Tetrahymena thermophila: TTHERM_00850520
Help
Entry
TTHERM_00850520 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7841735
NCBI-ProteinID:
XP_001019255
TGD:
TTHERM_00850520
UniProt:
Q23R31
LinkDB
All DBs
AA seq
3474 aa
AA seq
DB search
MVKFLVLFCIIRFTLSQICSNFCLQCNNRQLLCEQCQEGFVVNNQNGKCQSNCKYGQYYY
LETNQCVSICPDKYYNDDDSFTCRQLQNCPFLSEQGLQFFDEFRLSVTLQDLVVTAGVSY
LYDDFTLKIFNATNGKYLGYLDGHDSEVLMLNVIESTQQLLSISENQMIWWNLYYGQMDY
VIEFGQLDENQQISPNQIQSNKNSTYMYSLDKGIQIYYDEQIIILMLNPKQFGILYHQNM
RNDLTSTKNIQQFQQYFQLFETCHISAIKGFFKIQDDIICSYSSQQIITWDIKQNKTISG
SKGVCNFDKQIIQRVIKLNEQQNILQFTNDPYLQIYDVDLNLCIQVEYDPPPLNDKDNKF
IIEDILVFDQIQKLIIVRTKKSIFFYKLQEYIDTLNDNKIYYTFIQIGEQNSNNVFIQII
PNFNYVLVLQSSGLLNYFLVTQTDDSIGLDLIGIIDFQFNQQMYITDIHFQKESLTTILI
GKGIICAKFNSADNDKFFDYEIISSLKNISPQLNGHRSQINGIVIDRVFKNRIITYSSDG
SFKIWQMLEDISHIDGFTPVNSQGGYLEKASLLFDQYHPECNIIESSKCPWGVINLEQIE
QNLILTQYSDNFIIIWEYYEDTISFKFRYSLGDESIKLNNYQYNKDLKYLLICSEQQLVI
FDTQNDGEVIFKEANVYHRGYFFKGDISYDNNYTLVYLINLGANFQFMAYYYDINTKQFT
LQKQNIFRNKYIYSEIFSDNVIICVTANYLYYQLKINPDHIRVSMRFSIAYFTRDPESSK
TFLLIRNGMVGIGDAPKFKYFSITSSSFTLKCTAIAKNPLILFYFQNNVYYQGYNHVLGI
NEKFEVVFYMVLDYTISSINVDSNNSKLFIGFQNGKIYHGSYVKQQINTRDTIANLNMPF
YSTSLRQLFYRGTTSVLKKDLFTNQLVEFNYSGNQTVHKQKLEGYLVDEINNFLITFSKE
TSTCLYRWSLQNPQQNQKISDSDTKGISKIFLDLKGDILIGYSENWQDPNNYQFDFIVWQ
YSTLKKLYINQSHKLFFEDLKKDELPENISQMEYIVRQIIYMPNNQTIVSLNSYFNVFVY
YYTIDQSDQITINNVVKLFYDDQSNYLYAKIVDNLSQAIQIYDLQFKLKSTKVEHIFEIR
DIIFSGDKAIIYDIQTILILDRQNLQQIQKFSTVNPKVTSLIISSKLNLAIVWNNFMTDN
VLSDKIGIFELTTGKSIYELQPQSITDYGNTNLVYLEESTCQLYYTRTTGNIYSFNVCEL
YNSGVYSANMQNILNIIYIPEFNYLSTINSNQACLTRVESSISSKQRFSSLYSQKNNNYF
MNKASDKIYYIDFDSSVWQLNNKNYNFGYISQLDKIQFSKQYNNYFYVITKNHLYQYDLD
FTLIRSIEIHLKNIYFSGDYIFFQNQNFVLCKLNIKDFSLDSTFQISLSYYIYDFFVLES
FNEFIFYDGSQKIYRYNYVTNQKVYEEPVLQPFQKGYFFRQLNMIIHIQKNSDIIFYYNL
TANMKSQDSANIYQFKNSDFQSVATQKLFFDKDNLNLIISYADNTIRVFKLSLVDNLIQS
LNLIKTIPQPSVTNILRIKIKNQNIQMFLPWQVIEYDRQTFIQKNNFNSSQVFQNLQDYS
ISKDYPNYGIILQQDSIRMINVQQQKIISKFDLSYPQLTSYQIQEQIYQFDIELKGISNG
VFFKYNFLIPKQVSIINQNTSYKECYFSLSIYYQKEIDMYNSKVQFDGKKQNGDLKQLNI
KSDTFYEEPLKEVQIQNYILDITDSGFMTFNKATKKVTFKDLKFTGNCKNSTLNFQNMDY
VILENIIFDSIDLDNNSTLLKLTNLQFVLLKNITFTNITLHHTAKLILLKNIFRFFIANL
TINGMNLYNPESTSIIQISNIKNGFIKDSFLSDLKLVEPNNKKGIYFLIDLQGNSMLSIQ
TLTYQNSSYISLINSQNSYEQDQKIYFRVLDQVSLSELDVFNIKNLRQSLIYATGHQVTL
QKCNFQNIDCFECEGGIANFHQINILSIFNSIFDSAKAKNGGAIAILESRFNQSSIQDCN
FYNNSAQSSGGAIYLKMSDLEFIGNIVENNTALIGGGIRYIGIQPKFVEKIQKDKENKKL
NQFISNRASLHSQDYGSYLYSATVQSNLDLIEIPKKKYLGEENLEINQINQQDLVIKEYE
IHDFQSGGTIDLSFQIVDVENKPINFDLDNVYEKKYLAEVIDEIQKVQVKATVENNDIKI
YGQYITNYQQYDMQNLQFSIKEMQIISMPSTSNSIFLEVPAIKRVINSNQIFQNGPFYIK
IVIYFRKCVQGEIYTPSSNMYFCGECKVGTYSLEEPIKEKSDLQICNRCPAEADHCFRNK
IKLKNGYWRISNQTDSIIKCSNNPLNCVGDEEKGYCKIGHYGPLCEECDVNGIVWGKKYV
TDGRYNCVDCTELQNDFKYFLPSIIVGILMVFYMVISIRIAIDISTRIIVGYYLRKMNII
SISKSAFMDTTNMNMKAMMNYMQIALLVNTFDVELPEFFKILPEYVGQPISNFLYTLDCF
LNEIANEDFPVVYIRTIWSLAMPILYIFGMGIIYFFLILCRFTKHSKQHIISGLVFLIFF
FQPSMISNLLRVMSCRKIDNKRYILADVTQSCYSQTHILYIFYICIPGIIMWGLLIPLFI
LRKLYQNKSNLDNALVRIPYGFLYQDYKQDKYYWEFLKSYMKILFVVIHNFYGDPYNNQL
VLTMIIMLIYQVALIIMKPYQMRYFQNIEQRSMGVLIVIVTMNIFLYNRPSIVQQQIFYV
TVLAIHNFYQLFLIWCVVKAKYKIIYNQNKEKIQLLLKKYFPWFLRLIQMKETNSMKVFK
NWKRIRNEIIIAKKKKQKLIQQKNVKIYFDDELEQEREKVKKIPITISQLSMRAELSSHK
NLQHDNCSCDNLDIISQRSFIMRDHISIISPQNYNKDQQNSFLIKSPTSQNEPLFSPKYQ
SSRKNSLFIDSSAKSSFRSQYDDNKTNNRQFDRLFEALMLQKKIQSQNETIQGDDEEEED
FNQVRDPSTYSNQRQYLIYNNLSKVPTILIQAQASENQLKSLKIQNFNQINEEESLVLND
SPLLLPQKNINSFQPKYSNFSQNQNIFENQNNLFNQERMKSSLKNMNINKQQNQKLRLKN
DNSEQYESVCENEPYSPFNLNNFLQFKQLSSLMDKNQKYFGKEDQNSQALSSSDKKSQQN
LSILKKNQIEQVINNTEKQNLERYYQDQDDQLDNKKQIIQLKNQSQHMNSFSQFDQDQSQ
SMEQHQKNINSIQPKQFNFNKLQTQVLSQSLHVEKNQEIIMNQQNICKLQDQLELAEQNE
QEEQDFKKAQTQVDQNFEDQAIKDLNQIRQNDVVENSNSQNNNQNTETDKNEEQKSNKQA
QLDILFGDIEAQPKSFLNKLKVTSEYYNKVDLVNHDWINSSNSIKTFKNDDRFDVYTLKN
NLASNVIAKNIQTDPDSAIQQQDYFSSRIQEISSNFDGNGVLINILSIGLKRCN
NT seq
10425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaaatttttggttttattttgtataattagatttactctttctcaaatatgtagt
aacttttgtttataatgcaataatcgacaactattatgtgagtaatgtcaagaaggtttt
gttgttaataattaaaatgggaagtgccaatctaattgcaaatatggccaatattactat
ttagaaacaaactaatgcgtttctatttgccctgataaatattataatgatgatgattca
ttcacctgtaggtaattataaaattgtccttttttatctgagcagggattacaatttttt
gatgagtttaggctatctgttacactctaagatcttgttgtgacagctggtgtaagttat
ctttatgatgattttaccttaaaaatttttaatgcaactaatggaaaatatcttggatac
ttggatggacatgattctgaagttttaatgctgaatgtaattgaatccacatagcaactt
ttaagtataagtgaaaattagatgatttggtggaatctttactatggataaatggattat
gtgattgaatttggttaattagatgaaaaccaacaaatttccccaaatcaaatacaaagt
aataaaaatagtacatatatgtatagtttagataaagggatttaaatttattatgatgaa
caaattattattttaatgctaaatccaaaataatttggaattctttatcattaaaatatg
agaaatgacttaacttcaactaaaaatatttaataattttagtaatatttttaattattt
gaaacttgtcatatatcagcaataaagggtttttttaaaatctaagatgacattatctgt
agttattctagttaatagattataacttgggatattaagtaaaataaaacgattagtgga
tctaagggtgtttgcaacttcgataagtaaataatacaaagagttattaaattaaacgaa
caataaaacatactataattcaccaatgacccttatttacaaatttatgatgttgacttg
aatctttgcatctaagtagaatatgatccacctcctctcaatgataaagacaacaaattt
attatagaagatattttagtttttgactaaatttaaaaattaataattgttagaactaaa
aaatcaatattcttctataaattgtaggaatacatagacacccttaatgacaataaaata
tattatacatttatctaaataggtgagtaaaactctaataatgtgtttatataaataatt
ccaaactttaattatgttttagttttgcaatcttctgggcttttaaattattttctagtt
actcaaactgatgatagcataggattagatcttataggaattatcgatttttaatttaat
taataaatgtatattacagatattcactttcaaaaagaaagcttaaccactattttgatt
ggtaagggaattatatgtgctaagtttaactctgctgataatgataaattttttgattat
gaaattatttcttctttaaaaaacatttctccataacttaatggtcacagaagctagata
aatggaattgttatagatagggtctttaaaaatagaataattacttacagttctgatggg
tcttttaaaatttggtaaatgcttgaagatatatctcatatagatggctttacacctgta
aattcttaaggggggtatttagaaaaagccagtttgttatttgattaatatcatcctgaa
tgtaatattattgaaagtagtaagtgtccttggggagttataaatttagaataaatagaa
taaaatttaattttaacttaatactcagataattttataatcatatgggaatattatgaa
gacacgatatcatttaaatttaggtatagcttaggtgatgaatctataaaattaaataat
tattaatataataaggatttaaaatatttgcttatttgtagtgagtaatagctagtaata
tttgatacctaaaacgatggtgaagttatttttaaagaggcaaatgtttaccatcgaggg
tacttctttaaaggtgatataagttatgataataactatactttagtgtatcttatcaat
ttaggtgctaatttttagtttatggcatattattatgacataaatacaaaataattcact
ctataaaaacagaatatttttagaaataagtacatttattctgaaatattttcagataac
gtcataatttgtgttacagcaaactatttgtattactaattaaaaataaatcctgatcac
atcagagttagtatgagattttctattgcttattttacccgtgatcctgaatcatcaaaa
acttttcttttaattagaaatggtatggtaggcataggtgatgctcctaaatttaagtat
tttagtattactagttctagcttcacactaaaatgcacagcaatagccaaaaatcctcta
atactattttacttttaaaataatgtctattatcaaggatacaatcatgtattgggtatt
aacgaaaaatttgaagtagttttttatatggttttagattacacaatttcttcaattaat
gttgactctaataattctaaactatttattggattttaaaatggtaaaatttatcatggc
agctatgttaaatagcaaataaataccagagacactatagctaatttaaacatgccattc
tattccacctctttgagataactcttttatagaggcacaacatcagtactcaagaaagac
ttatttacaaactaactagttgaatttaattatagcggaaattaaacagttcataagcag
aaattagagggatatctagttgatgaaataaataatttcttaattactttttcaaaagaa
actagtacttgcctctatagatggtctctttagaatccttaataaaattaaaaaattagt
gattcagatactaaaggtatttctaaaatatttttagatttaaaaggtgatattctgata
ggttacagtgaaaattggcaagatccaaataactattagtttgattttattgtttggtaa
tatagcactctaaagaagctctatattaattaaagtcataagctattttttgaagattta
aaaaaggatgagcttccagaaaacataagttaaatggagtatatagtcagacaaataatt
tacatgcctaacaatcaaacaatagttagtcttaatagttacttcaatgtctttgtttat
tattacaccatagactaatctgattagattacaattaataatgttgttaaacttttttat
gatgactaaagtaattacctttatgcaaaaattgttgataatctatctcaagccatataa
atttatgacctttaatttaagttgaaatcaactaaagttgaacacattttcgaaatcaga
gatattattttttcaggtgataaagctattatctatgatatttaaactattctaatctta
gacagataaaatttataacaaatttaaaaattttctacagttaatcctaaggtgacaagc
ttgataatatcctctaaattaaatttagctattgtatggaataattttatgacagataat
gttttatctgataaaattggtatttttgaattaacaacaggtaaatctatttatgagttg
taaccttaatcaattactgactatggtaatactaatttggtatatttagaggaatcaact
tgctagctttattatacaagaactactggaaatatatattcttttaatgtatgcgaatta
tacaattcaggagtttattcagcaaatatgtaaaatattcttaacataatctatatacca
gaatttaactatctttcaacaataaattcaaatcaggcttgcttaactagggtagagtca
tctataagctctaaatagagattttcttctctttattcttagaagaataataattatttt
atgaataaagcaagtgataaaatttattacatagattttgatagctcagtatggcagttg
aataacaaaaattataactttggatacatttcatagctagataaaatttaatttagcaaa
taatacaacaattatttttatgttatcaccaaaaaccacctttattaatacgatttggat
ttcacattaattagaagtattgaaatacatctaaaaaatatttatttttctggagattac
attttcttttaaaattaaaactttgtactttgcaagttaaatattaaggatttttctctc
gattccactttttaaatttcattaagttattatatttatgactttttcgttttagaatct
ttcaatgaatttattttttatgatggatcataaaagatatatagatataattatgtcaca
aaccaaaaggtttatgaagagcctgtattatagccattttaaaaaggatatttcttcaga
taactcaatatgattattcacatctaaaagaactcagatattattttttattataattta
acagctaatatgaaatcttaagattcagcaaatatatattaatttaaaaattctgatttt
caatcagttgccacttaaaaattattttttgacaaagataatttaaacctaattataagt
tatgcagataatacaattagagtcttcaaattatccttagtagataatttaatttaatca
ctaaacttaattaaaacaatcccataaccttctgtcacaaatattttaagaataaagata
aaaaattaaaatatatagatgtttttaccatggtaagtcatagaatatgacagacaaact
tttatctaaaaaaataatttcaatagcagttaagtattttaaaatttgtaagactactct
atcagtaaagattatcctaactatggtattattttgtagtaagactctataaggatgatc
aatgtttaacagcaaaaaattatttctaaatttgatttaagctatccatagttaacaagc
tattaaatttaagaacagatctattaatttgatattgaattaaaaggaataagcaatggt
gtattttttaaatacaattttttaattcctaaataagtttcaataataaatcaaaatact
tcttataaagaatgctatttctcgcttagtatttattatcaaaaagaaattgatatgtat
aactcaaaagtacagtttgatggaaaaaaataaaatggtgatcttaagcaattaaatatc
aaatcagacacattttatgaagaacccttgaaagaagtttaaatttaaaactatatttta
gatataactgatagtggatttatgacctttaataaagcaacaaaaaaggtaacttttaaa
gatttgaaatttacaggtaattgcaaaaatagtacgcttaacttttaaaatatggattat
gtcattctagagaatattatttttgattcgatagatctggataataattctactttattg
aagttgactaacttacagtttgttcttttaaaaaacatcacatttacaaatataacttta
catcatacagcaaaattaattttactcaaaaacatattcagattttttatagcaaattta
acaatcaatggcatgaatttatataaccctgaaagtactagcataatataaatatctaac
ataaaaaatggttttataaaggatagttttctatcagatttaaaattagttgaaccaaac
aataaaaaaggcatttattttttgatagatctttaaggaaattcaatgctaagtattcaa
acactaacttattaaaattcaagctatatcagtttaattaatagctagaatagctatgaa
taagatcagaaaatatatttcagagtccttgatcaagtaagcttaagtgaactagatgtt
ttcaacatcaaaaatttaagataatctttgatttatgctacaggtcattaagtgacactt
caaaaatgtaatttttaaaatattgattgctttgaatgtgaaggagggattgcaaatttt
cattaaattaatattctctctatctttaattcaatatttgattctgcaaaagctaaaaac
ggaggagcaatagctattcttgaaagtaggtttaactaatcaagcatttaagattgcaat
ttttataataattctgcttaaagtagtggtggagccatttatttaaaaatgagcgatttg
gaatttatcggaaatatagtggaaaataacacagccctaataggtggaggaatcagatat
ataggaatataacctaaatttgttgaaaaaatataaaaagataaagaaaataaaaaatta
aattaatttatttctaatcgagcttcacttcatagctaagattatggttcttatttatac
tcagcaactgtgtaatctaatttagatttgattgaaatacctaaaaaaaagtatttagga
gaagaaaatttagagattaactaaataaattaataagatttagttatcaaggaatatgaa
atccatgatttttaaagtggaggaacaatagatttatcctttcaaatagttgacgtagaa
aacaagcctataaattttgatttagataatgtatatgaaaaaaaataccttgcagaagtg
atagatgagatttagaaagtttaagtaaaagcaacagtagagaataatgatattaaaatt
tatggttaatacatcactaattattaatagtatgatatgtaaaatctttagttttcaatc
aaagaaatgtaaatcatttctatgccatcaacttcaaattctatattcttggaagttcct
gctattaaaagagttatcaattccaatcaaatattttaaaatggtccattctacatcaag
attgttatatacttcagaaaatgtgtgcaaggagagatttacactcctagcagcaatatg
tatttttgtggtgaatgcaaggttggtacttattcgcttgaagaacctattaaagaaaaa
tctgatttgcaaatttgcaatagatgtccagctgaggctgaccattgctttagaaataaa
ataaaacttaaaaatggatattggaggatttcaaactagactgactcaattataaaatgc
tcaaataacccattaaattgtgttggagatgaggagaaaggatattgtaaaattggacat
tatggacctttatgcgaagagtgtgatgtaaatggtattgtttgggggaaaaaatatgta
acagatggaagatacaactgtgtagattgtacagaattataaaatgattttaaatatttt
ttaccttctataatagtcggtatactgatggttttttatatggttataagtataaggata
gcaatagatataagtactcgtattattgttggatattacttaagaaagatgaatataatt
agtatctcaaagtctgcttttatggatacaacaaatatgaatatgaaggctatgatgaac
tatatgtaaatagcgttgctcgtaaatacttttgatgtggaattgcctgaattttttaaa
atccttccagagtatgtaggttaaccaataagtaattttttgtatactttggactgcttt
ttaaacgaaatagcaaatgaggattttcctgtggtttacattagaacaatttggagtttg
gcaatgcctattttatacatttttggtatgggaatcatatattttttcttaatcttatgt
agatttacaaaacacagtaagcaacatataataagtggtttggttttcttgatattcttc
ttctaaccgagcatgatttctaatttgttaagggtaatgtcttgcagaaaaatagataat
aagagatatatcctagcagacgttacttagagctgctattcttaaactcatattttatac
attttttacatttgtatacctggaataattatgtggggtttattgatacctttgtttata
ttgagaaaattatattaaaataaaagtaacctagataatgcactagtaagaataccttat
ggattcttgtactaagattacaaataagataaatattattgggaatttttgaagagttat
atgaaaattctatttgttgttattcataatttttatggtgatccatacaataactaatta
gtccttactatgataattatgctcatatatcaagttgcattaataattatgaagccttac
taaatgagatacttttagaatatagagtaaaggtctatgggagttttaatagttattgtc
actatgaatatattcttatataataggcctagtattgtttagcagtaaatattttatgta
acagtcttagcgatacataatttttatcagttattcttaatatggtgtgtagtaaaagcg
aaatacaaaattatttataactaaaacaaagaaaaaatataattattgctaaaaaaatac
tttccttggtttttgaggctgatataaatgaaagaaactaattctatgaaagtatttaag
aactggaaaaggataagaaatgaaattataattgcaaaaaaaaagaaataaaagttaatt
taatagaaaaatgttaaaatatatttcgatgatgagcttgaataagagagagaaaaagtt
aaaaaaataccaataacaatctcataattatctatgagagcagagttatcatcccataaa
aatttgcaacatgataactgtagctgtgacaatttagatataatctcttaaagatctttt
attatgagagatcatatcagcattatatcgccttaaaactataacaaagactagcaaaac
tcttttttaataaaatcaccaacttcttagaacgaaccattgttctctccaaaatattaa
tcgagtagaaaaaattcacttttcattgattcaagtgctaaaagcagttttagaagttaa
tatgatgataataaaacaaataacagatagtttgacagattgtttgaggcccttatgctt
caaaaaaaaatttagtcataaaatgaaacaatttaaggagatgatgaagaggaggaggat
tttaattaggtaagagatccaagtacttattcaaactaaagataatatttaatttataat
aatctctcaaaagttccaacaattttaatttaagcacaggcttcagaaaattagcttaaa
agccttaaaatatagaattttaattaaatcaatgaggaagaatctttggtattaaatgat
tcacctttgctcttaccttaaaaaaatataaattccttccaaccaaaatactctaatttt
tcataaaaccaaaatatatttgagaatcaaaataatttatttaactaagaaagaatgaaa
tcaagcttaaaaaatatgaacataaacaaataatagaattaaaaattgagattaaagaat
gataactcagaataatatgaatcagtatgtgaaaacgaaccttattctccgtttaattta
aataattttttacaatttaagtaattaagtagtttgatggataaaaattaaaaatacttt
ggtaaagaagattaaaatagttaagctctcagctcttcagataaaaaaagctaataaaat
ttaagtattttaaaaaaaaactaaatcgagcaagtgatcaacaatactgaaaaataaaat
ttagaaagatattattaagactaagatgatcaattagataacaagaaataaattatttaa
ctgaaaaattaaagttagcatatgaactcatttagttaatttgaccaagaccaaagttag
tctatggaataacattagaagaatataaatagcatttaaccaaaataatttaattttaat
aaattataaacctaagtactaagttagtctttgcatgtagaaaagaattaagaaattatt
atgaactaataaaatatttgcaaattataagattagttagaattagcagaataaaatgaa
caagaagaataagattttaaaaaagcttaaacttaagtagattagaattttgaagattaa
gctattaaagatttaaattagatacgtcaaaacgatgttgttgaaaattctaatagttaa
aataataattaaaatacagaaacagataaaaatgaggaataaaaaagcaacaaataagct
tagcttgatattttatttggagatattgaagcacagcctaagtcgttccttaacaaatta
aaagttactagtgaatattataataaggtggatttagtcaatcatgattggattaattct
agtaattcaataaagacatttaaaaatgatgataggtttgatgtgtacactctcaaaaat
aatctagcctctaatgtgattgctaagaatatataaacagatcctgactcagcaatttaa
taataagattattttagctctaggatataagaaataagctcaaattttgatggaaatgga
gtattaataaacattttgtcaataggattaaaaagatgtaactga
DBGET
integrated database retrieval system