Tetrahymena thermophila: TTHERM_01124000
Help
Entry
TTHERM_01124000 CDS
T01020
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 26 containing protein
KO
K18466
vacuolar protein sorting-associated protein 26A/B
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Pathway
tet04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
TTHERM_01124000
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
TTHERM_01124000
Membrane trafficking [BR:
tet04131
]
Endosome - Lysosome transport
Rab GTPases and associated proteins
Retromer subcomplex
TTHERM_01124000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Vps26
AstE_AspA_cat
Pepdidase_M14_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7830528
NCBI-ProteinID:
XP_001030180
TGD:
TTHERM_01124000
UniProt:
Q22B38
LinkDB
All DBs
AA seq
2038 aa
AA seq
DB search
MVGFKLNIISISQKSSNPINQQNTLHIKNHSFLTLFQINHQQSFFGFGNSGANITIELDG
LEKRKKTTIRPKGQEPFKLPVYTGDDDISGLIDIRIKGKKLEHQGIRVELVGHIEVTYDN
KQNSDFMSMARELEPAGTLFEDKKFKFLFPKFEKTFETYYGKSAKVRYFLRVSINKQYNQ
KIVQTLDFAVVLPSQDSDKIETNPIKLEVGIQECLHIEFEFSKDKYHLKDCLIGKVHFLL
VKIRIKHMQLQVIRQEITLNNGVVNKDNEVLVDYEIMDGCPRKGEVIPIRLYLSGVDLTP
SYSESTSNKFQVKHFINLILIDDEGIIAKNNFLFQMLGYSQFALKKLQNPNELVESGKYQ
LDGKIKLKFIDLDIETMDLMMERKQESDYQLYWKSLNSQKRENLVYRGEEQEKKDHECIL
DEKNCRCKICGRCLKWTTYGIIRDLEPFEQKMKKMDIDYYKYESILNKINKQIELQQLLQ
DQKVFSIRNFTQFKNASQMRDFIYFTLCLPLSYGFTNQIKAYKDRQRFISRPSNFNLSFL
HNQNLLTDQIAQNNVIFSNTLQNAKNDANKNENQIKNLSQNNQYKAAYYSSTRFSLLIQN
DKQIQPPLSIRDLQIEGNQHPDFEIFGDFECANFLHAYYDPKNLKVQIILKADTNTDGFT
SWFYFGLKVKTNEPLRLNFEILNCRKEKSLFQQGMNVCIARLNDNMIYSNFNNQLRTWRR
DMAFDIKYQQSTYPRKVFKRTSSFRILPVNDFVEVDNTFFPENPQIEERCTKILELKQAG
LDVSSQMDKFYNYKLKDKKFIKNYFHGLSFIYQFQINSKDSTILFSQAIPYTFSNLIEFI
ENIEATIKQQNPLFRYSFNNDTRVYTIDTFNFIYEKTIIGASIIGLPITEIQITSQNSVR
ALPIQKRPYIIIIARQHPNETPGSFVCQGFIKFLLSSEPEAISLRQMFIFKIIPMVNPDG
VVVGNSRASVKGVDLNRGWEFSDSNNYPEIHCIKQRIQQLNDENKSVYMFLDLHGHTVKP
GSFLLCTLKEDSSNLEWAKVRLFPKVIAENCKFFDISSCKYSFISTHKNCCAREYVWRDL
KVENSYTLETSFFGSKEVFNGLKIGDNLIIDQSDKSIKHFSVQDYEYIGQQVCKSILQFS
GCLTLMIEQAQLNEKLDIDEETLLTGQAPQELEIPQEELNKIQEMTISKKYQQNLQNLSS
DSSILRSTQIKSIFNKDSLSPKVKKNIKSASIALSQILRLKQMVDEKEKLKDIQLFTDHR
ADSLTISNQVSFQDIESEEYQQAITNQEDNQQQVIVNIDLMNQSSSKTEEQAKRVLNEMK
QSTQNDDKIQQKTISKEQSYPTNNQNKANQKSSLNKFQKYVLQTKEQIKVLFALKKGLEW
NKFYTQKDAEELKEFKEQKQQLKQNKEPRIEQQQLNQSSQSQAKADIEADLETDNANTND
EEVNLKQSGDKDSDSEPEDDCRKQNKHNGLSQNTQQSQQNISCNFRLQTDESEQTQSDKI
KNDNLQNELAYGQQNNQKQDNSDESLNKNGLNQDGIDLNGKQNEDSKKNKNEMGNNMNDN
INFKQKGRNTNGKKLRGDRDGVSGDENTKNQNLEKFFLQTSKYNFGQAFLQRNQIEKIKL
KSPFLPSQDEIFEAYSLKSPKNLQNLSMKKLMTDFNLTLFPNLSQQFNIEEERKNEMQQM
NIVNDNEQSENDESNINFRKISEIQIQDQFMFFDVSQKISLNTSPIISPINQNKLLDPQS
IQLNTENNQNKNLQQNEQKLFSNPSYDKSQGCQISQQDQISIENDYVIEEQQQNNTQKTN
KLQQDLHSLQLQKDYSIFKINKATSLKEGMENPLTVQTPLQNSIYGGIIAAIQQDPNSPA
QKSIYKQNSTLNKITIPSSQKQSSSPINKAIIAYRPPSGNVWNTAKGLRDANSPVFQSNK
QELQEDNQIDSSSQILSKTPTQKARSINQSNSQPSFRIKQNNVNKAYKDFIQQQQNKTQK
QSQPTELKRQQTSLKKQSSPSNSDERSQLSSQQQSQYYILRNSAINFSQAQSSQTYNS
NT seq
6117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaggatttaaattaaatattatttcgatttcataaaagtctagcaacccaataaat
tagcaaaataccttacatataaaaaatcacagttttctaacactattttaaataaatcat
taatagtcatttttcggttttggcaattcaggtgcaaatattactattgaattagatggt
cttgaaaagagaaaaaaaactactattagacctaagggataagaaccttttaagcttccc
gtttatacaggtgatgatgatattagtggtttaatagatattagaattaagggtaaaaaa
ttagaacatcaaggtattagagttgaactagttggtcatatagaggttacttatgacaac
aagcaaaatagcgattttatgagcatggccagagaattggaacctgctggtactttattc
gaagataaaaaattcaaatttttattccccaagtttgaaaagaccttcgaaacttactat
ggtaaatctgcaaaggttagatactttttgagagtaagtatcaacaaacaatataactaa
aaaattgtttaaacacttgattttgctgtcgtccttcctagctaagactcagataaaatt
gaaactaatcctatcaagcttgaagtcggtattcaagaatgtcttcatatcgaattcgaa
ttttctaaagataaataccacttaaaagattgtttgattggaaaggttcacttcttatta
gttaaaataagaattaaacatatgtaattgtaagttatccgtcaagaaatcactctcaat
aatggagttgtaaataaagataacgaagttttagtagattatgaaattatggacggctgc
cctagaaaaggagaagttattcccatcagattgtatctcagtggtgttgacttgactcct
tcttattcagaaagtacttctaataaattccaagtgaaacatttcatcaacttaatttta
attgatgatgaaggaattattgctaaaaacaacttcttatttcaaatgctaggttattcc
taattcgctctaaaaaagctgtaaaatccaaatgaattagttgaaagtggtaaatactag
cttgatggtaaaattaagttaaagtttattgatttagatattgaaacaatggacttaatg
atggaaagaaaataagaatcagactattaattgtattggaaatctttaaactcttaaaaa
agggaaaatttggtgtatagaggagaagaacaagaaaaaaaagaccatgagtgtattcta
gatgagaaaaactgtaggtgtaaaatatgtggtagatgccttaaatggactacttatgga
atcattagagatttagagccttttgaataaaagatgaaaaaaatggatatagattattac
aaatatgaaagcattttaaataaaataaacaaataaatagagttatagcaattattataa
gactaaaaagttttttcaattagaaattttacttaatttaaaaatgctagttaaatgaga
gactttatttacttcacactgtgcttacctctaagctatggatttactaattaaattaaa
gcatacaaagacaggtagagatttatatcaagacctagcaactttaatttatcatttcta
cacaattaaaatttattaacagatcaaatagcttaaaacaatgtcatattttccaataca
ctttagaatgcaaaaaatgatgccaataaaaatgagaactaaataaaaaatcttagttaa
aataatcaatacaaagcagcttattactcttcgactagattcagtcttttaatttaaaat
gacaaataaatttaacctcctcttagtatcagagatctttaaatagagggtaatcaacat
cctgactttgaaatatttggagattttgaatgtgctaattttttgcatgcctactatgat
cctaaaaatttaaaagtttaaattatattaaaagctgacactaatactgatggctttact
tcttggttttattttggtttaaaagttaaaacaaatgaacctttacgtctgaattttgaa
atactgaactgcagaaaagaaaaatctttatttcaataaggtatgaatgtttgcattgct
agactcaacgataacatgatttacagcaattttaacaattaattaagaacttggagaaga
gacatggcttttgatattaagtatcaataatctacttatccaagaaaagttttcaagagg
acgtcttcatttagaattttaccagtaaatgactttgttgaagttgataatacatttttt
cctgaaaatccttaaattgaagagagatgtacaaagattttagagttaaaacaagctgga
ttagacgtttcaagctaaatggataagttttacaattataaattaaaagacaaaaagttt
attaaaaactattttcatggactttcatttatatattaattttaaattaactctaaagat
tctactatcctattctcgtaagctatcccttacaccttctcaaatttaatagaatttata
gaaaatatagaagcaactattaaatagtaaaatcctttgttcaggtactcttttaataat
gacacaagagtttatacaattgatacttttaattttatttatgaaaagacaataattggc
gcttctattataggtttgcctattacagaaatacaaataacatcataaaactctgtaaga
gcccttccaatttaaaagaggccatacataattataatcgcaagataacatccaaatgag
actccagggagctttgtttgctaaggctttataaaatttttactcagctctgaacctgaa
gctatttcattaagataaatgtttattttcaagatcattccaatggtaaatccagacgga
gtagttgtgggaaacagtagagcctcagtaaagggagttgatttgaatagaggatgggaa
tttagtgatagcaataattacccagagattcattgcataaaatagagaatttaataatta
aatgatgaaaacaaaagtgtatatatgtttttagatttacatggtcatactgtaaaacct
ggtagctttttattgtgtacattaaaagaagattcttcaaaccttgaatgggcaaaggtg
cgtctctttccaaaggttattgctgaaaattgcaaattttttgatatcagtagttgcaaa
tattcttttatatcaactcataagaactgttgtgcacgtgaatatgtttggagagacttg
aaagtagaaaattcttataccttggaaacctcattttttggaagtaaagaagtttttaat
ggcctaaaaataggtgataatttgattattgatcaatcagataaatcaataaagcacttt
agtgtttaagattatgaatatattggatagtaagtttgcaagtctatattacagttttct
ggctgccttacgttgatgatagagtaagcctagttgaatgaaaaattagacattgatgaa
gaaactttattaacagggcaagctccataagaattggagatccctcaagaagaattaaat
aaaatataagaaatgactatttcaaaaaagtattaataaaatctttagaatttaagcagt
gatagctctatattaaggtcaacttaaataaaaagtatctttaataaagactcattgtca
cctaaagttaaaaagaatataaaatcagcttcaatagctttgtcttaaattttaagattg
aaatagatggttgatgagaaagaaaaattaaaagacatttagctctttactgaccataga
gctgattcattaacaatatctaattaagtaagtttctaggatatagaatcagaagaatac
tagtaagctatcacaaatcaagaagacaatcagtagtaagtgatagtaaatatagatttg
atgaattaaagctcatcaaaaacagaggagtaagctaaaagagttttgaatgagatgaaa
caaagtacataaaatgatgataaaatttaataaaaaactatttctaaagaataatcttat
cccacaaataactaaaataaagctaatcaaaaaagttctttgaataaattttaaaagtac
gtgctttaaactaaagagcaaataaaggttctttttgcattaaaaaaaggtttggaatgg
aataaattttacacctaaaaagatgctgaagaacttaaagaatttaaagagtaaaaacaa
caactaaagcaaaacaaagaacctagaattgaataataataactcaatcaatcaagttaa
agtcaagctaaggctgatattgaagcagatcttgaaactgataatgctaacacaaatgat
gaggaggttaatttaaaacaatcaggtgataaagatagcgattctgaacctgaagacgac
tgcagaaaataaaataaacataatggtttaagttaaaatacttaataaagctaataaaat
attagttgtaattttagactttaaacagatgaatcagaataaacttaatctgataaaata
aaaaatgataatttataaaatgaattagcatatgggcaataaaataattaaaaacaagat
aactcagatgaatcattaaataaaaacggtttaaattaagatggcattgatctaaacggg
aaataaaatgaagatagcaaaaaaaataaaaatgaaatgggtaataatatgaatgacaat
attaattttaaataaaaaggaagaaatacaaatggcaagaagttaagaggtgatagagat
ggagtatctggtgatgagaatactaaaaattaaaatcttgaaaaatttttcctttaaact
tctaaatataattttgggcaggcatttttatagagaaattaaatagaaaaaattaaatta
aaatctccctttttgccctcataagatgagatttttgaagcttattccttgaaatcgcca
aaaaacttacagaatttaagcatgaagaagttgatgacagactttaatctcacccttttc
ccgaatctatctcaacaattcaatattgaagaagaaagaaaaaatgaaatgcaataaatg
aatattgttaatgacaatgaatagtctgaaaatgatgaaagcaatattaattttagaaaa
atatctgaaatacaaatttaggactagtttatgttttttgatgtttctcaaaaaatatct
ttaaatacaagtcctataatatctccaatcaactaaaataaattattagatccttaaagc
atttaactgaatacagaaaataatcaaaataagaatttgtaacaaaatgaataaaaatta
tttagtaacccatcatatgataaaagttaaggttgtcaaatttctcagtaagatcaaatt
agtatcgaaaatgattatgtaatagaagaataataataaaataatacccagaaaactaat
aaattataataagatttacattctctacagttataaaaagattactctatttttaaaatt
aataaagccacttcactaaaagaaggtatggaaaatcctttgacagtttaaacaccttta
caaaattcaatttatggaggcataatagctgcaatacaacaagatcccaattctcctgca
taaaaatcaatatataaataaaactcaactttaaataaaatcactataccttcaagctaa
aaataatcctcatctccgataaataaagcaattattgcatacagacctccttcaggtaat
gtctggaatacagccaaaggattaagggatgctaattctcctgtttttcaaagtaataaa
taagaactttaagaagacaaccaaattgactcaagttcttagattttatctaaaacacct
acttaaaaagcaagatctataaactaaagcaattcgtaaccatcttttaggattaaataa
aataatgtaaataaagcgtacaaagattttatacaataatagtagaataaaacgcaaaag
taatcatagcctacagaattaaaaaggtagtaaaccagcctaaaaaaacaatcctcacct
tccaattcagatgaaagatcctaactatcttcttaataataaagttaatattatatttta
cgaaattctgcaataaattttagctaagcttaatcatcttaaacatataattcttga
DBGET
integrated database retrieval system