Tetrahymena thermophila: TTHERM_00925710
Help
Entry
TTHERM_00925710 CDS
T01020
Name
(RefSeq) REJ domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
REJ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7843388
NCBI-ProteinID:
XP_001031187
TGD:
TTHERM_00925710
UniProt:
Q22DY8
LinkDB
All DBs
AA seq
1916 aa
AA seq
DB search
MIDINYFLKEFNLLIQMNQKRVERLCQLFSITILLLRVKADCNDPTFIQQTGYKNYDCLV
QTGQYFTEAQAVAYGLDAETAFGLPMVKVNYNCNPDLVSVGHTVSLGSLFGNKIHLYMKS
KQQIQDLTISYDFFYSDLPWLIYYNELTLTYGTKYITKYPPKDVYTQLAGCLVYKFSINY
EFKGLSDEKFEYFDFQMFSSSQQIFCFQGVNNVVVYVNYQCPLNCSSCDSNQNCLTCLDN
YYIATNPNTNLAYCKLTCAPQQYATLPDSITQSQTCQNCIDYCQSCSTDKQCDTCNTNYE
FISQIASCLPVCNSNQYRDSNYQCQNCIANCLKCTGPLNCTNCQNPFQFDNSLLQCICPS
QGYYLDSNGNCNSCDSTCQTCSGSLNSNCTSCPPNWFSLGGYCYQWCPNNYQQQLSNFEC
VQCQQFILPNCQTCYPTCKNCLFQQKNKCIDCYETRQIQNGKCVCRDSNDQRDIHFQCSY
KNIAVLQATLDASQPLLIIDFGVNLNQIDNLSCSQIFQNPTLTSIGQSATCAINSTQIQV
QLSQDSIIIENDQLSLVSGVLSYQASPSIFIDTFYLLNVVQLRNLPPQINVLYDKIQNTC
NDITYSLTLKNDASRGFLSLQWSVQIIPSLDTKTQSQVDSIIQAANTQMSQTLTINKYII
PPNSQINLQLNYQLKINSNGLLQYSTQYLKVKQIVISVIQSQYPPIYRYYDLTIDYSIYV
QTCDQNGPFIFMEPLSVQIQSSVMPSLNYNNPTFTDAQIEINVKPFTIPIGSILDLNIVA
TLVSNQDISQTNAIQINPKLTNLFILIEGGSNQLVNYKQPLVLSGIARDYEVEDENSPQG
ISLTWSCESIVQNNGDYQCYNYLNKVQTIQQTGISTTIPGKTFQPYQTLKFTFQGIKDSR
NSASSVLVIFAEIDLPPLTVIFYKVPQIEIVNLNEDINVQLIYSSNVSSDILTYAGAILY
DDDVQGVIKFDFYQVKLRIWDYFSKVLPSNPVVQLRFTVYNPAYLMPSMTIINFNINLPP
QNCVLQITPANGQAIQTNFQIQMVGCSSNNLPITYQIFYYLNQDDMKSEIQNPKIILRRQ
IQDQVVLNQKFTILPEGNLIIMAQAMDSKLAVNNSTIQVQVSPLNCDEQTLLGILDNALN
PTSNLLPSQNVLNLSIIGEQISKSNPLYNLTSVNQKKLQIIQQLITQSSQLPKSSFLYTY
SNKIIAQLQSSLPIQSDAQVTTILEQLNQLLQKQQQMPSNNQLINNNNILLQNLIDSYKI
LNATTQTVSYDMLPTQINISNSICNQLNNQTLPNQGGIQLQGNLINLDCQQITDKNLQQY
MQIFSTPPTNETNIYNAANLVFSQNPYKETASFQNYTQALTKADPNLTISYNQVIQPNIS
NRNKSSDYQPNSKVVLKFQNSHQSSNNSNMTCIQQKQTTWSKNGCQILKENSIFGYFCYC
EQQHPTTLIDDLESILNNKNLETAFSSQGFDNISHFSDFYKFVVFWFLSSLTLVQFGLYF
YGNFLDKKYQGGINFYHASSRVFPIIQVNQTEQVQSQQYHSIAQQTPQLQPLTQQEAPQQ
EQQINKQDEKPQRKDSKSIYSRRSISFTAFEYQKDGLKLASNQDFIFKKTSQFSHKVIEN
NELKIDNQIVEDCKLQNLEIQKDVEELNLDQQQINQMQSERKCVSLSNFGQNNISNKENP
TKLTANISNERIVSHQDENKQENQNSIFDNDQEQQKIKHQKELELKKEQENNLIIEKYMS
YPALIRVLVFHDFFSIFFLYDKVLSRSIRFTIYYIRIIHCLSISTIFGQQYNEAEMIMVS
IINSIVLQVSVGIITLTHKIKRIGKYLSTFCMIVLCLFYYYLILAVVSGQSAPSSNSKIV
SFFIMIGIDFVVVSFIVSALKMKIISHMLNKAKRIKIIVKLFYLLNFVDIIQNLSV
NT seq
5751 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgatattaattattttttgaaagaatttaatttgttaatttagatgaattaaaaa
agagtggaaagactttgttaactattttcaataacgattcttctattgagagttaaggct
gattgcaatgatccaacttttattcagcagactggctacaaaaattacgactgtttagtc
tagacagggtaatatttcactgaagcttaagcagtagcttatggattagatgcagaaaca
gcttttggtcttcctatggttaaagtcaattataattgcaatcctgatttagtttcagta
ggacatacagtatctttaggttccttatttggaaacaaaatacacctatatatgaaaagc
aaacaacaaatttaagacctcacgatttcatatgattttttttactctgatctaccatgg
cttatatattacaatgagcttactttgacttatggcaccaaatatatcacaaaatatcct
cctaaagatgtttacacctaattagctggatgcttagtttataaattcagtattaattat
gaatttaaaggattatctgatgaaaaatttgaatactttgatttttaaatgtttagcagc
agctaataaatattctgtttttaaggcgttaataacgtagtagtctatgtgaattattaa
tgcccattaaattgctcttcatgtgatagcaactaaaattgcttaacttgccttgacaat
tactatatcgctacaaacccaaatacgaatcttgcatattgcaaattaacttgtgcgcca
taataatatgccactttaccagattcaattacttaatcttaaacttgttaaaattgcatt
gattattgctaatcttgcagcacagacaaataatgtgatacttgtaatactaattatgag
tttatttcataaattgcatcgtgtcttcctgtttgtaattcaaattagtatagagattca
aattactaatgttaaaattgtatagcaaattgcctgaaatgtactggccctcttaattgt
acaaattgttaaaacccattttaatttgataattcgttactgtaatgtatttgtccatca
tagggatactatctagactcaaatggaaactgtaattcatgtgattctacttgttaaaca
tgctcaggaagtctaaatagtaactgtacaagttgtccccctaactggtttagtttggga
ggctactgctatcaatggtgtcctaataattaccaataacaactatcgaattttgagtgt
gttcaatgttaacaatttatcctacctaactgtcagacttgttatccaacttgtaaaaat
tgtctcttttaacaaaaaaataaatgcatagattgttatgaaacgagataaatataaaat
ggaaaatgtgtttgcagagattctaacgattaaagagatatccacttctaatgcagttac
aaaaacattgctgtattataagcaacattagatgctagctagccactattaatcattgat
ttcggagttaatttgaatcaaatcgacaatctcagttgcagttaaattttctaaaatcct
actttaacaagtataggccaatccgctacctgcgcaattaattctacttaaatttaagtt
taattaagctaagattctataattattgaaaatgattagttatctttagtatctggagtt
ttatcttactaagctagtccaagtatttttattgacactttttatctcctcaatgttgtt
taattaagaaatttacctcctcaaataaatgttttatatgacaaaatttaaaatacttgc
aatgacataacttatagcttgacactaaaaaatgatgcaagcagaggatttttatctctc
taatggagtgtttaaataatacccagcttagatactaaaacgtaatcttaagttgattct
ataattcaagcagctaatacttagatgagctaaactttaacaataaataaatatattata
ccacctaattcttaaatcaaccttcagttaaactactaacttaaaataaattcaaatggc
ttgttacaatattctactcaatatttaaaagtgaaataaattgtgatatcagtcatttaa
agctaatacccacctatttacagatactacgaccttactattgactactcaatttatgtt
taaacctgcgattaaaatggaccttttatattcatggagcctttaagtgtttaaatttaa
tcatcagtaatgccttctctaaattacaataatcctacctttacagatgcatagattgaa
attaatgtgaaaccttttactattccaattggaagtatcttagatttaaatatcgtagca
actttagtaagcaattaggatatatcttagaccaatgctatataaataaaccctaaatta
actaatttgtttatattgattgaaggaggatcgaattaacttgtgaattacaaataacct
ctcgtgctttcaggtattgcaagagactatgaagtagaagatgaaaattctccataagga
atatcattaacctggtcatgtgaatcaattgtttaaaataatggagattattagtgctat
aattatttaaataaagttcaaacaattcagtaaacaggaattagcactactattccaggg
aaaacattttaaccctaccaaactcttaaattcactttccaaggtataaaagacagcaga
aatagtgcatcaagtgtacttgttatttttgcagaaatagacttacctcctttgacagtt
attttttataaggtgccatagatagaaatagttaatttaaatgaagatattaatgtttaa
ttgatatatagctccaatgtatcctctgatattctcacctacgctggagctattttatac
gatgacgatgtgtaaggtgtaataaaatttgatttttactaagtcaagctaagaatatgg
gattatttttctaaagtactgccttctaatccagtggtttaattaagatttactgtttat
aatcctgcttaccttatgccaagtatgactataattaacttcaatatcaacttaccacca
tagaactgcgttttataaattactccagctaatggataagctatttagactaacttttaa
atataaatggttggttgcagctcaaataatttacctataacttattaaattttttattac
ctcaactaagacgatatgaaatctgaaattcaaaatccaaaaattattcttagaagataa
atctaggatcaagtagtactcaactaaaaatttactatattgccagaaggaaatttaata
ataatggctcaagctatggactctaagctagctgtaaacaattcaacaatataagtatag
gtttctccactaaattgtgatgaataaactctattaggcatattagataatgctctaaat
cctaccagtaatctactaccttcctagaatgttttaaatttgtcaattataggtgaacaa
atatctaaaagtaatcctctttataatctaacctctgtgaattaaaagaaattgtagata
atatagcagttgatcactcaatctagttagcttccaaagtcatcattcttgtacacatat
tcaaacaaaataatagcttagttgcagtcttcattacctatttagtcagatgcataagtc
acaacaattttggaataattaaactaattattgcagaaataataataaatgccttcaaat
aactagttgataaataacaacaatatccttctttaaaacttaatagattcttacaaaatc
ttgaatgctactactcaaacagtgtcctacgatatgctacctacccagataaatatttca
aattcaatttgtaactagctaaacaactaaacactcccaaaccaaggagggatttagctt
caaggaaatttaataaatttagattgccagtaaatcacagataaaaaccttcagtaatac
atgcagatattcagcactcctcctacaaacgaaacaaatatttataatgcagcaaattta
gtattttcttagaatccttacaaagaaacagcctcatttcaaaattacacctaagcttta
acaaaagcagatccaaatctaacaatatcttacaattaagtaatctaacctaatatatct
aatagaaataaaagctcagattatcagccgaattcaaaagttgtattaaaattctaaaat
tctcattaatcaagcaacaacagtaatatgacatgcatataacaaaaataaacaacttgg
tctaaaaatggatgtcaaattttgaaagaaaatagtatttttgggtatttttgctattgt
gagcaatagcatcctactactctaatagatgatttagaatcaatattaaacaataaaaat
cttgagactgcattctcctcttaaggattcgataacattagtcatttttcagatttttat
aaatttgttgtattttggttcctaagctctttaactcttgtttaatttggactctatttc
tatggaaattttctagacaaaaaatattaaggaggtataaatttttatcatgcctcatca
agagtttttccaataatttaggtaaatcaaactgaataagtataaagctagtaatatcac
tccatagcttagtaaactccttaactacagccattaacataataagaagcaccttaatag
gagtaataaattaataaacaagatgaaaaaccgtaaagaaaggattcaaaatcaatctat
tctagaaggtcaatatcttttacagcctttgaatatcaaaaagatggattaaaattagct
tctaattaagatttcatatttaaaaaaacatctcaattttctcataaagttatagaaaat
aatgaactaaaaattgataattaaattgttgaggattgcaaattacaaaacttagaaatt
taaaaagatgttgaagagttaaacttagattaatagtaaattaactagatgtagagtgag
agaaagtgtgtttctttatctaattttggctaaaataatatatcaaataaagaaaaccca
acgaaattaacagcaaacatatcaaatgagagaattgtaagccatcaagatgaaaataaa
taagaaaattagaacagcattttcgataatgattaggagcaacaaaaaatcaaacaccaa
aaggaattagaattaaaaaaagaataagaaaacaatcttattattgaaaaatatatgagc
tacccagctttgataagagttcttgtctttcatgattttttcagtattttctttttatat
gacaaagtgttatcgagatcgataagattcactatatattacataagaattatacactgt
ttaagcatatcaacaatatttgggtaacaatataatgaggctgaaatgattatggtgtct
ataataaattcaatagttttataagttagtgttggaatcataaccctcactcataaaata
aaaagaatcggaaaatatttatccaccttttgtatgatagtgctttgcttattttactat
tatttaatattagctgtagtcagtggatagagtgctccctcatcaaattctaaaattgtt
tccttttttattatgataggaattgattttgttgtcgtgtcttttattgtttctgcgctt
aaaatgaaaattatttctcatatgctaaataaagcaaaacgaataaaaataattgtaaaa
ctattctatttacttaattttgttgatataatttaaaacttatctgtctga
DBGET
integrated database retrieval system
