Tetrahymena thermophila: TTHERM_00979830
Help
Entry
TTHERM_00979830 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824413
NCBI-ProteinID:
XP_001016915
TGD:
TTHERM_00979830
UniProt:
Q23JH4
LinkDB
All DBs
AA seq
1381 aa
AA seq
DB search
MNVLAHLQNKLLITQQILQDTICLENIQIQSIKITKPSLYPIVSIRSSQIYLNQSSAKNN
IANFTNQNSLFTLQAENLLITNSTLNQNSGFQNLLLIQNTQQGNIQSLIVSNNLIMAALL
ISQSNIQIQVSQIKQNQSKSVKQQSSVVTIIQNSLIQIQSLEFEQNQSNNGGSLFISSSQ
LIISQSFFKGDKSILNGGSIYSQNSQLTIQQSQFYQCSSMIGGCIFAQEGNLNISQLLSQ
NNTATQLGGFLYINQLDQFILQDIDISNSISFGDGGSIYIQQSKGINSVIAKSTFLNNQA
KGSGGSILTDNSNFQIIQCKFQGNSAGIGGAIRYLNLKPAFMLNLKNNIQDTCNTYQNNE
CYNNTSLIFGNSIASYPCRASVLPSKYFNVHSEFPNISFSNFQSGLSNFDLVIVFFDEFN
NPINQIDFQNQTIINQLSSELFQEISQYSCRVHIQQVNSQLQNQTIKLDGAQFSQYQYLS
NQQIGCFINGLKITGIPSQSAIMNLQLYGMKAANKSNQFTDINDIQIKIQFRSCQTGEYY
NKICQNCLLQECVQCMNGTYSLIYPFEDKKIECKSCDMSKSYSCYSDQIILRENYWRINN
HSDLIYECNQVTNSCNGDSQKGYCADGFVGALCSSCDAYGKVWGQPYQFDNYSIKNGVQC
IKCSQYSSILLKELFAFTIISIYLIVLIIQSQDSNCKVCLMRILQSLDLLYVGVSSFLSD
NQVISKIFINQFQILSTLKYSLRINISQVFSNFLTIPQSASQPINVFTYSFDCILSQIKI
NIPIQYKRFINISLVLPLIFIISFFIFVYLILQGIKCLIPKQYFFYKTKYLRLNVLISAL
IVLTYIASQNIYQAALENIFCDKYSNVYYMKSQMDEICYTQEHYYYIFFLIGPVLFVVSV
VYPITMLIILYRNRFKLFDSKQKSINLIRRYGYLFKGFKKDRWWWEILKTWYKFLITFMA
TLYRSQPLPQILSIIFLQMIYLYLLMKYQPYQHYKINLLEKRSVIYTLLIFQISIVYLYN
SDGILSIFSQIGLIILLVILLGRLILSFIEVHSRVHFYAIGKIGCLRSICKYLRNHLQGE
KCKFWIKNYLFNNFWGLYNMLYIENYDPYRVFGNWKKLRLLFKNGNIKLTRVNNTSLTQQ
RSNKKTFQNQTINQNSSQTYNLSNYKRISLNNSIYSPKILQERDNSISPITQNTDYFQFS
NYSKQSFKTFTFQGLFTPKKINSPINSKCVLQAKNSEKDNQAPCVVFQNTNPLKQIKKQR
STYLNTECQSIFSPKRNSVNQQNILNQFQFEQDYSKSPISKITSPSQQLNGSNCNFKKQQ
NELQKLNINSKNIKKIRQLESYSSFSAINQNSNLFQSVNQQFFQPQYSNTPQTKDANTNQ
N
NT seq
4146 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgttttagctcatctataaaataaattgttgataacttaataaatactttaagat
actatatgtttagagaacatataaatataaagcattaaaattactaaaccatctttatat
cctatagtctctattagaagctcttaaatttatcttaattaaagctcagctaagaataat
attgcaaatttcactaattaaaattctttatttactctgcaagcagaaaacttactaatt
actaattcgacattaaattaaaattctggtttttaaaatttattgttgatataaaataca
taataaggaaatattcaatcattgatagtttctaataatttaattatggcagctttactt
ataagccaatctaatatataaatataagtatcttaaataaaataaaattaatctaaatct
gttaaatagtaaagttctgttgttacaattatacaaaattcattaatttaaatttaatct
ttagaatttgagtaaaattaatcaaataatggaggttcactatttatatcttctagttaa
ttaataataagctaatctttttttaaaggagataaaagcatactaaatggaggttctatt
tattcatagaattcttaattaactatttagtaaagttaattttatcaatgctcctctatg
attggaggatgtatatttgcataagaaggaaatttaaatataagttaactgctttcttaa
aataatacagctacataattaggtggctttttatatattaattaattagattaatttata
ttataagatattgatatttctaatagtatatcgtttggtgatggtggatctatatatata
taacaatcaaagggaattaattctgttatagcaaagagtacttttttaaataattaagcc
aaaggaagcggagggtcaatactgacagataattcaaacttctagataatacaatgtaaa
ttttaaggaaatagtgcaggtataggaggagccattagatatttaaatttaaaacctgct
tttatgctaaatttaaaaaataatatttaagacacttgcaatacttaccaaaataatgaa
tgctacaacaatacgtctcttatatttggaaactctatagccagctatccttgtagagct
tctgttttaccaagcaaatattttaatgtgcattcagaatttccaaacattagttttagt
aatttttaaagtggattatctaatttcgatctagttattgtattttttgatgagtttaac
aatccaatcaattaaatagatttttagaattaaacaataattaattaacttagttcggag
ttattttaagaaattagttaatatagttgtagagttcatatataataggtaaactcatag
ctataaaattagacaattaagcttgatggtgcataattttcctaatattaatatttaagt
aattagtaaataggatgttttataaatggcttaaaaattacaggtattccttcttaatca
gctattatgaatttacagctttatggaatgaaagcagcaaataaatctaattaatttacg
gatattaatgatatctaaataaaaatttaatttagaagttgccaaactggtgaatactat
aataaaatttgctaaaactgtcttttgtaagaatgtgtttaatgtatgaatggaacatac
tctttaatttatccttttgaagataaaaaaattgaatgcaaaagttgtgatatgtctaaa
tcatactcttgttactcagattaaataattttgagagaaaattattggagaataaataat
cattctgatttgatttatgagtgtaattaagttaccaattcttgtaatggagattcttag
aaaggatattgtgcagatgggtttgttggtgctttatgttcttcttgtgatgcatatggc
aaagtatggggataaccttattaatttgataattattctattaaaaacggagtataatgt
ataaagtgctcataatattcctctatattattaaaagaactgtttgcattcacaataatt
tcaatttatttgattgtattgattatttagtcataagatagcaactgtaaagtatgctta
atgaggatcttgtaatctcttgatctgctttatgtaggtgtctcatcatttttatctgat
aactaggttatatctaaaatatttattaactaattctagatactttcaactttaaaatat
agcttaaggataaatatatcttaagttttctctaattttttaacgatcccttaatctgca
tctcagcctatcaatgtttttacttactcatttgactgcattttaagctaaataaaaata
aatatacctatacaatataaaaggttcataaatatctctttggtgctccctttaattttc
attatttctttttttatttttgtatacttaatactttaaggtattaagtgtttaattcca
aagcaatacttcttttacaaaactaagtacttaagattgaatgttctgataagtgcctta
attgtactaacctatatagcatcttaaaatatttattaggcagcacttgaaaatatattt
tgtgataaatacagcaatgtttattatatgaagagctaaatggatgaaatatgctacacc
taagaacactattattatatttttttcctaataggtccagttttattcgtagtatcagta
gtctacccaattacaatgcttataatattgtatcgaaatagatttaaattatttgattca
aagcaaaaatctattaatttaattagaagatatggatatttattcaaaggttttaaaaag
gatagatggtggtgggagatacttaaaacctggtataaatttttaattacctttatggca
actctttacagatcataacctttaccttaaatattgagcattatctttctctaaatgata
tatctttacttacttatgaaatattaaccctatcagcattataaaattaatttattagaa
aaaagatctgtaatttatactctactaatattttagatatctatagtgtacctttataac
tcagatggaatcttatctattttttcataaattggattgataattcttttagtcattttg
ttagggagattaattttaagctttatagaagttcattcaagagtacatttttatgctatt
ggtaaaataggctgcttacgtagtatttgtaaatacttgagaaaccatctttaaggagag
aagtgtaagttttggataaaaaattatttattcaataatttttggggcttatacaatatg
ctgtatatagaaaattatgatccttacagagtctttggcaattggaaaaaactgagattg
cttttcaaaaatggaaatattaagttaacaagagtcaataatacatctttaacataataa
agaagtaataagaagacattctaaaattaaactataaatcaaaattctagttagacttat
aatctgtctaattataaaagaataagtttaaataattctatttattcccctaaaatttta
taagaaagagataattcaatatctcctataacataaaatactgattacttccaatttagt
aattattcaaagtaatcttttaaaacttttactttttaaggcttatttacccctaaaaaa
attaatagtcctattaattctaaatgtgttttataagctaaaaattcagaaaaagataat
taggctccatgtgtcgtattttaaaatactaatcctttaaaataaataaaaaaataaagg
agtacttacttaaatactgagtgtcaaagcattttttctccaaaaagaaactcagttaat
taataaaatattttaaattaattttaatttgaataagattattcaaaatctcctatatct
aaaattactagtccttcccaataattaaatggatcaaattgtaatttcaaaaaataataa
aatgaattacaaaaattaaacataaattctaaaaatattaaaaaaattcgttaattagaa
tcatattcatcattttctgcaataaattaaaattctaatttattctaatcagtaaatcaa
taatttttttaaccttaatattctaatactccataaacaaaagatgccaatactaattaa
aattga
DBGET
integrated database retrieval system