Entry |
|
Name |
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
|
Organism |
tet Tetrahymena thermophila
|
SSDB |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
AA seq |
1936 aa
MNCFETMKISQQYSKIIQKIQQRNDKDPKNKKSNLIQISKTNKQNILGTQNQLISHIQNN
TKPNSNLSCNQTINSTTSSIQKGQQQIKDKSPSQTTPRYNYTPLTPLKNLIGNNSSLSPL
PHLQQQQIRNVSKTIHYPQNQQQNNNVSNTILNTTNMLEDNSFVSINNHLSNIQQEIRIS
QKKPYLNDQDSTQKALSQRLLVNNYDQNSQNTPKRLFFNYKNTVNESLKNHSHEQKNQQK
ELINFKCSLCQMKNAKYQSKITHNTGEYTKYYCSKCAIKLMEQGQKMDCIPNIKTPQSQL
KNQQSNYQQKNQQEEIQLIHDDQDSSAHILKNVQLENFSRIDQKQHSNKQISQLEFPPNF
QFDRKESPNKHSSNQKENIFLPTLGGVDCYQNDALDNSQRNLQLNQIAIDQLSQKNQQVQ
IKQQIQNHNGILSDSIINHQLINGCNQNLFSQNQQIQLQSKQDQNRMQVWNFHDSENQDD
QKWQDLGPKLTFEGESQRPSDQDLFNIQQQDINRAIIVFNDSENNQQSKNIQDSEGQEEQ
SDSNQKDSDIATISQVNPINHNNSLQKEDDNRQMIMQQEQIVDEDSQSQFLPQFSDQSNY
EQSRQRKIQILENFSQELNLSNTRAAACLNQLAQRKKEVTKFYENQELKLQQNAQNLMQF
IQQELNESIEKLRNAQVKTLSLFAEKEHQLQRIYHEIQSTELDVKKNRIQIVEFMEEQPF
NNIIQIYHQNLSKNTYTINELPNQILCLSKTYQLAEKKQASALFQQGLKDALVVQEKRTT
MFGNSSYASATSTPQTASTNNNSYNLVISPRSSNNQNINQFNFVNNQNMLSYQSHQSQYQ
TQKRNLSQTNSMTSSKVFTSQSNQTILQNQPTLNIKQNSQQQQFFSAQVNNPSPLKKQNI
DNSYVQEESQQLPQSSDFGNNNQNQFQNHENIQSSFSQQNQNFQQISNNFSLQNSGNKSQ
FKPIISNSISSPLIKKNNSLKNIQNYPIMYENQYIQNPYSSVENHFEQIYKPDVTRENAP
SYSSVQFQRWKDCEKTIIEQIMSIEQNEMNLTPGRDSKQDIELLSPCQQSSKISGIVPQN
LFQSPIQIQHQNNEISIANQKNDFAQDEIKCLSDYEKKIQSQINQQNNTQQIQNIDNDQQ
ENQDLKQVKQEDFKKQGTSKFEDIKNNYQWMIEQYKMEQNLVSSHLVPQEPRNAKKVNSL
AVKQNLDNLAKGSNQNQTKQFEQNKIIRERCELQDITYLKLQQNDQIQNKLLRAENNNQL
IDEINLSENLINKAQFKQSSNQSYSSNNQTGEFQLNDHGIIQNQNQAVHSYGDQYSDQIA
KDKSISEGVDLSYSVSVAAGLASTNDQMINNPNSQSIQNSNNLFKIKSYKQEEQALSKDG
QFCTLQPLCQSNLLTQQEQKQELYQDGNKRETSINQIDLISNSDQQIQIQKENQNLTHLN
RQNLISSFSQNIKLSDDLIETSIVQNYINRESFSQNNDQTSYYSQNTNQFNQQLMNDQNT
LNQFDKKAILNEYKPSFNNNQNEANEDKNIQFIQSTTLNYPQMNKNEIQLGFSINIQQSQ
DDKIYRQLQNIAKDSFSDANYTIQHQESQEEQNDQKEDIILDINQLHDISGDEDTDSGLG
SNASKRPLKYSEIIQKIHENYNRLSQNCQKKSNNLQKNQSQPTLSQENQQETHQANQQKL
NPQECQNNENNLDSQQQNFKTEESQLVFSNQEQIHLEIAQNLSDLVLNKNNENFSSFCTN
MNQLEQSLTPMNNQQNEQVLQNDIIQISIISPHIKQNEIIDQEVNFIQNSQKESENYVNT
VASFSQQQFEQQHQELSNNNYPSKEEQYVIQTQINNTVEVSPNSNKEELIVNQDKDSTFS
RFLDNYGCVSTNIEAQINDHINNQISQKRINFNKYSELIKSSPHFRAHKFTEDSVLSDED
DNLDEEQFEVRSTPFK |
NT seq |
5811 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaattgctttgaaactatgaaaatatctcaatagtattctaaaattatacaaaaaata
taacaaagaaatgataaagatcctaaaaataaaaaatccaatcttatataaatatccaag
actaataaataaaatattttaggaacttaaaattagttaatatctcatatttaaaataat
actaaaccaaattcaaatttatcttgtaattagacaataaactcaactacatcaagcatc
caaaaaggctagcaacaaattaaagataagtctccctcttaaactactccaagatataat
tatacgccattaacacccttgaaaaatttaattggaaacaattcatcattgtctcccctt
cctcatttacaataacaatagattagaaatgtaagtaaaacaattcattatccttagaat
caatagtagaataataatgttagtaatacgattttaaatacaactaatatgcttgaagat
aacagttttgttagcattaataatcatctttcaaatatttaacaagagatcagaattagt
taaaaaaagccttatttaaatgattaagactcaactcaaaaagctctttcctaaagattg
cttgtcaataattatgattaaaatagttaaaatactccaaaaagattattttttaactac
aagaacactgtcaatgaatctcttaaaaatcattctcatgaacagaaaaattaatagaag
gaacttattaattttaaatgttctctatgctaaatgaaaaacgcaaaataccaaagcaaa
ataactcataatactggagaatatacaaaatattattgttctaaatgtgccataaagttg
atggaacaaggatagaaaatggattgtattcctaatataaaaacacctcaatcataatta
aagaaccaacaatctaattactagtagaaaaattaataagaagaaatataattaattcat
gacgactaagattcatctgcacacatacttaaaaatgtataacttgaaaacttctcaagg
atagattaaaaatagcacagcaacaagcagatatcataactagagtttcctccaaacttt
caatttgataggaaggagtcgccaaataagcatagctcaaattaaaaggaaaatatattt
ttacctactttagggggtgttgattgctattaaaatgatgctttagataatagctagaga
aatctttaacttaatcaaatcgcaattgattaactgagttagaaaaatcaataagtacaa
attaaataataaatttagaatcataatggaatattaagtgatagcataattaaccattaa
ttaataaatggatgcaattaaaatctttttagttaaaatcaataaatctaattacaatca
aagtaagattaaaatagaatgtaagtttggaattttcatgactcagaaaactaagatgat
taaaaatggcaagatttaggtccgaagcttacttttgaaggagaaagctaacgtccatct
gactaagatttatttaatatctaatagcaagatattaatagggcaattatagtatttaat
gattcagaaaacaattagcaatcaaaaaacatctaagattcagaaggataagaagaatag
agcgacagtaattaaaaggattctgatatagctacaattagtcaagttaatccaattaat
cataacaatagcttatagaaggaagatgataataggtagatgataatgcaataggaataa
atagttgatgaagattcttaaagtcagtttttaccttaattttcagattaaagcaattat
gaataatcaagatagaggaaaatttaaattttagaaaatttttcttaggaactaaatcta
agcaatactcgagcagcagcgtgcttgaatcagcttgcgcaaagaaaaaaagaagttact
aaattctatgagaattaagaactcaaattataataaaatgcataaaacttaatgtaattt
atttagcaagaattaaatgaatctattgaaaaattgcgaaacgctcaagtaaaaacttta
agcttgtttgctgaaaaggaacatcagctttaacgaatttatcatgaaatacaatctaca
gagcttgatgtaaaaaagaaccgcattcaaattgtagaatttatggaggagtaaccgttc
aataacatcatttaaatttatcactaaaacctttccaaaaatacttacactataaatgag
ctaccaaattagattttatgtctttctaagacttattaattagctgaaaagaagtaagct
tcagctttgttttagcaaggacttaaagatgcattagtagtttaagaaaagagaacaact
atgtttggtaactcttcatatgcttcagctacttctactccttaaacagcaagtacaaat
aataatagctacaacttagtaatttccccaagatcgagcaataatcaaaatataaactaa
ttcaattttgttaacaattagaatatgctttcatactagtctcattaaagctagtatcaa
acccaaaaaagaaatttatcatagacaaatagtatgacttcaagcaaggtttttacatct
tagtctaatcaaactatattataaaattaaccaacattaaatattaagcagaactcataa
taataataattcttttcagcataagttaataatccatctcctttaaaaaagtaaaatatt
gataatagctacgttcaagaagaaagttaataattaccttaatctagcgattttggtaac
aacaattaaaactaattttaaaaccatgaaaatatttaatctagcttttcttaacaaaat
taaaattttcagcagattagtaataatttttctttacaaaattctggtaataaatctcaa
ttcaaacctattatttctaattcaatttcttcacctctaataaaaaagaataattcttta
aaaaatatataaaactacccaatcatgtatgaaaaccaatatatctaaaatccatattct
tcagtagaaaaccattttgagtaaatatacaagcctgatgtaacaagggaaaatgctcca
tcttactcttctgtataatttcaaagatggaaagactgtgaaaaaactattattgaatag
attatgagtatagaacaaaatgaaatgaatttgactcctggaagagattcaaaacaggat
attgaattactatcgccttgccaataatcttcaaaaatatctggaattgttccttagaat
ttattttagtctcccatacaaatttaacattaaaacaatgaaataagtatagcaaattaa
aaaaacgactttgcataagatgaaattaaatgtctaagcgactatgaaaaaaaaatataa
tctcaaataaatcagtaaaataatactcaataaatttaaaatatagacaatgattaataa
gaaaattaagatcttaaataagtcaaataagaagattttaaaaaataaggaacaagtaaa
tttgaagatataaaaaataattattaatggatgatagaataatacaaaatggaataaaat
cttgtttcttctcatcttgtaccataagaaccaagaaatgctaaaaaagtaaattcttta
gcagtaaaataaaatttagacaatttagcaaagggctcaaaccaaaatcaaacaaaataa
tttgaataaaataaaattattagagagagatgtgagttgcaggatattacatacttaaaa
ttataataaaacgattaaatttaaaataaattattaagagctgaaaataacaactaactt
attgatgagataaatttaagtgaaaatttgatcaataaagcataattcaaataatcaagt
aattaaagttattcttctaataatcagacaggagagttttaattgaatgatcatggtatt
atacaaaattagaattaagcggtacatagttatggagattaatactcagattagatagct
aaagataaaagcataagtgaaggagttgatttatcttattctgtatctgttgcagcaggt
ttagcaagcacaaatgatcaaatgataaataacccaaatagttaaagtatttaaaattca
aataatctatttaaaataaaaagctataaataagaagagtaagctttatctaaagatgga
tagttctgtactctttagcctttgtgtcaaagcaatttattgacgtagtaagaatagaag
caggaattatatcaagatggaaataaaagagagacatctataaaccagattgatttgatc
tcaaacagtgattaataaatacagatttaaaaagaaaactaaaacttaactcacttaaat
agacaaaatttgataagttctttttcttaaaatataaaactttctgatgatttaatagaa
acaagtattgtttaaaattatataaatagagaatcattttcttagaataacgactaaaca
agctattactcctaaaatactaaccaatttaattagtaacttatgaatgactaaaatact
ttaaattaatttgataaaaaagctatactaaacgaatacaagccctcgtttaataataat
caaaatgaagcaaatgaagataaaaatatccagtttatataatctacaactttaaattat
ccttaaatgaataagaacgaaatatagcttggattttctattaatattcaacagtcataa
gatgataaaatatataggtaattataaaatatagcaaaagattccttttctgatgctaac
tatactatacaacatcaagaaagttaagaagaatagaatgattaaaaagaagacattatc
ttagacataaattagttgcatgatatttctggcgatgaagatacagactctggtttagga
tctaacgcatcaaaaagacctcttaaatactcagaaataatttaaaaaattcatgaaaat
tataacaggttgtcttaaaactgctaaaaaaaaagtaataatctttaaaaaaattagtca
tagccaacactttcataagaaaatcaataagagacgcattaagcaaaccaataaaagtta
aatccttaagaatgttaaaacaacgagaataatttagactctcaacaatagaattttaaa
actgaagaatctcaattagtttttagcaattaagaataaattcatttagaaattgcataa
aatctttcagatctagtattgaataaaaataatgaaaattttagcagcttttgtacaaat
atgaattaacttgagcaatcactcactcctatgaataactaacaaaacgagcaggttctt
taaaatgatattatacaaatatctattataagtcctcatattaaatagaatgaaattata
gatcaagaagtaaattttatttaaaactcctaaaaagaatctgaaaactatgtaaatact
gtagcatcttttagtcaataataatttgaacagtagcattaagagttatcaaataataat
tatccttctaaagaagaatagtatgtcatttaaacataaattaataatacagttgaagta
tcccctaactctaataaggaagagctaatagtaaattaagataaagactcaacattttca
aggtttcttgataattatgggtgtgtaagcacaaatatagaagcttagatcaacgatcac
ataaacaattagatttctcaaaaaagaatcaattttaacaagtattcagaactaattaaa
agctcccctcattttagggcacacaaattcactgaagactctgtactaagtgatgaagat
gataacttggatgaagagcaattcgaagtaagaagtaccccattcaagtga |