Tetrahymena thermophila: TTHERM_00977683
Help
Entry
TTHERM_00977683 CDS
T01020
Name
(RefSeq) cyclic nucleotide-binding domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
cNMP_binding
Ion_trans
Ion_trans_2
zf-CCHC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7830034
NCBI-ProteinID:
XP_001471488
TGD:
TTHERM_00977683
UniProt:
A4VCQ2
Structure
PDB
PDBj
LinkDB
All DBs
AA seq
1471 aa
AA seq
DB search
MSVPSLEYQKQYIYSMQKSQCSIQNQSINIIADEQQAPQESYLSRKCQRHLFETKCVQLE
LGLNGDYSLSNNSLFIQNNNTVFDNLQQNTESNIKQTNRSNKERYETQIFEQHPIIKNPK
NDQVSSIMNEQEQKKFINTDENVQQTAQVSKNSKQSFKNGIQQVQTLSIDKSQASIREQK
KISDCNLDKQFIKGDSRLDESSKIPSKCCGWIPEDIIFENNIHQLNKKVTLVAKNNFSDS
KIQNHKEKKYQQNFQKAAEIVNRLLNTSMNRIMRVRQHVRNFIMLLKLRYLNRKIDDLTD
RDYASINDLSNFYKSHKKKRNSKAFMKHFNFVIKLSQKLPIFMPTDTLRVVWDVILVLFT
YIFLYFYSILMFFNQDNPDTEFIKEFYFCTFFIFLIDVLVNFNTAFFNKDLIIINRRQIA
KQYIFSTVFFTDFVSLIVLGIKVIKRSNFIVYNPNHNLLTYCFNMLIFFKVNGISSKKKG
FDYVFTLKESEKHVIKLINQLFSVITVAHLAAIGWYFLGILQVVNDNQTNWLVKLNISEG
VYYQKYIYSIYWSITTMTTVGYGDISATNYGEALYISIVMLLFSCVFAYSINNIGFILQE
IEKSSKQLNDKITTMQRYLNRKKVNISLKSRIRHYLSFLAQEQRDRDKQAEDEIISILSN
KLREEITVEINSKILNKFNIFSSNFSKQTLDKLVFKMTEVLINPNEIIFREEQNDDMSIY
FIQSGVIEVYQQSVQKQDKVTVIQTLTDESLFGEISFFSGLSRKASARSINLSTLYKISR
EDFIYIIQENNEDYERFKMIQEQIVFQGELPLLHVECYNCKKIGHISSSCPKTHQIFDKQ
FIILREIYSSFQQRIFFDRTRYKNNLKPLNLIQDNQNVCKILKQNLQDDNISIEIMFDSC
NRYTGSSYYNSEDLEDDEYGQCDEYATSSNSQTNIDNFSNKSSLNNIKNNALQKKKTMKK
KEVSKKYLDNNQICENISSILNSDQYCNSQKVISNNINDNLEIKKSYVKSFNLSNRQKSL
DDFEKIKSSQNLEQNNNFNNSDIQHSKSQIQIKADSEQFQQNIKAYSQTNKNEVDGDQEQ
SNISQIFKKRKSQKQQEQINNTNTDIKLQTEYPKQQARFSSTSGSTLQSQQLKMPSQKVQ
DELQLNINQNLKGQEFNINQSNKRVSTLLNQISNNHNQILKNCTEQTNYRNSIDQILLQG
ILVNNLIQSHSSQNILPIEQSFKYLKKADGDLEKKKNSILLQNFSLNNNKSSINITKEFI
EDQAAVSHKNLSQIKTKQSIGKSSILNALSNINNIDGNTNDLNNKNNNSKLLQAQNSQIT
NGNQLQIVDRLSKLLLNPQLPLLLKLTSVGMSFREMNSINSNNAMDMFDKMHNFKKFFPH
NNIENVLNKLKLLQLELKKQKKQKQINKPRRQNILFFRYYSNCGSQVHDNLKLLQQEFNI
DDYRPTYLSYGVSKRRGQQFPCNKHNLTLYF
NT seq
4416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgtgccttctcttgaatattaaaaataatatatatattctatgcaaaagtcataa
tgctctatataaaattaatctattaacattatagctgatgagtagtaagcaccttaggaa
agttatttaagtagaaaatgttagagacatttgtttgagactaagtgcgtttaattagaa
ctaggactcaatggagactattccttatctaataatagtttgtttatttaaaataacaat
acagtttttgataatttatagcagaatacagagagtaacattaaataaaccaatcgttct
aataaagaaagatacgaaacataaatatttgagcaacatcccataattaagaatccaaaa
aatgattaagtttcaagcataatgaatgaataagaataaaaaaaatttattaacacagat
gaaaatgtgtaataaactgcataagtttctaaaaatagtaaataatcctttaaaaatggc
atacaataagtctaaacactgagtattgataaatcttaggcctcaattagagaatagaaa
aagataagtgattgtaatttagataaatagtttattaagggtgacagtcgattagatgaa
agttcgaagataccatcaaaatgctgtggatggataccagaagatattatatttgaaaat
aacatccattaattgaataaaaaagtgactcttgttgctaaaaataactttagtgatagc
aaaatataaaatcacaaagaaaagaaatactagtagaacttttagaaggcagcagaaatt
gtaaatagacttttaaatacatcgatgaatagaattatgagagtaagacagcatgtcaga
aattttattatgctacttaagcttagatatcttaaccgcaaaattgatgatcttactgat
agggattacgcatcaattaatgatttaagcaatttttataaatcacataaaaagaagagg
aatagtaaagcttttatgaaacacttcaactttgtaattaagttaagctaaaaattgcct
atttttatgccaactgacactttacgagttgtttgggatgtcatattagttttattcact
tacattttcctatatttttactcaattcttatgttttttaactaagacaaccctgatact
gaattcataaaggagttttatttctgcacattttttatttttttaattgatgttttggtc
aatttcaacactgccttttttaacaaagatttaataataattaatagaagataaatagcg
aaatagtatattttttccactgtttttttcactgatttcgttagccttattgtattagga
atcaaagtaattaagagaagcaatttcatagtttataatccaaatcacaatttattaaca
tactgctttaacatgctaatattttttaaagtaaacggaatttcctcaaaaaaaaaagga
tttgactatgtttttacactaaaagaaagtgaaaagcatgtaataaaattaattaattaa
ttatttagtgttatcactgtggcacatttagcagcaattggttggtattttcttggcata
ttataagttgtgaatgataactaaacgaactggttagttaaattaaatatttctgaaggt
gtatattaccaaaaatatatatattctatttactggtcaataactactatgacaacagtt
ggatatggggacatttcagcaacaaattatggtgaagctttatatatttctatagttatg
cttttgtttagttgcgtctttgcttattcaatcaacaacataggattcatcttataagaa
atagaaaaatcatcaaaatagcttaatgataaaataactactatgcagaggtatctaaac
agaaaaaaagttaatatttctttgaagagtagaataagacattacttatcgtttttagct
taggaatagagagatagagataagcaggctgaagatgaaattatttcaattttatcaaat
aaattgagagaggaaataacagttgaaataaattctaaaattttaaataaatttaacatc
tttagctcaaatttttctaagcaaactttggataaattagtatttaaaatgacagaagtt
ttaataaatcccaacgagattattttcagagaagagcagaatgatgacatgtctatatat
tttatctaaagtggagtcattgaagtctattaacaatcagtatagaaataagataaagta
actgtgatttaaactctaacagatgagagtctatttggagagatctcgttcttctcaggg
ttatctagaaaagcttcagctagaagtattaatctttctactctctacaaaatatccaga
gaagattttatctatataattcaagaaaataatgaagattatgaaagatttaaaatgata
taggaatagattgttttctaaggagagctgcctttacttcatgtagaatgctataattgt
aaaaaaatagggcatatttcaagctcatgtcctaaaactcatcaaatttttgataagtaa
ttcataattctaagagaaatctactcatcatttcaacaaagaatcttctttgatcgcacc
agatataaaaataatttaaagccactaaatttgatttaggacaatcaaaatgtatgcaag
attcttaaataaaatttataagatgacaacatttcaattgaaattatgttcgattcttgc
aatagatatacaggatcttcttattataactcagaagatttagaagacgatgagtatggc
tagtgtgatgaatatgctacgagctcaaactcgtagacaaatattgataacttttcaaat
aagtcatctttaaataacataaaaaataatgcattgcaaaaaaagaaaactatgaaaaaa
aaagaagtgtcaaaaaaatatttggataataatcaaatttgtgaaaatataagctcaatt
cttaactcagattaatattgtaatagctaaaaagttatttcaaataatataaatgataat
ttagaaataaaaaaaagctatgttaaaagttttaatctctcaaacagataaaaatcatta
gatgactttgaaaaaataaaaagtagctaaaatttagaataaaataataattttaacaac
tctgacatatagcattctaaatcatagatttaaataaaagctgattcggagcaatttcaa
tagaatattaaagcttattcctaaacaaataaaaatgaagttgatggagattaggaataa
agcaacatttcataaatatttaaaaaaagaaaaagttaaaaatagcaagagcaaattaat
aatacaaacactgatattaaacttcaaacagaatatccaaaatagcaagctagattttca
agtacgtcaggttcaactttgtaatcttagcaattgaaaatgccttcataaaaggtttaa
gatgagcttcaattaaacataaactaaaatttaaaaggctaagaatttaatattaattag
tcaaataaaagagtaagtacactcctgaatcagataagtaataaccataattaaattcta
aaaaattgtacagaataaactaattacagaaactctattgattaaattttactataagga
attttagttaacaatttgattcaatctcattcctcctaaaatattttaccaatagaacaa
tcatttaagtatttgaaaaaagcagatggtgatttagaaaaaaagaaaaatagcatatta
ttataaaacttcagtctaaacaacaacaaaagctcaataaacattacaaaagaattcatt
gaagattaagcagctgttagccataaaaatttatcttaaataaaaacgaaataatcaatt
gggaaaagctctattcttaatgctttgagtaacataaataatattgatggtaatactaat
gatttaaataataaaaataataatagcaaattgttataagcttaaaatagctaaattaca
aatggtaattaattataaatagtggatagactttctaagctattattgaatccatagctt
cctctattactcaaactcacgtctgtaggaatgagttttagagaaatgaattcaataaac
agtaataacgctatggatatgtttgacaagatgcataactttaaaaaatttttccctcac
aacaacattgaaaatgttttgaataaacttaaattgttgtagttagaattaaaaaaataa
aaaaagcagaagcaaataaataagcctcgccgctaaaatatattattcttccgttactat
tccaattgtggttcttaagtacatgataatttaaaattattacaacaagaatttaacatc
gatgattacagaccaacttacctttcttatggtgttagcaagagaagaggataacaattc
ccatgcaataagcataacttaactttatatttttga
DBGET
integrated database retrieval system