Tetrahymena thermophila: TTHERM_00849430
Help
Entry
TTHERM_00849430 CDS
T01020
Name
(RefSeq) PAS domain S-box protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7841726
NCBI-ProteinID:
XP_001019245
TGD:
TTHERM_00849430
UniProt:
Q23R41
LinkDB
All DBs
AA seq
1444 aa
AA seq
DB search
MNEILNQAVNSFDENVIVFDRNSDHTVNQLKTNQNTIIDQSAQKNSVELIDLFIGITFDE
RLNEIEQDYYHLINDKIDVVQLLCNDTIDITHFKIKANLFSQKRNKFLTQLQELSKINRL
NSKIQLMQEGYINYFSFGEKKKQLFKKVKAYQNNQSDSNQINKQETEIQSSNISVIKRKK
IKLEQGIFERKNCVIFVSLLGEPGIVKRVQHQFENIFGYSTKQIIGQNINLIIPNMIKKF
HNSILLDFINNPYLEKGNQIDYGSQINQENQNFDNQYQIYDLRQLLLAKDLNGWAIPVKI
AMKTDVIGFEDCGITSYIQQIKDDCSYILSNCGYFKCELMSQKLYERMFTQYITTSEISH
IYFNRVIPILHYLEKEWLKLSSSNTNPDSFIHPNQRDFFSTIAFLPKINTSLVKKRQYKF
TQKLEYDNLQDEIDKYSIEHYDIYQVKLRLFLNRNKYFQYNIIQVSQIRKLMHPFEMKEN
LINFANQMQLFLGIKYNTHRDIHNIQLLLDLQQFDATSQLQNSFFEIPQTIQEDNEQISD
RKKDYSYIFHSKSTQKTFENGEKQILDQTSEMKQKTVFNQDKFDETHHQLQMTGRNVQDI
DNNYSQQNLVHLSSRNDLNTIVNGLDATQNQILDQNQSSRYLFSKNILQEERELQQPIQG
QIGSLQQMLTQNHLLLQNEGEDDYKKNTKNIKVIDDMTTVQEKSESKQLNSIYQSSHNQK
NVGSFSKNFTTQNSFNSKNLELTQFYNSQKTQNSKRKGYKKLFSKGQTEIQNQLQNFKEY
GFSKPDFKMLKYQNKGDDYLNQAQSFTVSNEREKKLRKEQEEKSKALEASSIKSSQSYNH
DFKKQIRKKVLQRSQNFNLKILNIFGYISLFCISIITIYEYLNSIYSFQIVEQTFHYVSW
PMSFRSSYSISAAYIAMIYMTENKIFNSLNEASGYEKIVEGRLNQTTVRLKKVFLTYEDS
NFNEINFFKRVNEELTYFTLTKDIYVQTGNIYDYQPQYKINITMTLAYFLQNSIANIYRF
SLRKNNLVEQIIRIDNFPTLNANVTTVDQNIHDETNDVLNSMNSQALLLMLIVILVSFTL
IIMIFPLYYTIQKKNEQILKLFATMHQNSLDAVLQPLYISILMQNKRQSQNLTMKPHIQK
KKNISTTNSLPKYKISYIIFTMIAFICLIVQPIVNLILINNFQDQNLQNLALLSNLYDMR
AQLISNTAQNYNYLTHRLDTNYQLYNPNYYKNRIAQLITQNQGKLNNMYSVLNSQTNIVR
FQQSKFNSFFNQIFYGNVCEALQNNPDYVSQENNVNYNECINIGNGRFKQGFIIVLKNFL
STIEDLSYIYKIQDKNLFKEAAYKWENTVNIKIFDDTFVVLAKSMDSFKDFMLTMISEYV
DYVKMILTALLIFQFCMLILIFYFGWVKFYQLTSQDMHQVKSLFSIFPIDIVLDNPYIIS
FLNK
NT seq
4335 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgaaatattgaattaagctgtaaactcttttgacgagaatgttattgtatttgat
agaaatagtgatcacactgttaatcaattaaaaacaaactaaaatactattatagattaa
agtgcttaaaagaattcagtggaattaattgacttatttataggaataacatttgatgaa
aggttaaacgaaattgaataagattactatcatttaataaatgataaaatagatgtcgtg
caattactttgtaatgacaccatagatattacacactttaaaattaaagcaaatctattt
tcttaaaaaaggaataaatttcttacttaattgcaagagctaagtaaaataaatagactt
aattctaaaatttagttgatgcaagaaggttatatcaattatttttcattcggagagaag
aaaaagcaattatttaaaaaagtaaaagcctactagaacaattaaagtgatagcaactag
ataaataaataagagactgagatttaatcctccaacataagtgttatcaagagaaaaaaa
ataaaacttgagtagggaattttcgaaagaaaaaattgtgtcatttttgtgagtttactc
ggcgagcctggtatagtaaaaagagttcaacattaatttgaaaatatttttggatatagt
acaaagtaaattattggataaaacatcaacttgataataccaaatatgattaaaaaattt
cacaattctatattgctagattttattaacaatccctatttagaaaaaggaaattagata
gattacggaagctaaataaattaagaaaattaaaattttgataactaatactaaatatat
gatttacgttagttgcttctggccaaggatttgaacggatgggctattccagttaaaata
gcaatgaaaacagatgtaatagggtttgaagattgtggaataacaagctatatttaacaa
attaaagatgattgttcttacatactgagtaactgcggctattttaaatgcgagttaatg
agctaaaagctatatgaaagaatgtttacttagtatataaccacatctgagatcagtcat
atctattttaatagagtaattccaatactacattatttagagaaagaatggctaaaactt
agttctagcaacactaatccagactcatttattcatcctaatcaaagagactttttcagt
acaatagcgtttttacccaagataaatacaagtttagtaaagaaaagataatataaattt
actcaaaaacttgaatacgataatttataggatgagatagataaatacagcatcgagcac
tatgatatttactaagtaaagttaagattgtttcttaatagaaataaatacttttaatac
aatattattcaagtctctcaaattagaaaacttatgcatccctttgaaatgaaagaaaat
ttaattaattttgctaatcaaatgtaattatttttaggaatcaaatacaacacacacaga
gatattcataatatctaactgcttttagacttatagcaatttgatgctacatcttaatta
taaaatagtttttttgaaattccataaacaatttaagaagataatgaataaatatcagac
cgaaagaaagactattcatatatttttcattctaaatctacctaaaaaacatttgagaat
ggagaaaaataaatacttgattaaacaagtgaaatgaaataaaaaactgtatttaatcaa
gataaatttgatgaaactcatcattaattataaatgacaggaagaaacgtataagatatt
gacaataattacagttaataaaacctagttcacctttcttcaaggaatgacttaaatact
attgtaaatggtttagatgctacatagaactaaattttggatcaaaatcaaagctcaaga
tatttattttcaaaaaatattttataagaagagagagaattatagcagcctatttaaggt
taaattggtagtctttaataaatgctaacataaaatcatttgttattacaaaacgaagga
gaagatgattataagaaaaatacaaaaaatatcaaagtaatagatgacatgacaactgta
caagaaaaatctgaaagcaaacaattaaatagcatttatcaatcatcacataattaaaaa
aatgtaggaagtttttcaaaaaattttactacccaaaatagctttaactctaaaaactta
gaattgacatagttttataactcttaaaaaacctaaaatagcaagagaaaaggatataaa
aaattatttagcaagggttaaacagaaattcaaaaccaacttcagaatttcaaagagtac
ggtttttcgaaaccagatttcaagatgctcaaatattaaaacaaaggagatgattattta
aattaagcctagtcttttacagtttcaaatgaaagagagaaaaagttaagaaaggagtag
gaagaaaagtcaaaagctctagaagcaagctctattaaaagtagttaaagctacaatcac
gattttaagaagtagattagaaagaaagtattataaaggagccaaaattttaatcttaaa
attctaaacatatttgggtatatttctctcttttgtatttcaataatcacaatttatgaa
tacttaaattctatatactcattttaaattgtagaataaacatttcactatgtttcctgg
ccaatgagttttagaagcagctattctatttctgcagcttacattgctatgatatatatg
acagaaaataaaatttttaacagcctaaatgaagcttctggctatgagaaaatagttgaa
gggcgcttaaatcaaacaactgttagacttaaaaaggtgttcctgacttatgaagatagc
aatttcaatgaaataaatttttttaaaagagtaaacgaagaattaacttattttacatta
actaaagatatttatgtttagacaggtaatatttatgactatcaaccataatataaaatt
aatattacgatgactcttgcttacttcctacagaactctattgccaatatttatagattt
tcattaagaaaaaacaatttagtagaataaattatcagaatagataattttcctacttta
aatgcaaatgtgactacagtagaccaaaacattcacgatgaaaccaacgatgtattaaat
tctatgaattcttaagcccttttactaatgctcattgttattttagtttcgtttacattg
attataatgatatttcctctttattatacaatacaaaagaaaaatgaataaattcttaaa
ctttttgctacaatgcattagaactctttagatgcagtattacaaccactatatatatct
atattaatgtaaaataaaagatagagctaaaatttaaccatgaaacctcatattcaaaaa
aagaaaaatatttccacaacaaattcacttccaaaatacaagatctcgtacattattttt
actatgattgcttttatctgtttaatagtacaaccaatcgttaacttaattctaatcaat
aatttctaggattagaatcttcaaaatttggccctattaagtaatttgtatgatatgaga
gcataattaatcagcaatactgcttagaattacaattatttaacacatagattagataca
aattactaactgtacaaccctaattattataaaaatagaatagcttagcttataacataa
aatcaaggtaagttaaataatatgtacagtgttttgaactcataaactaatattgttaga
ttttaacaaagtaaatttaattcgttctttaactaaatattttatggaaatgtttgtgaa
gctttataaaataacccagattatgtatctcaagaaaataatgtaaattacaatgaatgc
attaatattggaaacggaagatttaaataaggatttataatagtgctaaaaaatttctta
agcacaattgaagatttaagttacatttacaaaatacaagataaaaatttatttaaagag
gctgcatataagtgggagaatacagtaaatataaagatatttgatgatacctttgtagta
cttgcaaaatcaatggatagttttaaagatttcatgcttactatgatttccgaatatgtt
gattatgtgaaaatgattttaactgcacttttaattttctaattttgcatgctcattttg
atattctattttgggtgggttaaattctattaactgacatcataggatatgcatcaagta
aaatctctttttagtatctttccaatagatattgttttagataatccttacatcatatct
ttcctaaataaatga
DBGET
integrated database retrieval system