Tenacibaculum finnmarkense: PJJ26_01840
Help
Entry
PJJ26_01840 CDS
T08880
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
Organism
tfi
Tenacibaculum finnmarkense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
AAA_30
AAA_11
Viral_helicase1
DpnI_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCC42625
LinkDB
All DBs
Position
272806..275931
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MKNPSNFQVYNASAGSGKTFTLVKEYLKVLLNSEDIFRFQKILAITFTNKAAGEMKERVL
ENLQEFSQGKENDLFQIIIKEISIDKEKVQERSQKILDAVLQNYSAFSITTIDSFTHRII
KSFAYDLGLPLNFEVEMDAISLLNEAVDVLISKIGTDTDLTKLLIDFSLDKADDDTSWDI
SVELNEFSRILLNEDDTEHFRALEDKKLSDFTNLKSKLFKNQRQIKTRFSEIGKKGLAII
ETAQLEAKDFYYSMLPKHFLALSQNPAKATFFEESKLREHIEENNFYSKSKSNDIKSAIE
GILPELLTLYMESEKLYQQFLMNKLALKSVIPLAVLNYINVELTHIKEENNIRLNAEFNQ
LISDNIKDQPAPFIYERIGERFMHYFIDEMQDTSVLQWENIIPLIDNALAQENSNLLLVG
DGKQAIYRWRGGKAEQFISLGSSTDNPFHIEKEIKSLETNFRSYTEVIDFNNQFFQHTAN
FLENQQYKKLFIDGNKQLTTAKNGGFVSLSFLDKEEEKADEQLKYPKKILETIQKVSASF
SLNEICVLVRKKKDGVAVANYLSENGVNIISSETLLLENSASVKFMVDILQIIQHPNDKE
ALLEVLYFLHTHLELEIAKNLFISEMIQQPIDVVFEELKIHQVSFELSRFHQLPFYEKVE
EIIRCFKLIDSSDAYVQFFLDIVLEQQRRGTSIQEFLDFWEEKKANLSIVAPESGNAVQI
MTIHKSKGLEFPVVIFPYDLDIYRQINPKIWLDDLPSYFDDFKELLVPYNKDLKSINERS
LEIFNEQRSALELDNFNLLYVALTRAVEQLHIITEYKISKKGEENTNFYSGVFINYLKEK
NCWNDGQLDYHFGNSTRASVQKEIFSMAEVQEVFISTPWQAHNIHMLASASKLWNTEQGK
AIEFGNLIHEMMAKIMTQKDIARVVRQYEQQGVIDKRQAVHIEADINKIVSHPELQEYFA
ENATVYNEREIVDVDNQILIPDRLVLSKDNEVTILDYKTGKPSKSYHQQLLKYERVLKSI
HYKVSKKLLIYINEEILVEEV
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaaatccatcaaattttcaagtatataatgcctcggcaggtagtggaaaaacgttt
actttagtaaaggaatatcttaaagttttattgaactcggaagatatttttaggtttcaa
aaaatattagccatcacttttaccaacaaagctgctggtgaaatgaaggagcgtgtttta
gaaaatttacaagagttttcacagggaaaagaaaatgatttgtttcaaattattatcaaa
gaaatttcgattgataaagaaaaggtacaagaacgaagtcagaaaatattagatgccgtt
ttacaaaattattcggctttttcaattactactattgacagttttacacatcgaattatt
aaaagttttgcttatgatttaggattaccgctaaattttgaggtagaaatggatgcaatt
tcattgttaaatgaagcggtggatgtgttaatttctaaaattggtaccgataccgattta
acaaaattactcatagatttttcgttagataaagcagatgatgacacttcttgggatatt
tcggttgaattaaatgagttttcaagaattttattaaacgaagacgatactgaacatttt
agagcgcttgaagataaaaaattaagtgattttacaaatttaaaaagtaaattatttaaa
aatcaacgacaaattaaaacgcggttttcagaaataggaaaaaaaggtttagcaataata
gaaacggcacaattagaagctaaagatttttactattcgatgttgccaaagcattttttg
gcgttgtctcaaaatcctgcaaaagcaacgttttttgaagaatcgaaacttcgagaacat
attgaagaaaataatttttattcaaaatcaaaatctaacgatataaaaagtgcaattgaa
ggaattttacccgaacttttaactttatatatggaatctgaaaaactgtatcagcagttt
ttaatgaataaattggctttaaaaagtgtaattccgttagcggttttaaattatatcaat
gtagaattaacgcatattaaagaggaaaataatattcgattaaatgccgagtttaatcaa
ttaatttcagataatataaaagatcaacctgcgccgtttatttatgagcgtatcggggag
cgatttatgcattattttattgatgaaatgcaagatacatcggtgttgcaatgggaaaat
ataattccgttaatagacaatgcactagcgcaagaaaatagtaatttattattggttggt
gatggaaaacaagccatttatcgttggcgtggtggaaaagcagaacagtttatttcattg
ggttcaagtactgataatccgtttcatattgaaaaggaaataaaaagcctagaaacaaat
tttagaagttataccgaagtgattgattttaacaatcagttttttcagcacacggctaat
tttttagaaaatcaacagtataaaaaattgtttatcgatggtaacaaacaattaacaaca
gctaaaaatggcggttttgtgtctttatcgtttttagataaggaagaagaaaaggcggat
gaacaattaaaatatccgaagaaaattttagagactattcaaaaagtatcggcttctttt
tctttaaatgaaatatgtgtgttggttcgtaagaaaaaagatggtgttgcggtggcaaat
tatttatctgaaaatggcgttaatattatttcttctgaaactttattgttagaaaatagt
gcgagcgtaaaatttatggttgatatattgcaaataattcagcatccgaatgataaagag
gctttgttagaagtgctgtattttttacatacgcatctagaattagaaatagctaaaaat
ttatttatttcagaaatgattcaacagcctattgatgttgtttttgaagagttaaaaata
catcaggtttcttttgaattatcaaggtttcatcaattgccgttttatgaaaaagtggaa
gaaattatccgatgttttaaattaattgattcttcggatgcttatgtacagtttttttta
gacatcgttttagaacagcaacgaagaggaacaagtattcaagagtttttagatttttgg
gaagagaaaaaagcaaatttaagtattgtagcgcccgaaagtggaaatgcagtacaaata
atgactattcataaatcgaaaggtttggagtttcctgtggtgatttttccgtatgattta
gatatttatcgacaaataaatcctaaaatttggttggatgatttgcctagttattttgat
gattttaaagaattattagtgccatacaataaagatttaaaatcaataaatgaacgaagt
ttagaaatatttaatgaacagcgttccgccttagagctagataattttaatttgttatat
gttgctttaacacgtgctgttgagcagttgcatattattacagaatataaaatcagtaaa
aaaggcgaagagaatactaatttttattccggagtttttatcaattatctgaaagaaaaa
aattgttggaacgatggacaattagattatcattttggaaattcaacaagggcaagtgtg
caaaaagaaattttttcgatggctgaggttcaagaagtatttatttcaacgccttggcaa
gcgcataatattcatatgttggcaagtgcatcaaaattatggaataccgagcaaggaaaa
gctattgaatttggaaatttgattcatgaaatgatggcgaaaattatgactcaaaaagat
attgcaagagtggtacgtcaatatgaacagcaaggagttattgataagcgacaagctgta
catattgaagcggatattaataaaattgtaagtcatcctgagttgcaagaatattttgcc
gaaaatgcaacggtatataatgagcgtgaaattgtagatgttgataatcaaattttgatt
cctgatagattggtgctttctaaagataatgaagtaacaattttggattataaaacagga
aaaccctctaaaagttatcatcagcaattattaaaatatgagcgtgttttaaaatcgatt
cattataaggtctcaaaaaagctattgatatatattaatgaagaaattttggttgaagag
gtttaa
DBGET
integrated database retrieval system