Tetrahymena thermophila: TTHERM_00886950
Help
Entry
TTHERM_00886950 CDS
T01020
Name
(RefSeq) cation channel family protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ion_trans
Ion_trans_2
cNMP_binding
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7827036
NCBI-ProteinID:
XP_001013625
TGD:
TTHERM_00886950
UniProt:
Q239Y3
LinkDB
All DBs
AA seq
1425 aa
AA seq
DB search
MQNYADFEFPSKQKEQILDNKMDDISKLDESYNKYMTRSFSSYSMNGQGADNRRGMFQNF
QLEKFQKDQSDISANFDQERFEDINDDTNTFKNKKPSVFQRNLQNLDIKATSSKKFVDSL
ILPANSQRASEEEIYMKKNMNFPFKYASFDQKQGQIYDINQSTIEKEKEGSQKYSPTNGL
NNNNNNNNNNSSSSNYLDTPPMIKSSAKARRSTQIALKMKVFQGILTKSNQFDQQYVQSP
LNQAQNRKIKKVLQSQIVGNSPSFHNCNVFSYNQEALQQQGVEEKTFNQEDESHVDQNKK
QHLIILTYMKRFINQLLKRLSYNKIELLSEQQFQMIGDQSFPPQCYKNIQNVFNDKNSYQ
MSLLSKRRYHFEQINYQKKQGLKQFLDSFYIHRIGNSQIFSFLQKIPVTDPSSQFIIIWE
ALLLIIILFYLIFTPLKTSFEFSIDENSYLSLFAYKIPPFIFLLDIFMGFQTGYYELGRI
VQKRKLIALRYCKNKFTTDFLGTLMMFLNGFVENSNFLEILILIFRITQMKNKLSMINDF
FRIQNKYPAGYEMLKIAAFILFMSHMWGCLFHLVGQTEDGNSYQNTTGGGKQYQDKNWLQ
DQGLQDADWYTKYIFSVYFSIITMVTVGFGDIHPVNIYEKMFVIGMTIISCGIFAYCVNS
ISSIFSQLSQKNIIFKQKQYDLLNYMNQKNIKMETQTKIMKYLEYLEQESDQCIPKGEAV
LSQFPLELKEQIMKEYFVKILQDVPIINENFSLAFLSAISLKMKEKILGPGEKLLVKDTR
QQTLYFITKGSIEYSIDDGDHQKALCQIQSVKSVIDFRQFITGLKPQVSIQSTTMTNVAY
ISYNDFIEEIKKFYKDYEKFCYLRDQFLNDGRFEKLCPSCNHFGHEINNCPQIHFSVNRP
IFSQKVFYSIPQNRQQNPRQRFIDKRISWRNIYHEARNDLKYLRWAYVIEYHNLYNQVNI
DEQIKIIESDKTFFKRCPKIKPDIIQYMKNSATTQNGLDVIIEENEGSDNTQSNSEESDF
QTDYSETQVNQKNMKTLQDEDVQDSQYADQGGGLAMQVQNISIHSEKYNGDNPSLSNIIP
DGDINKMVNDSINQGSVKNKSEASIKRQESLKSNKRKHTLTGVVQQQISRTQNRKLTNEL
QDFEKMRSQTRHLTNRSIAQMINSSQAIINEKSSMQQSYISYQQEYQNSSSMSNSLPGKI
IPNINQSQKVNNNQQESLRQLDQLVEKFKRQCMKMMTNNLKVDYLTHVSQQNSKDENQSK
ILTLSRQSKATNRVNTYNSISNTQQCKSIQTIKSLQENLKKTKIDAKDVQTIHNKNLQRY
GTSHNSLLHIFGPLQFKFDKIKEYQIYYPKGNASNIIKVYKKIQSQNKTQTKLPILRHRY
SGQSDQFIQHNHQEKFNQFSKKAASKASKMSYISQVDGYKNMFNF
NT seq
4278 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaattatgctgactttgaatttccatcaaagtaaaaagaataaatattagacaat
aaaatggatgatatcagtaaattagatgaaagctataataaatacatgactagatcattt
tctagttatagcatgaatggataaggagctgataatagaagaggaatgttttaaaatttt
taactagaaaaattttaaaaagatcaaagcgatatatcagctaattttgattaagaaagg
ttcgaagacataaatgatgatactaatacatttaagaataaaaagccttcagtcttttaa
agaaatttataaaatttagatattaaagctacttcatctaaaaagtttgtggatagttta
attttgcctgcaaatagccaaagagctagtgaagaggagatttatatgaaaaaaaatatg
aattttcctttcaaatatgcatcatttgatcaaaagtagggttaaatctatgatatcaat
taatctactattgaaaaagaaaaagaaggaagctaaaaatactcaccaacgaatggttta
aataacaacaacaacaataataataacaactcatctagctcgaattatctagatacccct
cctatgattaaatcatctgctaaagcaaggagatcaactcaaatagctttaaagatgaag
gtattttaaggtattctaaccaaatctaattaatttgattagtagtatgtttaatcacct
ttaaattaggcgtaaaatagaaaaattaaaaaagttttatagagttaaatagtaggaaat
tctcctagttttcataattgtaatgtatttagctacaattaagaagctctataatagcaa
ggtgtggaagaaaaaacttttaactaagaagatgaaagtcatgtagattaaaataaaaag
cagcatttgataatactcacttatatgaaacgatttataaattaacttttaaagagacta
tcttacaataaaattgaattactttcagaataacaattttagatgataggagactaatct
tttcccccacaatgttataagaacatttaaaatgtatttaatgataaaaattcctattaa
atgagtctattgtcaaaaaggagataccactttgaacaaataaattattaaaagaagtaa
ggattaaaataatttttggattctttttatatacataggataggtaattcatagattttt
tcatttttgtaaaaaatacctgttactgaccccagtagttaatttataattatatgggaa
gctttacttctgataatcattttattttatttgatatttacccctctaaagactagcttt
gaatttagcattgatgaaaattcttatctaagcttgtttgcttataagatacctcctttt
atatttttactcgatatatttatgggttttcaaacaggttactacgagctaggtagaata
gtttaaaaaaggaaattaattgctttaagatattgcaaaaataaattcactactgatttc
ttaggtactttaatgatgttcctaaatggttttgtagaaaattcaaactttcttgaaatt
ttaatcttaatctttagaattacataaatgaagaataaattgtcgatgataaatgatttt
tttaggatttaaaataaatatcctgcaggatatgaaatgcttaaaattgctgccttcatt
ttgtttatgtctcacatgtggggatgcctttttcatcttgttgggtaaacagaagatgga
aactcttatcaaaacactactggaggtggaaaataatatcaagataaaaattggttgtaa
gattaagggctttaagatgctgattggtatactaaatatatattttctgtttatttctct
ataataacaatggttacagtaggttttggtgatatacatcctgtaaacatttatgaaaaa
atgtttgtaattggaatgacaattatatcttgtggtatctttgcatattgtgttaactca
ataagctcaattttctcttagctatctcaaaaaaatataatatttaaataaaagcaatat
gatcttctcaattatatgaaccaaaaaaatattaaaatggaaacccaaaccaagattatg
aaatatttagagtatttggaataagagtctgaccaatgcataccaaaaggagaagctgtt
ctatcataatttccattagagcttaaagaataaattatgaaagaatacttcgttaaaata
ctctaagatgtaccaataataaatgaaaattttagtttagcttttttgagtgcaatcagt
ctaaaaatgaaagaaaaaattttaggtcctggagaaaagctgcttgtgaaagacacgaga
caatagactctgtattttataacaaagggaagtattgaatattctatagatgacggagat
cattaaaaggctttatgctaaatttaaagtgtcaaaagtgttatcgattttagataattt
attactggattaaagccataagtgtctatctaaagtacaactatgacaaatgtagcctac
ataagctacaacgattttattgaggagataaaaaaattttataaagattatgaaaaattt
tgctatttaagggattaatttttaaatgatggtagatttgaaaagctctgcccttcgtgt
aatcattttggtcacgagatcaacaattgcccataaattcacttcagtgtaaatagacca
attttcagctagaaagtattttactcaataccttaaaatcgctaataaaatccaagataa
agatttatcgataagagaatatcttggaggaatatatatcatgaagcgagaaatgactta
aaatatttgagatgggcttatgtaattgaatatcataatttgtataattaagtgaatatc
gatgaataaattaagataattgaaagtgacaaaacattctttaaaagatgtcccaaaatt
aaacctgatattatctagtatatgaagaactctgctaccacataaaatggcttggatgtt
attattgaggaaaatgagggtagtgataatacctaatctaacagtgaagaatctgatttc
taaacagattattcagaaacttaggtaaactaaaagaatatgaaaactctttaagatgaa
gatgtataagatagttaatatgcagattaaggaggtggattagcgatgtaagtgcaaaac
ataagtattcattctgaaaaatacaatggagataatcccagtctttcaaatattatccca
gatggtgatatcaataaaatggtcaatgattctataaatcaaggatcagttaaaaataaa
tcagaagctagtataaaaaggtaagaatcccttaaatcaaataaaagaaaacatacttta
actggtgtggtttaataataaatttcaagaacataaaatagaaaacttactaatgaactc
taggatttcgaaaaaatgagaagccagactaggcacttaactaatagatcaatagcctaa
atgataaatagcagtcaagcaattataaatgaaaaatcatctatgcaataatcttatatt
tcttattaataagagtactaaaactcaagtagtatgagtaattctttacctggaaaaata
attccaaatatcaattaatcataaaaagtaaataataactaataagaaagtctaagataa
cttgattaattagtagaaaaattcaagagataatgcatgaaaatgatgactaataatcta
aaagttgactatttaactcatgtatctcaataaaatagtaaagatgagaattaatcaaaa
attctgacattaagtagatagagtaaagctactaatagagtgaacacttataattccatt
tcaaatacctaacaatgcaaaagtatctaaacaatcaaaagtttacaggaaaatttaaaa
aaaacaaaaattgatgcaaaagatgtataaacaattcataataaaaacttgtaaagatat
ggcacttctcataactctcttctgcatatatttggtcctttgtagtttaaatttgataaa
attaaagaatattaaatttattatcccaaaggaaacgcatcaaatataattaaggtgtac
aaaaaaatctagagttaaaacaagacataaacaaaattacctattcttaggcatagatat
tcaggatagtcagattaatttatttagcataatcattaagaaaaattcaattaattttca
aaaaaagctgcttctaaagcgagtaaaatgtcttatatatcttaagtggatggatataaa
aatatgtttaacttttga
DBGET
integrated database retrieval system