Tetrahymena thermophila: TTHERM_01216140
Help
Entry
TTHERM_01216140 CDS
T01020
Name
(RefSeq) type III restriction enzyme, res subunit
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ResIII
Helicase_C
Ribonuclease_3
Ribonucleas_3_3
Dicer_dimer
Cas3-like_C_2
SH3_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7846721
NCBI-ProteinID:
XP_001009465
TGD:
TTHERM_01216140
UniProt:
Q22V99
LinkDB
All DBs
AA seq
2352 aa
AA seq
DB search
MDFSQFKDESSSESNFEEQDRVESFLKKNETILDYSSIDQIQQSFNSSDLAILQSIHNKI
GNQNSLLLKNIEIAQNPEGFNKNLNPGQKDVETKQIQKGEAIEDKQESLVSSQNQNKKVL
KNSQNSDLLNDQLEAPSLSNQKNQQDFLQEKSKLTSLNGQNIIQNQQYQNLEQKNQVKDN
IEEESLILSQPSNKQPIENNKSFNQQETLNTELQNQQNIISQQQFPITQQNIIQNQQNQN
LEQKNQVKSNIEEESLILSQPSNKQSIENNKNFKQQETLNTELQNQQNIISQQQFPITQQ
NISQKEESLILSQPSNKQPIENNKNFKQLETLNTELQNQQNIISQQQFPITQQNIIQNQQ
YQNLEQKNQVKDNIEEESLILSQPSNKQSIENQQFPITQQNISQNQLYQNQEQKMIIKDD
VASNTQENRMLPQLENQKITKNNQNGIQQPILPLLLSMQSNQQDQQSSFQSQKSTINSSN
GLKILQNQQYQNLELKNLDKQDIDQNNEDCSKKFQISNQQHFQNKQNCNLEQILPFPHFL
PSQSDQDLESIVIIDQSSKIDSSNGLNILQNQQCQNLEQKNLDKQDIAQNISDSSISSQK
DNQKLFQNNQNCIDESSVQSQRNQQTIIENVNQQETKTHYQSNQIKQQNEQMISLNQCLK
KQSENKIDYDNKLLNLQENQINYCQKKLITQQLSQQQNNNPIQQSNYQYNNNNNLNGSDQ
IQLQISQENISQQQSSNDNFTISSTQKQFGQKLLEDQKNIQNISNQIDCLDLDSQNIIQN
QEDENRQLQFSSEDEGDNEEKKTSQDQNILKQHQELLGEPISSISNVEIDSNSSFLDEFE
FLENKKHSALYQKSKNIKDFCNILKKQKQLKQQYVQIEPRDYQEEIFKNLIQNYGNYIIF
LETGTGKTLVSQMIAQYTLSKFKGSKVAFLANQVNLVEQQYNNFLTYQRSIEEYLVKQNL
SEEINQNINISFFHGKMNLDFWNRSFWQKNVEQSQIIFFSSQIFLNGLRRGHFQLTQFKL
IIFDECHNTSKEHAFSQIMKEFYFQVKKNDIVLKNTPNIIGLSATPITQGNKGNFNVRRE
MLKLAHNLDCQFINYDLQKVYAQLRNIKQTEKFYEVNMNENDYQYIESNNIKGFDQADKV
LYELQEQYPELKELYKQLQALSRLDNLASKAFTQILRKIINLLEEYIIILIYQIGVYVVQ
FFIFDILQELKGVNITAPKTLCMKQQLEDILQQFYEIFRAKYNNINNDLSNKSQVLLSIL
SKSEGISLIFCNSKVVVKYVTKFIQSVFQNSNSDQKCCEYIMGQTSQNKKDEEDDNNLKI
INSINPYEIQNLKSQSVQQAQNIIQQEKQFSIKFYALKQKYSEQQKIVERFRNKQFKILV
STSVVEEGFDIPSCNIVIAFSKIISQRQYIQMKGRARAENSKFYALVAVYNNNKIKLQNH
QIVSDQIKQEYYSLSLLTQKQFSQEKEKHQVNDEDDTSMENYENFIIPETNANVNTFWVK
EIVNQFCQSFCYNSQLDNRFPIVFDCLINERGQYLSLIILPFQLQANIFMNLQKLKFKKE
DAQRCAFMQAVKSLLKNKYISNELRPRHKSYKNFYFGRGEDDYYVEYSDRYFAIIQKNMQ
EVFVGYLNGKKRQIVVYKKLYRQIVDEVFVQKEQIQQREFHPFYLYDIQYKGELLQVKLI
YDKQCLEGFIHQDIKFIFHNQINLSNEELNEIRKINQQAHLKLLNLDKMNLEPKKIYTSK
CLIYKKTQILDYKNTEESVLINENVVFLYIMSDLNQNQIKEIKQINNHIDQIRDFLKLKI
ISEKISKKLNQEIIDFQNMQIEQLNVFIKPNFKLTGSLSKSNIKQDQKEIYPLQFENLLT
LTERDLIQIFQKKQLEKNLVFLGKQYFRFITSINVFNENFKTHYDILISELDMRFNDCFV
MSKAVESKFFKYLLIKDYVTLAPCLSIISQKLHTFVADQLTLQEKILIKNHQQNPLNYNM
AEIRNKQFTEIIYYIIGITINQNQNIFKNFEKYSSLFQPLLKSFNLIEKYSVLTKFVNIQ
PEQIQYKPDKQNLLNQFSQNSINYKFNNIGLLQQVFTHSSYKQDMVCSDLNKIFGTLEKS
LNDFITEIQKTEKRQSFIQLNDVSNDVLSFLGSIIFSQIVLKRLYTRYSQSNPNELDIFM
EIICCEQTKSFLSAKFKLDQYFIYGIQYQQIFQKINHAANFLRQQNIQSFRNIATNYNKD
ISILSQLFDSLVGAIYIDLQQDFEKTSDFFNQNQHIQLIIKDICQIADQYPKYSLIKVLK
QKGYDWEDIQIIKLPHPEQFLPINQNKYNFQIYDIKNEKLLIDKVFECQRIEEAYLAIKE
QIINNPINQQSL
NT seq
7059 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttcagtcagtttaaagacgaaagtagctctgaatccaattttgaagaataagat
agagtagaaagcttcttgaaaaagaatgaaacaattttagattatagcagcattgattaa
atttaataatcctttaattcatcagatttggctattttataatcaattcataataaaatt
ggtaatcaaaatagcttattgctcaaaaatatagaaattgctcaaaatcctgaaggattt
aataaaaatttgaatcctggacagaaagatgttgaaactaaataaatataaaaaggtgaa
gctattgaagataaataagaaagtttggtttcatctcaaaattaaaataaaaaagtgctc
aaaaatagctaaaattcagatttattgaatgatcaacttgaggcgccttctttatctaat
taaaaaaatcaataagattttttgtaggaaaaatcaaaattaacatcccttaatggataa
aatattatttagaattaataatattaaaatttagagtaaaaaaattaagtaaaagataat
attgaagaagaaagcttaattttatcttaaccatcaaataaataaccaattgaaaacaat
aaaagctttaactaataggaaacattaaatactgagttataaaattagtaaaatattatt
tcgtagtaataatttccaataactcaataaaatattatttagaattaataaaattaaaac
ttagagtaaaaaaattaagtaaaaagtaatattgaagaagaaagcttaattttatcttaa
ccatcaaataaataatcaattgaaaacaacaaaaactttaaataataggaaacattaaat
actgagttataaaattagtaaaatattatttcatagtaataatttccaataactcaatag
aatatttcttagaaagaagaaagcttaattttatcttaaccatcaaataaataaccaatt
gaaaacaataaaaactttaaataattggaaacattaaatactgagttataaaattagtaa
aatataatttcgtagtaataatttccaataactcaataaaatattatttagaattaataa
tattaaaatttagagtaaaaaaattaagtaaaagataatattgaagaagaaagcttaatt
ttatcttaaccatcaaataaataatcaattgaaaactaataatttccaataactcaataa
aatatttcttagaattaattatattaaaattaagagtaaaaaatgataataaaagatgat
gttgctagcaatacttaagaaaatagaatgttaccttaattagaaaatcaaaaaattaca
aaaaataaccaaaacggtatctaatagcctatattacctcttttattatctatgtaaagt
aattagcaggattaataaagtagtttttagtcataaaaatctacaataaattcctctaat
ggattgaaaatactttagaattaataatattaaaatttagagttaaaaaatctagataaa
taggatattgattagaataatgaagattgctcaaaaaagttttaaataagtaatcaataa
catttttaaaataaacaaaattgcaatcttgagcaaatattacctttccctcatttttta
cctagccaaagtgattaggatttagaaagcattgttataattgattaatcttcaaaaata
gattcttctaatggattgaatatcctttagaattaatagtgttaaaatttagagtaaaaa
aatctagataaataagatattgcttaaaatatcagtgatagttcaatatcgtcttaaaaa
gataaccaaaaacttttttaaaataatcaaaattgcatagatgaaagctcagtttaatct
taaagaaattaataaactattattgaaaatgttaattaacaagaaacaaaaactcattat
taatctaatcaaattaaatagcagaatgaataaatgatatcattaaattaatgtctaaaa
aaataatctgaaaataaaattgattatgataataaattattaaacctttaagaaaatcag
ataaattattgctaaaaaaaattaattactcaataactaagccaataacaaaataataat
ccaatttaataaagcaactatcaatacaataataacaataatttaaatggtagtgattaa
atttaactataaatatcttaagaaaacatttcataataataaagctcaaatgataacttt
acaattagctctacccaaaaatagtttggatagaaacttttagaagattagaagaatatt
caaaatatctcaaactaaattgactgtttagatttagatagttaaaacattatttaaaat
taagaagatgaaaatagataacttcaattttcatcagaagacgagggtgataacgaagaa
aaaaaaacttctcaagactaaaatatattaaaacaacattaagaattgttaggagagcct
ataagtagtataagcaatgtagaaattgatagcaattcgtcatttttagatgaatttgaa
tttttagaaaataaaaagcatagtgctctttattaaaagagcaaaaacataaaagatttt
tgcaatattctgaaaaaacaaaagtaactgaaataataatatgtctaaattgagcctaga
gattactaagaggaaatatttaaaaatcttatttaaaattatggaaattacattatattt
ttagaaacaggaacaggtaaaacattagtaagctaaatgatagcttaatacactctttca
aagttcaaagggtctaaggttgcatttttagcaaatcaagtgaacttagtggaataacaa
tataataatttcttgacgtatcaaagatcaatagaagaatatttagtcaaacaaaattta
tctgaagagataaattaaaatattaacatctcttttttccatggtaaaatgaatttagac
ttctggaatagatcgttttggtaaaaaaatgttgaacaatcacagattatttttttttct
tcttaaatttttttgaatggattgagaagaggtcatttccagctcacttaatttaaattg
atcatatttgacgaatgccacaatactagtaaagaacatgctttttcttaaattatgaaa
gaattttacttttaagtaaagaaaaatgatattgtcttaaaaaatacaccaaatattatt
ggattgtctgctactcctattacacaaggaaataaaggaaattttaatgtgagaagagaa
atgctaaaattagctcataatttagattgctaatttattaattatgatttacagaaagtc
tatgcacagttaagaaacattaaataaactgagaagttttatgaagttaatatgaatgag
aatgattatcaatacattgaatctaacaacattaaaggctttgatcaggctgataaagtt
ttatatgagctataagagtaatatcctgaattaaaggagctatataaatagttataagcg
cttagcagattagataatcttgcttctaaagcctttactcaaatacttaggaaaataatt
aatctcttagaagaatatatcattattttaatttatcaaataggtgtttatgttgtgcaa
ttttttatcttcgatatcttgtaagaactcaaaggtgttaacataactgcaccaaaaact
ctctgtatgaaacaatagctggaggatatcttacaataattttatgaaatatttagagca
aaatacaacaatattaataatgatcttagcaataaatcataagttttgctatcaattctt
tcaaaaagtgaaggtatttctttgatattttgtaatagcaaagttgttgtcaaatatgtc
acgaagttcatttaaagtgtattctaaaatagtaattcagactaaaaatgttgcgaatat
ataatgggataaacaagccaaaataaaaaagatgaagaagatgataataatttaaaaata
ataaatagcataaatccgtatgaaatctaaaacttaaaatcgtaaagtgtataataagct
tagaacattatacaacaagaaaaataatttagtatcaaattttatgcgctaaaataaaaa
tactctgaacaataaaagattgttgagagattcagaaacaaataattcaaaattttagta
agcactagtgttgttgaagaaggtttcgatattccttcatgtaatatcgtcatagctttt
agcaaaataattagtcaaagataatatatacaaatgaaaggtagagctagagcagaaaat
agcaaattttatgccttagttgctgtttacaataataataagataaaattataaaaccat
taaatagtgagtgattaaataaaataagaatactatagcttatccttattgacctaaaag
taatttagttaagaaaaagaaaagcattaagttaacgatgaggatgatacgtcgatggaa
aattatgaaaatttcattattccagaaactaacgcaaatgtgaatacattttgggttaaa
gaaattgtcaactaattttgtcaatcgttttgctacaatagttagttggacaatagattc
ccaatagttttcgactgtttaattaatgaaagaggttagtatttgtctcttatcatttta
ccttttcaactctaagcaaatatttttatgaatctccagaagctaaaatttaaaaaagaa
gatgcttaaagatgtgcttttatgcaggcagtcaagagcctattaaaaaacaaatatatc
tcaaatgagctaagaccgagacataaatcttacaaaaatttctattttggaagaggtgaa
gatgattactatgttgaatactctgatagatattttgctattatataaaagaacatgcag
gaagtatttgtaggatatttaaatggaaaaaagagataaattgttgtctacaaaaaactt
tatcgttaaattgtagatgaagtttttgtttaaaaagaataaatctaataaagagaattt
catcccttttatctctatgatatataatacaagggtgaattactttaagttaaacttatt
tatgacaagcagtgtttagaaggctttatccattaagatattaaatttatcttccataac
taaattaatttaagcaatgaagaattaaacgaaattagaaaaattaaccaataagctcat
ttaaagttattaaatcttgataaaatgaatcttgagcctaaaaaaatttacactagcaaa
tgtttaatttataaaaaaacataaatcttagattataaaaacacagaagaaagtgtgcta
attaatgaaaatgtggtttttctttacataatgagtgatctgaattaaaattagatcaaa
gaaattaaataaataaataaccacattgattaaattagagattttcttaaacttaaaatt
atttctgaaaaaatatcaaaaaaacttaactaagaaataattgatttttagaatatgcaa
atagaacaattaaatgtttttatcaagccaaattttaagcttactggttcgctctctaaa
tcaaatattaaacaagattagaaagaaatttatcctctttaatttgagaatctgttaacc
ttaacagaaagagatttaatctaaattttttagaaaaaataattagagaaaaaccttgtg
tttttaggaaagtaatatttcagatttataaccagcattaatgttttcaatgaaaacttt
aaaacacactatgatattttaataagtgaactagatatgagatttaatgattgctttgtt
atgtctaaagcagtagagtctaagttttttaagtacttgctgatcaaagactatgtaact
ttggctccttgcttgagtataatttcatagaaattacatacgtttgttgctgatcagtta
acattacaagaaaaaattcttatcaaaaatcattaataaaatccattaaattataacatg
gcagaaattagaaacaaataatttacagaaataatttattatataataggaattaccata
aatcaaaaccaaaacattttcaaaaactttgaaaaatatagctcattattttaacctctt
cttaaatcatttaacttgattgaaaagtatagtgttttaaccaaattcgtaaatatctaa
ccagaatagatttagtataaacctgataaataaaatttattaaattaatttagctagaat
tctatcaattacaaatttaataacataggtcttctctaataggtatttactcattcttca
tataaataagatatggtttgttcagatcttaataagatctttggaactctagaaaaatct
ttgaatgacttcatcaccgaaatataaaaaacagaaaaaagataatcttttatacagcta
aatgatgtttcaaatgatgtactttcatttttaggatctataatattctctcaaatagtc
ttaaagcgactttacacgagatacagtcaatccaatccaaatgaattagatattttcatg
gaaataatatgttgtgaataaacaaagtctttcttgtctgcaaaatttaaattagattaa
tacttcatttatgggattcaatattaataaatattttaaaaaataaatcatgcagctaat
tttttgagatagtaaaacatttagagtttcagaaatattgcaactaactataataaggat
ataagtattttatcttaactctttgactctttggtaggagctatatatatagacttacaa
taagattttgaaaaaacatcagatttctttaattaaaattaacacatataattaattata
aaagatatttgccaaatagcagattagtatcctaaatattctttaattaaagttttaaaa
taaaagggatatgattgggaagatattcaaattattaaattaccacatccagagtagttc
ttaccaattaattagaataaatataacttctagatttatgatattaaaaatgaaaaatta
cttattgataaggtttttgaatgccaaagaatcgaagaggcatatttggctatcaaagaa
taaatcattaacaacccaataaattaatagtctttatga
DBGET
integrated database retrieval system
