaaatagctaaaatgatggtactaca
agcattgttgcctcaagtggataaatttcacttctcaaattttaaggtgtaaataactaa
attactttcaatcaaaataactatcttatatcctttagcactacttcgcaattaatacct
aatagttttattgatatttaatttccactcgatgattttctatttaaataaattagctaa
tcatctttctcatgctaatttattagtggatagttttcttcttagaattcatgttctcta
aatataggaaatattgttgaaataaacctctaatccagtcaaagtattccttctggatct
gtgattactcttatgataaatggtataataaatcctagatcaacaaggcctactggataa
ctcaacatcacaactttatcacccactagaaacataatagatacaatatagaccagtagt
agtattggaagtctaagtatgagcatacctaatactctttaaatatttagtgtctagcct
taatctttcttaattggtgataaaactatgtacacttttactctttaatctcctgtttag
atcctttctggagatgtcttaacaataaatgttttagaacttttgcctcaaaattagtaa
agtatgatatgcagtggaatataaggtttacctattactttaagctgttcttagagtggt
acaaatattactttaaccatgcaatcaccaatagcccctaataccgttatatagtttaca
gtttcaaatctttaaaatccttactctaatgtgatatcagctccacttttattttgtatt
tatgactcgtaaggctatataatagcaacttcttagttttcagatgtggctaagagagga
agctaaataggttatgactcagtgatattccaataaacatctgtaacgccagatagctac
aaagttggatagataacaacctatagattaaactttaatctcccaatccccataaattaa
agttaatccataataatttatctccctagtgatattggtatcaataactcaaatataagt
tgctacttattatttaagaatttatcataaaatacaaacacaatatgcagttatcagtaa
gctaaccattctattttaattacaaaattcttgccaattagtaataggagattacttagc
tcaggccaatagtatatctaaaaggaatactcagatatatagtccatgaacttttaacaa
gagtaaagatatctctcaagtatttcaacaataccaataaacacaaatttgataatttct
ttaactggtatacaaaataaattaaacaatggtcctttctaaagcaatacatcctcttaa
tttaaagtttctataagtaatatcgatagctctggtaaaatagtagagttagcttcatcg
ataattagtttagcaccttcttatacctgttcatcaccatgcattaattgttaaggaatc
gatacttaatgcacttcttgctaaggatcataaattcttcttcctgaattaagctaatgt
gaggctaactgtcctaataactatgtcagggtatagagtcaaaaatattaatagtaagta
tgcctgaggtgtttgtcttttgagtctgatattaactgctcttcatgtgatccttacaac
ttaaatgtatgcacataatgtgttaatagatataaattaatttatgattagaatggaaca
gctcgttgtgaggaaatcagtagcgataatgaccctcttcgtgactttgtttacaacatt
gagtacaatctaccttatatttccttatacattttaattgttagcatttattgtatagta
agaaagatatttaaggtaaagaatctgatcttagttgcagtcttactctcatgctattct
ttaattgaaatcattgtactaatagcttttattgttaagatatgtcttcttcaataattt
ttacccatattgcttgcaggattgctgattttggtatatgttgtttctcagtatttcttt
gcttacagattcaaaaaatcacttttcaaagatcagggatataacttatatgaaccaaac
tataaaacagtgagagttgtgtaaaaattagctcttatttttaactttaaaatatttctg
atgtatagaagcaacttttcacatataaaagacatcttttacataccttttagtaattca
taattacttttgcacacaataaaaaaaggtttataaatttgtcttcttctagggatagca
attctagcatttgatggatgggttatgtattacacatacaattacaggaatgtaattatc
cctccatttttctttattgaatttgcatttttccattttttgattgtaataatgcttcta
ctcctcctaattccaaataaaaaatatagtttagatattattttcgattctgttaacgaa
aatgacattaagtataaatcaaagtaacttgatttaaaaaatatatcctctactttaatt
tagaccaagactatataggctgtagatcattaaaatcaattttaaactcattctatctac
atgacagctaagaatccaacttactcttcatcagacatttaacatataagtgttactaga
aataacatacctagaagcacgactgttatacacttagataataatgcaaaaaaatatggc
aattaataagattaatcattaatttaaaacgaataaaaaagcaattaaatgatccctcca
ataaataataatagagataagaaataattaccaggaatgggcaagtaaattatgaataaa
taagagagttaatcttttttgattcttaataatggactttaacaaaacttatcaaattcc
acaccaaacaactaatctatgaaccatgaactcttcccttctaattttaattcttcttct
gaattataaatttaagaaagattccaaagccaagcacagaggtctcctataaatataaat
aatcacagtaactcatctaacatctaaatttaacaatcggagtcagaagatgaaaagaaa
ttaaaaaaaataaataacaattataacaattaagaatctgattaaactaagtcacataaa
tcaaaaactatacacaatattgattctaatttaaatagagacaactatcattagtaaatg
atattaaataattaaaaattatcttctgatgatagaagtccttaaagccactcaccagaa
taggtgaatacaggaaattttgaaaaataatctacaagtgtttagtcacaaagacattaa
gaattgaaaacaccagataaattaacaaagtcaagctcaaaatccttgtcacctaaggat
ttaagcaaccaaaagcttacttaaaaagaaaaaaacttagaagtttaagctcgtactatt
ttttcacctacttaacttttattgaataatttagaggaacagaaaaatggaatgaaaaaa
tcttaagatataaaataatagaaataattccaacaaatttaatctagcaaagcctaatta
gatgaagctgatatagaagttgatatttaagactctaatatcagaaatctaaaaaattaa
atgtatgccagtaagcagcattaaaataatttttataataagaaatagtaaaacagagta
tctcagcagatttaatcttcataagatcaaacttaaaataatcttactgaaaaatataca
gagagctctcaagaagtggaggaaaatcattgcttaaatgcttaactttagtcattaact
aagcacaataatttaagctaataaaataatcaattcatatctcctagagtgaatatactc
caagcaaatgatataacaaattcttatagtactccttaaattgggtaataaatgagtaat
taaactagctaaatgtaagaacatgcaaactaagaattataagaacaataattgagcaat
ttctcaaaattttaagataataactaatcaaacaataatatgaataatcaatctgagaat
tccccaataaacttaaaaaagaattaagcttttgatttaaacaaaaactaacctccttca
ttctcacaaaatttaaatatatctaatggtaaataaaataattaccagcagttatacagt
tttaacaataaccgataggctaagattccatcaacataatacgtttctagttttgataaa
ttttaaatggataataatcaataataactcctttcataaaacaatcaataacctgtaaat
actatacaagaaactagaaatattcctatataaatctaaaccaactaatctactcctact
gattaaaaaaaaaatagtaaaatttttggcaatcttttacatgatatgctttagaatcct
atttctagtgttatatagagtactgatagcaaaactagctaatacttcccataagagaac
atcagtaactattga
DBGET
integrated database retrieval system
