Entry |
|
Name |
(GenBank) ABC transporter
|
KO |
K18887 | ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump |
|
Organism |
tfc Turicibacter faecis
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:tfc00001]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
T23_07950
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:tfc02000]
T23_07950
Transporters [BR:tfc02000]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
T23_07950
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
884059..885789
|
AA seq |
576 aa
MIKLLRYLKGSAILYAILAPLFMLVEVSMDLMLPTMLSNIIDIGITNGDTTYVWMTGAKM
IGFAVIGLIGGVGCSIFSTIAAVNLGQNLRDGLFATIQSLSFLELDHFKTSSLITRLTND
ITQIQTMVMMGLRILVRAPLLCIGGILMAYRLSSDLSGIFVITIPVILIFVAIVMSRSFP
LFKSMQEKIDKVNNVMRENLLGVRVIKAFTIEHKQKDRFNEANDDLMNQSIRAQKLMIIL
NPVVMLLVNFSIVAVLWYGGFLVQAGVLETGKIMAFINYLTQIMMSLMMVIMISMNFSRA
KASADRINEVLMTESSIQDSKSPEVIDQYDIEFKDVSFKYHDHSEEVLTDLSFKIKQGDR
VGIIGGTGAGKSSLVQLIPRLYDVSSGEVLIGGRNVKEVSLHELRDKIGVVLQESILFSG
TIESNIKFGYHDATDEELDQAARDAQAMEFIQLKESGYQTEVEQRGKNLSGGQKQRVSIA
RTLIRKPKILILDDSSSALDMATERQLQEAIKEQMTGSTVIMIAQRISAVMDANQIIVLD
QGHISGIGTHEELLKTNEIYRSIAISQLGEEAVHHG |
NT seq |
1731 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgattaaactattacgctatttaaagggatcggccatcctttatgcgattttggcccct
ttatttatgcttgttgaagtttcgatggatttaatgttaccgacgatgttatcgaatatt
attgacattggaataacaaatggcgacacgacctatgtatggatgaccggagctaaaatg
attggatttgcggtgatcggattgattggcggtgttggatgttccattttttcaacgatt
gctgctgtcaacttaggacaaaatttgcgtgatggattatttgcgacgatccagtccctc
tcttttttagaattggatcattttaaaacatcatcgttaattacgagattgactaatgat
attactcagattcaaaccatggtgatgatggggttgcgtattttagtgcgagcaccgtta
ttatgcattggtggaattttaatggcttatcgattaagttcagatttatctggtattttt
gttattacaattcctgttattttaatctttgttgctatcgtcatgtcacgatcgttccca
ttgtttaaaagtatgcaggaaaaaatcgataaagtgaacaatgtcatgcgtgaaaactta
ttaggggttcgcgtcattaaggcatttacgattgaacataaacaaaaagatcgatttaat
gaagcaaatgatgatttaatgaatcaaagtattcgtgctcagaaattgatgattatttta
aatccagtggtcatgcttttagttaactttagtatcgttgctgtcttatggtatggtgga
tttttagttcaagcaggtgtgttagagactggaaaaatcatggcgttcatcaattattta
acgcaaattatgatgtcgttaatgatggttattatgatatcgatgaacttttccagggca
aaagcgtcagcagatcgtattaatgaagtgttaatgacggaatcaagcattcaagattca
aagagtcctgaggtcatcgatcagtatgatattgaatttaaagatgtgtcatttaaatat
catgatcacagtgaagaggttctaacggatctttcctttaaaattaaacaaggagatcga
gtagggataattggtggaacaggtgcaggtaaaagttcgcttgttcagttaattcctcgt
ctttacgatgtaagttcgggggaggtcttaattggtggtcgaaatgttaaagaggtaagc
ctacatgaattacgagataaaattggcgtagttttacaagagagtattttgttttcggga
acaattgagtcgaatattaaatttggatatcatgacgcgacggatgaagaattagaccaa
gcggcaagagatgcacaagccatggagtttattcaattaaaagagtctggttatcagaca
gaagttgaacaacgtgggaaaaatttatcgggtggacagaaacaacgggtttccattgca
aggactttgattcgtaaacctaaaattttaattttagatgattcttcaagcgcattggat
atggcaaccgagcgtcaattacaagaggcaattaaagaacagatgacagggagtacggtg
attatgattgcccaacgtatttcggcagtcatggatgccaaccagattattgttcttgat
cagggacatatttcgggaatcgggacgcatgaggaattattaaaaacgaatgaaatctat
cgtagtatcgccatttcacaattaggagaggaggcggttcatcatggctag |