Tetrahymena thermophila: TTHERM_00835520
Help
Entry
TTHERM_00835520 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7833450
NCBI-ProteinID:
XP_001031315
TGD:
TTHERM_00835520
UniProt:
Q22E76
LinkDB
All DBs
AA seq
2144 aa
AA seq
DB search
MIRFDQQLVAHYINYIVSKKKGKFNIQQKKQSFNKAKITQFIQFLQRMSNQRKALKGTVQ
YQGGIQQEDQWNQLRNLKIRTFYNPSRDHLLQRSSKVFYFVNYFEKQLTRPKFYYHFLII
IFFLQLIGSVSSSQVQIQDKLLYYFLKTCEYTRVSPLLKDFLQIQQEAQGILINSLIIFL
EVVFLITFYILGRSTTNLSDKKFKKRLLLMGYTTFFLEMQRWILFNIQADITASMMFCVQ
GQQNLEKRCQNNIQYSDDSLRYILIVINIVLGVFLSVINSIIHSIAQFIPINGLRSQFTN
LKLFDYSFILIIHILSYLDSQLSLFAFEILAVFYFIQYFFSYPLYTKNISYVYAVSLNFF
FAATILFHIRYYKNLSDSNFLYLFLVLGSFMAGVLAQWERMQLFKTRMFDFSIFREKPQE
TVNALQEVVHLLMEKTYQNQMTLLGIFEVHQRECVDNFCPCQYQMILNEDFDVHKQVNNG
SLVPINGFGKKSDLEQFKTTRKNIYRDQEDIEEYDNIQRIKNMSPTDGKSLRQTLRKSIM
TATPKQAQFSKGTKTQLFTEMVNFQNNELKNKQQSSTTKSSKTSTTNQSNTKSRRKSAVK
QRTIKGSYKLAKINFSVLQQDFLSFKKWTLTFVDYQYEQLLRYLYTSRNYQLLIGLGIRY
IYFEIEIKANFIKALYFVRKWAFHIDQKPYYFRVVEKSLSDLIENEIKNKDKALKYSIRK
KDNLEAKAYENFESYVVIEEIKKFFNQRLQEMIKLKQFYFEKLIQGFSSLNDLYAEQKNI
IKKGMVFKSKVEAFYSYHQNSPHLSKLLTIFYAVLFQDLKKALFLEDKLKDSLKKVDYYS
SWYTISGLEILQGNVATVIAHFRTKVGKILKYSASAPMFFGYKKLEFDSLQSVNDVMPQI
IGEKHDLFLERFIDQGQSKILRQYRQTLAKNKKGFIFPIKLYINYFFELHNDFIFSSLIV
RKQSNSQYLFINQHGFIDSFSQNFYEFCQIICPQVTVQQLIHSNIYLFIEDLDTHLRECQ
QKSKISNLKCVLKLNSRMNEMIIKFKNYWRKDKHYNRLMYHIIRVQEEYEDEFEEEENED
IYQFDIKANLILNQFSLISGEQLILYILEIISIIPIKSDNGSMQKSNTQFSCYSQKMQNQ
VTSNAFIPSMTALINNKPSSDQCKSEKEASKQINFQEDKKQAQQDTHSTKITSNPINSHD
RLDYEELINIQSKNYINSQKSLKSLDENNKHIISQLDEMDQDLIFMNDSFQHKTNVVPKL
NDNNNLRFISRVNDSYKIVENDWLGGGQNQKNNNIEQKLGYIPITISQKNIQSINSQHTQ
NNLTTHGDLEQINLTHMVSPRGSLIDHSLAQINNQQEKIFHALSNNNLSINDSHIMEIEN
INCKSLSQLNDYNNQRALEFNQSRIINLNKVPVEMSSSDSNSNIDQIDEVANSESSSSKN
KKIANKNYNIQFNNQSYWKSKSSKQIDIFQIENQQTFIQKEEKNSQFTKGTIITNKDSKV
SKRSSKKEIIMKIQQMTEKNNAINIECTLSDENDEEDEEAINYLMKNGKKNNNEQDENFS
IRSEGKKEETETVSEKSSHLSEVAKKIENIRRIVYTNKKPKFIALVKVIFLFIICLHIFA
TIGSQIFSNNYVKKIIDDSTLYEIQESTSLSFSQSISSVFGLQNDPNNQSFYQFNLNLSY
SKLQSIINQLLNNYIDEYESLNVIINSQYGLQNSISNKLENFLSDIFQATSQNNFVGIQT
SANSIFQISQIMESLSQKIQESIDSTFQMIKKMNLIIMILVVVLIFLSILILIKINLRFR
DIVKQYLYISTRISQNEAEQEYIKLSNIINFLEQNEDQYVKFNLQHSHIFNSKQITNIRP
LTFQKQEKHKHTQVLYNSINNQNLVFIKMIFFTILAASMSVTLQAVIFIVTKNQLNSLVE
PLDQYKEYSQKISQLTCLNTAHQLISYQPELDPLKLSNQFVNNNIKQISSYYLENFQIIP
IKGQQYYYSDQIQQLNQANSCLILDSSPQLYKECNTINQGIFIEGLLRVLRKVFQFYSDT
PAQNDPATFEYIRISMLLLDILDLSQKYFQKSIELIESDEKIQKFILIIIGNIFIIIVYM
ILSIYLIRKMNQNIELVKYSISFIPNKRLIEDNSTIQLIKAIQN
NT seq
6435 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacgctttgattaatagttggttgctcattatattaattatattgtaagcaaaaaa
aaaggtaaattcaatatttaataaaaaaaataatcttttaataaagcaaaaatcacttaa
ttcatttagtttttatagcgaatgtcaaattaaagaaaagcattaaaaggaacagtttaa
tattaaggaggaatataataggaggaccaatggaattagctaagaaatttaaaaataaga
acattttacaatcctagtagagaccacctattataaagaagctcaaaagtcttttatttt
gttaattactttgagaaacagctcacgcgacccaaattctactatcactttttaatcatt
atttttttcttgcagctgattggatctgtttcttctagccaagttcaaattcaagataaa
cttttgtactattttttaaagacttgtgagtacactcgagtgtctccgcttttaaaagat
tttttgcaaattcagcaagaagcacaaggcattttaataaattcattgataatttttcta
gaagtagtctttcttatcaccttttatattttaggaagatcaactacaaatcttagtgat
aaaaaattcaaaaaaagattgcttttaatgggttatacaacatttttcttggaaatgcag
agatggattctatttaatatttaagccgatattacagcaagtatgatgttctgtgtttaa
ggctagtaaaacttagaaaaaaggtgctaaaacaatatacaatattcagatgattcttta
agatatatattaatagtaattaacatagtactaggtgtttttctatcagtaataaatagt
ataattcattctatagcacaatttatccctattaatgggctaagaagtcagtttactaat
ttaaagctatttgattattcattcattttaattattcatatactgagttacttggatagt
tagctttctctctttgcttttgagatacttgctgtgttttacttcatttaatacttcttt
tcctatcctctttacactaaaaacatctcttatgtatatgcagtctcccttaactttttc
tttgcagccacaatcctctttcatatcagatactataaaaatttaagtgattccaacttc
ctttacttatttttggttttaggaagttttatggcaggagttttagcttagtgggagaga
atgtagttgtttaaaacaagaatgtttgatttttctatttttagagaaaaaccataagag
acagttaatgctttgtaagaggtagtacacttactaatggagaaaacttattaaaattaa
atgactttattggggattttcgaagttcactaaagagaatgcgtagataacttttgtcct
tgttaatattaaatgatattaaatgaagattttgatgtgcacaagcaagttaacaatggt
agtcttgtgccgattaatggatttggaaagaaatctgatttagagtaattcaaaactaca
agaaaaaatatttatagagattaagaagatatagaagaatatgataatattcaaagaatt
aaaaacatgtctccaactgatggcaagagtctgcgctaaaccttaagaaaatctattatg
acagccactccaaagcaagcacaattttcaaaaggaaccaaaacccaattattcactgaa
atggtaaacttttagaataatgagctcaaaaataaatagcaaagttctactacaaagtct
tcaaaaacgtctaccacaaactaatccaatacaaaaagtaggagaaagtcagcagtaaag
caaagaacaattaaaggtagctataaattggcaaaaataaacttttcagtgctttaatag
gactttttaagctttaagaaatggacgctaacattcgttgactaccaatacgagtagctc
ctcagatatctttatacttctagaaactattaacttttaataggcctaggcatacgatac
atttattttgaaatagaaatcaaagcaaattttattaaagctctttattttgtaagaaaa
tgggctttccatattgattaaaaaccttactactttagagtagttgaaaaatcgttatcg
gatttgattgaaaatgaaatcaaaaataaagataaagctttaaaatactctataaggaag
aaagataatttagaagctaaagcttatgaaaattttgaatcttatgtagtgatagaggag
ataaaaaaattttttaattaaagattacaggagatgattaagttgaaacaattttacttt
gagaaactcatttaagggttttcttctttaaatgacctttatgcagaatagaaaaatata
attaaaaaaggcatggttttcaaaagtaaagtagaagcattttattcatatcaccaaaat
tctccacatttaagcaaattgctcactatattttatgcagtgctttttcaagatttaaag
aaagctttgtttttagaagataagttaaaagattctctaaaaaaagtggattattacagt
tcttggtacacaatatctggattagaaattttataaggcaacgttgcaacagttattgca
cattttagaactaaagttggtaaaatactcaaatattcagctagtgctcctatgtttttc
gggtataaaaaattagagttcgactctctttaaagtgtgaatgatgttatgccttagata
ataggagaaaagcatgatcttttcttagaaaggtttattgattaaggttagtcaaaaatt
ctaagataatacagataaactcttgctaaaaataagaaaggatttatctttccaattaaa
ttatacattaattatttttttgagctgcataatgactttatctttagttctctaattgtt
agaaagcaatctaattcacagtatttgtttatcaatcagcatggattcattgatagcttt
tcctaaaatttttatgaattttgtcagattatatgtccttaagtcacagtacaataactc
atacactctaatatttacctcttcattgaagacttagacactcatttaagagaatgctaa
cagaagagcaaaatcagcaatttaaaatgcgtcctaaaactgaattctcgcatgaatgaa
atgatcatcaaatttaagaattattggagaaaagataaacactataatagactaatgtat
catataataagagttcaagaagaatacgaagatgaatttgaagaagaagaaaatgaagat
atttatcagtttgatataaaggcaaatttaatattaaattaattctctttgatcagtggt
gaatagttgattttatacattcttgaaattattagcatcataccaattaagagtgataat
ggatcgatgtagaaaagcaacacttagttttcttgttattcataaaaaatgtagaattag
gttacttcaaatgcttttattccttcaatgactgctttaataaataataaaccttcttca
gatcagtgcaaaagtgaaaaagaagcttctaaataaataaatttctaagaagataaaaag
caagcacaacaagatactcattcaactaaaataacatcaaacccaattaactctcatgat
agattagactatgaagaactcataaacattcaatcaaagaattatataaactcgcaaaaa
tcattgaaatctcttgatgaaaataataaacatattatttcataattagatgaaatggat
caagaccttatttttatgaatgacagcttttagcataaaacaaatgttgttccaaaactc
aacgataacaataatttaagatttatttcaagagtgaacgattcatataagatagttgaa
aatgattggttaggtggaggataaaattaaaaaaataacaacattgaataaaaattagga
tatattccaattacaatatcataaaagaatatttaaagcattaacagtcaacatacttaa
aataatttaacaacacatggagatttagagtaaattaatttaactcatatggtttctcca
agaggaagtttaattgatcactctttagcttaaattaataactaacaagaaaaaatattt
cacgctttatcaaacaataacttatcaataaacgatagtcatattatggaaatagaaaat
ataaactgcaagagtttatctcagttaaatgactacaataattagagagcacttgagttt
aactaatctcgcattataaatctaaataaagtaccagttgaaatgtcttcttcagacagc
aattccaatattgatcaaatagacgaagtcgccaactctgaaagttcaagctctaaaaac
aaaaaaatagcaaataaaaactataatatccaatttaataattaaagctattggaaaagc
aaatcatctaaataaattgatatttttcaaattgaaaattaacaaacttttattcagaaa
gaagaaaaaaattcctaattcactaaaggaacaatcatcacaaataaggacagcaaagtt
tctaaaagatcaagcaaaaaagagattattatgaaaatttaacaaatgactgaaaaaaat
aacgcaataaacatagaatgcactctttctgatgaaaatgatgaagaagatgaagaagct
atcaattatttaatgaaaaatggtaaaaaaaataataacgaataagatgaaaatttcagc
ataagaagtgaaggtaaaaaagaagaaaccgaaactgtctcagaaaaatctagtcacctt
tctgaagttgcaaaaaaaattgaaaatattcgcagaatagtttacacaaataaaaagcct
aaatttatagcactagttaaagtcatcttcttattcattatctgtcttcatattttcgca
acaatcggctcttaaattttctccaacaactatgtgaaaaaaattatagacgattctact
ctttatgaaatacaagaatctacttccttatccttttcttagtctatttcgtcagtattt
ggtcttcaaaacgatccaaataattagagcttctactaattcaacttgaatttaagctat
tctaaattataatcaatcattaactaattattgaataactatattgatgaatatgagagt
ttgaatgtgatcataaactcttaatatggtctatagaactctatttctaataaattggag
aactttctttctgatatattttaggcaacatctcaaaataattttgttggtatacaaact
tctgctaatagcattttttaaattagttagattatggaaagtctaagccaaaaaatttaa
gaatcaattgatagcacattttagatgattaaaaaaatgaatttaataataatgatattg
gtggtggttctcatatttttgtcaattttgattttgataaaaataaatttaagatttaga
gacattgtgaagtaatatctttacatcagcacaagaataagttaaaacgaagcagaataa
gaatatattaagctttcaaatataattaattttctagagtaaaatgaagattaatatgtt
aaatttaatcttcagcattcccatatttttaattcaaagcaaataactaatattagacct
ttgacattttaaaaacaagaaaaacataaacacacttaagtactttacaatagcattaat
aactagaacttagtttttatcaaaatgattttttttacaattttagccgcctcaatgagt
gttactcttcaagcagtgatatttatagtaacaaagaaccagcttaatagtcttgtagag
cctttagactaatacaaagaatactcgcaaaaaatatcatagctaacttgtctaaataca
gctcatcaactaataagttattaacctgagttagatcctttaaagctttctaatcagttt
gttaacaataatattaaatagattagttcttattatctagaaaattttcagattatacct
ataaaaggataacaatattattattcagattaaatttaataacttaactaagcaaacagc
tgtttaatccttgattcttctcctcaattatataaagaatgtaatactataaatcaggga
atatttattgaaggtttgttaagagttttaaggaaggtgttttaattttactcagatact
cctgcccaaaacgacccagctacgtttgaatatattaggatcagtatgcttttattagat
attcttgatttgtcatagaaatatttctagaaatcaattgaacttattgaatctgatgaa
aagatctaaaagtttatcttaataataattggaaatatctttattattattgtttacatg
atactttctatttatttaatcagaaaaatgaattaaaatatagaactagtaaagtattct
ataagctttattcctaataaaagacttattgaagataactcaaccattcaactaattaag
gcaattcagaattga
DBGET
integrated database retrieval system