Tetrahymena thermophila: TTHERM_00865230
Help
Entry
TTHERM_00865230 CDS
T01020
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ECSCR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7839838
NCBI-ProteinID:
XP_001026763
TGD:
TTHERM_00865230
UniProt:
Q24FE0
LinkDB
All DBs
AA seq
791 aa
AA seq
DB search
MSIYSGFSTRKQEYEYNICVDQILSLLSTRTIKHICGEKVDEDKFRKIFKKLFKILQKME
VHKYLNPKFSETLSSLGRVLKIKILDPLKISAKDSKTDLREFGVKSTQQQQNNLVVINNQ
QQGGNNVNNIHLINTTTRCSSVNKDMPSNSFHQRPMSMEMRSRATYSKRYIPQSQQGILP
IKENIKYSNQHQILINNVINVNKQEEDPQQSNLNKLYQPPSTANNQKSSQFNIVSEEKTQ
VNTSNGELFKENNNKEEDLFTLSQVTNKKYIGQADELGENKENVASSVQKQVQNSKKLNQ
NSKIDEKQRCKTPPSQHTQQNHLLNLQNHSKNEGLKQISQYESQNNSELQDSDGINKKIK
KGRYLKQNNDSLQLRRESQTQAIPKNLEIGVNNYNTPNTVITTGGEYTQKNQIPQQTRKR
SSKSIRAQPRLPLSINQNVQVKNQKESDSSKSLQQYESPTKQDLNYNSFYVETSSIKNLK
KNLISHQNKQLNNSGKKYAHNQIHILQEISINNSSTQPNSNAKNFQFNDMYSKQMSSKNK
QNLSPNSFAQNVRQQNFKNGESNDSSQNSTIQQIIYNPTDKQQQQQQSNIYSSQQSSKEQ
TINNDSSFKEFLFNSQKQEQSETQFRNRMLVQNLNILKEDIEKQQIQTRSQSLLLQQQNY
LLENSAAGLSKLTPQNNTLKNRDAQDNTEPKIIQPTHLYNPFYKQQNAQQSPRFENDTFG
LTDNQLSLTPIKQLVKRKKSKKKSGRNQNEKKSSQSFIISTPKITPAIHSKYNYNISPKN
LNQVANNEIKL
NT seq
2376 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctatatatagcggattcagtacgaggaagcaagaatatgaatataatatttgtgtt
gattaaattttatcgcttctctcaactcgtactataaagcatatttgtggagaaaaagtc
gatgaggacaagtttaggaaaatctttaaaaagctttttaaaatactacaaaaaatggag
gttcataaatatttaaatcctaaattttcggaaactttgtcatctttgggaagagtattg
aagattaaaatattagatccattaaagatatcagcaaaagattcaaagactgacttacga
gagtttggagttaaatctacttaatagcaacaaaataatttagtggttataaataactaa
tagtaagggggcaataatgtaaataatattcatcttataaacactacaacaagatgcagt
agtgttaacaaagatatgccaagtaatagtttccatcaaagaccaatgagcatggaaatg
aggagcagagcaacatatagtaagagatacattccttaaagctaatagggaattttacca
attaaagagaatataaaatactcaaattagcactaaatattaattaacaatgtaataaat
gttaataaataagaagaagatcctcaatagagtaatttaaataaactttatcaacctcct
tcgacagccaacaattaaaaatcttcacaattcaatattgtttcagaagaaaaaacttaa
gtaaatacttcgaatggtgagctctttaaagaaaataataataaagaagaagatttattt
accctttcataagttacgaataagaaatacattggataggcagatgaattaggggagaat
aaagaaaatgtagcatcttctgtttaaaaataagtgtagaatagtaaaaaattaaattaa
aatagcaaaatagatgaaaaataaaggtgtaaaactccaccttctcagcatacttaataa
aatcatttacttaacttacaaaatcattcaaaaaatgaaggcttaaagtaaatttcttaa
tatgaaagttaaaataatagtgaactttaagattcagatggtataaataaaaagataaag
aagggtaggtatttaaaataaaataacgatagtttataattaagaagagagagttaaaca
taggctatccctaaaaatttagaaattggagttaataattacaatacgccaaatacggta
ataactactggaggagaatatacccaaaaaaattaaattccttaacaaactagaaaaaga
agttcaaaatcaataagagcttaaccgaggctacctctatctataaactaaaatgtccaa
gttaaaaattaaaaagaatctgattcgtctaaaagcttatagtaatacgagtctcctaca
aaataagatctcaactataattcgttttatgtagaaacttcgagtattaaaaatttaaag
aaaaacttaatttcacattaaaataaacagcttaacaattctggtaaaaaatatgctcat
aattaaattcatatcctttaggaaatatcaattaacaattcatcaactcagccgaattct
aatgctaaaaatttctagtttaatgacatgtattcgaagcaaatgtcttctaaaaataaa
taaaatctcagtccaaattcatttgcataaaacgtacgtcaataaaattttaaaaatgga
gaatccaacgattcatcttaaaactcaactattcaataaataatctataatccaacagat
aaataataacaataacagcaaagcaatatttattcctcacaataatcatctaaagaacaa
actattaataacgactcttcatttaaagagtttctttttaatagttaaaagtaagaataa
tccgagacttaattcagaaatcgtatgttggtttagaatttgaacattcttaaagaagac
atagaaaaatagtaaattcaaaccagatcttaatcacttttgttataatagcaaaattat
ttattagaaaactctgctgcaggtttaagtaagttaaccccatagaataataccttaaaa
aatagagatgcataagataacactgaacctaaaataatataaccaactcatttatataac
ccattttataaataacaaaatgcacaatagtctcctagatttgaaaatgacactttcggg
ttaacagataattaactatctttaaccccaataaaatagctagttaagagaaagaaatca
aagaaaaaaagtggaagaaattaaaatgagaaaaagagttcttaatcttttataatctca
acacctaaaataactcccgctattcatagtaaatataattacaacatatctcctaaaaat
ttaaattaagtcgctaacaatgaaatcaaattgtga
DBGET
integrated database retrieval system