Tetrahymena thermophila: TTHERM_01132860
Help
Entry
TTHERM_01132860 CDS
T01020
Name
(RefSeq) piwi domain protein
KO
K02156
aubergine
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
tet03036
]
TTHERM_01132860
Chromosome and associated proteins [BR:
tet03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
RISC (RNA-induced silencing complex)
TTHERM_01132860
piRNA pathway
TTHERM_01132860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Piwi
PAZ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7837671
NCBI-ProteinID:
XP_001027583
TGD:
TTHERM_01132860
UniProt:
Q24HU6
LinkDB
All DBs
AA seq
775 aa
AA seq
DB search
MNKLSKRPIISYDQSNQQEGSFLKQVQLRTNLFQMSNTINTKNDVQQQIIIYHYSIKIIP
STCIRVKKLLWQARELLQNVYGRNFISNQEIYSFKKVEENQKIYIEIENIIYCLKIFYRR
EIELNLTESNQINQNKTLQKKISSLAIQSISAIYKSVYKQFQKDILKQTGLAKNDCKQLD
HYNFQCFFREQINYRANLNEAILSDQNLSSLLKDVKNQKNVEDIILGKYVRMKHQLNKLY
QIQRIDYTKNPLSTFYCAKYKQNMTFQKYYKERYNLEIIDLNQPLFVVNIKKQSIQPIDQ
HIKYQEIYLIPEFCLIFFQLKPQKFNKIKQIQVNLRQKIYYLKFLQKLQHETGIQISKES
CTVNAYALNPPKLIFQKNKKFIDLKNSKTNFNISNQILSNISFKEWIFIYPKSDANLCLQ
LSQQIQEQGQVLGIRIPQPTMIQMKRHNLSDGINLLENYFLVNQVPQFILSYVNFNHPRQ
QTFYQELKLYLYATVAIEHQHFNDDFSCHKNKNAAISSLIIQIASKLGYPLWQTHIPNQI
FNKTMIIAIAVEQKTLHLNKQQQMIAVVTTISKDFTQMHSEIFFNEIQNGPISILSKIIL
SSIKNYVLNTKQLPDQIIIYRQGLIEPSLQIEKESIINGFRLFKEDYQPKFAYFCVSQSK
KQQIFSQSDQKMDITGSVIPLVQNNQVKFEFFLCSKIIQEGFSIPTRYSCLYDDTLISQE
QHWQFTYYQCFNYFNFQGALKIPAQLKYACKLLKFRKYVMEIDPSKDLKQSFYYI
NT seq
2328 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagttatcaaaaagacctattatatcatatgatcaaagtaattaacaggaaggt
agctttttaaaataagtctaattgagaactaatttattctaaatgagcaatactataaat
acaaagaatgatgtttaataataaataattatttaccattacagtataaaaataattcct
tctacttgcataagagtgaaaaaacttttatggcaagctcgagaactgttataaaatgta
tatggtagaaactttatctcaaatcaagaaatttattcttttaaaaaggttgaagaaaat
tagaaaatatatatagaaattgaaaatattatttattgcttaaaaatattctatagaaga
gagatagaattaaatttaacagaaagcaattaaataaattaaaataaaactttataaaaa
aagatatctagtctagcaatataaagtataagcgctatttacaaatcagtttataaataa
tttcaaaaagacattcttaaacagactggacttgctaaaaatgattgcaaacaattagac
cattataatttttaatgcttttttagagaatagattaattatagagcaaatttaaatgaa
gcaatcttgagtgattaaaatcttagctccttgctaaaagatgttaagaatcaaaagaat
gttgaagatattattttaggaaaatatgtgaggatgaagcactaattaaacaaactgtat
taaatataaagaattgactatactaagaatccactaagtacattctattgtgcgaagtat
aagtaaaatatgacattttagaagtattataaggaaaggtacaacttagaaataatagat
ttgaattagcctttgtttgttgtaaacataaaaaaacagtcaatttagcctatcgattaa
catattaaatatcaagaaatttatttaattccagaattttgtttgatttttttccaacta
aaacctcaaaaattcaacaaaattaaacaaattcaagttaatttgagataaaagatttat
tatctaaaatttttataaaaattacaacacgaaacaggaatataaattagcaaagaaagt
tgcactgtaaatgcatatgcattaaatccaccaaaattaattttttaaaagaataaaaaa
tttattgatttaaaaaattctaaaactaattttaatatatccaactaaatattaagtaat
atatcattcaaagaatggatttttatatatccaaaaagtgatgcaaatttgtgcttataa
ttatcataataaatttaagaataaggtcaagtgctaggaattagaattcctcaaccaact
atgatataaatgaaaaggcacaatctttcagatggaataaatttattggagaattacttt
ttagtgaattaagtaccttaatttattctttcttatgtaaattttaaccatccaagacaa
taaactttttactaagaactgaaattatatttgtatgctactgtagccattgagcactag
catttcaatgatgatttttcttgccataaaaataaaaatgctgctatttcttctctaatt
atctaaattgcttctaaattaggatatcctttatggtaaacacacattcctaatcaaata
tttaataaaacaatgatcatagcaatcgcagtagagcaaaaaacactccatcttaataaa
taatagcaaatgatagcagttgttaccacaataagcaaggattttacttaaatgcactca
gagattttttttaatgagatataaaatggaccaatttcaatactctctaaaattattttg
agctctataaagaattatgttttaaatacaaaacaacttcctgattaaataataatatat
agataaggtttaatagaaccttccttataaatagaaaaggaatctattataaatggtttt
aggctttttaaggaagattattaacctaaatttgcttatttttgtgttagttaatccaaa
aagcaatagattttctcttaaagtgactaaaagatggatatcaccggaagtgtaattcct
ttggtacaaaataattaagtgaaatttgagttttttctttgttctaagattatctaagaa
ggttttagcataccaacaagatattcatgcttatatgatgatactttaatctcataagag
tagcattggcaatttacttattactaatgcttcaattactttaattttcaaggagcatta
aagataccagcacaacttaaatatgcttgtaagctattaaaatttagaaaatatgttatg
gaaattgatccatccaaagacttaaagcaaagcttttactatatttga
DBGET
integrated database retrieval system