Entry |
|
Name |
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
|
Organism |
tet Tetrahymena thermophila
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
AA seq |
1727 aa
MHFSQGNNTFALSSLQSSASAQVNRQQDIAKDNSVLQSSEKLHQTYIQLCQERGQQIDKI
LIFQNMKIREKNWVEIELDREIGIEMFRIICEVIRMNKFYVSLRAKNFDLGQNHFQVIES
LIKDKLIELSMNNCNLSTNMLSILSSLIKSKQCKMQKLKIINNNIGYDGACILQDCLSHH
KYLKYIYIEYCSIDNQTISQIMNAAETIQNLQFISLEGNKLEYIGLQIILETMKRNTNIK
QLYIRNNPIGDESINLFKQEFFTFSDIDFSNCMLTFIGINDLTKTIMISEEFKNCCNSLN
LSNNILASKGAKQIFQLISIQFQKIDNLNLSNTKLGDQVIDSLSLALKSRNCQLKSLDLS
NNYITDNGAIKIFESIKQSPNSQLQRVNLIGNYISEQCENYLIQNNTQLGSSFKFKLGQQ
MSVTNLSNLHFLENYYQEFENINKKINTLWKNYLDKSKRLNVNYSRTLRAITQQITCCKQ
KEPLRNMIVNQTNIGINEIEIIQLIARYVPSIENLTITNCDLINYVQLQNSHQNQEGVHN
SQQSIQYRNNESDYDQSLIIVKIGEIISDNNNINNLQLTSLNLTTNQIKDLLEYLKYTNK
PIRIDFSKNLIDDNGFLLMLEFQKNFHKIFQHIVLSDNKLSYQVFPILIQHLKQAQNVGL
IEEVSLDSVNDIQANNIGEFFYDLSLFQPKLVNLSLCKQRINDSVAETISYFIKNSQYIE
SLNLSFNELTDVGANVIINGAWANQFRFQKLSMLGNFFSKKFFNYVQNQQQQNNYKVQIL
IEPSLTSSNQQQNQENILQDLEIRMAQLNSSLGAANQEDPQMPIVEQSLKDHEISYQADQ
VQQDIVEQPIVSGNHAAISQSKETQSGHFPVQSINSKKFINSQENIQSQHSQHQSQNQLS
QQKIRDSQPNIPSFLQNSDKLSNRQTQENINFDENFKKQEFRQSNTELQKSYKKDDMTFG
INSQQKSEKNNIPSFENQQQYQQQINFKQNATSTTSLENQNKNQASVYIDEYIKEIHQIE
GHIKDLFERQTFLVEEIKQKISLEPQIRKTRQQESVNQLSKEQISQRSHLSQIQNSANDL
NEHVKKSKIKNDQNFNKLINLPSEQYLNIENHFSPQINQIGEKKRTQNTLSQLGTNNDFN
QMQLNSKNDLNKNQYSVSNNHLPRNFPISSALLENTDRQQSINSQKVVHSLNALKERIQD
LEEQVERESIRQMQHPNYQQDERGYQTQQQQLVQEILENNKPQNEQLKVRINSNLHSIYQ
KNAPSSVAIGSTLNEINATHNQLLAPKSMYTATSIPTENNLEFQSVGQNLNKYSNKYNPA
IRQSKVSSNIQTFTSNLVNDEDNRKNSFLSAIQGETRIPQPNESTMKQINGLQNQKKIDP
QNVKEPHQRDNSQQKNRNQSIPPQSMILMEDNIMNLNASPQRQQRNNEIRMNQDKEIQDF
LNIQHQNIINHQQNRSQVDNEPEQSETFTFYQSGSHQINYNMYQPHQNEYQSSMQQSRMN
NSNESPHKILSKQKLQISQISNVSGLSQMQTSSQSSPSKSRMKGSIVGNKNIGFSKRVDN
VQYLVEELVKLIERYEYLIQMCSELKQIKQKIIENLGGDYNYNQINNNNLQKICGVETDL
RDKMKTQERQIYESINELREIGLQIDDSKLKNWDNLKAVLISASEEYQKNQQLEKQQFAD
YIDYRNQDFIVDSTVQNQQYQQYNQNYDFKSNQKNRLQNSQTYQLHS |
NT seq |
5184 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgcatttctctcaaggaaataatacttttgcactaagttctttgcagtcatctgctagt
gcttaggtaaatagataataggatattgctaaagataatagtgttctttagtcatcagaa
aaattacatcaaacttatattcagctatgttaggagcgaggacaataaatagataagatc
ttaatattttagaatatgaaaataagagaaaaaaattgggtagaaatagagctcgataga
gaaataggaattgaaatgtttagaattatatgcgaggtcatcagaatgaataaattttat
gtcagtttaagagcaaagaatttcgatttaggtcaaaatcactttcaggtcatagaatct
ttaataaaagacaagctgattgagctatcgatgaacaattgcaacttaagtacaaatatg
ttatcaatcttaagtagcttgattaaaagtaagcagtgcaaaatgtaaaagttgaaaatt
attaacaacaatattggatatgatggagcttgtatacttcaagattgtctaagtcaccac
aagtacttgaaatatatttacatagaatattgttctatagacaaccaaacaataagtcaa
attatgaatgcagctgaaactattcagaatcttcaattcatttctttagaaggaaataaa
ttagagtatatcggtctataaattatccttgaaacaatgaaaagaaatactaatattaag
tagctttatatccgcaacaatcctattggggatgaatctatcaacttgttcaagtaagag
ttcttcactttttctgatatagatttttctaattgcatgttgacattcattggtataaat
gatctaacaaagacaattatgatcagtgaagaattcaagaattgttgcaatagcttaaat
cttagcaataatattttagcgtcaaaaggagccaaataaatattttagcttatttcgatt
tagttttaaaaaattgataatttgaatttaagtaatacaaagctaggtgatcaagtaata
gattctttatctcttgcattaaaaagcagaaactgctaattaaaatctcttgatttatca
aataattatatcacagataatggagctataaagatatttgaaagtataaagtagtctcct
aattcctaattgtaaagagttaatttaattggaaactatattagcgagcagtgtgaaaat
tatttaatacagaataacactcaacttggtagttcatttaaatttaagttaggttagtaa
atgagtgtaactaacttgagcaatttacattttttggaaaattactaccaagagtttgaa
aatattaataaaaaaataaacactttgtggaaaaattaccttgataaatctaaaaggcta
aatgttaattatagtagaactcttagggcaataacacaataaattacttgttgtaaacag
aaggaacctttaagaaatatgatagtgaattaaacgaatataggaataaatgaaatagaa
attattcaactgattgctagatatgtgcctagcatagaaaatttaactattactaactgt
gatctaataaattatgtgtaattgtaaaactctcattaaaattaagaaggagttcataat
agttagcaatcaatatagtatagaaataatgagtcagactatgattaaagcttgattatt
gttaagattggagaaatcattagtgataacaataatattaataatttataattaaccagt
ttaaatctgacaacaaactaaattaaagacttacttgagtatttaaagtatacaaataag
cctatcagaattgatttttctaaaaacctaattgatgacaacggatttttattgatgctt
gaattttagaagaatttccacaaaatcttttagcacattgtgctttcagacaataagctg
tcttatcaggtttttcctatattaattcagcacctaaagtaagcataaaatgttggtcta
attgaagaagtatctcttgattcagtgaatgatatttaggcaaataacattggagagttt
ttttatgatctttctttgtttcaaccaaaattagttaacctttctctgtgcaagtagcgc
attaatgattcagtggcagagacaatttcatactttattaaaaattcttagtacattgaa
agtttaaatttaagctttaatgaattaacagatgtaggagctaatgttattatcaatggt
gcttgggcaaattaatttaggttctaaaagctttctatgttaggaaactttttttcaaag
aaattctttaattatgtttagaattagcagtagcaaaacaactacaaagtttaaatatta
attgaaccttctttaacttcatcaaattagtaataaaactaagaaaacattttgcaagat
ttggagatacgaatggcttagctaaattcttctttgggtgctgctaattaagaagaccct
caaatgccaattgttgagtaaagtttaaaggatcacgaaatatcttatcaagcagaccaa
gtataataagatattgttgagtagcctatagtttctggtaatcatgcagcaatctctcag
tcaaaagaaacttagagtggacattttccagtgtaaagcataaattctaaaaaattcatt
aattcataggagaatatctaaagctaacatagctagcattaaagtcagaactaactcagc
caataaaaaattagagattcttagccaaatataccttctttcttgcaaaattctgataaa
ctctcaaataggcaaacctaagaaaatataaatttcgatgaaaatttcaaaaaacaagaa
ttcagacagtccaacactgaattgtaaaaaagctacaaaaaagacgacatgacatttgga
ataaattcgtaataaaaatcagagaaaaataatattccctcatttgaaaattaacaataa
tattaatagtaaataaacttcaagtaaaacgctacttcaaccacttcattagaaaaccaa
aacaaaaactaagcatctgtgtatatagatgaatacatcaaagaaatacactaaatagag
ggtcatattaaggacttgtttgaaagataaactttccttgtagaagaaataaaatagaag
atctccttggaaccttaaataaggaaaacaagataataagagtctgttaattaactaagt
aaagagtaaattagttaaagatctcatctgtcatagatttaaaatagtgctaatgatttg
aatgaacatgtgaaaaaatcaaagattaaaaatgatcaaaactttaacaaactaataaac
ttaccgagtgagcaatatcttaatattgaaaatcatttttcaccataaataaattaaatt
ggtgaaaaaaaaagaacataaaatacattaagttagctaggaacaaataatgactttaat
caaatgcagttaaattcaaaaaatgacttaaacaagaactaatatagtgtgagtaataat
catcttccaagaaattttccgatttcttctgctctcttagaaaatacagatcgctaacaa
tctataaatagctaaaaggttgttcatagtctaaacgcacttaaggaaagaatttaagac
ttagaagagcaagtagagagagaatcaataaggtaaatgtaacatccaaattactaataa
gatgaaagaggatatcaaacttagtagcaataactagtttaagaaattttagaaaataac
aagccataaaatgagtaattaaaagttagaataaacagtaacttacatagtatatactaa
aagaatgctcctagcagtgtagcaataggtagtactttaaatgaaattaatgctacgcat
aatcagttattagctccaaaatcaatgtatacagccacttccatacccactgaaaataac
ttagagttttaaagtgttggataaaacctaaataaatattcaaataaatataatccagcg
atcagatagagtaaggttagttcgaatatccaaacatttactagcaatttagttaacgat
gaagataatagaaagaatagctttttaagtgctatttagggagagactaggattccttaa
ccaaatgaatctactatgaagtaaataaatggtttacaaaattaaaaaaaaatagatcct
taaaatgtaaaagagcctcattaaagagataactcgcaataaaaaaatagaaattaaagc
atacctccataatccatgatattgatggaagataatataatgaatttaaatgcttcacct
caaaggtagcaaaggaacaatgaaattagaatgaattaagataaagaaattcaagatttc
ttaaatattcagcactaaaatattataaatcactaataaaatagaagctaagttgataat
gaaccagaataaagtgagaccttcactttttactaaagtggcagtcactaaataaattac
aatatgtattaacctcactaaaatgaatatcaatcttctatgtaataatctagaatgaat
aacagtaatgagtctcctcacaaaatattgtccaaataaaagctttaaatttcacagatt
tctaatgttagcggtttgagctaaatgtaaacatcatcctaatcgagcccttctaaaagc
agaatgaaaggctcaatagtaggaaataaaaacataggattctcaaaaagagtggataat
gtctaatatttagttgaagagttagtcaaactaattgaaagatatgaatatttaatttaa
atgtgcagtgaattgaaataaattaaataaaaaattattgaaaatctaggaggcgattac
aattataatcaaatcaataacaacaatttataaaaaatatgtggcgttgagaccgatctc
agagataagatgaagactcaagaaagacagatctatgagagcataaatgaattgagagaa
ataggattacaaatagatgactcaaaactaaagaattgggacaatttaaaagcagtacta
ataagtgcttcagaagaatactaaaaaaatcaacagcttgaaaagcaatagttcgcagac
tatattgattatagaaactaagattttattgtagattcaacagtataaaattaataatac
tagcagtataatcaaaattatgattttaaatctaattaaaaaaatagattacaaaatagt
caaacatattaacttcattcttga |