KEGG   Tetrahymena thermophila: TTHERM_01113080
Entry
TTHERM_01113080   CDS       T01020                                 
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet  Tetrahymena thermophila
SSDB
Other DBs
NCBI-GeneID: 7838726
NCBI-ProteinID: XP_001025942
TGD: TTHERM_01113080
UniProt: Q24D44
LinkDB
AA seq 1989 aa
MSSKSNNKNSLDHSVPSPKKNQSSNYYSQLLGRTNSHLHSGFMSPQINSINAIHQSQTAM
TNSVQVSSILYSSQNQNSINSAFQNSANIGTAINSIQNIPINIESSQKNTSQVNSSTAQS
NMNNSNNNYKLTDILSTRYSSGTLKLIRNGQTSVSSNPRQLSSDARQFDGGGSQHSNSNQ
DFNHSPANIHNNKQATLNNVQLSQSSFNNTNIPSSNFSSIGSATSQKQQLMNKVKIQLSS
QQQQKNQQFTTQPHSQNVHNIHTGYGTHSTTNQNIQSNAISPRTFSNLVQDKLMRSKLQS
SQQLQTNALGSSQSSVKDTNKNALSQSKRPKSLKQIENEYNSNSQNHQMIHEQNMNILAG
MTSNNRNGSEKNLLRSQQMAGQIVSQNVPAQQQINQQQNQYQQHVQQIQASKIMLMQQQN
NAHNSAIASEQLNNLINTQTKITNTMTPSTQTQASQKQEINMTKHQTSHSVEKFRGQSES
LDTHNRQQETAVHQVQKAVGNKQPLKKVSTTIPETSKNRNKKNNEFNQINNNYRGSFSKK
QQQNSTLQTNLSSSQHGITLHQNNQNSNQQQLNNTSNNTNNNYMISNINNQANQGLSNSY
VNNHLIANSSKQTLTAITQRIQQNLNTLTDPIHSNKAATTHQNINNQQVINNQQSKQNNL
QNIDDIINKVEINQQDMMKYEKRESSEKNSQPNQPNISPISSSKTHKQTNSLSESNKNSQ
QNTLQREDIQNYQQTLQHSINLLVNSTQINSKSSQQPQLEQINSNSNTPQGKLINQGHYK
HQTVQSKDGAKHQIYFMKEKDRVSKKNDYGQQKNKRKGEQSTPHSNSQGYPQILMSNSAL
NQSTQGQLALSALQKSSGSITNSVNHNLLSSNIMKYINKQTNKNEEHQLFEQPGLNQIQT
SQYLANTNKDSSSKQRESHVSQQNQNSEAENHHEKKSSLPEGNQTFKKVFASTEGSCYLW
DLKNQNDEIIPYISPKNITNYSSLTGQNKHQEKNMSSIQEVNSYQSIQNKNSSQNMSNSK
QLSNKHVVLSQNAFASPISPNLQNQNQQIGNSINQSKSINEDQLNSNATIQDKGKYFQAL
FNNLFIKDNKKHFLEKATAQDNVLASNSNSHQKSNTEQFNNLSQVNESTQKQLTKDYPQS
DQKLEEIPSMALSYNIKNQLKMQTSEIPQIKLYAASAETSPPLVGQNYNVEQITQPITQI
NSQFVCINPFNQLKSQVLRQGEQVIEKLKEAFQKDNQQNNNSRHNGAEVSSLNSSLVQIK
SRQSLYSQSECQLQNSNSKNNLQANLIENENNISFSQNKFQYNPNLEFKSIQKKTEIILD
RYKQNSIQQAQSIKESNIRISELNQILKEKDNQLQALQNLLKESENLIESQKQEVNEKNE
FIDLLKNQIQDILQNPQMYQTTPKNSGKTLQSFQNNNNNKINVVNNYVSSPSVANHSSHS
INSSSPKRLIKNNNYLQHPSLQPFNGAYYAQEGFANSCSNQQQVRLSLPVFPQKHFGLSA
ETPTNKQENCLFQSHKDLEESADFTGNKDNSLELLKRKYQINSLNKKYLNYNSIQVEMYG
SKSLQSSQKMHSNKDQQKGNHNQSPNNGDQENDPLNDSTKLLKQISKKSSNQHVQNLSNK
DIQLSDHSWPKQIQQQSLDFTKHNYDQNLNVNNSEQNKFIENHFNFGIQGSFSNLQTVEN
QEENIKHEFQNQQVHKQSEAFTQATPTNSQNQTLTNQKENQPNQRYQNRLFSTDQEDCQS
NKCSNNPFNQNDSFNTGFAHFGGSNEAEANSQNIDNSFKECCFGQQSNNEQIFSQSDFNS
NMMNVQNVVEQNQRLKSQNEEIISVSSKSSYCFKTASGCNSPNMNDSFNKKQSQIQSNEN
NLLKESSNFNQFNNSFNNNYKNEEEEEQEDQAAHVQFTNSSFSQIPDINQVQQNQLLSQN
NNRQSFSGDNQINISFEGGCGLVYQNDEKRIDEYEPIQYQNQEQQNEENQLQQEEDQQAG
ISFANQSFG
NT seq 5970 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcagtaaatctaataataaaaattctctagatcattcagtgccatctcctaaaaaa
aattaatcttctaattactactcttaattgctagggagaacaaattcacatttgcattca
ggatttatgagtccctaaataaattctattaatgcaattcattaaagctaaacagcaatg
acaaattcagtataagtttcaagtattttatattcttcttaaaattagaatagtataaat
tcagctttttaaaattcagcaaatattgggacagcaataaattctatttaaaatattcct
ataaatatagagagtagctagaaaaataccagtcaagttaatagctcaactgcttaatct
aatatgaataatagcaataataactataaactaactgatatattatctactagatactcc
tcaggaacattgaaattaataagaaatggataaacatcagtctccagtaatccaagatag
ctttctagtgatgctagataatttgatggaggtggaagccaacactctaatagtaattaa
gattttaatcatagccccgcaaatatacataacaataaacaagcaacattaaataatgtg
caattgagccaaagctcattcaataatacaaatatacctagctctaattttagcagtata
ggtagtgctacttcctaaaagcaatagctaatgaataaagtaaaaatatagttgtcttca
tagcagcaataaaaaaattaataatttactacacaacctcatagttaaaatgtacataac
atccacacaggatatggcacacattctaccacaaattaaaatatatagtcaaatgctata
tctcctagaacattttcaaatttagtctaggataaattaatgaggagcaaactctagagt
tcttagtagctttaaacaaatgctttaggatcaagttagagttcagtaaaagatactaat
aaaaacgctttaagtcagtctaaacgaccaaaatccctcaaataaatagaaaatgaatat
aattcaaattcttaaaatcattaaatgattcatgaataaaatatgaatatccttgcagga
atgacgagtaacaataggaatggaagcgaaaaaaatttattaaggtcctaataaatggct
ggataaatagtttcataaaatgtaccagcttaacaataaataaattaacaacaaaattag
tattaatagcatgtgtaataaatctaagccagtaagataatgttgatgtaacaataaaat
aatgcccataacagtgctattgcttctgaatagttaaataatttaataaatacttagaca
aaaatcactaacactatgactccttctacttagacataagcaagccaaaagtaagaaata
aatatgacaaaacatcaaactagccatagtgtagaaaagtttaggggataaagcgagtca
ttagatacccataatagataataagaaactgcagtccatcaagttcaaaaagctgtggga
aataagtagccactaaaaaaagtgtcaacaacaattcctgaaactagtaaaaatagaaat
aaaaaaaataatgaatttaattaaataaataacaattacagaggtagctttagtaaaaaa
taataatagaattctactctttaaactaatttatccagctcttaacatggaattacctta
cattaaaataactaaaattcaaattaacaataattaaataatacatctaataatactaat
aacaattacatgatttcaaatattaataaccaggcaaaccaaggattatctaatagttat
gttaacaatcatttaatagctaattcatcaaagtaaactctaacagcgattacacaaaga
atacaataaaatctaaatacacttacagatcctattcattcaaataaagctgcaactact
cactagaatataaataatcagtaggttatcaataattaataaagtaaataaaataatctt
caaaacatagacgatataataaataaggtagaaattaattagcaagacatgatgaagtat
gaaaaaagagagtcttctgaaaaaaacagttaacctaactagccaaatatatccccaata
agctcatcgaagacacataaataaacaaatagtctttcggaatctaataaaaacagttaa
taaaatacacttcagagagaagatatccaaaattactaacaaactttataacactccata
aatttacttgtaaatagcacataaattaactctaaaagcagttagtaacctcagttagag
taaataaattctaattcaaatactcctcaaggaaaattaattaattaaggtcactataaa
cattaaacagttcaaagtaaagatggagctaagcactaaatttatttcatgaaagaaaag
gatagagtttctaaaaaaaatgattatggctaataaaagaataagagaaagggagaatag
tcaactccacactcaaatagttagggttatcctcaaatattgatgagtaactctgcttta
aattaatcaacataaggacaactagctttatctgccttataaaaatcttcaggctcaata
acaaattctgttaatcataatttattgagtagtaatatcatgaagtacataaataaataa
accaacaagaatgaagagcattagttattcgaatagccaggattaaattaaatacaaact
tcttaatatttagcaaatacaaataaagatagctcctctaagcaaagagaaagccacgtt
tcttagtaaaattaaaactcagaagcagaaaatcaccatgaaaaaaagagttctttacct
gaaggaaattaaacttttaaaaaagtttttgcctctacagaaggtagttgttatctttgg
gatcttaaaaattaaaatgatgagatcattccttatattagtcctaaaaacataacaaac
tatagctcgctaacaggatagaataaacactaagaaaaaaatatgagcagtatataggag
gtgaacagctattaatcaatataaaacaagaattcttcataaaatatgtctaattctaaa
caattatctaataaacatgttgttctttcatagaatgcgtttgcatcacccatctctcca
aatttataaaactaaaattagcaaataggaaattctatcaaccaatcgaaatcaattaac
gaagattaattaaacagcaatgcgactatttaagataaaggaaaatatttttaagctttg
ttcaacaatctctttattaaggataataaaaaacactttttggaaaaagctactgcttaa
gataatgttcttgctagcaactcaaattctcattaaaagagtaatacagagtagtttaat
aacttatcttaagtaaatgagtctacataaaagtagctgaccaaagattatccctaatca
gattaaaaactagaagaaattccttcgatggctttatcttataatattaagaattaactt
aaaatgtaaacgagcgagattccatagattaaactgtacgcagctagtgctgagacatct
cctcctcttgtaggttaaaactataatgttgagtagataacttaaccaatcacctaaatt
aatagctaatttgtttgtattaatcctttcaattagctaaaaagttaggttttaagataa
ggagagcaagtaatagaaaaacttaaagaagcttttcaaaaagataactaataaaataac
aactcacgtcataatggagctgaagtatcttctcttaattcgtcattagttcaaattaag
agcaggtaatctttatattcataaagcgagtgtcaactatagaattcaaatagtaaaaac
aatttataagcaaatctaattgaaaacgaaaacaatatcagtttttcataaaataaattt
taatacaatcctaatctagaatttaaatccatctaaaaaaagactgaaattattttagat
agatacaaacaaaactctatctagtaagcgtaatcaataaaagagtccaacattcggatt
tccgaattaaattaaatcctaaaagagaaggataattaattgtaagctctttaaaatttg
cttaaagaatctgaaaatttaatagaaagttaaaaataagaagtaaatgaaaaaaatgaa
ttcattgatttacttaaaaattaaatttaagatattctctaaaatcctcaaatgtactaa
actactcctaagaatagtggtaaaactttgtaatcattttaaaacaacaacaacaataag
attaatgtagtaaataattatgtatcttctccttcagtagctaatcatagcagccactca
ataaatagctcttcaccaaagcgtttgattaaaaacaataattacctttagcatccaagc
ttatagccatttaatggggcatattatgcttaagaaggatttgctaattcatgttcaaat
taacaataagtaaggctttctcttccagtattcccttaaaaacattttggattatcagct
gaaactccaacaaataaataggaaaattgtttattttaatctcacaaagacttagaagaa
tcagcagacttcacaggaaataaagataattcattagaattattaaaaagaaaatattag
ataaattctcttaataaaaaatatttaaattataattctatttaagtagagatgtatgga
tctaagagcttataaagcagctaaaaaatgcatagcaataaagatcaacaaaaaggaaat
cataactaaagcccaaataatggagattaagagaatgatccacttaacgacagtactaag
cttttaaagtaaatttctaagaaaagctcaaatcagcatgtctaaaatctttcaaataaa
gatatttaactttccgatcattcttggccgaaataaatacaatagtagagtttagatttt
actaaacacaattatgattaaaatctcaatgtcaacaatagcgaataaaataaatttata
gaaaatcattttaattttgggatttaaggatctttttcaaatttataaactgtagaaaac
taagaggaaaatatcaaacatgaattctaaaactaataagtacataaacaaagtgaagcc
tttactcaagctacaccaactaattcctaaaactaaactttaacaaatcaaaaagaaaac
taacctaattagagatactagaatagactattctcaactgaccaagaagattgctaatca
aataaatgcagtaataatccatttaatcagaatgatagttttaatacaggatttgctcat
tttggaggatccaatgaagctgaagctaactcttagaatatagataatagtttcaaagaa
tgttgtttcggccagtaatctaacaacgagcaaatcttttcataatctgattttaatagc
aacatgatgaatgtataaaatgtagttgaacaaaattaaagattaaaatctcaaaatgaa
gaaataatcagtgtaagtagtaaatctagttattgttttaaaacagccagtggttgtaat
agtccaaatatgaatgatagttttaacaaaaaacaatcttaaatacaatcaaacgaaaat
aatcttttaaaagaaagctctaatttcaattagtttaataatagttttaacaacaactac
aaaaatgaagaagaagaagaataagaagattaagcagcacatgtttagtttaccaactct
tctttttcataaatcccagatattaatcaagtgtaataaaactaattattaagttagaat
aacaatagacaaagcttttcaggagacaattagataaatatttcttttgaaggtggttgt
ggtttagtttattagaatgatgaaaaaagaattgatgaatatgaacctatctaatattaa
aattaagaataatagaatgaagagaattaattacaataggaagaagactaataagcaggc
ataagctttgctaattaaagttttggctga

DBGET integrated database retrieval system