KEGG   Tetrahymena thermophila: TTHERM_01248880
Entry
TTHERM_01248880   CDS       T01020                                 
Name
(RefSeq) endo-1,4-beta-xylanase xylA, putative
Organism
tet  Tetrahymena thermophila
SSDB
Motif
Pfam: LRR_6
Other DBs
NCBI-GeneID: 7823707
NCBI-ProteinID: XP_001029892
TGD: TTHERM_01248880
UniProt: Q22AC0
LinkDB
AA seq 1727 aa
MHFSQGNNTFALSSLQSSASAQVNRQQDIAKDNSVLQSSEKLHQTYIQLCQERGQQIDKI
LIFQNMKIREKNWVEIELDREIGIEMFRIICEVIRMNKFYVSLRAKNFDLGQNHFQVIES
LIKDKLIELSMNNCNLSTNMLSILSSLIKSKQCKMQKLKIINNNIGYDGACILQDCLSHH
KYLKYIYIEYCSIDNQTISQIMNAAETIQNLQFISLEGNKLEYIGLQIILETMKRNTNIK
QLYIRNNPIGDESINLFKQEFFTFSDIDFSNCMLTFIGINDLTKTIMISEEFKNCCNSLN
LSNNILASKGAKQIFQLISIQFQKIDNLNLSNTKLGDQVIDSLSLALKSRNCQLKSLDLS
NNYITDNGAIKIFESIKQSPNSQLQRVNLIGNYISEQCENYLIQNNTQLGSSFKFKLGQQ
MSVTNLSNLHFLENYYQEFENINKKINTLWKNYLDKSKRLNVNYSRTLRAITQQITCCKQ
KEPLRNMIVNQTNIGINEIEIIQLIARYVPSIENLTITNCDLINYVQLQNSHQNQEGVHN
SQQSIQYRNNESDYDQSLIIVKIGEIISDNNNINNLQLTSLNLTTNQIKDLLEYLKYTNK
PIRIDFSKNLIDDNGFLLMLEFQKNFHKIFQHIVLSDNKLSYQVFPILIQHLKQAQNVGL
IEEVSLDSVNDIQANNIGEFFYDLSLFQPKLVNLSLCKQRINDSVAETISYFIKNSQYIE
SLNLSFNELTDVGANVIINGAWANQFRFQKLSMLGNFFSKKFFNYVQNQQQQNNYKVQIL
IEPSLTSSNQQQNQENILQDLEIRMAQLNSSLGAANQEDPQMPIVEQSLKDHEISYQADQ
VQQDIVEQPIVSGNHAAISQSKETQSGHFPVQSINSKKFINSQENIQSQHSQHQSQNQLS
QQKIRDSQPNIPSFLQNSDKLSNRQTQENINFDENFKKQEFRQSNTELQKSYKKDDMTFG
INSQQKSEKNNIPSFENQQQYQQQINFKQNATSTTSLENQNKNQASVYIDEYIKEIHQIE
GHIKDLFERQTFLVEEIKQKISLEPQIRKTRQQESVNQLSKEQISQRSHLSQIQNSANDL
NEHVKKSKIKNDQNFNKLINLPSEQYLNIENHFSPQINQIGEKKRTQNTLSQLGTNNDFN
QMQLNSKNDLNKNQYSVSNNHLPRNFPISSALLENTDRQQSINSQKVVHSLNALKERIQD
LEEQVERESIRQMQHPNYQQDERGYQTQQQQLVQEILENNKPQNEQLKVRINSNLHSIYQ
KNAPSSVAIGSTLNEINATHNQLLAPKSMYTATSIPTENNLEFQSVGQNLNKYSNKYNPA
IRQSKVSSNIQTFTSNLVNDEDNRKNSFLSAIQGETRIPQPNESTMKQINGLQNQKKIDP
QNVKEPHQRDNSQQKNRNQSIPPQSMILMEDNIMNLNASPQRQQRNNEIRMNQDKEIQDF
LNIQHQNIINHQQNRSQVDNEPEQSETFTFYQSGSHQINYNMYQPHQNEYQSSMQQSRMN
NSNESPHKILSKQKLQISQISNVSGLSQMQTSSQSSPSKSRMKGSIVGNKNIGFSKRVDN
VQYLVEELVKLIERYEYLIQMCSELKQIKQKIIENLGGDYNYNQINNNNLQKICGVETDL
RDKMKTQERQIYESINELREIGLQIDDSKLKNWDNLKAVLISASEEYQKNQQLEKQQFAD
YIDYRNQDFIVDSTVQNQQYQQYNQNYDFKSNQKNRLQNSQTYQLHS
NT seq 5184 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcatttctctcaaggaaataatacttttgcactaagttctttgcagtcatctgctagt
gcttaggtaaatagataataggatattgctaaagataatagtgttctttagtcatcagaa
aaattacatcaaacttatattcagctatgttaggagcgaggacaataaatagataagatc
ttaatattttagaatatgaaaataagagaaaaaaattgggtagaaatagagctcgataga
gaaataggaattgaaatgtttagaattatatgcgaggtcatcagaatgaataaattttat
gtcagtttaagagcaaagaatttcgatttaggtcaaaatcactttcaggtcatagaatct
ttaataaaagacaagctgattgagctatcgatgaacaattgcaacttaagtacaaatatg
ttatcaatcttaagtagcttgattaaaagtaagcagtgcaaaatgtaaaagttgaaaatt
attaacaacaatattggatatgatggagcttgtatacttcaagattgtctaagtcaccac
aagtacttgaaatatatttacatagaatattgttctatagacaaccaaacaataagtcaa
attatgaatgcagctgaaactattcagaatcttcaattcatttctttagaaggaaataaa
ttagagtatatcggtctataaattatccttgaaacaatgaaaagaaatactaatattaag
tagctttatatccgcaacaatcctattggggatgaatctatcaacttgttcaagtaagag
ttcttcactttttctgatatagatttttctaattgcatgttgacattcattggtataaat
gatctaacaaagacaattatgatcagtgaagaattcaagaattgttgcaatagcttaaat
cttagcaataatattttagcgtcaaaaggagccaaataaatattttagcttatttcgatt
tagttttaaaaaattgataatttgaatttaagtaatacaaagctaggtgatcaagtaata
gattctttatctcttgcattaaaaagcagaaactgctaattaaaatctcttgatttatca
aataattatatcacagataatggagctataaagatatttgaaagtataaagtagtctcct
aattcctaattgtaaagagttaatttaattggaaactatattagcgagcagtgtgaaaat
tatttaatacagaataacactcaacttggtagttcatttaaatttaagttaggttagtaa
atgagtgtaactaacttgagcaatttacattttttggaaaattactaccaagagtttgaa
aatattaataaaaaaataaacactttgtggaaaaattaccttgataaatctaaaaggcta
aatgttaattatagtagaactcttagggcaataacacaataaattacttgttgtaaacag
aaggaacctttaagaaatatgatagtgaattaaacgaatataggaataaatgaaatagaa
attattcaactgattgctagatatgtgcctagcatagaaaatttaactattactaactgt
gatctaataaattatgtgtaattgtaaaactctcattaaaattaagaaggagttcataat
agttagcaatcaatatagtatagaaataatgagtcagactatgattaaagcttgattatt
gttaagattggagaaatcattagtgataacaataatattaataatttataattaaccagt
ttaaatctgacaacaaactaaattaaagacttacttgagtatttaaagtatacaaataag
cctatcagaattgatttttctaaaaacctaattgatgacaacggatttttattgatgctt
gaattttagaagaatttccacaaaatcttttagcacattgtgctttcagacaataagctg
tcttatcaggtttttcctatattaattcagcacctaaagtaagcataaaatgttggtcta
attgaagaagtatctcttgattcagtgaatgatatttaggcaaataacattggagagttt
ttttatgatctttctttgtttcaaccaaaattagttaacctttctctgtgcaagtagcgc
attaatgattcagtggcagagacaatttcatactttattaaaaattcttagtacattgaa
agtttaaatttaagctttaatgaattaacagatgtaggagctaatgttattatcaatggt
gcttgggcaaattaatttaggttctaaaagctttctatgttaggaaactttttttcaaag
aaattctttaattatgtttagaattagcagtagcaaaacaactacaaagtttaaatatta
attgaaccttctttaacttcatcaaattagtaataaaactaagaaaacattttgcaagat
ttggagatacgaatggcttagctaaattcttctttgggtgctgctaattaagaagaccct
caaatgccaattgttgagtaaagtttaaaggatcacgaaatatcttatcaagcagaccaa
gtataataagatattgttgagtagcctatagtttctggtaatcatgcagcaatctctcag
tcaaaagaaacttagagtggacattttccagtgtaaagcataaattctaaaaaattcatt
aattcataggagaatatctaaagctaacatagctagcattaaagtcagaactaactcagc
caataaaaaattagagattcttagccaaatataccttctttcttgcaaaattctgataaa
ctctcaaataggcaaacctaagaaaatataaatttcgatgaaaatttcaaaaaacaagaa
ttcagacagtccaacactgaattgtaaaaaagctacaaaaaagacgacatgacatttgga
ataaattcgtaataaaaatcagagaaaaataatattccctcatttgaaaattaacaataa
tattaatagtaaataaacttcaagtaaaacgctacttcaaccacttcattagaaaaccaa
aacaaaaactaagcatctgtgtatatagatgaatacatcaaagaaatacactaaatagag
ggtcatattaaggacttgtttgaaagataaactttccttgtagaagaaataaaatagaag
atctccttggaaccttaaataaggaaaacaagataataagagtctgttaattaactaagt
aaagagtaaattagttaaagatctcatctgtcatagatttaaaatagtgctaatgatttg
aatgaacatgtgaaaaaatcaaagattaaaaatgatcaaaactttaacaaactaataaac
ttaccgagtgagcaatatcttaatattgaaaatcatttttcaccataaataaattaaatt
ggtgaaaaaaaaagaacataaaatacattaagttagctaggaacaaataatgactttaat
caaatgcagttaaattcaaaaaatgacttaaacaagaactaatatagtgtgagtaataat
catcttccaagaaattttccgatttcttctgctctcttagaaaatacagatcgctaacaa
tctataaatagctaaaaggttgttcatagtctaaacgcacttaaggaaagaatttaagac
ttagaagagcaagtagagagagaatcaataaggtaaatgtaacatccaaattactaataa
gatgaaagaggatatcaaacttagtagcaataactagtttaagaaattttagaaaataac
aagccataaaatgagtaattaaaagttagaataaacagtaacttacatagtatatactaa
aagaatgctcctagcagtgtagcaataggtagtactttaaatgaaattaatgctacgcat
aatcagttattagctccaaaatcaatgtatacagccacttccatacccactgaaaataac
ttagagttttaaagtgttggataaaacctaaataaatattcaaataaatataatccagcg
atcagatagagtaaggttagttcgaatatccaaacatttactagcaatttagttaacgat
gaagataatagaaagaatagctttttaagtgctatttagggagagactaggattccttaa
ccaaatgaatctactatgaagtaaataaatggtttacaaaattaaaaaaaaatagatcct
taaaatgtaaaagagcctcattaaagagataactcgcaataaaaaaatagaaattaaagc
atacctccataatccatgatattgatggaagataatataatgaatttaaatgcttcacct
caaaggtagcaaaggaacaatgaaattagaatgaattaagataaagaaattcaagatttc
ttaaatattcagcactaaaatattataaatcactaataaaatagaagctaagttgataat
gaaccagaataaagtgagaccttcactttttactaaagtggcagtcactaaataaattac
aatatgtattaacctcactaaaatgaatatcaatcttctatgtaataatctagaatgaat
aacagtaatgagtctcctcacaaaatattgtccaaataaaagctttaaatttcacagatt
tctaatgttagcggtttgagctaaatgtaaacatcatcctaatcgagcccttctaaaagc
agaatgaaaggctcaatagtaggaaataaaaacataggattctcaaaaagagtggataat
gtctaatatttagttgaagagttagtcaaactaattgaaagatatgaatatttaatttaa
atgtgcagtgaattgaaataaattaaataaaaaattattgaaaatctaggaggcgattac
aattataatcaaatcaataacaacaatttataaaaaatatgtggcgttgagaccgatctc
agagataagatgaagactcaagaaagacagatctatgagagcataaatgaattgagagaa
ataggattacaaatagatgactcaaaactaaagaattgggacaatttaaaagcagtacta
ataagtgcttcagaagaatactaaaaaaatcaacagcttgaaaagcaatagttcgcagac
tatattgattatagaaactaagattttattgtagattcaacagtataaaattaataatac
tagcagtataatcaaaattatgattttaaatctaattaaaaaaatagattacaaaatagt
caaacatattaacttcattcttga

DBGET integrated database retrieval system