Tetrahymena thermophila: TTHERM_01025120
Help
Entry
TTHERM_01025120 CDS
T01020
Name
(RefSeq) PAS domain S-box protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PAS
PAS_9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7827900
NCBI-ProteinID:
XP_001009493
TGD:
TTHERM_01025120
UniProt:
Q22VB7
LinkDB
All DBs
AA seq
1363 aa
AA seq
DB search
MKSSQIFYFFQLKERIMKYYEDTFFNSNIENQKINMMDAIYFGDKINACKEKLKSVLLQS
GQFYDLLCGNYISLQSIEILALPLLKQKEDLDSNLVELFKINPNDLDLQYLACIYIQILD
FQNRKIPQIQKQAIGSLKLVQKQNRLKINQLIQNYLSAKNCVIFSSLLQNTYAINLVSNS
FSKIFGVTADLVLGKQLNILIPNAIKKDHNKMIQNFIDQDSMNIIERGERQVFAKDRDGF
IFPISLRIKIEMLNEDIGACILIQKINQQKQYVLFDEDGYVTDYSKKLYNDLFQPTIKQV
DDDQNIFNMIPSLQDIIQKKQMYTQFCSVLIAQKQQDKKVKSQNIQEHLIQTPYNNQTFY
SLNDDVFIIKFKFCQNQTKINVKMNFIEIDNYEKETNQSKKKKIIEELNRQLMYKEIQNN
LNKNVFNSIDNFNQVQQYSTDRQTYQNFESNGLVQKNQQQNQKQSIVNKLRSFKFNNQDI
TESEQNVTTNLEYKEEILTKYFSEQTDTNRFNQRHEVYECQGDSIEQINQNSDTQDITLN
RYKNINESKQIGLHKMLQMLNNDNTINFYTIDNNQSNFNLSQQKYSTIINDQNESNPIIS
GNSKYFFEQGNNNFDISLNQLQQNNNISEQICQQFKFNKNFNEHNAFDLESYQKTNQCTN
KSMSIEESSSNKKSKKSREVMENEEQKKEQQNEIASVNSSKYTSVDRIKGKMIKKIQEKI
FAKSLQIMVIAGFTASIALIAVTIIVYLQNLNSLDNFVDSFLKIDGAIFCFIDVMKVLAW
SNYQVLFGFQDFILDSLDLLNQENIQVSYQLNSIISDYNNNFQQLVLNNNSQKQLNQLQN
IPFLIQIYPPYFYYPSLVQSTKIISYYQNLQYTIMQFFYEIIFYIINYQEQQESFIWANI
VQFKNSMIDLQLIVENYAQTQFNNMNQQQISVITIVGLLSFFMIFSIIPLNTYIQMKREK
MMKLFGTFQPQILDFQIQLIELAIYKIDKTKMITQTNKKAQSSVKSSKKQKSIYIKDLME
QTLQLKLQNKEDAQNKNNNFKQTDLIPKYIQRQQQSRNRSIASFNSLPKFNMIIIILGII
SVALLCIQPALNILQFKPFQTESNALLQDRIVLIDIFTLLMENQASHMEQILALAQSQVL
STTYYYTYLKNLTNQNEQTISQLPNLTTNLEIQRHNQNLFENFYKNILNQDVCQIRQNFT
QYFNSNVTQVTCESLYNGVLKRGLILSIKRVFQTYDELMEMYVMNDFGQQNDFFTQFQIQ
NSFINFKLLVQIISESVDAIRLYQNQSLQDYKSDLQQTLLQLFVAQLLIVLVVFLIGWLT
LFYSFVDQLQKTQSIFKVFHINVLYENEYIQQYFRQLQLNQKS
NT seq
4092 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcctcttaaatattttacttcttttaactcaaagaaagaataatgaaatattat
gaagatacttttttcaattcaaatattgaaaactaaaaaattaacatgatggatgctatt
tattttggtgataaaattaatgcttgcaaagaaaagcttaaatctgttttattacagagt
ggccaattttatgatttactttgtgggaattacatctcattataatctattgaaatttta
gctttgcccttgctaaagtaaaaggaagatttggattccaacttggtagaacttttcaaa
ataaatcctaatgacttagatctttaatatttagcatgcatttatatctaaattttagat
ttttaaaacagaaaaataccttaaattcaaaaataagcaattggtagtttaaaattagtc
taaaagtaaaatagattaaaaattaattaactaatttaaaattatttatctgctaaaaat
tgtgttattttttcttctcttttgcaaaacacatatgctatcaacttagtttctaactct
ttttctaagattttcggagttacggctgatttagttttaggaaagtaattaaatatattg
atcccaaatgcaattaaaaaagaccacaataagatgatataaaattttattgattaagat
tcaatgaatattattgaaagaggtgaaagataagtctttgctaaagaccgtgacggattc
atttttccaatatcgcttaggatcaagatcgaaatgctaaatgaagatattggagcttgt
atattaatttaaaaaataaattaataaaaacaatatgtactatttgatgaggatgggtat
gtcactgattactctaaaaaattatacaatgatttatttcaacctacaataaagcaagtt
gatgatgatcaaaatatttttaacatgattcctagtcttcaagatataatatagaaaaaa
caaatgtatactcaattttgcagtgttttgattgcataaaaatagtaagataaaaaagtg
aaatcacaaaatatataagagcatctaatttaaaccccttacaataattagacattttat
tcgttgaatgacgatgtatttataatcaaatttaaattttgttaaaatcaaactaaaatt
aatgtcaaaatgaacttcatcgaaatcgataactatgaaaaagaaacaaatcaaagtaaa
aagaaaaaaataattgaagagttaaataggtaattaatgtacaaagaaatacaaaataat
ttaaataaaaatgtatttaacagtattgataatttcaattaggttcaataatattcaact
gataggtaaacttattaaaattttgagagcaatggccttgtctaaaaaaattaataataa
aattaaaaacaatcaatagtaaataaacttagaagttttaaatttaataattaagatata
acagaaagtgaataaaatgtaacaacaaatcttgaatataaggaagaaatattaacaaag
tatttttctgagtaaactgatacaaatagatttaattaaagacatgaagtttacgaatgt
taaggagatagtatagaatagatcaattaaaatagtgatacctaagatattacattaaat
aggtataaaaatataaacgagagtaaataaatagggcttcataaaatgctttaaatgtta
aataatgataacacaattaatttttatactattgataataactaatcaaactttaattta
tcttaataaaaatattctacaattataaatgattaaaatgaatctaacccaatcatctca
ggaaattcaaagtacttttttgaacaaggaaacaataattttgatatttctttaaattaa
ttgcagcagaataataacatatcagaataaatatgttagcaatttaaatttaataaaaat
tttaatgaacataatgcttttgatttagaatcttactagaaaacaaactaatgtacaaat
aaatccatgagcatagaagaaagttcgtcaaataaaaagagcaaaaaaagtagagaagtt
atggaaaatgaagaataaaaaaaagagtaatagaatgaaatagctagcgtgaattcaagt
aaatatacttcagtagatcgcattaaaggaaaaatgataaaaaaaatctaagaaaagata
tttgccaaaagtttatagataatggtaatagctggttttactgcttcaattgctttaatt
gcagttactatcatagtttacttatagaatttaaatagcctagataattttgttgattct
tttttaaaaattgatggtgctattttttgtttcatcgatgttatgaaagtattagcttgg
tcaaactattaagttttgtttggtttttaagattttattttagatagcttagatttgctg
aattaagaaaatattcaagttagttattaattaaattccataatttcagattataataat
aacttttaacaacttgtattaaataataatagttagaaatagcttaattagctataaaac
attccttttttaatatagatatatcctccttatttttattacccttctttggtataatca
actaagattatatcttattatcagaacttacaatacaccataatgcaatttttttatgaa
atcatattttatattattaattactaagaataataagaaagttttatttgggcaaatatt
gttcaattcaaaaacagtatgatagatctttaattaattgtcgagaattatgcctaaaca
taatttaacaatatgaactagtaataaatttcggttatcacaatagttggtcttcttagt
tttttcatgatattctcaataatacctttgaatacttatatttagatgaaaagagaaaaa
atgatgaaactgtttggcacattttaaccacaaatccttgattttcagatttagttgata
gaacttgcaatttataaaatagacaaaactaagatgataacttaaactaataaaaaagct
caatcaagtgttaagtcttctaaaaagcaaaaaagtatttatattaaagacctaatggaa
taaacactatagttaaaattataaaacaaagaagatgcttaaaacaaaaataataatttt
aaataaacagatttaatccctaagtatattcaaagatagtagtaatctagaaatagatca
atagcttcgtttaatagcttacctaaatttaatatgataattattatattaggaataata
tcagtagcactactatgcatctagcctgcattgaatattttgcaattcaagcctttttaa
accgaatcaaatgctcttttacaagacagaatagtattaattgacatcttcacgttgctt
atggagaattaagcttctcatatggagtaaattttagctttagcacaatcttaagtactt
tctaccacatattattacacatatctgaagaatcttacgaattagaatgagtaaactatt
tcataattaccaaatttaacaacaaatttagaaatttaaagacataattaaaatttgttt
gaaaatttttataaaaatatactaaattaagacgtgtgttaaataagataaaactttaca
taatattttaactcaaatgtgacttaagtaacatgtgagagtttatataatggagtatta
aaaagaggattaattttatcaataaaaagagtatttcaaacgtatgacgaactgatggaa
atgtatgttatgaatgactttggtcaataaaatgacttttttacttaattccaaatttag
aattcttttataaattttaagctgttagtgtaaattatatctgaatctgtagacgctata
agattatattaaaatcagtctttgtaagattataaaagtgatttacaacaaaccttactt
tagttgtttgttgcttaattacttatagtcctagtagtatttttgattggttggctaaca
ctcttttacagttttgtggattaattacaaaaaacttaaagcatctttaaagtttttcat
attaatgtactgtatgagaatgaatatattcaataatatttcagatagttgtaattaaat
taaaaaagttga
DBGET
integrated database retrieval system
