Tetrahymena thermophila: TTHERM_00964310
Help
Entry
TTHERM_00964310 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
Pattern recognition receptors [BR:
tet04054
]
Cytoplasmic pattern recognition receptors
NOD-like receptors
TTHERM_00964310
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_6
PG_binding_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7828215
NCBI-ProteinID:
XP_001008919
TGD:
TTHERM_00964310
UniProt:
Q22TT7
LinkDB
All DBs
AA seq
2059 aa
AA seq
DB search
MVIANIYEDTITNRKQKDKLNEIDFSYLTFLSTFDNNQCTAYLKIFNVKTNKRLLLGIKD
KQKLETIFKKAESKNNDVNRFAGRRNQFKLYNLLQFEEDINKIQLLYSECLNLYSAVIKM
LMKNFIKINEMFTLLKQYMDSRTKLETKIQLQLKQNHKSEALKNICINFDFYLLYKQNLI
NSYQKSNRSSSQYLARQEYYHKSSCFAFVSLLDQSFGAIKKVNTSFVKTFGYLNKQQIQD
KSIFQVLPSSNYQRDQQLILQQLLLPTYSDIQTLPLFLAKHQAGYCVPIQLQIQSQILDS
QDFGFTLWAKPIYEETIYLLLDNQNPNLIKLANKLFYKKYLKEKVYHSQIQLIKTESIIP
IIHYLIQISRKEKNKQFQTVFVSPNQDFLKEKSLEDWNFLNYLKHAQIFSATVSLHFQNE
LSQFQSGIYLAIENIQPLNSLKEKFDLLKFYQQQIKEICNISLELELDCLEYNQIGLTNF
NFSDHYDDNTLQTRSQIQLSKYNSLQNEKFPYTNQLTSSTTNYNSLYKSNGILIKQIIDS
DMTRNKAIITAVSPRYNFECMPMTPAASQTHQLNIQVDESFDECQNINKENNINYFHEQQ
ANQSNNNLESPTIILSHNKNQRHHQIEQINQFHFNYDVDLQKLNQDQENKSRNLNLNNLN
YYLSKQQSEEPLPNSKCELVLSTTPTKAQTKSQFKFKKSNLKHKNFQENILQQNLDIQSI
SSSSKSSFQTMQVFENIHKRKQMKYLKVINILGIASILVTLSMNLLGFFTFIENLIYQRE
NFKYINWIYMINVQISYSLSERNIILLNQNNFLSTTSSQHQQFMDLLNEQNQSRINLSKD
YMKQLFNNTNNEIEVFNIIQKGSIIQDIYQNTQIAKQKDLPMIYSILLQIYGIYYFVSNK
DPEGIIKKQNEMNYPDLNEQVQSIFSQMNEEYQNQLSEIHSLSIIYLYVITFMTLAFLIS
IIPSYIFAKKKQQQILKLFATFDKKQLKEILDKLANQISQFSINQKQNFSKFDSKFSNIL
NQTETYEEKKFNISKTQSLKYSLKKLLLGLTAIFCLCIIHPILNYFIEEKFIDNSRAIFN
FNNIACVSYFTVLNSLRVRQGLAMAFLMPEKQAFSISQYQKIINQVTDQMNQLPNLIKKN
LENVNSKQQHNQEIFEDFLINLFTQNTCDTIQKYSQYQNGDFLYNECNTVGKGAFQQGLI
NGLVYFIGVYRDYLSFAFSQNAESFQQGFNNYNKNIPAINLKQIGDEDASGLGSTLAKCI
NLSNLTLNLFQNKIGDEGASGLGFALEKCINLSNLTLNLSYCKIGVMGASGLSSGLAKCI
NLSNLILELDGNEIGDGGVSGLGSALEKCINLSNLTLNLNGNEIGDEGASGLGCALAKCI
NLSNLSLQLFGNKISAMGASGLGSGLAKCINLSNLTLNLRGNKISAMGASGLGSGLEKCI
NLSNLTLNLRGNKIGAMGASGLGSGLAKCIKLSNFTLQLNENQIGIGGALDLVSGLEKCI
NLSNLTLNLDGFQIGDQGASGLGSALAKCINLSNLTLNLGGNYIGDEGASGLGSGLAKCI
NLSNLILELDGYQIGDKGASGLGSALGKCSNLSNLTLKFSLNEIDYEDASCLGSGLAKCI
NLSNLTLNLRYNKIGAMGASGLGSGLAKCINLSNLTLDLRNNEIGDEGASDLGCALTKCI
NLSNLTIKLRYNKIGAMGVSGLGSGLAKCINLSNLTLNLRPSEIGDEGASILGSVLEKCI
NLSNLTFNLNNNKIGAMGASGLGSGLAKCINLSNLTLDFRDNEIGEEGASGLGSALAKCI
NLSNSTLKLPFNQIGAMGASGLGSGLANCINISYLTLDLHGNEIGEEGSSGLGFGLAKCI
KLSNLTLSLYENQIGDQGLSSLGSGLAKCIKLSNLTLNLDANQIGAMGASGLGSCLAKCI
NLSNLTLDLDENQIGDEGALGLGFGLANCINLSNLTLLLIHNKIGAMGALGLGSSLAKCI
NLSNLKLKLKYNIIGDEGASGLIFGLAKCINLTNLALNLCENQISDEGASCYGSGLAKCI
TLQYLTLNLEQKQFICFGL
NT seq
6180 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaattgcaaatatttacgaggacacaataacaaatagaaaataaaaggacaaactt
aatgaaatagatttttcttacttgacttttttgtctacatttgataataatcagtgcact
gcctatctaaagatatttaatgtcaagacaaataaaaggcttttattaggaatcaaagac
aaacaaaagcttgaaacgatctttaaaaaagctgaaagtaaaaataatgatgtaaataga
tttgcaggtagaagaaattaatttaaattgtataatttattgcaatttgaagaagatatc
aataagatttaattactttatagtgaatgcttgaatttatactcagcggtaattaaaatg
cttatgaagaatttcatcaaaattaatgaaatgtttacactgctaaaataatatatggac
tcaaggaccaaattagagacaaagatctaattataattaaaacagaatcacaaaagcgag
gctcttaaaaatatttgcattaattttgatttttatttgctctataagtagaatttaatt
aattcctactaaaaatcaaacagatcttcttcatagtatttagcaagataagaatactat
cataaatcaagctgttttgcattcgtttcccttttagattaatcttttggcgctattaaa
aaggttaatacctcgtttgtcaaaacttttggatatctaaataagtagcaaatttaagat
aaatctattttttaggtacttccttcaagtaattattaaagagattagcaattaatttta
caataattactattaccaacttacagcgatatttagactttgcctctctttttagcaaaa
cactaagctggatattgtgtgccaatttaactgcaaattcaaagctaaatcttagactcg
taagattttggtttcactttatgggcaaagcctatctatgaagaaactatatacttatta
ttagataactaaaatcctaatctgattaaacttgccaacaaattattttacaaaaaatat
ttaaaagaaaaagtatatcactcataaatacaattaattaaaacagagagcataatacca
ataattcattatttgatttaaatttctcgaaaggaaaagaacaaataattttaaactgtt
ttcgtatcaccgaattaagatttcttaaaggaaaaatctttggaggattggaatttctta
aactatttgaagcatgcttaaatatttagtgctacagtatctcttcacttttaaaatgaa
ttgagctaattttaatcaggtatttacttagccatagaaaatatatagcctcttaactca
ttaaaagaaaagtttgatttattaaaattctactaataacaaataaaggaaatatgcaat
atttctttggaattagagttagattgtttagaatacaattaaattggtttgacaaatttt
aatttcagcgatcattatgatgataatacattgcaaactagaagttaaatttagctttca
aagtataatagcctttaaaatgagaaatttccttatacaaattaattaaccagctcaact
acgaactacaattctttatataaatcgaacggaatactaattaagcaaatcatagactca
gatatgacaagaaataaagcaataattaccgctgtatctcctagatataattttgagtgc
atgccgatgactccagctgctagctaaactcattagctgaatatttaagttgatgaatcg
tttgacgaatgctaaaatataaataaagagaataatataaattacttccatgaataataa
gcaaattagagtaacaataacttagaatcacctacaattatccttagtcacaataaaaat
caaagacatcatcagatagaataaataaactaatttcactttaattacgatgttgacctg
taaaaattaaattaggattaagaaaataaaagcagaaatttaaatttaaataatttaaat
tattatctttcaaaacaatagagtgaagaacctttacctaacagtaaatgtgaattagtt
ttgtcaactactcccacaaaagcataaaccaagagttaatttaaattcaaaaaaagtaat
ttaaagcacaaaaacttctaagaaaacatccttcagtaaaatttagacatttaatctatc
tcctcatcatcaaaaagctcattttaaactatgtaagtttttgaaaatatccacaaaaga
aagcagatgaaatatctgaaagtaattaatatcttgggaatagcttctattttagtcact
ctttctatgaatctgctgggattctttacttttattgagaacttaatttatcaaagagaa
aatttcaaatacataaattggatttatatgataaatgtttagattagttattccctttct
gaacgcaatataattctattaaattaaaacaattttttgtcaactacttcttctcaacac
tagcaatttatggatcttctaaatgaataaaaccagtcaagaattaatcttagtaaagat
tatatgaaacaattatttaataacactaataatgagattgaggtctttaatataatttaa
aaaggttcaattatttaagatatttatcaaaacactcaaatagcaaaataaaaagatttg
cctatgatttattcaattctattgtaaatatatgggatttattactttgtttctaataaa
gatcctgaaggaataatcaaaaaataaaatgagatgaactacccagatttaaatgaacaa
gttcaatctattttttctcaaatgaatgaagaatattaaaattagctctcagaaattcat
agcttaagcatcatttatttatatgtgattacttttatgactttggcttttttaattagt
atcattccaagttacatttttgctaaaaaaaaatagcaacaaattctaaaactttttgca
acttttgataaaaaatagttgaaagaaattttagataaattagcaaattaaattagctaa
ttttcaattaattaaaagtagaatttttctaaatttgactcaaaattttctaatattttg
aattaaactgaaacatacgaagaaaaaaaattcaatatcagcaagacttaatcgttgaaa
tactctttgaaaaagttactacttggtttgactgcaatattttgcttatgtattatacat
ccgatattaaattattttattgaagagaaatttattgacaattcgagagccattttcaat
tttaataatattgcttgcgtttcttattttactgtattaaattctttaagagtgagatag
ggtcttgccatggcgttcctcatgcctgaaaaataagcattttcaatatcttaataccaa
aaaattataaattaagtcacagattagatgaatcaattacctaatttaataaaaaaaaat
ttagaaaatgtaaattcaaaataatagcacaactaagaaatttttgaagatttcttaatt
aacctttttactcaaaatacttgcgacactatttaaaaatacagttagtatcaaaatgga
gattttctatacaatgaatgcaacacagttggaaagggagctttttagcaaggtcttatt
aatggtttagtttactttataggagtatacagagattatttatcttttgcttttagctaa
aacgccgaaagcttttaacaaggctttaataactataataaaaatatccctgccataaat
ttaaaataaattggtgatgaagatgcatcaggcttaggttctactttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgacacttaaccttttttagaataaaattggtgatgaaggtgcatca
ggcttaggttttgctttagaaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttaaccttagt
tactgtaaaattggtgtaatgggtgcatcaggcttaagttctggtttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgatacttgagttagatggaaatgaaattggtgatggaggtgtatca
ggtttaggttctgctttagaaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttaaccttaat
ggtaatgaaattggtgacgaaggtgcatcaggcttaggttgtgctttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgagtctttaactttttggcaataaaattagtgcaatgggtgcatca
ggcttaggttctggtttagcaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttaaccttcgt
ggcaataaaattagtgcaatgggtgcatcaggcttaggttctggtttagaaaagtgcatt
aatctctcaaatttgacacttaaccttcgtggcaataaaattggtgcaatgggtgcatca
ggcttaggttctggtttagcaaagtgcattaaactctcaaattttacactataacttaat
gaaaactaaattggtattggaggtgcattagacttagtttctggtttagaaaagtgcatt
aatctctcaaatttgacacttaaccttgatggcttttaaattggtgatcaaggtgcatca
ggcttaggttctgctttagcaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttaaccttggt
ggaaactatattggtgatgaaggtgcatcaggcttaggttctggtttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgatacttgagcttgatggctattaaattggtgataaaggtgcatca
ggcttaggttctgctttaggaaagtgcagtaatctctcaaatttgacacttaaatttagt
ttgaatgaaatagactatgaagatgcatcatgcttaggttctggtttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgacacttaatcttcgttacaataaaattggtgcaatgggtgcatca
ggcttaggttctggtttagcaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttgatcttcgt
aataatgaaattggtgatgaaggtgcatcagacttaggttgtgctttaacaaagtgcatt
aatctatcaaatttgacaattaaacttcgttacaacaaaattggtgcaatgggtgtatca
ggcttaggttctggtttagcaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttaaccttcgc
ccttctgaaattggtgatgaaggtgcatcaatcttaggttctgttttagaaaagtgcatt
aatctctcaaatttgacatttaaccttaataacaataaaattggtgcaatgggtgcatca
ggcttaggttctggtttagcaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttgactttcgt
gataatgaaattggtgaagaaggtgcatcaggcttaggttctgctttagcaaagtgcatt
aatctctcaaattcgacacttaaacttcctttcaattaaattggtgcaatgggtgcatca
ggcttaggttctggtttagcaaattgcattaatatctcatatttgacacttgatcttcat
ggaaatgaaattggtgaagaaggttcatcaggcttaggttttggtttagcaaagtgcatt
aaactctcaaatttgacactttcactttatgaaaattaaattggtgatcaaggtttatca
agcttaggttctggtttagcaaagtgcattaaactttcaaatttgacacttaaccttgat
gcaaattaaattggtgcaatgggtgcatcaggcttaggttcttgtttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgacacttgaccttgatgaaaactaaattggtgatgaaggtgcatta
ggcttaggttttggtttagcaaattgcattaatctctcaaatttgacacttttacttatt
cacaataaaattggtgcaatgggtgcattaggcttaggttctagtttagcaaagtgcatt
aatctctcaaatttgaaacttaaacttaaatacaatataattggtgatgaaggtgcatca
ggtttaatttttggtttagcaaagtgcattaatctcacaaatttggcacttaacctttgt
gaaaactaaattagtgatgaaggtgcatcatgctatggttctggtttagcaaagtgcatt
actctctaatatttgacacttaaccttgagtaaaaacagtttatttgttttggattgtga
DBGET
integrated database retrieval system