Entry |
|
Name |
(RefSeq) PRP38 family protein
|
Organism |
tet Tetrahymena thermophila
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
AA seq |
2242 aa
MKTSLSLVLPKLQNILSPVNGINLSKQNSESPKIFQKVIKKEASYQQSLLLSQQVSYNSD
EEEIEVSLENTWQILLKDPQSRTDKQHDCVNEYVKELEMFKHYIGIVKKEIIKKISGKLI
GYEFQKNQVVLSNEVLDNSYLFIILEGKVSIYDCNQASNGEQSKANFIKQYQKGYCINLN
HIIFQRPFTDIAISDSHTLIAKLDKKIFRKYLLEIEEQAVEDEISFLQNIDLFSQLSLDE
FQDLLLNMDIQTLSLNETLYNTFSKPDEFYIIKSGKIGIFKGRQVGQIQKELNFIDNEQI
KIINIGIQEENIQTKNQINFQNTFQSGKPNFQSLLKSNYYTKIKELNTFDFLGYEEILSN
TYRDHIAKSLQNNTILYVFRRSYFIKKLMKFKCFEKIIFKKRYSNKLESKKQQKLNIQFE
QDLQLGLKFIENHSKPKSYLLQDLSLNNSALIDTTNTYERNQKNFNSLNNSQKQKQSFSL
YCSQNQEECISPKKICIPIQNNQNRQVNVSNKKILIQQNYYLKNYSNSETKGNLQNIGFM
MRQQDKINAYLYKQNLKEQSACLDMLTPRSDYSQNSARKLLIHNQVNQNDHEKQQNTQNQ
KNFAIIEESQARQRKQQNKNNLHKDQHNQLDSPLIYYSPLNQIQKTFLKTEQEYFNSNLQ
QKTKSEQSFLQQEQQRNCNSVLSSTKKINTHTNSRNIFSDPSPCLSQISLKDEITLQQKK
KGSPEHLQTFGSQMIGINIDFIQQGLGSDKNSMLLSQLARIKQILEINYGSQVSELYAAS
QFQQKIIDGAILLNYKMFQPPSLNLNKFQSGKISPLESQLYSKNKLLFDFWYKQGQNDVS
QLSSIAYKDYLQSSLTSMILRASSQSRKTDFSNRSYSQYILKSKLLKIIPPINDTEYLTS
MVDECSGDVTFKGCQNQFSETYQQNSFWHTSPTEYELEKQFSNLCSITFGNQENVNNTHS
ILCQEIPLQILFSNFTSINQTSGLNIIVVDPSSQRQIYNNNKRILTPNDNFTSILQTEQI
SPQGIQSAESQYKQILQDFKLSENQSKDYYDIRSRGIQKTIDTLNGPKDFLLQMIVINFK
EQKSKQTSYYNLYNVISWIDLNQLIEDSNKLKDDVNRFILVSYLVCAFVIFFILIISFLH
AINIQILTEKPIEELTQILQNIRTDIFNETKETHNKEFNYELQQDLDQISESFSSCQELK
CLFETFRQTFQTIQYANEAYFKGDQASSLLHWAQAVVFFENIKNYRAHGISLNNLGNIHL
LELRYDEAIDCYEKSIEIINNEIKESYKQEFHKFEKKQQKQYEQEQDQEFNSFKDFNFIK
LSRIIQYLHANIKKYKGALELVNKEQYKEFFDNKLQFYEKQIFEIIQILDIDLKRDCLCY
VILCTCYFIDKNQEKTDQFLENIQNILIQMENTKQYQSEYNSCSPLKYQGMMTFTADQNN
QSQLQTPLSQIDFKFNKNQRLTLFTQVSLNGVEEQHSSLIPPIKQSSSSITLNVNTFNNQ
KQHIYNILNEKKNQMNTKNKQKEENHLISNSFKTVFSYNKMQAQQKVLPQILSKRFKKPS
LNKNLSYNSEIVEKIQKVEEQNQDQEEEEFSNGNCVSQIPSSEQTTIKNSFILNKINPKQ
NSLVSQKPLHLLEELTKNLPTVPSSNIIDNNFQECSFQKNNSKQFLRKNSLCNISNCQQI
NNQNNTNLSYLEPQNLQETLDQTHFSFYERQNKFINIQDQMYSINTELDQNNHSLHQART
PELPFIKQGTEETLKTIFELPNPQQITQIPDLTLQTTDRGSQEDNRIKLFTPLKIEKKMS
SPRNSWKEDSPQIENRLKRIASQNIINRGKNLSIFNKPAQQKQESPYQNIPLEIFQQKFL
LLKALLNNSKIQKTYEQVELITQIFENYQRYYLQDRLEALKFLSKTFNTKDQDLYLKDLY
QKFQEAKWNLKIVIHEQFGDQSYYKVESCIKTVVGLIQKISPNKTNKYSIYINNDIQEEL
MSDSFGDINLNFLNDFELLLRKHFQTNTATQNSKNFYKESFQNDETPTQTFISQEDLYKK
YSSQNANNQKKDLLKQHQFVIQAIEILRKYTDASLKKETKLVTVNNVFIKQFHSLTDQLN
NPKFVNLFLVFWKLIFKFYGQNLCKIDDQKNDIEQIENIILSIHDAEDEKSIYDAIFILI
RMKHFLIKLKIKVIIRIIIKQSYQIDLCTQNQIAKQAKKYVQLMQLNHLIQVISSSNHLN
NFIQQIREPIRYLGNQLIIEKI |
NT seq |
6729 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaagacatctctatcactagttttaccaaagctctaaaatattttgtcccctgttaat
ggtatcaatctaagcaagtaaaactctgagtctcctaagattttccaaaaggttataaaa
aaagaagctagctatcaataatctctactactgagtcaacaggtatcatataattcagat
gaagaggaaatcgaagtatcccttgagaatacttggtagattttattgaaagacccttaa
agtagaacagataaataacatgattgcgtaaacgaatatgtaaaagagctggaaatgttc
aaacattatattgggattgtaaaaaaagaaataataaaaaaaatatctggaaagctaatt
ggttatgaattctagaaaaactaagtagttctatcaaatgaagtcttagataacagctat
ttattcattattttggaaggtaaagttagcatatacgattgtaattaagctagtaatggg
gagcaatcaaaagctaattttatcaaacaatactaaaaaggatattgtattaatttaaat
catattatcttttagagaccttttactgatattgctatttctgattcacatacattaatt
gcaaaattggataaaaagatttttagaaaataccttctagagatagaagaacaggcagta
gaagatgaaatctcttttctttaaaatatagatctattttcataattaagcttagatgaa
ttttaagatttattgttaaacatggatatctaaacactttcactaaatgaaaccctatat
aatactttctctaaacctgatgagttttacataataaaatctggaaaaattggaatattt
aaaggaagataagttggttagatataaaaagaactaaatttcatagataatgaatagatc
aaaattattaatattggaatttaagaagaaaatatacaaacaaaaaactagattaacttt
taaaatactttttaaagcggcaaacctaatttttaatctttgttgaaatctaattattat
acaaagattaaagagttaaatacttttgatttcttaggttatgaagaaatattatcaaac
acatatagagatcatatcgcaaagagtttacaaaataatactattttatatgtttttcgt
agaagctactttataaaaaaactcatgaaatttaaatgttttgaaaagataatttttaaa
aagagatattcaaataagctagaaagtaaaaaacaataaaaattaaatatccaattcgaa
taagacttgcaattaggacttaaatttatagaaaaccattcaaaacctaaaagttatttg
ctctaagatctatctttaaataattctgctctaattgatacaacaaatacttatgaaaga
aactaaaaaaattttaattctttgaataattcttagaaataaaaataatcattttctctt
tattgtagttagaattaagaggaatgtatcagtcccaaaaaaatatgtataccaatttaa
aataatcaaaatagacaagtaaatgtaagcaataaaaagattctaatacagtaaaattat
tatttaaaaaactattcgaattcagaaactaaaggtaatctacaaaatattggtttcatg
atgagacaacaagataaaattaatgcctatctttataaatagaatttaaaagaataatca
gcttgtttagatatgcttactcctagatcagactattctcaaaatagtgcaagaaaatta
ttaatccataattaagtaaatcagaatgatcacgaaaaataataaaatacttaaaattaa
aaaaactttgcaataattgaagaaagttaagcaagataaagaaaataataaaataagaat
aatttgcataaagattaacacaatcaattggattctcctttaatatattattcaccttta
aattaaattcagaagacttttttaaaaactgaataagaatattttaatagtaatttataa
taaaaaacaaaatctgaacaatcttttctataataagaatagtaaagaaattgtaacagt
gttctttcatcaacaaaaaaaattaatactcatacaaattcaagaaatatattttctgat
ccttctccgtgtttatcacaaatttctttaaaagatgaaattactctttaataaaagaaa
aaaggatctcctgaacatttataaacgtttggctcctaaatgataggaataaatatagat
tttatataataaggcttgggcagtgacaaaaacagtatgctacttagccaattagcaaga
atcaaataaattttggagatcaattatggatcttaagtttctgaattgtatgctgcttcc
taatttcaataaaaaataatagatggagctattttattaaattataaaatgttttaacct
ccttctctcaatctaaataaattttaatcaggaaaaatatctcctcttgaaagttagctc
tacagtaaaaacaaacttctatttgacttctggtataaatagggataaaacgatgtttct
taactttcttcaattgcttacaaagattatttgtaatccagcttaacctcaatgatttta
agggcaagctcttaatcaagaaaaacggacttcagtaatcgctcttatagctaatatatt
ctaaaaagcaagttactaaaaataattcccccaattaatgatacagaatacttaacatct
atggttgatgaatgttctggagatgttactttcaaaggctgctaaaatcagttttcggaa
acttattaacaaaatagcttttggcatacttctccaacagaatatgagttagaaaaacaa
ttttcgaatctttgctcaataacttttggaaattaagaaaatgtaaacaatactcactct
attttatgttaagaaatacctctataaattttattcagcaatttcacaagtatcaatcaa
acttctggacttaatattattgtggtagatccatcatcataaagataaatatacaataac
aacaaacgaattctaactccaaacgataactttacttctatcttataaactgagtaaatt
tctccacagggtatttaaagcgcagagagttaatataaataaattttataagatttcaaa
ttatccgaaaactaatctaaagattactatgatattagatcaagaggaatttaaaaaact
atagacactttaaatggccctaaagattttttgcttcagatgattgtaattaattttaaa
gaataaaaatctaaataaacttcctattacaatttatataatgttatttcgtggattgat
ttaaatcagttaatagaggattcaaataagttaaaggacgatgtgaatagatttatttta
gtttcttatcttgtttgtgcttttgtcattttttttattttaataatatcttttcttcat
gcgattaacatttagatactgacagaaaaaccaattgaggaactcacttaaattctctaa
aatataagaacagatattttcaatgaaacaaaagaaactcacaacaaggagtttaattat
gaattataacaagatttagattaaattagtgagagtttttcgtcttgttaagaacttaaa
tgcttatttgaaacatttcgctagacattttaaacgatttaatatgcaaatgaagcctat
tttaaaggagattaagcatcttctttacttcattgggcacaagctgtagtttttttcgaa
aatataaaaaattacagagctcatggaattagtttaaacaaccttggaaatattcatctt
ttagaattaagatatgatgaagcaattgattgttatgaaaaatcaattgaaattattaat
aatgaaattaaagaaagctataaataagaatttcataaatttgaaaaaaaacaataaaaa
taatatgaacaagaataagattaagaatttaatagcttcaaggattttaattttataaaa
ttgagcagaattatttaatatttacatgctaatattaaaaaatataaaggtgctttagaa
ctagttaataaggagtaatataaagagttttttgacaataagctttagttctatgaaaaa
tagatttttgaaataatttaaattcttgatattgatttgaaacgagattgcttgtgctat
gtaatattatgcacttgctactttattgataaaaattaagaaaagactgattaatttttg
gaaaacatttaaaatattctaatataaatggagaatactaagtaatactaatcagaatat
aatagttgttccccattaaaatactaaggaatgatgacttttacagcagattaaaataat
caaagttagcttcaaacacctttgtcataaatagattttaaatttaacaaaaatcaaaga
ctcactttgtttacttaggtatctttaaacggtgtagaagagtagcattcgagtttaatt
ccaccaataaagcaatctagttcttcaattacattaaatgttaacacttttaataatcaa
aaataacatatttataacatcttgaatgagaaaaaaaattaaatgaatactaagaataaa
taaaaagaagaaaatcatttaatttcaaattcttttaaaacagtttttagctataacaaa
atgtaagcacaataaaaagttttaccataaattttatcaaagagatttaaaaagccttca
ttaaataaaaatctttcatataactctgagatagttgaaaaaatataaaaagtagaagaa
taaaattaagatcaagaggaagaggaattttcaaatggaaattgtgtaagctaaattcca
tcctctgaataaaccacaataaaaaattcttttattttgaataagataaacccaaaataa
aattccttagtctcataaaagccattacatttacttgaagaattgactaaaaatctacca
acagttccatcatcaaatattattgataataatttttaagagtgttcattttaaaaaaat
aattctaaataatttcttagaaaaaatagtttatgtaatatttcaaattgttaataaata
aataattagaataacaccaacttaagctatttagaaccttaaaatttacaagaaacactt
gatcaaactcattttagtttttatgaaagataaaataaattcataaatatttaagattaa
atgtattctataaatactgaacttgattaaaataatcattctttacatcaggcaaggact
cctgaacttccttttatcaaataaggaacagaagaaactcttaagacaatatttgaatta
cctaatccttaataaataacttaaatacctgatttaactctttaaactactgacagagga
tcacaagaagacaatagaataaaattatttactccattaaaaatagaaaagaaaatgtct
tcaccgagaaatagctggaaagaagattctccctaaatagaaaacagactaaagagaatt
gcaagctaaaatattataaacagaggtaaaaatctctctattttcaataagccagctcaa
taaaaataagaatctccatactaaaatattcctttagaaattttttagtagaaatttttg
cttttaaaagccttgttaaataactctaagatataaaaaacttatgaataagtagagttg
ataactcagatatttgaaaattatcaaagatattatctctaagatagattagaagctctt
aagtttttaagcaaaacatttaacactaaagatcaagatttgtacctaaaagatttatat
caaaagttttaggaagctaaatggaatttaaagattgttatccatgaataatttggtgat
tagagttattacaaagttgagagctgcattaaaacagtagtagggctcatttaaaaaata
tcaccaaacaagacaaacaagtattcgatttacattaacaatgatatttaagaagaatta
atgtctgattcttttggagatattaacttaaattttttaaatgattttgaattgcttcta
agaaaacacttttaaacaaacacagctacttaaaatagcaaaaacttttacaaagaaagt
ttttagaatgatgaaacaccaacctaaacatttatttcttaggaagatttatataaaaag
tattcttcttaaaatgcaaataactaaaagaaagacctacttaaataacattaatttgtt
atttaggctatagaaattttgagaaaatacactgatgcaagcttgaaaaaggagactaaa
ctagtgacagtaaataatgtatttattaaacaatttcattcgttaacagattaactaaat
aaccctaaatttgttaatctttttctagtattttggaagttgatttttaagttctatggc
taaaatctatgcaaaattgatgattaaaaaaatgacatagaataaatagaaaatataatt
ttatcaattcatgatgctgaagatgaaaagagtatatacgatgcaatatttatactaatt
agaatgaaacattttctgataaaacttaaaataaaagttataataaggattattattaag
taatcatattaaatagatctttgcacttaaaaccaaatagcaaaacaagcaaaaaagtat
gttcaattaatgcaattaaaccatttaatttaggttattagttcatctaatcaccttaat
aatttcatttagtaaataagagaacctatcagatatctaggaaaccagttaatcatagaa
aaaatttga |