Tetrahymena thermophila: TTHERM_01247820
Help
Entry
TTHERM_01247820 CDS
T01020
Name
(RefSeq) PAS domain S-box protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PAS
bHLH_INO4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7841291
NCBI-ProteinID:
XP_001029910
TGD:
TTHERM_01247820
UniProt:
Q22AC7
LinkDB
All DBs
AA seq
1496 aa
AA seq
DB search
MQNQRLFQEFLNSSDLLQYKDQKFLKVIRILLDQAVLSQNNYLLRGQGINYEIIIQLHKK
QCAQNNQYCFCQKFRRNENKESLQIEELSEQHFRQEYAQLVILQLIEVFIQSSQKNNQRE
ISYLLKLSYLSYLYEIINNPTRALVQIQKISIYILNKTNKTSLINLFYFEQLKLQILNDY
QTKLFDSNIENQQLNMMETILFDDKINTCKEIFSSLLLQIGHFYDFLSGNNIQLHQLEEM
SVPLINLNQNLEQNIIELFQINPSDFDLKYLTSIYIQLIDFQNRRIKEFQQTALDISKQK
TDNQKKLVEIGQSSEKICVFFTSFIEKEFLIKKTSKEFDKIFGYSPEFIQGKQLNILIPN
LIKRQHNQMLQSFIDEQSMDIVYQGERNLFGLDKKGFIFPISLRVKIQVFENDLGVCALV
KKNKQIFSYIFFENEGVITDFSKRIFVDIFQSLGIQKQQQLNIFELIPSLEEIINTQQIN
KHISAVLVVKEQYSTFTSNNRFSQPKQVNNLLTQNDEIFQIQFRFFSRQTKNKVDVNYIE
IDFYSKETNPVKKSMILDQLNKQKIKKESLIFQKSEGQQTIEFANSQYQQCFSTKDFTYV
FDNSDQNPNKYKEDIKHYQNNFQKQQTEKSKSSKTTELTQNQNDTNKLTFQNSNNNYLRY
LSDQAFQKSSENSNINQRNYELKQLNLNGLSDKQNQELQLSMINSPNKVLTSAVDQTEMI
LSPAFSYQEKQQFLINQSNENYNLKLYSQQVQQNSNNLQEISLNNISSYQNLNRQHSKNN
IAHYQHIKQNSFFDNNFQRKKTTGEELSVNKRESRSFNNFREQDDQKQEQKNEIASVNSS
KYSTEEIMKRKMIQRIKKKDFNRGLQLMVLAGISAFVILSIVSLIIYFENLNSLDSFVLS
FLKIDHALYCFIDIMNFVALNNYQSVLGGQSLIIDKLDLQNQEYKQSDYQQQAILKDYSA
NLQNIVLNNDSTDQLNDLQNNLFQVQIYSSGFYNNNRVQKNSTTTFEQSLQYTLMQFFYE
IRYYYISFEESQEDFIWGNIVSFKQRMKNLQLIVENYATEQFNKMNLQQISAIVLFTSIS
AFLVFSVLPLNILIQIYKEKILKLFGTFQPSIIEFQIKQIELGLFKIEQINILEQTNNST
YSNKRSTSKRKQIQQVRDLNFYSNQQDQEQKYENKLNYQIPLYVQRKADKRTRQIASFSK
IPKFNFFLFFLGIIAVALLLIIPILNFVEFNPFERESKVTLNDRISLIDVLSLIIENQSP
QMEQVYLIAIGIPPQTSYYQSYIQNLQDQNNQVFQYFQNLTADLGVERNNQKIFMDFYQN
LLNENVCSVRENYPQYFNSNITQSRCNQLFNGILQRGLIFSIQKVFQTFQEIYQIYQIQD
IHVLIKSFKYLQKSYSFIEFKQLIQVISEVVNAIRQYQNEQLQQYEINLKQNLLYLFIIQ
LVIICLVFLIGWLYLFQWFRNQLQRATKIFTLFHINLLYENDFIQSYFRKISQKQS
NT seq
4491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtaaaatcaaagactattttaagaatttttaaatagcagcgaccttttataatataaa
gactagaaattcttaaaagttataagaatacttctagattaagcagtattaagctagaat
aactacttgttaagaggataaggaatcaactatgaaattataatttaacttcataaaaag
caatgcgctcaaaataaccaatattgtttttgtcaaaaatttcgaagaaatgagaataaa
gagtcattgcaaattgaggaattatctgagcagcatttcaggtaagaatatgctcagctt
gttatattataattaatagaagtatttatctaaagcagtcaaaagaacaactagagagaa
atttcttacttactaaaattatcatatttgagttatctttatgaaataatcaataatcca
actagagctttagtatagatttaaaaaatatcaatatatattttaaataaaacaaataaa
actagtttgattaatttattttactttgagtaattgaagctataaattttaaatgattat
taaacaaagctatttgactctaacatagaaaattaatagctaaatatgatggaaaccatt
ctatttgatgataaaataaatacttgcaaagaaatatttagttctcttttattgcaaata
ggtcatttctatgattttttgagtggaaacaatatttaattgcatcagttagaagaaatg
tctgtccctttaataaatttaaactaaaatttagaataaaatattattgagcttttttaa
attaacccttcagattttgacctaaaatatctaactagtatatatatctagctcatagat
ttctaaaacagaagaattaaagaatttcagtaaacagctttggatatttcaaaatagaaa
actgataattaaaaaaaattagttgaaataggctaaagttcagaaaaaatttgtgtgttt
ttcacatccttcatagaaaaagaatttttgattaaaaagacttcaaaagaatttgataaa
atatttggttacagtcctgagttcatccagggaaaatagctaaatattttaataccaaat
cttattaaaaggtaacacaaccaaatgctttagtcatttatcgacgaataatctatggac
attgtttattaaggtgaaagaaatctatttggcttggataaaaaaggttttatttttcca
attagtttaagagttaaaatacaagtttttgaaaacgatttaggagtctgcgctcttgtt
aagaaaaataaataaattttttcttacatattttttgaaaatgaaggagtaatcactgat
ttttcgaagagaatatttgtagacatattttaatctcttggaatttaaaaataacaatag
ctaaatatttttgaattaattccatctcttgaggagataatcaatacttaatagataaat
aaacatataagcgctgttttagttgtaaaagaatagtattcaacctttactagtaataat
cgcttttcacaaccaaaataagtgaacaatttattgacacaaaatgatgaaatttttcaa
atataatttagattttttagtcgtcaaacaaaaaataaagttgatgttaattatattgaa
attgatttttactcaaaagaaacaaacccagttaaaaaatctatgattttagatcaatta
aataaataaaaaataaaaaaagaatctttaatatttcaaaaatcagaaggctaataaact
atagaattcgccaactcttaatatcaataatgtttttctacaaaggatttcacctatgtt
tttgataattctgattaaaatccgaacaaatataaggaagatataaaacattattaaaat
aatttttaaaaatagcaaacagaaaaaagtaaatccagtaaaacaactgaattaacttaa
aactaaaatgataccaataaacttacattttaaaatagtaacaataattatctaagatat
ttatctgattaagctttttagaaaagctctgaaaattcaaatattaatcaaagaaactat
gagctaaaatagctcaatttaaatggattatctgataaataaaattaagaactttaatta
tcaatgattaattctccaaacaaagttctaactagtgctgtagattaaacagaaatgatt
ttatctcctgctttttcttattaagaaaaacaataatttctgataaattagtcaaatgaa
aattataatttaaaactttattcataataagtttaacaaaatagtaacaacttacaagaa
atatctctaaacaacatttcttcctactaaaatctaaataggtagcatagtaaaaacaac
atagcgcattattagcatatcaaataaaatagcttcttcgataataatttttagcgaaaa
aaaacaactggtgaagagttatcagttaacaaaagagaatctagaagttttaacaacttt
agagaataagatgattaaaagcaagagtaaaaaaatgaaatagctagcgtaaattctagt
aagtacagtactgaggaaataatgaaaaggaaaatgatacaaagaataaaaaaaaaggat
tttaatagaggattacagcttatggttttagcaggaatttcagcatttgttattttaagt
attgtatcacttatcatatattttgaaaatttaaatagtttagattcttttgttttatca
tttctaaagattgatcatgctctttactgctttattgatataatgaattttgttgcactc
aataattactaatccgttttgggaggttaatctttaattatagataagctagatctttaa
aattaggagtataaacaatcagattattaacaataagcgatattgaaagattacagtgct
aacttataaaatattgttcttaataacgatagtaccgattagcttaacgatttataaaat
aatttattttaagtttaaatttactcttctggattttacaataataatagagtttaaaaa
aactcaaccactacttttgaatagagtctacaatacactctgatgtaatttttctatgaa
ataagatattattatattagttttgaggagtcgcaagaagattttatttggggaaacatc
gtcagtttcaaataaagaatgaaaaatttacagttgattgtagaaaattatgcgacagag
taatttaataaaatgaatttgtagtagatatctgctattgttttatttacttctatcagc
gcatttttagtattttcagttttacctcttaacattctaattcaaatttacaaagaaaaa
attttgaagctatttggaacgttttaaccttcgataatagaattttaaataaagcaaata
gagcttggcctttttaaaatcgagtaaatcaatatcttggagcaaacaaataacagcact
tactctaataaacgatctacaagtaaaagaaagtaaatataacaagtaagggatttaaat
ttctattcgaattagtaagatcaagaataaaaatatgaaaataaattaaactatcaaatt
cctctttatgttcaaagaaaagcagataaacgaactagacaaatagcatcttttagcaaa
attccaaaattcaatttttttttattttttttaggaattattgctgtagctctgttacta
atcattccaatattaaattttgttgaattcaatccttttgaaagagaatcaaaagttact
ctgaatgatagaatttctttaattgatgtcttgtctttaataattgaaaactaatctcca
taaatggagcaagtttatttaatagctattggtataccaccttagacctcttactattaa
agctatatacaaaatctctaagattaaaataactaagtcttctaatacttttaaaattta
actgccgacttaggagttgaacgaaataattaaaaaatattcatggatttttattaaaat
ctattaaatgaaaacgtgtgctctgttagagaaaattatccttaatattttaattcaaat
ataacttaatctcgatgcaactaattatttaatggaatattgtaacgaggtttaatattc
tcaatctaaaaagtgttttagacattttaagaaatatattaaatctattaaattcaagat
attcatgtgctgatcaaatcatttaagtatctataaaaatcttattcgtttatagaattt
aagcagttaattcaagtaatctcagaggttgtaaatgcaataagacagtactaaaatgaa
cagttgtaataatatgaaatcaatttaaagcagaatttgctttatttatttataattcaa
ttagtaattatttgtcttgtatttttgataggttggctctacctcttttaatggtttaga
aactaactccaaagggctaccaaaatattcacactatttcatataaatcttctctatgaa
aatgattttatttaatcatactttagaaaaatctcatagaagtaaagttga
DBGET
integrated database retrieval system