Tetrahymena thermophila: TTHERM_00912170
Help
Entry
TTHERM_00912170 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NCD3G
Ephrin_rec_like
TNFR_ELAPOR1_6th
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7834050
NCBI-ProteinID:
XP_001020186
TGD:
TTHERM_00912170
UniProt:
Q23TV4
LinkDB
All DBs
AA seq
1244 aa
AA seq
DB search
MLFTLNNNIHVILRQVYVENSNQNNIFYLQNNYMVEIEDIFIEQSNYLNIFQVILGNSLN
INNIQISNGQNSRILQILGTVDVNIQKIQVNESNLIKLIEINSFYIQNQKFLQIQNEIRN
LKIFNSTDVFLQIDCGASSIYDLQFIQLNYTLNYCISLRTDDLIMDNITVKNSQSNSPGF
IQIFMFNNCKIQNIYSFSNDLQFIYLMNQNQGGFAYILNSKFINCNLQQNDYLIYLISLD
NIFLDQIQIKDNLFNSTDRSSALLIMESQTITLTNFQVKNNTNMMGAGGSIYVFESVNIT
IKNSIFIQNKCLYFQGGALFISSSNFQSQLNIYDSIFLQNQALVSTGGAISVQNTNIIMK
NTEISQNRASIGGGVYYEQVIPQFILDLKQVLKNNDNNNNNNTIQNNQAHIYGNNFGSSL
RKISINIKSIQIPKESAIEQEMDNIKISLFKSGQIISFNKIQLLDEEDNPIFIPKIGESD
FNKLTQDIQSLIKQIIISLRWDQQNYQIQLQGQLQSQEFINGGFNLNAQIMYQPQKNMVL
QIVSNTFQQLQDPKGNIVIQGGQFLQNITIDFVSCSTGEIQKDQGNSIVCDQCPDGKYSL
NTADTDCQQCPIVAISCYGSVINLKNGYWRESEMTDQIAYCQYNPISCQSQSKNSKYGCI
EGYVGTLCQSCDIYGVVWKQRYSEIFKPGKCYICEENALLIFVQNLIIFLLISTYIFYIL
KNIISKLQSKLAGYYIQRLDIIYLGSTLSKLDRPQIVSKIMTDHLQILSLLISFQVNIPI
SFQLPVQFLGNSLQYASKSIDCVFSKNKHLQPLWFYQSLWSFALPLSLLIAYFTVGISYS
LFKKNKIMLKYKTTAFLFIYFYFLPMVITLLSRSINCIQIANKAYLDIDINIQCFDDNWH
KPFIYYYSIPMLTIWLLVIPLCLLIKIRDFKNQQKSSIFSVCKYSFIFAGYKEKFYYWEF
GKLIYKSLLIFIGILLQQKPFLKVCLLNGLIFFQFYLIFKAKPYQIQSFNNSLQKSTLLC
SYTLNLSTIYQQVINENLIYQIVMIGLLIIPNLLFIHQILLGIVFISISSDKNDRNLFQN
ILFSLKCNFPTQFENIQIQNKKKIKYLIKFKQVKNKIQKLIQYLKSYDFYSQQTLQSHFN
LQRCSPQQQTSQIIQNTKLQLDQQTNSQDNTKNPFFLKINSLNKMRNKWSYYSRKTRQSP
LCKIQNESNQGMELTSAKLKYTQEDEICSINATNENINQNIEYN
NT seq
3735 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatttactttaaataataacattcatgttattttaagataggtttacgttgaaaac
tcaaattaaaataatatattttatttataaaacaactatatggttgaaatagaagacata
ttcatagaataatcaaattatcttaatatattttaagttatcctaggaaatagtttgaat
attaataatatttaaatcagtaatggttaaaattcaagaatattataaattcttggtact
gttgatgtaaatatataaaaaatccaagtaaatgaaagcaatttaataaaattaatagaa
attaactcattttacatacaaaaccaaaaatttttacaaatataaaatgaaattagaaat
ttaaaaatatttaattcaacagatgtttttttataaattgattgtggagcatctagtatt
tatgatctttaatttatttaattaaattataccttaaattattgtatttctttaagaaca
gatgatttaattatggataatattacagtcaaaaattcctaatcaaactcgccaggtttt
atataaatttttatgtttaataattgcaaaatataaaatatttacagctttagtaatgat
ttacaatttatttatttgatgaattagaattaaggtggatttgcttatatattaaactct
aaatttattaactgtaatctataatagaatgattatttaatctatttaataagtttagat
aacatatttttagattaaatttaaataaaagataatttatttaatagtactgatcgatca
tctgctttacttataatggaatcctaaacaataactctcactaatttttaagtaaaaaat
aatactaatatgatgggagctgggggttcaatttatgtttttgaaagcgtaaatataact
ataaaaaatagtatttttatttagaataagtgcttatatttttaaggtggagctttattt
atttctagttctaacttttagagctaactaaatatttatgattcaatatttttataaaat
taagctcttgtttcaactggaggagcaataagtgtttaaaatacaaatattattatgaaa
aatacagaaatttcatagaatagagcttctataggtggaggcgtttattatgaataagtt
ataccataatttattttagaccttaaataggtgttaaaaaacaacgataataataataat
aataatacaatataaaataattaagctcacatatatggtaataattttgggtcttcttta
agaaaaattagtattaacattaagagtatttaaattccaaaagaaagtgctattgaataa
gaaatggataatattaaaataagtctattcaagagtggatagataatttcatttaataaa
atctaattactagatgaagaagataatcctatttttattcctaaaattggagaatcagat
ttcaataaattaacttaagatatataatctctaattaaataaattattatttctttgaga
tgggatcaataaaattattaaatatagctctaaggataactttaatcataagaatttata
aatggtggattcaatttgaatgcataaattatgtattaaccataaaaaaatatggttctc
taaattgtttcaaacacatttcaataactttaagatccaaagggaaatattgtaatttaa
ggtggatagtttttgcaaaatataactattgactttgtaagttgttctactggagaaatt
caaaaggattaaggtaattctattgtgtgtgattaatgtcctgatggaaaatactcttta
aatacagcagatacagattgctagtaatgcccgatagttgcaatttcatgctatggttca
gtgattaatttaaagaatggttactggagggaaagtgagatgacagaccaaatagcttat
tgctagtataatccaatatcgtgctagtcttaatcgaaaaactcaaagtatggttgtatt
gaaggttacgtaggtactctttgctaatcttgtgatatatatggagtagtttggaaataa
cgatactctgaaatatttaaaccagggaaatgctatatatgtgaagaaaatgcattactt
atctttgtccaaaatttaataatatttttgctaatttctacatatattttctatatttta
aaaaatataatttcaaaactttaatcaaagctagctggctattacatttagaggttagat
ataatttatttaggatcaacattaagtaaattagatagaccacaaatcgtatctaaaatt
atgacagaccatctttaaatcttatcgttattaatatccttttaagttaatataccgata
tcgttttaattgccagtttaattcttaggaaactctctataatatgctagtaaatctatt
gattgcgttttttctaagaataaacacttacagccactgtggttttattaatctttatgg
tcatttgctttgcctcttagcttattaattgcttattttactgttggaatatcatatagc
ctattcaaaaaaaataaaattatgctaaagtataaaactacagcttttctttttatttat
ttttactttttacctatggttataacacttttaagcaggtctattaactgcatctaaata
gcaaataaagcatatttagatatcgatataaatatttaatgctttgatgataactggcat
aaaccgtttatatattattactcaataccaatgttaacaatttggttattagtaattcct
ctttgcttattgataaaaattagagattttaaaaattaataaaagtcctctatatttagt
gtatgtaaatattcatttatatttgcaggatacaaagaaaagttttattattgggagttt
ggtaaattaatttataaatctttgctaatttttattgggatcttactctaataaaagcca
tttctaaaagtatgcttgttgaacggtttaatatttttttaattttatttaatcttcaaa
gctaagccatattagatataaagctttaacaattcactgtagaaatcaactttgctgtgc
tcatatactttgaatctatctactatttattaataggttattaatgaaaatttaatttat
caaatagtaatgattggattattaattataccaaaccttttatttattcattagatattg
ctaggtatagtttttattagtatctcaagcgataaaaatgatagaaacttatttcaaaat
attttattttctttaaagtgtaattttccaacttaatttgaaaacatttaaatttaaaat
aagaaaaaaataaaatatttaattaaatttaaataagtaaaaaataagatataaaaactt
atttaatatttaaaaagctatgatttttatagctagtaaaccttacaatctcattttaat
ttacaaagatgctcaccataataataaacttctcaaattatacaaaacacaaaattataa
ttagattagcaaactaattcataagataacaccaaaaatccattttttttaaagattaac
tcattaaataagatgagaaataagtggtcttactacagtagaaaaactagataaagccct
ttatgcaaaatttaaaatgagtctaattagggaatggaactaacttcagcaaaattaaaa
tatacctaagaagatgagatttgttcaataaacgcaactaatgaaaatatcaattaaaat
attgaatataattga
DBGET
integrated database retrieval system
