Tetrahymena thermophila: TTHERM_01307920
Help
Entry
TTHERM_01307920 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
7835575
NCBI-ProteinID:
XP_001029771
TGD:
TTHERM_01307920
UniProt:
Q22A03
LinkDB
All DBs
AA seq
2635 aa
AA seq
DB search
MKTRYLILTHTIFQLVILVSGQSIPTQTCPTLSQYDILKGQISFIKYISGTSLYAVADNQ
NKFVVADSDSALIKSSFQTFQAGGSNQSSQIISIELISSLSMYVVTQNGITIRDIGTMTD
QQVQGLNLNSIGQPSGSSTPSVPIITQFKVDPTNSGNLYFGINLQGPTDIYVAYFSNNRL
SSFQLTLQSNPPPPPTVTLIGILVNLQIQNTQFTVVVGQYATNLCFSFIQMSQDPQNAVN
PQWDVTPKFPNGCSAITSQYFDDNNSLIYIAFQCLPKNQIQVYDMTQSKLTKVPQPQGPD
QNSWTLPTSTPLNSQITQTINLIKSVTINNSQYLFMGASQSNQQMLIFGSLIDFKQTSYN
SANFQNKITALDYLTGTSTIILGTLVSEIIHFNYVQKLTSINTKPSNLQNYDTVSLDSSD
NLLMLSSTVQPSTAGTIGKFNIKFTQQTSPISLVSNLQKIYCIAIYDQTTFARALLIQVN
KPGTPPTSTLQVMIEFQIQQNDGTYKSYLSMSLLQVQDINSPISFVMQFTSSKTIAIAYQ
SQTSAIAIVTYNQNPSPSVAISYSLPGVISAKQIWLIADSNNNIIIPNGPNLYCYQYTQQ
PPALTQNSKISQLSFNGVLQNIYFLTGDQYIGAFVNQPQQNGVISVLYIYSYNPSTMDTT
VKYQTTIISQATNLIYSSSNKIIAITSGQQYQLFYLDTVNNKLTSILTTQQIGSSVLNYF
ITSTGSLLIASSSGIIKLDISSNCITQTCTQCALNAYYNIPLTANNPSQLTDQNGSGKTN
TDPYISLAKFYSFYWDVINTFSSLSNQSFTSIYIVNYIQLGSQFINQQNLFNIYSAISSG
SLGTVQQQPQFSSIYIVFQSFNNANSQATRYQYFFSSSLTLPSNLASVTFQDIEFCQLSQ
FSGNLFTSSSNLFMLSNVGFSTTDALKNYQVTSLQIQLLAGQQFNLAQSSISNLQFPAMI
PALINVNSYLTVTVDTVVFDGCNFNGASLIKGNNPSPQVIINNSKILNSQIVQANQVQVF
ISFSQLIITTFTIQSNTIKNFLLFQNQECTDVVSCQSVSVSISTLTLKSNQVTIGSSQVQ
FGLQISFSSSNLQNQICIQNSSISQNTVTIVSSGSQQQGSDILKSISQNFFLVASNVFNV
TMITVTFIDNGATGFMQGTKMQGVNITSLSCSQSQLSLSQSQSSCLNLLEHTKLNLNIAT
SSFKNIFVLNGYVISITTSSFTSVDSGSYDGSVKISNTQFENISIQTNSEFITGSVINYN
TLQQDSIILDTVTFTTIKLTTPTKVFSPLGSALTVYAPFSNLAQTTCTFQNFQSNGPKGP
QEINVRIFSIIKGTFLQSNYQQNIYTQTGGFGKLTARQGSIDTSTFSYANALTGGALYLV
PTISQSVFTITNSQFTMLSSIQDGGAIMFAQITDQTTLGLTGCTFSYIFSLGNGGCINSA
YVLSTNSDITSFTNIPTINMSKSTINDVFSTQGGILYVQNMNLNIDNMTVSGINSNIAKT
SNNDDVSQTLKDFVNFGPLFYIYQSNVSFKTSVFDALKIHLSISQNQDTNFMVSTYKSIL
NFNDLNITNAQFSNSNFIVISNSTFTCTTLNITTAQYQAQSSTRLLNSRAILQERSTRLS
QIIPKQLDARLKILDKNDRLFDIRSRLLHKSFRILQSTQSIDASQAISLLVIQKLSTITA
TGIYIQKVTCSAANCFGGGILINQSSGSVSSSNISFNSATYGGGFAIYNPSNTINIQGVT
LNNNTASSNGGGLFFYLTSSQQLLNIQKSTLDGNVANIGGGAYLNQVVASASDPSKVIVT
ITDTSISSNTCNLYGGGISYVGVDPSMTNTKLLDNQSKTSFGVNKFSSPASLVWNKEKTN
KNSANQIILNQTNVNGVVVYTLPDQQSAQTVTPLIFNLLDSDNAIITTDYTNLLTTKVTS
TITVDSSLSTKIYLTEQNVYSFDPNNYFNYTNINIAGIPGSPVILNVQSNQIIDPVTQQE
VYKIVLKFNLLYCVRGEVFQAFNFITPNDGAKMFYQCNYCKSGTYSIIYPKLEDTTVHTC
QKCSNNAQCPGGDVIQVNPSYWRINDQDDLLIYCENAPGNCLGGATNSTCSIGHVGALCE
SCDIENNYTRAGNFQCANCGDVLLNSLKVIGLMAFYVLSAKMSVNGILGKVQQEWHGNVE
METNASIILKLFLTYIQIIMVMTTFNISVPNTLNTGVSSVSSPTVQVLYSFECFFYQISL
KTNINIIYIALIFDLILPIICVIMFVLSGLISYRNNIFYKSFYIYTSLLYCLMYFQPNIF
KDAISLASCRDIGRKSYIRYNVFFECDTDEYKVWTVRFVLPVILVLVFIIPGLILWRIKV
NQNTKLGQRKFSFMTSEYTQKAFYWEIVKMNLKLFIMCSLNFLEHDYPNKIMSIFFLVVV
YGVLLFFVKPYNKELYNTIDKYSMAVLCLSIYFGFIAYYNNATFWVWLIAVVLIGILNII
FIIWCIQNLILAYIPLVKSQQKNYYNILMSIRFIRNKFFSKERRIRYLWMFWMKGLIKQL
KDMKLYNPLSFDPEKNRISRKMIIKALKEKTKEGELQIGYESQDKKDEDEDDDENTEKGD
KKKYLKMKVIDNNKFSSVKLLEKQLQNVDTNKGSPPTSYLTSTPINQEQIALDIK
NT seq
7908 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaagatatttaatattaactcatactattttttagttagttattctagtaagt
gggtaatctattcccacttagacttgcccaacattatcatagtatgatattttaaaaggg
caaattagcttcataaaatatatctcaggcacttctctttatgcagtagctgataactaa
aataaatttgtagttgctgatagcgattcagcactcattaagtcctctttctaaactttt
caagctggtggtagcaattaaagtagctaaataattagtatcgaattaataagtagttta
agcatgtacgttgtaacttaaaatggaataacaattagagacatcggaacaatgacagat
taataagtttaaggacttaatctaaactctattggataaccttcaggatcatcaacacct
tctgtcccaataatcacttaatttaaggtcgatccaactaattcaggcaatttatacttt
gggatcaatttacagggaccaacagatatttacgttgcatatttttctaacaaccgttta
tcctcattccaattaactttgtaatcaaatcctccaccaccacctacagtaactttaatt
ggaattcttgtaaatttatagattcaaaacactcaattcacagtggttgttggttaatat
gctacaaatttatgcttttctttcatctaaatgtcttaagatccttagaatgctgtaaat
ccataatgggatgttactcctaaatttccaaatggatgctctgcaataacatcttaatat
tttgatgacaacaatagcttaatatatatagctttttaatgtttaccaaaaaatcaaatt
taggtttatgatatgacttaatctaaacttactaaagttccttaacctcaaggccctgat
taaaattcttggactttacctacttcaactcctctaaatagttaaataacctagacaatt
aatttgatcaaaagtgtgacaataaataattcttaatatttatttatgggtgcttcttaa
tccaattagcaaatgctaatatttggaagcctgatcgatttcaagtaaactagctataat
tctgctaatttttagaataaaattactgctttagactatctaacaggaacatctactata
atattaggaactttagtatctgaaataattcactttaactatgtctaaaaattaacttca
ataaatactaagccttcaaacctttaaaactatgatacagtttctttagatagctctgat
aatttgttgatgcttagtagcactgttcagccttcaactgcaggaactataggaaaattt
aacattaaatttacttaataaacttctccaatttccttagtttcaaatctttaaaaaatt
tattgcatagcaatttacgattagactacttttgcaagagcgcttttaatttaagtcaat
aaacctggtactcctcctaccagtactctttaagtgatgattgaattttaaatatagcaa
aatgatggtacttacaaatcttatctttcaatgagtttactttaagtttaagatattaat
tcacctatttcttttgtgatgcaatttacttcctcgaaaacaattgctatagcttatcaa
tcttaaactagtgcaatagcaatagttacttataactagaatccttctccatctgtagca
atatcttactctctaccaggtgtcataagtgctaagtaaatttggttaatagcagactca
aacaacaacataattataccaaatggacctaatttatattgctattaatatacctaataa
cctccagcgctgacctaaaatagtaaaataagctaactaagttttaatggcgtacttcaa
aatatttatttcttaactggggattaatacattggagcttttgtaaactaaccttagtaa
aatggagtaatatctgttttatatatttattcatacaatccttcaactatggatactact
gttaaatattaaacaacaataatttctcaagctactaatctgatctattcaagcagcaat
aaaataatagcaataacttcaggataacaatactaacttttctatttagatacagttaat
aataaactaacatctatattgactacataatagattgggtcatctgtcttaaattatttc
attacaagcacaggatctcttctaattgcttcatcaagcggcataatcaaattagatatc
agctctaattgcataacttaaacatgcactcaatgtgctttaaatgcttattacaatatc
cctttaactgctaataatccgagctaacttacagactaaaatggaagtggtaaaacaaat
acagatccttacatttctttagcaaaattttactctttctattgggatgtcataaatact
ttttcctctctatcaaattaaagtttcacatctatctacatcgttaactacatttaacta
ggttctcaattcataaatcagcaaaatttgtttaatatttattcagcaatatcttctgga
tctcttggaacagtttaataataaccttaattttcatcaatttatatagttttttagagt
tttaacaatgctaattcttaagcaactagataccaatatttcttctcttcttctttaaca
ttacctagcaacctagcttcagttactttttaagatattgaattttgctagttatcttaa
tttagtggaaatttatttacaagctcttcaaatttatttatgttgtctaatgtaggcttt
tcaacaactgatgctcttaaaaattatcaggttaccagtctataaatataacttttagca
ggtcagtaatttaatttagcttaatctagcatatctaacctccagtttcctgcaatgatt
cctgcactgattaatgttaatagttatttaactgttacagtagacacagtggtatttgat
ggttgtaattttaatggagcgagtcttataaaaggaaataatcctagtccataagttatc
ataaataattccaaaatactaaacagctaaatagtttaagctaattaagtttaggttttt
atttctttttcgcagcttattattactacatttacaatccaatcaaatacaattaaaaac
tttttgctgttccaaaatcaagaatgcacagatgtagtttcttgccagtccgtatctgtc
tcaatatctacactcactttaaaatcgaaccaagttactataggatcttcctaagtttaa
tttgggctctaaattagttttagttctagtaatttacaaaattaaatttgcatttaaaat
tcctcaatcagctaaaacacagtgacgattgtatcttcaggttcataacaatagggcagt
gatatattgaaatcaataagctagaatttcttcttggtagcaagcaacgttttcaatgta
actatgattacagtcacttttatagataatggggcaactggttttatgcaaggaacaaag
atgtaaggagtaaatataacttctttgagttgcagccaatcataactatccctctcttag
agttaatccagttgtttaaatttgctagaacacactaaactcaaccttaatattgctaca
agctcgtttaaaaatatttttgtgcttaatgggtatgttatatcaataacaacttcctca
tttacttcagttgactctggaagttatgatggtagtgttaaaatatcaaatacttaattt
gaaaatatttcgattcaaacaaattcagaattcattactggatcagttattaattacaac
actttgcaataggatagtattattttagatacagttacttttactaccattaaacttact
actccgaccaaagtattttctcctctaggatctgccttaactgtgtatgcacctttttca
aatctagcatagacaacttgtacctttcaaaactttcaatcaaacggacctaaaggtcct
caagaaattaatgtgaggatattttcaataataaaagggacattcttataaagtaattat
tagcagaacatctatacttaaacaggtggttttggtaagttgactgcaagataaggttct
attgatactagtaccttttcttatgctaatgctctaacaggtggagctttatacttagtt
cctactatttcttaaagtgttttcacaataactaacagctagtttacgatgctttcttct
atttaggatggtggagcaatcatgtttgctcagataacggattagactacattaggatta
actggatgtactttctcttatatattttctcttggtaatggtggctgtataaattctgct
tatgtgctatctacaaacagtgatataacatcatttactaatattcctacaataaatatg
tcaaaaagcactataaatgatgtattttcaacttaaggaggtatactctatgtttaaaat
atgaatttaaatatagataacatgactgtaagcggaataaattcaaatattgctaaaact
agtaacaacgatgatgtttcataaacacttaaagattttgttaattttggtcccctattc
tatatataccagtcaaatgtttcttttaaaactagtgtatttgatgctttaaaaatacat
ttatcaatttcgtaaaattaagatacgaactttatggtctcaacctataagtcaatcttg
aattttaatgatcttaacataacgaatgcttagttttcaaactccaattttattgtaata
agtaattcaacttttacatgcactactttaaacattactactgctcaatattaagctcaa
tcaagtactagattgcttaattcaagggctattttataggaaagaagcactagattatca
taaataatacctaaataattagatgcaagattaaaaatattagataagaatgatagatta
tttgatataagatctagattgcttcataaaagttttaggatattataatcaacgtaatct
attgatgcctctcaagctatatcgcttttagtaatatagaagctttctacaatcacagct
actggtatttatatttagaaagttacatgttcagctgctaactgttttggtggcggtatt
ttaattaattaatcttctggttctgtaagttcatctaacatttctttcaatagtgccact
tacggtggaggatttgctatttacaatccttcaaatactataaatattcaaggtgtaacc
ttaaacaataacacagcaagttccaatggaggtggattatttttttatttgactagctct
cagcaattactaaacatacaaaagtctactttagatggaaatgttgccaatatcggtgga
ggagcatatttaaactaagttgttgcttcagctagcgatccaagtaaagtcattgtcaca
attaccgacactagtatttcttcaaatacctgcaacctttacggaggtggtatttcctat
gttggagtagatccaagtatgacaaataccaaactcctagataaccaatcaaaaactagt
tttggtgttaataaattttcttctcctgcaagcttagtttggaacaaagaaaaaacaaat
aaaaactctgcaaactagataattctaaattagacaaatgttaatggtgtagttgtttat
actttaccagatcagtaaagtgcctaaacggtcaccccacttatttttaatttacttgac
agtgataatgctattattacaacagattacactaatttgcttacaactaaagtaacttct
actattactgtagattcttctttgagtactaagatatatctaacagagcaaaatgtatac
agctttgaccctaataattacttcaactatacaaatattaatattgcaggtattcctggc
tcacctgtaatcttaaatgtttaatccaactaaattatagatccagtcacttagtaggaa
gtttataaaattgtcttaaaatttaatcttctttactgtgtgagaggagaagttttttaa
gcattcaattttataacaccaaatgatggagctaaaatgttttattaatgcaattactgt
aaaagcggaacgtattctataatatatcccaaacttgaagacacaacagtgcacacttgc
taaaaatgctcaaataatgcttaatgtccaggaggagatgtaatttaagtaaatccaagc
tattggagaattaatgattaagatgatttgctaatttactgtgagaatgctccaggtaac
tgtttgggaggagcaactaattctacttgctcaattggacacgttggtgctctttgtgaa
tcttgcgatattgagaataattacactagagcaggaaatttctaatgtgctaactgtgga
gatgttttgcttaactcactaaaagttattgggttaatggcgttttatgttttaagtgca
aaaatgagtgtaaatggaattttaggaaaagtttaataagagtggcatggtaacgtagaa
atggaaacaaatgcttcaattattttaaagttattcttaacatatattcaaatcattatg
gttatgacaacttttaatatttcagttccaaatactttgaatactggagtttcatctgta
tcaagtccaacagttcaagttctttattcatttgaatgtttcttttactaaatatcgctg
aaaacaaatataaatatcatttacattgctttgatatttgatctaattctacctattatt
tgcgttattatgtttgtgctatcaggattaatatcttacagaaataatattttctataaa
tcattttatatatatacatctcttttatattgcttgatgtatttccagccaaacatcttt
aaagatgccatatctctagcaagctgtagggacatcggaagaaaatcatatattagatat
aatgtattctttgagtgtgatacagatgaatataaagtttggactgttagatttgttctc
ccagttatattggtgcttgtatttatcataccagggctaattttatggagaataaaagta
aattaaaacactaaattaggataaagaaaattcagctttatgacatctgaatacacataa
aaagctttttattgggaaattgtaaaaatgaacttaaagctatttattatgtgcagtttg
aattttttagaacacgactacccaaacaagattatgtcaatattctttttagtcgtggtt
tatggtgttttactattttttgtcaaaccttataacaaagaattatataatacaattgat
aaatactcaatggcagttttatgcttatctatttattttggatttatagcttactataac
aatgctactttctgggtttggttaatagcagtggtattaattggaattttgaacatcatt
tttatcatttggtgcatttaaaatcttattttagcatatattcctctagttaaatcatag
cagaaaaattattacaatattcttatgagcatcagatttattagaaataagttcttttca
aaagagagaagaataagatatttatggatgttctggatgaaaggattaataaagtaatta
aaagatatgaaactgtataatccattatcgtttgatccagaaaaaaatagaatttcacgc
aaaatgattataaaagctctaaaagaaaagacaaaagaaggagagctataaataggctat
gaatcctaagataaaaaagatgaagatgaagacgatgacgaaaatacagaaaaaggtgat
aaaaagaaatatttaaaaatgaaagtcattgacaacaacaaatttagcagtgtaaaacta
ttagaaaaataactttagaacgttgatacaaataaaggttcacctcctacttcatatctg
acaagcacacctataaattaagaataaattgcattagatattaaatga
DBGET
integrated database retrieval system