Tetrahymena thermophila: TTHERM_01184230
Help
Entry
TTHERM_01184230 CDS
T01020
Name
(RefSeq) cation channel family protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
cNMP_binding
Ion_trans_2
Ion_trans
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7844573
NCBI-ProteinID:
XP_001019464
TGD:
TTHERM_01184230
UniProt:
Q23RR6
LinkDB
All DBs
AA seq
1407 aa
AA seq
DB search
MKLNIQRLNFEKTQKMHNEMVEIFHSRLVEKSLTEDESRAKNISINTNRSSFQDTTSIQI
QQQEATLSDKMASIVQQFDGKKRLKYQNESQQNDNAENQKATSIFYAQNQTQSDKNDDYS
KQEQSSQMLYSLNISVQNDKKSLQNQYELDQESKSHIEQEQNLNNSQMQLNITSIHPSFR
ANGQHNRLDNSCEKNEFEQIEKNQIHKPVSSQSKQITEAQQDISKSIQLSGNNSKQLNQK
ENEIIQDDSKLSFSMQNQSQLSSKFNEQQCKKQKQTMTSQFVSKKKVSRKPTENEKQFNQ
KKLKNSNFFHIIMKMKSYAYRIASNVESKRLAILQRQNFFYLRDKTINYEKQEKEDFEFY
DYNLIQKTIRWILEQAKTYLVTKKMIKSFPVIPLFQPQSIWKFVWDIFNMIITILFFFFL
PLHFIYNIQFSSIFYLQDLDIFLVTITTLDIFINLNTVSYRKGNLLNSRSLILLEYFSKN
GLLNIFFVIILWIIVASQRSQIVFIQNYKVNVFLFIVAIFKVLKQNSFKNRIYDRFYLRK
INRGFINLMQIFFNLFIVCHLFACIWLVVGKLNQSEESILCAQQSQDNNYNNDNCTYTWL
DKLKGTHNLAFYEEYLRAYYFTTVTMITVGYGDITPVNSKEYLLSILTMLIACGMFGYSL
NSIGQILSEMQINNKEYDEHFNAIYGFMHKKNISPDLQVQVREYLQYFFIQSNQEDIKKQ
QKVIQLLPDTLQNQILLDANKIIFENSPLFRTNFSEQTIQKTIQIIEQREFIPGQKFIEQ
DAESENCIYFIEKGCVEIYNSNNNEELKLLHKGQQFGEVQFFTGQASQVSARSVEFTKLL
VIKRNSFLEIIQSSPLDLEKFCMIKDSIIFNKKLDMIGVFCYCCKSSSHLVTQCNFIHLQ
QDKYKIVKDYAKNNIQVRDKDIQRRNYSYDTLQIKQQIEENAKIFVEENIEDLCCYGWFN
DLIQQEFQDNLVQFNQNIRYQSYPSLKFINQNQNIQDAQVIKTIQNIQNQFTNKKISYQK
LKNMIEIQNLSSHPELNPSIAHIQQNFQNAFQLYNEENCQSPLTPYNINKKVQFSINSLQ
DNIQEESQGDCKSLYNQQCQFQQFIKQQNNFHQHQINSPEFNNLKSPCNRQRQFCNFTDM
CPSPYSANKNFQVNLNNTNCYHQQYQNNGQSNSNNYPGNNCLFQCTQQVNYNMPEVTNQL
ANIESQNQDTYSQQSKKDFNDGNNQSLKLINQTPSNQSTQKQQELINQRSNIKKNTLKTE
YINKRKNYHQISKQQSSIIFQRQTDDALIKQLKELVQTPHNLTAHQDFQFDTLKNYSIYL
PHNNSERVLLLYSVFMRKNKKILQMYKTKKSINKNEDTQNNLKSQIQNFSDNSKKSTQNY
QNLLIQSQFEKNSEFLNEEQKNNNKTS
NT seq
4224 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttaaacatttaaagattaaattttgaaaaaacttaaaaaatgcacaatgaaatg
gtagagattttccattcaagattggttgaaaaatctttaacagaagacgagagtcgagca
aaaaacatatctataaatactaatcgatcatctttttaggacacaacatcaatataaata
taatagtaagaggctactcttagtgataagatggcaagcatagttcaacaattcgatgga
aaaaagagactaaaatatcaaaatgaaagttaataaaatgataatgctgaaaactaaaaa
gcgacttctatattttatgcttaaaattaaacttaatcagacaagaacgatgattattca
aagtaggaataatcatctcaaatgttgtattctttgaatatctctgtttaaaatgataaa
aaatctttataaaattaatacgaattagattaagaaagtaaatctcacatagaataagaa
tagaatttaaataatagttaaatgtaattaaatattacaagcattcatccttcatttaga
gctaatggttagcataatcgattggataattcctgcgaaaagaatgaatttgaataaatt
gaaaagaactagattcataaaccagtttcatctcaaagcaaacagataacagaagcctaa
caagatatctcaaaatcaatttagcttagcggaaataatagcaaatagttaaactagaaa
gaaaacgaaattatttaagatgatagcaaattatctttttcaatgcaaaattaatcttaa
ttaagctcaaaatttaatgaataataatgcaagaaatagaaacaaactatgacatctcaa
tttgtatctaagaaaaaagtatcaagaaaaccaacagaaaatgaaaaacaattcaattaa
aagaagttaaaaaattctaatttcttccatattattatgaaaatgaaaagctatgcatat
agaattgcgtctaatgttgaatcgaagagactcgcaatactttaaagacagaacttcttt
tatctaagagacaaaacaattaattatgaaaagcaagaaaaagaagattttgaattctat
gattataatttgatccaaaaaactattcgatggatattagaataagcaaaaacttatttg
gtcactaaaaaaatgataaaaagctttccagtaattccattgtttcagcctcaatctata
tggaaatttgtatgggatatatttaatatgataattactattttatttttcttttttctg
cctttacactttatctacaacatttaatttagctctattttttatttgtaagacttggac
atatttcttgttacaataactactttagatatctttattaatttgaatacagtctcttac
agaaaaggaaatcttctaaactcaagaagtcttattttgcttgaatatttttcaaaaaac
ggtcttttaaacatattctttgtcataatcctatggattattgtagcttcttagaggagt
taaatagtattcatttaaaattataaagtgaatgttttcttatttattgtggcaatattc
aaagttttaaaataaaattcattcaagaataggatttatgacagattttatttgagaaaa
ataaacagaggttttattaatttaatgcaaatattctttaatttatttatcgtttgccat
ttatttgcttgtatatggctagtagttggtaaattgaatcaaagtgaagaatctatttta
tgtgcttaacaaagttaagataacaattataataatgacaattgcacatatacttggcta
gataaattaaaaggcactcacaatttagctttctatgaagaatatctcagagcttattat
tttaccactgttactatgattactgtaggttatggtgacataactccagttaacagcaaa
gaatacttactttcaatattaacaatgttaatagcttgcggaatgtttggctatagctta
aattctatagggcaaattttatcagaaatgtaaattaataacaaagaatatgacgagcat
tttaacgcgatttatggatttatgcataaaaaaaatatttctcccgatttgcaagtccaa
gtgagagaatatttacaatacttctttattcaatctaactaagaagatattaaaaaataa
cagaaagtcatttaattattaccagatactctttaaaactaaatacttttagatgctaat
aaaattatatttgaaaactctcctcttttcaggacaaattttagtgaacaaacaatttaa
aaaacaatataaatcattgaacaaagagagttcatacctggataaaagtttattgagtaa
gatgcagaaagtgagaattgtatttattttatcgaaaaaggatgtgtagaaatatataat
agcaataataacgaagaattaaaacttctacataaaggataacaatttggagaagtttag
tttttcactgggcaggcaagttaagtttcagctagaagtgttgagttcacaaaattattg
gttataaagagaaatagctttttagagataatttagagttctcccttagatttagaaaaa
ttttgcatgattaaagattcaattatttttaataaaaaactagatatgattggtgtattt
tgctattgctgcaaatctagtagtcatttagttacttagtgcaattttattcacttatag
caagataaatataaaatagttaaagattatgctaaaaataatattcaagttagagacaaa
gatatttaaagaagaaattactcatatgatactctttaaataaaatagcaaattgaagag
aatgctaaaatatttgttgaagagaatatagaagatttatgttgctatgggtggtttaat
gatcttatttagcaagaattttaagataatttagtctaattcaatcaaaatataagatat
caaagttatcctagtttaaaatttataaactaaaatcaaaatatttaggatgcttaagtt
attaaaacaatttagaatatataaaattaatttacaaataaaaaaatatcatattaaaaa
ttaaaaaatatgattgaaatataaaatttaagctcacatcctgaacttaatccatcgata
gctcacatttaataaaacttttaaaatgctttttaactttataatgaagaaaattgctag
agtcctctaacaccttataatataaacaagaaagtacaattttctataaattccttacaa
gataacatctaggaagagagttaaggagattgcaaatctttatataattaatagtgttag
ttttagtaatttataaaataataaaataattttcactaacactaaataaattcacctgaa
ttcaataatcttaaatcaccatgtaataggcaacgctagttttgtaactttacagatatg
tgtccttctccttattcagcaaataaaaatttttaagttaatttaaacaatacaaattgt
tatcattaacaatatcaaaataatggataaagtaattcaaacaactatcctggaaataac
tgtttattttaatgcacataataagttaattataatatgcctgaagtgacaaatcaatta
gctaatatagagtcatagaattaagatacttactcttaataaagtaaaaaagattttaat
gatggtaataattagagtctcaaattaatcaatcaaacacctagcaactaaagtacataa
aaatagtaagagttaattaatcaaagaagtaatatcaagaaaaacactctgaaaactgaa
tatattaataagagaaaaaattatcattaaattagtaaataataaagtagtattatattc
tagagataaactgatgatgctctaattaaacaattaaaagaattagtttagacacctcat
aatttaactgcgcatcaagacttttaatttgatacactaaaaaattactcaatttatttg
ccccataataattctgaaagagttttgttactttactctgtatttatgagaaaaaataaa
aagattttacaaatgtataaaacaaagaaaagtattaataaaaatgaagatacttaaaac
aatcttaaatcttaaatacaaaattttagtgataattctaaaaagtcaacccaaaattat
taaaatttgctcatttaaagttaattcgaaaaaaattcagaatttcttaacgaagaataa
aagaataataataaaactagttga
DBGET
integrated database retrieval system