Tachysurus fulvidraco (yellow catfish): 113660268
Help
Entry
113660268 CDS
T08119
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
tfd
Tachysurus fulvidraco (yellow catfish)
Pathway
tfd04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tfd00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
113660268
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tfd00536
]
113660268
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tfd00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
113660268
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113660268
NCBI-ProteinID:
XP_027029423
LinkDB
All DBs
Position
20:12745966..12793913
Genome browser
AA seq
2899 aa
AA seq
DB search
MWSKGNLRCLAGCLALLGALVGSLSGEMPGRSQFQVERSSQTADSRVRRRGKQESLRGPN
VCGSRLHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGEGYCSRPNMCTCPTGQIAPTCAAKSSQ
QCSIRCMNGGVCEVDHCQCQKGYTGNYCGQPVCEKKCQNGGRCIGPSRCACVYGFTGPQC
ERDYRTGPCFSQVVNKMCQSQVSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEECPAQTQPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAVPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHRLNDGTNKCEDVNECTTIPH
VCDGGQCTNSVGSFSCVCPSGFLLSADKTRCFGQHIGSCFAAVVSGRCAQEMSEHYTKAQ
CCCDRGHCWARGTVPVICPSRRSDEFQKMCLEGGYPDVEPGFRADRVPQQPYGPDGLPHY
PTNGNGHIYPELPQIPQIPQIPQIPQIPQIPQIPHIPINGHGNGNGQRPQGPVVSLNQTT
NKCLLMPNLCLNGRCIPVGFGHRCECNIGYQVDSQKECSDINECASYPCTNGDCVNTAGS
YYCKCHTGFHRPPGKQACIDTDECLHNGVLCQHGRCLNMAGSFRCICNAGFQLTPDGRNC
MDHDECSITNMCLNGMCINEDGSFKCVCKPGFTLASSGRYCTDIDECLNPGTCINGRCIN
TEGSYRCECLAGLTVGPDGRSCVDTHMRSTCYGAIKKGVCVHPFHGAVTKSVCCCASTDY
SFGEPCQLCPALNSAEFNALCQSGIGFSVDGTDINECALDPDICSNGVCENLRGGYRCIC
NTGYETDQSGRACLDVDECLVNRLLCDNGLCRNIPGSYTCTCPPGYVFRQDTDTCEDLNE
CESSPCINGVCKNNAGSFSCVCSPGSVLDRTGLICIDSLKATCWMNIQEGRCEMNINGAT
LRSECCATLGAAWGSPCEPCEKDLVCQRGFTRPKGTICEDVNECEVFPGVCLNGRCLNTQ
GSFKCQCPEGLTLDGTGRLCIDIRSELCYLTYDEDMCGQPVPGRFRMDVCCCTVGAAWGK
ECDACPEPGTRNYEMLCPRGPGFANRGDILTGRPMYKDINECKVFTSICTHGTCRNTIGS
FRCRCNSGFTLDMDGRNCTDIEECQISPDLCGHGTCVNTPGSFECDCLPGYESGFMMMKN
CMDIDECERNPALCRGGSCENTEGSYQCVCPPGHQLSEDEEACEDINECELSATLCPNGE
CVNVAGTYHCTCFSGYQSIPDRKGCTDIDECTIENGGCDFHCTNSEGSYTCSCGQGYALM
PDQRTCTDVDECEEEPDICDGGQCTNVPGEYHCDCYDGYTSSMITKTCIDVNECELNANI
CMFGECENTKGSFICHCEVGYSVQKGSSGCTDFDECEMNAHNCAIHATCVNTPGSFQCSC
KKGWVGNGIDCVDVDECTNQTHMCSPNAKCMNVPGSYRCACSVGFNGDGFTCLDIDECTE
NAELCENGQCLNIPGGYRCDCEMGFTSTPDNRACQDIDECSFQQLCVFGTCKNLPGLFLC
ICEEGYELDRSGGNCTDVDECLDPINCVNGHCVNTPGSYECNCPTDYELNPTGVGCVDPR
VGTCFMEVVNRGRAGLTCSVEVGVGVSRSSCCCSKGRAWGNPCELCPPVNSSDYNTLCPG
GEGFRPNLITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCDCPNGYYLNADSRICEDIDE
CLVNPGICGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYMQVNGGNKCLDMRKSLCFRNYNGTTCENELAF
NITHRICCCGYNMGKAWNKPCQACPKPGTEGFHVLCGNIVPGFEISIETGKPVDIDECQQ
IPGICANGVCINHIGSFHCECPRGFSYNDLLLICEDNDECSGSEILCQRNADCINSPGSY
RCECSDGFKLSPIGACIDRNECLETPNLCSHGKCVDIQGGYMCTCHAGFIATPSGKMCMD
IDECVHQPCRNGTCKNTVGSYNCFCHPGFELTLNNQCTDIDECSTAYSQLCRNAHCINSI
GSFQCLCEDGYDLTQDRTNCVDVNECIMLPGICAPGTCHNLDGSFRCICPPGYIVQNNQC
VDENECEEDPNICLFGSCYNNPGSFECVCKTGFVLSENGRRCYDTRESFCFTRFENGKCS
NPQAFNTTKDKCCCSTMSNEGWGYPCELCPKEHDAGFQDICPFGYGIIPGIGDTIIDLNE
CVENPGICHNGHCINTDGSFRCECSTGYTLNYTGTHCIDVDECAVGNLCGNGSCTNVIGS
FECNCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCAFRCINTFGGYECSCPSGYTLRDDGRMCQD
LNECAEGLHDCDTKGMNCKNLIGTFMCLCPVGMVRKMDDEVCHDENECRTKPGICENGHC
VNTIGSYMCECGEGFQSDSSHTQCLDYRQGFCFTEVLQTMCQMSSSSRIPSTKSQCCCYG
GRGWGNQCELCPLPGTVKYKKLCPHGPGFATDGTDIDECKVIPDACKNGRCINTVGSFKC
HCSAGYTATITATACVDLDECLMSPKPCNFICKNTEGSYMCSCPRGYILQEDGRTCKDLD
ECQLKRHNCQFMCINTIGGFACKCPPGFTQHHTACMDNNECAAEPRLCGAKGICQNSPGS
FSCECQQGFSLDSTGLHCEDIDECKSNHKCQYGCDNMLGGYRCSCPQGYTQHYQWNQCVD
ENECSIPGTCGTASCYNTLGSFKCACPSGFNFEQLSSSCQDVDECTSFKSPCSYGCSNTQ
GGYKCGCPPGYYRVGQGHCVSGLGFGKGQLGSVSSAGMAEDISLSSEVCNDCTVNSPQKR
GIRKRHAIHQTAPEEEAPVNVDSVDMEQPLLLVLNISQCTHKDHILELVPALRALVHHIT
YNITEGNQDKIFQLRQHEELSYLHCMPEKAFPGFYILKISSSPLYDHTELRELENKRDRD
YLSGELGQNLHMKLHITLQ
NT seq
8700 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggtctaaagggaatttgaggtgtttggcaggttgtttagctctgcttggtgctcta
gtagggagtttatccggagagatgcccgggagaagccagttccaggtggagcgcagctca
caaaccgccgacagccgagtgaggagacgcggcaaacaggagtcgctcagagggccaaat
gtgtgtggatctcgtttgcactcttactgctgtccaggctggaagactttgcccgggggc
aaccaatgtatcgtaccaatatgccgtaacagctgtggtgaaggctactgttccaggccc
aacatgtgcacgtgccccactggtcaaattgctcctacttgtgctgccaaatcatctcag
caatgtagcatcagatgtatgaatggaggtgtgtgtgaagtggatcactgccagtgtcag
aagggttacacaggaaactactgtgggcaaccggtgtgtgaaaagaagtgccagaatggt
ggccgttgcattgggcccagtcggtgtgcatgtgtgtacgggttcacaggtcctcagtgt
gaaagagattacagaacaggtccatgcttctcccaggtcgttaacaagatgtgccagagc
caggtgagtggcattgtgtgcactaagacgctgtgctgtgccactgttggccgagcctgg
ggtcacccatgtgaggaatgccctgctcaaacacagccctgccgcagaggcttcattccc
aacattcgtaccggagcatgccaagatgttgatgaatgccaggctgtaccaggtttgtgc
caaggaggaaactgcattaacactgtgggctcttatgagtgcaaatgccctgctgggcat
cgcctgaatgatggcaccaataagtgtgaggatgtgaacgaatgcaccacaattccacat
gtgtgtgatggaggacagtgcaccaactcagttggcagtttctcctgtgtatgtccatct
ggatttttgctctctgcagacaagactcgatgctttggccagcacataggttcctgtttt
gcagctgtggtgagtgggcgatgtgctcaggagatgtctgagcactacactaaagcgcag
tgctgttgtgacagaggtcactgctgggcccgagggacagtgccagtgatatgtccaagc
cggagatctgatgaattccaaaagatgtgtttagagggagggtatccagatgtggaacct
ggcttcagagcggacagagttcctcagcagccctatggacctgatggcctaccacattat
ccaacgaatgggaatggtcatatttatccagagcttccgcaaatcccgcaaatcccacag
atccctcaaatcccccaaatcccccagatcccccaaatccctcatattcccattaatgga
catggtaatggcaatggacaaagaccacaaggacctgttgttagtttaaatcagaccaca
aacaaatgcctgctgatgcctaacttatgtcttaatggccgctgtatcccagtggggttc
ggtcaccgctgtgaatgtaatatcggctaccaagtggacagccaaaaggagtgctcagat
ataaatgaatgtgcttcctacccatgcacaaatggagactgtgtgaacactgctggctct
tactattgcaagtgccatacaggctttcacaggcctccaggcaagcaggcctgcattgac
actgatgaatgcctgcataatggtgtgctttgtcagcacggccgctgtctgaacatggca
ggtagtttccggtgcatctgcaatgcaggattccagctaacaccagatggcaggaactgt
atggaccatgacgaatgttccataacaaacatgtgtttgaatggcatgtgcatcaatgaa
gatggcagctttaaatgtgtgtgcaaacctggtttcacacttgcctcaagcggtcgctat
tgcacagatattgatgagtgcttgaaccctggtacctgtataaatgggcggtgtataaat
acagaaggttcttacaggtgtgagtgcttggcaggactgactgttggacctgacggacgc
tcatgtgtggacacacatatgcgcagcacctgctatggagctattaaaaagggtgtgtgt
gttcaccctttccatggagcagtcactaaatcagtgtgctgctgtgctagcacagactat
agctttggggagccctgccaactgtgtcctgccctgaattcagcggaattcaatgctttg
tgtcaaagtgggattggattttcagttgatggaacggacattaatgagtgtgcactggat
cctgatatctgctcaaacggagtatgtgagaatctaagaggaggctaccgctgtatctgc
aacacaggctatgagactgaccagagcggccgggcctgtttagatgttgatgaatgcctg
gtgaacagactgctctgtgataatggattatgcaggaacattccaggtagctacacctgt
acatgtcccccgggttatgttttcagacaagacacagatacatgcgaagatctgaatgaa
tgtgagagcagtccatgtattaatggagtgtgtaagaacaatgcaggttctttctcatgt
gtatgctctcctggcagtgtacttgatcggactggcctaatatgcatcgactctctgaag
gcgacatgctggatgaacatccaagaaggccgctgcgagatgaatataaatggtgccact
ttgagatccgagtgctgtgccacgctgggagctgcatggggaagtccctgtgagccctgt
gagaaggatcttgtctgtcaaagaggcttcacacgaccaaaagggaccatttgtgaagat
gttaacgaatgtgaggtgtttcctggtgtttgtctgaatggacggtgtttaaacacacaa
ggatcatttaagtgccagtgtcctgaaggactgacactggatggcacaggacgcctctgt
atcgatatacgctcagagctttgttacctgacctatgatgaggacatgtgtggtcagcca
gtgcctggaagattcaggatggatgtttgctgctgcacagttggagctgcctgggggaag
gagtgtgatgcatgccctgagcctggcacacgcaattatgaaatgctgtgtcccagagga
cctggctttgccaatcgtggagacatacttacaggcagacctatgtataaagacattaat
gaatgtaaagtgttcacaagtatctgtacacatggaacatgccggaacacaatcgggagc
ttcagatgtcgctgtaatagcgggtttaccctggatatggatggacgtaactgcacagac
attgaggagtgtcagatctcccctgacttgtgtggacatgggacatgtgtgaacactcca
ggcagttttgagtgtgactgcttgccaggttatgagagtggcttcatgatgatgaagaac
tgcatggatattgatgagtgtgaacgaaatcctgcattgtgtcgcggaggctcctgtgag
aacacagaaggtagttatcaatgtgtgtgtccacctggtcatcagttatccgaggatgag
gaagcttgtgaagatattaatgagtgtgaactaagtgccactctctgccccaatggggag
tgtgtgaatgtggctggcacttaccactgcacttgtttttctggataccagtcaatccca
gatagaaaagggtgcacagatatagacgagtgcaccattgagaatggaggctgtgacttc
cactgcactaattcagagggcagctacacctgcagttgtggtcagggatatgccctaatg
ccagatcagagaacctgcacagatgtggatgaatgtgaagaagagcctgatatatgtgat
ggtggtcagtgtactaatgttcctggagagtaccactgcgattgttatgatggatacacg
tcgtccatgatcacaaagacctgtatagatgtgaacgagtgtgagcttaatgccaacatc
tgcatgtttggagaatgtgaaaacaccaagggctcattcatctgccattgtgaggttggc
tactctgtacagaagggttcttcaggctgcacagattttgatgagtgtgagatgaatgcc
cacaactgtgccatacatgcaacctgtgtcaacacccccggaagcttccagtgctcctgt
aaaaagggatgggtaggcaatggaatagattgtgttgatgtggatgaatgcaccaatcag
acccacatgtgcagtcctaatgctaagtgtatgaatgtgcctggctcttatcgttgtgcc
tgctcagtggggtttaatggcgacggctttacctgcctagacattgatgagtgcacagag
aatgctgagctatgtgagaatggccagtgtctaaatataccaggaggctatcgctgtgac
tgtgagatgggctttacttcaacccctgacaacagagcttgccaagatatcgacgagtgc
tcctttcaacaactctgtgtgtttggcacatgtaaaaacctccctggcttgttcctctgc
atctgtgaagaaggctatgagttagaccgatcaggggggaactgcacagatgttgacgaa
tgtttggacccgataaactgtgttaatggacactgtgtaaacacaccaggctcttatgaa
tgtaactgccctacagactatgaacttaacccaactggagttggctgtgttgatccacgt
gtagggacctgtttcatggaggtagttaaccgtgggcgtgctggcctgacctgtagtgtg
gaggttggcgttggggtcagtcgctcatcctgctgctgctccaaaggccgagcctgggga
aacccctgtgaattgtgtcctccagtcaactcctcggactataacacactgtgtccagga
ggagagggatttaggcccaacctaattactattatactggaggacatagatgagtgtcag
gagcttcctggtctgtgccagggtggaaattgtataaacacctttggcagcttccagtgt
gactgtccaaatggctactacctcaatgcagatagtcgtatttgtgaggatatcgatgag
tgtttggtgaatcctggtatctgtggtcctggcacatgctataacactctggggaattac
acttgtgtgtgtcctcaggattacatgcaggttaatggaggcaataagtgcttggatatg
aggaaaagcctttgctttcgcaactacaatggcaccacatgtgagaatgagctggccttc
aacataacacaccgcatctgttgttgtggatacaacatgggcaaagcctggaacaaaccc
tgtcaggcatgtcccaaaccaggcactgagggctttcatgttctttgtggaaacattgta
ccagggtttgaaattagcattgaaacggggaaaccagtggatattgatgagtgtcagcag
atcccagggatatgtgccaatggtgtgtgcatcaaccatattggaagttttcactgtgaa
tgtccaagaggattcagctataacgatttgctacttatatgtgaagacaatgatgagtgt
agtggttcagagatcttgtgccagaggaatgcagactgtattaacagccctggcagctat
cgctgtgagtgttcagatggcttcaagctctcacccattggagcctgtatagatcgaaat
gagtgtttggaaacccccaacctttgcagtcatggcaagtgtgtggacatacaaggtggc
tatatgtgtacatgccatgctggcttcatagccacccccagtggaaagatgtgcatggac
attgatgagtgtgtgcatcagccctgtaggaatggcacatgtaagaatactgtgggatcc
tacaactgcttctgccatcctggctttgagctcactctaaataaccagtgcacagatatc
gatgaatgttcaacagcatatagtcagctgtgtaggaatgcccattgcattaacagtatt
ggctccttccagtgtctatgtgaggatggctatgatctcacccaggataggacgaactgt
gttgatgtgaatgagtgcataatgctacctggaatatgtgctcctggaacatgccacaac
ttggatggctcttttcgctgtatttgtccacctggttacatcgtacagaataatcaatgt
gtagatgagaatgagtgtgaggaagaccccaacatctgtctatttggctcttgctacaat
aacccaggcagctttgagtgtgtgtgcaaaacaggcttcgttctctcagaaaatggacgc
cgctgttatgacacaagagagagtttttgcttcacccgctttgagaacggaaaatgctcc
aaccctcaggcattcaacaccaccaaagacaaatgctgctgtagcaccatgtccaatgag
ggctggggctacccctgtgagctctgccctaaagagcatgatgctggatttcaggacatt
tgtccttttggctatggaatcattccagggattggggatacaatcattgatctgaacgaa
tgtgtggagaacccaggcatttgtcacaatggccactgcatcaacactgatggctccttt
cgctgcgagtgttctacaggctacacactcaattacactggaacacattgtatcgatgtc
gatgagtgtgcagtggggaatctatgtggaaatggatcttgcactaatgtgataggaagc
tttgaatgcaactgtgaggaaggttttgagccagggccaatgatgacatgtgaagatata
aatgaatgtgcgcagaaccctttgctctgtgcgttccgctgcatcaatacatttggggga
tatgagtgctcttgcccgtccggctacacactccgagatgatgggcgaatgtgccaggac
ctgaatgagtgtgcagagggtttacatgactgtgacacaaagggtatgaactgtaagaac
ctcatcggaacattcatgtgcttgtgtcctgttggaatggtgcgcaagatggatgacgaa
gtgtgtcatgatgagaacgagtgccgcactaagccaggtatttgtgagaatggccactgt
gtgaacactataggcagttacatgtgtgagtgtggagaaggcttccagtctgattcttca
catactcaatgccttgactacagacaaggattctgtttcactgaggtgctgcagaccatg
tgtcagatgtcctccagcagtagaatacccagcaccaaatcccagtgctgctgttatggt
ggacgtggctgggggaaccagtgcgagctctgtcctctgccaggcactgtcaaatacaag
aaactgtgtccacacgggccgggctttgccacagatggcacagatatagatgaatgtaag
gtcataccggacgcatgtaagaatggccggtgtatcaatactgtgggttcctttaaatgt
cactgtagtgcaggctacacagccaccattacagccactgcttgtgttgatttggatgag
tgtttaatgtccccaaagccatgcaactttatctgcaagaacacagagggcagctatatg
tgctcctgtccacgtggctatatattgcaagaggatggcagaacatgtaaagatttggac
gaatgccagttaaagaggcacaactgccagtttatgtgcattaacactattggtggattc
gcttgcaaatgtcctccaggctttacacaacaccacactgcctgtatggataataatgag
tgtgctgcagagcctcgtctgtgtggagctaaaggcatctgccagaactcaccaggcagc
tttagctgtgaatgccagcaaggattcagtctggactctacgggcctgcactgtgaagat
attgatgagtgtaaaagcaaccataagtgtcagtatggttgtgacaacatgttagggggg
taccgctgcagttgcccacaaggctatacccagcactaccagtggaatcagtgtgttgat
gagaatgagtgctccattcctggcacctgtggcactgcgtcatgttacaacacactgggc
agcttcaagtgtgcctgtccctctggattcaacttcgagcagctctccagcagctgccag
gatgtggatgaatgcacttccttcaaaagcccctgcagctatggctgctccaacactcaa
ggaggctacaaatgtggctgtcctcctggatactatagggttggccaaggacactgtgtc
tcaggtctgggctttgggaagggtcagctgggatctgtcagttcagctggaatggcagag
gatatcagtctctcttctgaagtctgcaatgattgcactgtcaacagtccacaaaagaga
ggaatccggaagagacacgccatccatcaaacagcaccagaggaggaagctccagtcaat
gtggacagtgtggacatggagcagcccctgctactggtactcaacatatcccagtgcacc
cacaaagaccatatccttgagctggtgcctgccctcagggctctcgttcatcacattact
tataacatcacagagggaaatcaggacaaaatattccaactccggcagcatgaggagctc
agctacctgcactgcatgcctgagaaagcttttccagggttttatattttgaagatcagc
agttctccgctctatgatcacacagagctgcgggagttagagaacaagagggacagagac
tacctctcaggtgagctaggacagaacctgcacatgaagctgcacattacactacaataa
DBGET
integrated database retrieval system