Tetrahymena thermophila: TTHERM_01295340
Help
Entry
TTHERM_01295340 CDS
T01020
Name
(RefSeq) translation initiation factor eIF3 subunit
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
eIF3_p135
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7826988
NCBI-ProteinID:
XP_001020716
TGD:
TTHERM_01295340
UniProt:
Q23VB1
LinkDB
All DBs
AA seq
1417 aa
AA seq
DB search
MSMQEFNLEDFETIDIVEKLSQNSIKFNERLIELNKHLLCYYSDIPPYFYNSRQLPQNFY
PKQGIQILNIESIEKEDENNRTKKRPNVFKITFDKQYLIEFKKYGKEIAQKKQEFISFYQ
VIKNNSIQVLKDDPKNAKNKTDKLDQKTNKVQWLFRFKFQKERDEFFNKIVTLSKYLKDN
LEFEMRDQKSKEMELLYTSYKTANGSSSAYTHPNINDFNSSRMHQKDIKPTYKGLQQIEE
EAWNEKYMQSIDQNELSQNYESSNDIGAASASYKGDKINNFINKSQMNNQNRNKLINPQI
LSRGEIMSQEEEKDQYKNQQMRQQGRQYSMNQHFENLIDSSQIKASESILTNKSQQDEED
NYQLILKKEEEQRKKEIYEEEERKRQEKEEIERIKKQKEEEEQRKQNKLVYDSSYELQYQ
DKLNSTNLLQQIVENPSQLLVNSSNQLYFEQSQSLQSDISPNAKFNPNQSINLSPTKKEK
IEESFQKNYELLSLIGTFNETAQNATKQLIEDLIFSGSQKKYIPIQVKNDQSFELANNDF
NFKILPSYEFLVEAKSYNNFVIRLSWITQETIATEEDQRDQKNKEQNINQETPIFQMIEQ
FINQQNMSNNPEQKENQISPSKYLRQAKQREEQIKQMQDQQETQIIYSNYHGKSLQSEFK
ALNLINTWHIDHKTSGQQTVKVALSCIITYRGFKALVQSISSEAEGLVHGPVFDQDKYYQ
GYKTHPQIVPLLQKIGEDLGIKPHTFSLGNKPKCQVYLSFVTEVHQNQNITNLKKQITDP
QQMQYQKLQTYYIKNVGDIFPVNDNYLSENLQSKTIQFRPEYLKKLDAQLNPDAFEDSSP
DSEEDVKDIVQASIYLENTYIQRFLYHLDELNYNVIDSLSLQECMHKEGINMKYLGFIAK
NTSLPFIQNICLIDMVARVFKKILNFTISDIYLRFNKFLSQDEFQLSLQRQKQATFQQNQ
GIALTPQQQAQQNANNQMREQKINQLDELVKEAVIDILNLLYGRDEETIKFHEILYQQIK
YDFNYDQSFEIKSLQRGQLLESICFHCDLNMVYSTDLFTKADTQFADLQNNSKGSSNLDD
LIYTQQKQAQQQIFTKDNYIDHYVSSYVFTMDCLSVMQYISSNEINRLNKEYIDQQISAI
KQNIKVLKCTKSLTFFKYVQLKSALSELYLQKKDYLNCCKSASKVITLCTKKIDEVIVPN
IYLVKVMINLIQISLKKDISLEIKNKTTLGTKNIMKMIKFVVDDYHPLFYELTRIFIDDK
LIKRDLTNESVKQVMESELNGLTRALGSNHLLIAERYHDFAVYMYDQNNQLSIVYFDKAF
RIYTVNKEYQDKDIAMKLINPISPSHMVVQVQNLDYLRANCAYYLCILYFNQNKLNQSWI
FLEIALDFFKNRKDSKERLDKLQQIQKNILASNQKFN
NT seq
4254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcatgtaggaattcaatttggaagattttgaaactattgatattgtcgaaaaactt
tcataaaatagtattaaatttaatgagagattgattgaattaaataaacacttattgtgc
tattattctgatattcctccctatttttacaattctaggcagctgccatagaacttttat
cctaaatagggtatttaaattctaaatattgagagtatagaaaaagaagatgaaaataat
cgcacaaagaagagaccaaatgtttttaagataacttttgacaaataatatttgattgaa
tttaagaaatatggaaaggaaattgcatagaagaagcaagaatttatttctttttatcaa
gttataaagaataactcaatataagtgttaaaagatgatccaaaaaatgctaaaaataaa
acagataaactagattaaaaaacaaacaaggtctagtggctctttagattcaaattttag
aaggaaagagacgaattttttaacaaaatagttactctatccaagtatttaaaggataat
ttagaatttgaaatgagggattaaaaatctaaagaaatggagctcctatatacttcttat
aaaacagctaatggttccagtagcgcatacactcacccaaatatcaatgattttaatagt
tctcgtatgcatcaaaaagatattaaacccacatataagggtctttaataaatagaagaa
gaagcttggaacgaaaaatacatgcaatcaattgattagaatgaattaagttaaaattat
gaaagcagtaatgacattggagctgcctcggctagctacaagggtgataagataaacaac
ttcataaataaaagccaaatgaataattaaaatagaaataaacttattaatcctcaaatc
ctttcaagaggagaaataatgtcttaagaagaagaaaaagatcagtataagaactagtaa
atgagacaataaggaagatagtacagcatgaatcagcattttgaaaatttgattgattca
agttagataaaagcttcggagagtattctcacaaataaatcttaataagacgaggaagat
aattactagttgattttgaaaaaagaagaagaacaaaggaaaaaggaaatttatgaagaa
gaagaaagaaaaaggcaagaaaaagaagagatagaaagaatcaaaaagcaaaaagaagaa
gaagagcaaagaaaatagaacaaattggtttacgatagctcatatgaactctagtaccaa
gataaattgaattcaactaatcttttgtagtaaattgtagaaaatccttcatagcttttg
gtcaattcatcaaattagctttattttgaataaagttagtctttgcaatctgatattagc
ccaaatgctaaatttaatcctaaccaatccataaacttgtctccaactaagaaagaaaaa
attgaagaaagcttttaaaaaaattatgaacttctctcattgattggcacatttaatgaa
acagcctaaaatgcaacaaagcaactaatagaagatctcatttttagtggaagccagaaa
aaatatatcccaattcaagtcaaaaacgactaaagtttcgagctagctaacaatgatttt
aatttcaaaatacttccatcttatgaattcttagttgaggctaagtcttataataatttt
gtaattaggctctcctggataactcaagagaccatagcaactgaagaggattagagagat
caaaaaaataaagaataaaatatcaatcaagaaacacctatttttcaaatgattgaacag
ttcataaattaataaaatatgagcaacaatcctgagtagaaagaaaattaaattagtcct
agcaaatatttgaggcaagcaaaataaagggaagagtaaataaaataaatgcaagattaa
taagaaacttaaattatttactccaattaccatggaaagagtctttaatcagaattcaaa
gcattgaatttgattaacacttggcatattgatcacaaaacaagtggtcaataaactgtt
aaagtagctttaagctgtatcatcacatacagaggatttaaagccttagttcaatcaatt
tcttctgaagctgaagggcttgttcatggacctgtgtttgattaagataaatattatcaa
ggatataaaacacatccttaaatagtaccgctgctttaaaagattggggaagatttaggt
attaagcctcatactttttctttaggaaacaaaccaaaatgttaagtatacttgagcttt
gttactgaagttcattagaattagaatatcacaaacctaaagaaacaaattactgatcct
taataaatgcaatactaaaaactctaaacttactatataaaaaatgtaggagatatattc
ccagtgaatgataactatttgtcagaaaatttacaaagcaaaactattcaatttagacca
gagtatcttaagaaattagacgcacaacttaatccagatgcttttgaagattccagtcct
gatagtgaagaagatgtgaaagatatagtttaggcatcgatatacttagagaacacatac
atatagaggtttttatatcatttagatgagcttaattataacgttatcgacagcttaagc
ttacaagaatgcatgcacaaggaaggtattaatatgaagtatttaggatttatcgcaaaa
aatacttctcttccctttatacagaatatatgcctcattgatatggttgcaagagttttc
aaaaaaatacttaattttactatcagcgatatatatcttagatttaacaaatttctaagt
taagacgagttctagttgagtttataaagataaaagcaagcaacattttaataaaatcag
ggtattgctttgacacctcaacagcaagctcagtaaaatgcaaataattaaatgagagaa
taaaaaataaattaattggatgaattagtaaaagaagctgttattgatattcttaattta
ttatatggaagagatgaagaaactataaaattccatgaaatactatatcaacaaattaaa
tatgattttaattatgattaatcttttgagattaaatcattacagagaggataactgctt
gaatctatttgcttccactgcgatcttaatatggtttattccacagatttgttcacaaaa
gcagacacctaatttgctgatttataaaataattcaaaaggttcaagcaacctagatgat
ttaatttatacatagtagaaataagctcaataataaatatttactaaagataattatatt
gatcactatgtttcaagctatgtcttcacaatggactgccttagtgtcatgtaatatatt
agctctaatgaaatcaacagattaaataaagagtacattgaccaataaataagtgcaata
aaataaaatatcaaagttcttaaatgtacaaagagtcttactttcttcaaatatgtccaa
ctcaaaagcgctttgtctgaactgtatttacagaaaaaggactatctcaactgctgcaaa
tcagcttcaaaagttattactctttgcacaaaaaaaatagatgaggtgattgttcctaat
atttatttagtcaaagtcatgataaatctgattcagataagtttgaagaaagatatctcg
ttagaaataaaaaataagactacattaggaacaaagaatataatgaaaatgataaagttt
gtagttgatgattaccatcctctgttttatgagttaacaagaatttttattgatgataag
ttgattaaaagagacctaaccaatgaaagtgtaaaataagttatggaaagtgaacttaat
ggtctaactagggcgctaggatcaaatcatttgctaatagcagaaaggtatcatgacttt
gcagtatatatgtatgattaaaacaactaactttctattgtctacttcgataaagcattc
aggatatacactgttaacaaggaatattaagataaagatattgccatgaaattgattaat
ccaatcagtccatctcatatggtagttcaagtatagaatctagattacttaagagcaaat
tgtgcttattatctttgtattttatactttaactaaaacaagttaaattaaagctggatc
ttcctagaaatagctttggatttcttcaaaaatagaaaagattcaaaagaaaggttggat
aaattacaacaaattcaaaaaaatattttagcctccaattaaaagtttaattga
DBGET
integrated database retrieval system
