Tetrahymena thermophila: TTHERM_00849400
Help
Entry
TTHERM_00849400 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7841723
NCBI-ProteinID:
XP_001019242
TGD:
TTHERM_00849400
UniProt:
Q23R44
LinkDB
All DBs
AA seq
1906 aa
AA seq
DB search
MMQSVDQNIPDLRSISFLNPQVNSINVIYAGIALNFSLFICLIIDGILFTYQQKLNNFLK
SFHRKMQLYISFIAQIYNYVIFIPLVYHTLLQYDLYYISCISFISCILISTAISLHNQSY
GFSNQHTLGFRTPFVWQFCLRFLEVINCIFLSFVNELTGLIIVNFILAIYQLIYLSFGCF
LNRIKTLFWMVFFNCLYLFLAITLFIGDVNNQQISMILLALIVIPISYSITQIISKKDLD
FEVLKQNKDKYNPKKDFLIRQLLLLSKLDYEDYRTSSLSQFHEIISLDHIINCTQYPKCF
CFDTINQLDQYKYEDFQQSVLSGRLRLKFLNQFIYELFKNFCSNKRLLKNSGYTIDAYLS
FINYLIDIKKSKVQVFCELVKLNSKQNISLRERALLQETYKKAQKNFDNQTIAQTQIHAK
KVDKEQQIQQNVVYEKTRGSSKKSFVSVELRDYLCGIKFDEGLNSLQQLYEKCLAQKENI
LKMLSNDFINLKDFKQKAIEYYNNRLLLQNTLKNLSRIHYNSQKLQFFMDRYVQIMAFGQ
RKKDIFKNYKKNKQNFNEFNSESSNIILKMFNKVDQKIFDKDNCVIFITLIDDIGTIKRS
QSKFEPMFGYSLKEALGKNISIILPNQIAPFHNAILQDFVDEQLQYDESSNNLRNKYSNT
KSLLLAKNQDGWAVPISIVFKTDNIGLEDCGLTTHIIKLKSDSAFIMTSVQQFQIQLISE
ILFDRLFNRFINNQSDLRRIYLNKIIPLLHYFEKKWVKIQETTDSDIHKDFVKTIAFLPK
YDQKINSFKTNSLSTTNTFGLANTRKKRSFIFEAMEYSQLDNEIKNYSVESMDVFSVQIK
FTHTTNKYFSYNVIEIASFRKLLDTQEIKECLQTFSGMMKSLLDISYPLQREYAKLDMLN
QSQIQLQSSYSREQSANHTLQMQRVKKPYQQLEEILDRSELKQEEEIQSQQNIKNVNNNE
QGNENNNEQNDDKTPKDQSIYLDLKKLKLEVRDLSNQHIQSSSRMDLDYQHNQSFINSSS
NFFDQSQFIDQQNRTSKNHQILQLQNMDNKNSSYTKIPNIQETNINHIDANQYVQTLQSL
NKIAVKEFEKAEEFNHFSAKDSTYYNTELQTNAQNINTTDRIYDTQGQGQDQGKLEKLLF
EHKSSFQEISVNKQKSQNQIQNSKNMTTSLQMKMSEKKNQQDNLMMHAKQIGVSKNQQDN
NQKLNKRFSEQTFKKTGTIYSKNQEYNFGQNSSFEKKNSKAQQDLDIYQNKWIYENEFEG
EDILKKRQNNNGNGSYSSSDDYYYKYEKKKSNLVATSSIHTSKSHNYEQKRNLKASITSK
RKNFLMIALTLFGLCSVSVVVALTLFQYFNILNQFSLAQTCFQFLPWPMSIRGSYVITMQ
QESIISLINHNTFQGIQDNNYLQTSIQTLNDATKSLVQLFYQYQSSDQTRMTFFNYLNEN
QLHLVTSIDDRLSKNPETYNPAEKDIRNVTVAYFIQAICGYFNQISHQIQNTLYYQKIQT
DNFIDFNNHLVKLQSQIQDDATSIINSIQQQVLILLILVIVLAIILIGAIFPIYYFVQIQ
NELILKLFATIQPEHLKAMMIPIQLAQSEEKSSKFKILPENFKKKKTISSTSVLPKFKPI
FVVYCLISFAILIIQPITNYILNHAFQQETFLNIDLLLNLYDLKANFISSVAVFFSVIGD
QMELGIQLYNINYYQTRMGQLINTNQQKLDQMYSTMSSSYAQSRYQQSYYDNFLYKIIQD
NMCQAYQNYPQFISQEDQIDQKVCNSIYNGSLQKGFEFSVKLFLSSFVDLHQIIEDKPNF
KKNMIQWESENKIQEFNKFFNILYNSINIMRDFMLQMMKDQLEMMKEIQTILLLFQLFAL
FFVFLVGWVKFYNYVTEEMYLVKNLISIISIEVVLENPYIMSYLNQ
NT seq
5721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtaaagcgttgattaaaatattccagatttgagatcaatttcttttttgaaccct
caagtaaattctattaatgtgatttatgctggaatagctttaaatttttcattatttata
tgcttgattatagatggaatactatttacttactaacaaaaactgaacaatttcttaaaa
agttttcatagaaaaatgcagctttatattagctttattgctcaaatatacaactatgtc
atatttattccgttagtgtatcatactttgcttcaatatgatttgtattatatctcatgc
atctcatttattagctgtattcttataagtactgcaatcagtttacataattaaagttat
ggcttctctaactagcatactctaggttttagaactccttttgtttggtaattttgcttg
cgcttcttggaagttataaattgcatttttttatcttttgtaaatgaattaacgggtctt
attattgtcaatttcatattagcaatatattagcttatttatctgtcatttggatgtttt
ttaaatagaataaaaactcttttttggatggtgttttttaactgtttgtatttgtttctt
gctattactttatttattggcgatgttaataaccaataaatatctatgatcctactagct
ctaatagttattcctatatcctattcgattacatagattatctctaaaaaggatttagat
tttgaagtacttaaataaaataaagataaatataatcctaagaaagattttttaattcgt
caactcctactactttcaaagctagattacgaagattataggactagctctttatctcag
tttcatgaaatcatttcattagatcacattatcaactgcacttaatatcctaaatgtttc
tgttttgatactataaatcaattagattagtataaatatgaagatttttaataatcagtt
ttatctggaagattaagattaaaatttctaaactagtttatatatgagctttttaagaat
ttttgtagtaataaaagactcttgaagaatagtggttatactattgatgcctatttaagc
tttattaattatttgatagatattaaaaaatctaaagtttaagttttctgtgagcttgtc
aaattgaattcgaaataaaacatttcgttaagagagagagcattgcttcaggaaacatac
aaaaaggcataaaaaaatttcgataatcaaacaatcgcttaaacttaaatccatgctaaa
aaagtagataaagaataataaatttagtaaaatgtagtctatgaaaaaacaaggggaagt
tcaaaaaagtcatttgtctcagttgagttgagagattatttatgtggaattaaatttgat
gaaggacttaattcgctctaataactttacgaaaaatgcttagcataaaaagaaaatatc
ctcaaaatgctcagcaatgatttcataaatttgaaagactttaaataaaaagctattgaa
tattacaataatagattattattataaaatactctaaaaaatctaagcagaattcattat
aatagttaaaagctttaattctttatggatagatatgtgtaaataatggctttcggataa
agaaaaaaagatatttttaaaaattacaaaaagaataaataaaatttcaatgagtttaac
tctgaatctagcaacattattttaaagatgtttaacaaagtagattaaaaaatttttgat
aaagataattgtgtaatatttattacattgattgatgatattggtacgattaaaagatcg
caaagtaaatttgaaccaatgtttggctattcccttaaagaagctctaggaaaaaatatt
tctattattttaccaaactaaatagctccctttcataatgctattctataagattttgtg
gatgagtaattatagtatgatgaaagctcaaataacctaagaaataaatatagcaatacg
aagtctttgttattagctaaaaattaagatggatgggcagttccaatttcaattgttttt
aaaactgataacataggtttagaagattgcggactaacaactcatattatcaaattaaaa
tctgattctgcatttataatgacgtcagtttaataattctaaatttaattaatttctgaa
attttgtttgacagattatttaatcgatttataaacaaccaatcagatttaagaagaatt
tatttaaataaaataatccctttgctgcattattttgaaaagaaatgggtaaaaatataa
gaaactactgactcagatatccataaggattttgtaaagacaatagcatttctcccaaaa
tatgatcaaaagattaattccttcaaaactaattcattatcaacaacaaatacttttgga
ttagcaaatacaaggaagaaaagatcttttatatttgaagctatggaatattcgcagctg
gataatgaaataaaaaattacagtgtagaaagtatggatgttttttctgtgtagattaaa
tttactcatacaaccaataagtacttttcttataatgtaattgagatagcttcctttaga
aagctgctagatacttaggaaataaaagagtgtctttagactttttcaggcatgatgaaa
tctcttcttgatatttcttatcctttataaagagaatatgctaagttagacatgttaaat
taaagctaaatttaattgcaaagctcatattcaagagagtaaagcgcgaatcacactctt
taaatgtaaagagttaaaaagccatattaatagttggaagaaatcttagatcgctcagaa
ttaaagcaagaagaagagatttaatcttagtaaaatattaagaatgtaaataataatgaa
taaggtaatgaaaataataatgaataaaatgatgataaaactcctaaagatcagagtatc
tacttagatcttaagaaactaaaattagaagtgagagatttatcaaattagcatatacaa
agtagtagtaggatggatttagactatcaacacaattaaagttttatcaattcaagttct
aatttttttgattaaagttaatttattgactagtaaaatagaacttccaaaaatcattaa
atactacaattataaaatatggacaataaaaactcttcctacacaaaaattccaaatatt
taagagacaaatataaatcatatagatgcaaattaatatgtttaaactttataaagctta
aataaaatagctgttaaagagtttgaaaaagcagaagagtttaatcatttctcagctaaa
gattcaacttattataacacagaattataaactaacgcataaaatatcaatactacagat
agaatttatgatacttaaggataagggtaggattaaggaaaattagaaaagctactgttt
gaacataaaagttcattttaagagatttcagttaacaaatagaaatctcaaaatcaaatt
taaaactctaaaaatatgacaacatctttgcaaatgaagatgagtgaaaaaaaaaattag
caagacaacttaatgatgcatgcaaagtaaattggagtaagtaagaactaataagataat
aatcaaaaattaaataaaagattttcagagtagacatttaaaaaaacaggtactatctat
agcaaaaatcaggaatataattttggtcaaaactcaagtttcgagaaaaagaattcaaaa
gcacaacaggatctagatatttactaaaacaagtggatttatgaaaatgaatttgaagga
gaagatatccttaaaaaacgctaaaacaataatggtaatggatcctattcttctagtgat
gactattactacaaatatgaaaaaaagaaatctaatttagttgctacaagctctattcat
acttcaaaaagccacaactatgaataaaaaaggaacttaaaagcttcaatcacttctaaa
aggaagaattttctcatgattgcattaactttgtttggattgtgttcagtctctgtagtg
gtagctctgactctattctaatattttaatatactaaattaattctctctggcttaaaca
tgtttttaatttttaccttggcctatgagcattcgtggtagctatgtaataactatgtaa
taggaatctataatatcgcttattaatcacaatacatttcaaggtatttaagataataat
tatttgcaaacttcaatttaaactctaaacgatgcaactaaaagtttagtttaattattc
tattaatatcaatcttccgattaaacaagaatgacatttttcaattatttaaatgaaaat
taattgcatttagttacaagcatagatgatagactatctaaaaatccagaaacatataac
cctgctgaaaaagatatcagaaatgttactgtagcatattttatttaggcaatttgtggt
tattttaattaaatctctcactaaatataaaatactttatattatcagaagatataaaca
gacaattttattgatttcaacaaccacttagttaaattgcaatcgtaaatataagatgat
gctacaagcataattaattccatatagtagtaagtgttaatattactcatactcgtcatt
gttttagcaataattctaataggcgctattttcccaatatattactttgttcaaatttag
aatgagttaattttaaaattatttgcaaccattcagcctgagcatcttaaagcaatgatg
attccaatttaacttgcacaatctgaagaaaaatcaagcaaattcaagatattacctgaa
aattttaaaaagaagaaaactatatctagtacaagcgtactacctaaattcaaaccaatt
tttgtagtctactgtttgatatcatttgctatcttaataatccagccaataacaaattat
attttaaatcatgcattttagcaagagaccttcctaaacatagatttattattgaatctt
tatgatcttaaagcaaattttataagtagtgttgcagtatttttttcagtaattggtgat
caaatggaattaggaatttaattgtataatattaattattactaaacaagaatgggatag
cttatcaatacaaattagtaaaagttagactaaatgtactctactatgagcagtagttat
gcatagtcgcgctactagtaatcttactatgataacttcttatacaaaatcatctaagat
aatatgtgctaagcatactaaaattatccttaatttatttcacaagaggattaaattgat
caaaaggtttgtaactcaatttataatggatcactccaaaagggatttgaatttagtgta
aagttgtttttatctagttttgtggatttacatcaaataattgaagataaaccaaacttt
aaaaaaaatatgatttaatgggaaagtgaaaataagatttaagaatttaataaatttttt
aacatactatataattctattaatataatgagagatttcatgctatagatgatgaaagat
tagctagaaatgatgaaagaaatataaacaatattgctcttattttagttatttgcacta
ttttttgttttccttgttggctgggtaaaattttacaactatgtgacagaagaaatgtac
ttagtaaaaaatttgataagcataatttcgattgaagttgttttggaaaacccatacatt
atgtcttatttaaatcaatga
DBGET
integrated database retrieval system