KEGG   Tenacibaculum finnmarkense: PJJ26_01840
Entry
PJJ26_01840       CDS       T08880                                 
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
Organism
tfi  Tenacibaculum finnmarkense
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 PDDEXK_1 AAA_30 AAA_11 Viral_helicase1 DpnI_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: WCC42625
LinkDB
Position
272806..275931
AA seq 1041 aa
MKNPSNFQVYNASAGSGKTFTLVKEYLKVLLNSEDIFRFQKILAITFTNKAAGEMKERVL
ENLQEFSQGKENDLFQIIIKEISIDKEKVQERSQKILDAVLQNYSAFSITTIDSFTHRII
KSFAYDLGLPLNFEVEMDAISLLNEAVDVLISKIGTDTDLTKLLIDFSLDKADDDTSWDI
SVELNEFSRILLNEDDTEHFRALEDKKLSDFTNLKSKLFKNQRQIKTRFSEIGKKGLAII
ETAQLEAKDFYYSMLPKHFLALSQNPAKATFFEESKLREHIEENNFYSKSKSNDIKSAIE
GILPELLTLYMESEKLYQQFLMNKLALKSVIPLAVLNYINVELTHIKEENNIRLNAEFNQ
LISDNIKDQPAPFIYERIGERFMHYFIDEMQDTSVLQWENIIPLIDNALAQENSNLLLVG
DGKQAIYRWRGGKAEQFISLGSSTDNPFHIEKEIKSLETNFRSYTEVIDFNNQFFQHTAN
FLENQQYKKLFIDGNKQLTTAKNGGFVSLSFLDKEEEKADEQLKYPKKILETIQKVSASF
SLNEICVLVRKKKDGVAVANYLSENGVNIISSETLLLENSASVKFMVDILQIIQHPNDKE
ALLEVLYFLHTHLELEIAKNLFISEMIQQPIDVVFEELKIHQVSFELSRFHQLPFYEKVE
EIIRCFKLIDSSDAYVQFFLDIVLEQQRRGTSIQEFLDFWEEKKANLSIVAPESGNAVQI
MTIHKSKGLEFPVVIFPYDLDIYRQINPKIWLDDLPSYFDDFKELLVPYNKDLKSINERS
LEIFNEQRSALELDNFNLLYVALTRAVEQLHIITEYKISKKGEENTNFYSGVFINYLKEK
NCWNDGQLDYHFGNSTRASVQKEIFSMAEVQEVFISTPWQAHNIHMLASASKLWNTEQGK
AIEFGNLIHEMMAKIMTQKDIARVVRQYEQQGVIDKRQAVHIEADINKIVSHPELQEYFA
ENATVYNEREIVDVDNQILIPDRLVLSKDNEVTILDYKTGKPSKSYHQQLLKYERVLKSI
HYKVSKKLLIYINEEILVEEV
NT seq 3126 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgaaaaatccatcaaattttcaagtatataatgcctcggcaggtagtggaaaaacgttt
actttagtaaaggaatatcttaaagttttattgaactcggaagatatttttaggtttcaa
aaaatattagccatcacttttaccaacaaagctgctggtgaaatgaaggagcgtgtttta
gaaaatttacaagagttttcacagggaaaagaaaatgatttgtttcaaattattatcaaa
gaaatttcgattgataaagaaaaggtacaagaacgaagtcagaaaatattagatgccgtt
ttacaaaattattcggctttttcaattactactattgacagttttacacatcgaattatt
aaaagttttgcttatgatttaggattaccgctaaattttgaggtagaaatggatgcaatt
tcattgttaaatgaagcggtggatgtgttaatttctaaaattggtaccgataccgattta
acaaaattactcatagatttttcgttagataaagcagatgatgacacttcttgggatatt
tcggttgaattaaatgagttttcaagaattttattaaacgaagacgatactgaacatttt
agagcgcttgaagataaaaaattaagtgattttacaaatttaaaaagtaaattatttaaa
aatcaacgacaaattaaaacgcggttttcagaaataggaaaaaaaggtttagcaataata
gaaacggcacaattagaagctaaagatttttactattcgatgttgccaaagcattttttg
gcgttgtctcaaaatcctgcaaaagcaacgttttttgaagaatcgaaacttcgagaacat
attgaagaaaataatttttattcaaaatcaaaatctaacgatataaaaagtgcaattgaa
ggaattttacccgaacttttaactttatatatggaatctgaaaaactgtatcagcagttt
ttaatgaataaattggctttaaaaagtgtaattccgttagcggttttaaattatatcaat
gtagaattaacgcatattaaagaggaaaataatattcgattaaatgccgagtttaatcaa
ttaatttcagataatataaaagatcaacctgcgccgtttatttatgagcgtatcggggag
cgatttatgcattattttattgatgaaatgcaagatacatcggtgttgcaatgggaaaat
ataattccgttaatagacaatgcactagcgcaagaaaatagtaatttattattggttggt
gatggaaaacaagccatttatcgttggcgtggtggaaaagcagaacagtttatttcattg
ggttcaagtactgataatccgtttcatattgaaaaggaaataaaaagcctagaaacaaat
tttagaagttataccgaagtgattgattttaacaatcagttttttcagcacacggctaat
tttttagaaaatcaacagtataaaaaattgtttatcgatggtaacaaacaattaacaaca
gctaaaaatggcggttttgtgtctttatcgtttttagataaggaagaagaaaaggcggat
gaacaattaaaatatccgaagaaaattttagagactattcaaaaagtatcggcttctttt
tctttaaatgaaatatgtgtgttggttcgtaagaaaaaagatggtgttgcggtggcaaat
tatttatctgaaaatggcgttaatattatttcttctgaaactttattgttagaaaatagt
gcgagcgtaaaatttatggttgatatattgcaaataattcagcatccgaatgataaagag
gctttgttagaagtgctgtattttttacatacgcatctagaattagaaatagctaaaaat
ttatttatttcagaaatgattcaacagcctattgatgttgtttttgaagagttaaaaata
catcaggtttcttttgaattatcaaggtttcatcaattgccgttttatgaaaaagtggaa
gaaattatccgatgttttaaattaattgattcttcggatgcttatgtacagtttttttta
gacatcgttttagaacagcaacgaagaggaacaagtattcaagagtttttagatttttgg
gaagagaaaaaagcaaatttaagtattgtagcgcccgaaagtggaaatgcagtacaaata
atgactattcataaatcgaaaggtttggagtttcctgtggtgatttttccgtatgattta
gatatttatcgacaaataaatcctaaaatttggttggatgatttgcctagttattttgat
gattttaaagaattattagtgccatacaataaagatttaaaatcaataaatgaacgaagt
ttagaaatatttaatgaacagcgttccgccttagagctagataattttaatttgttatat
gttgctttaacacgtgctgttgagcagttgcatattattacagaatataaaatcagtaaa
aaaggcgaagagaatactaatttttattccggagtttttatcaattatctgaaagaaaaa
aattgttggaacgatggacaattagattatcattttggaaattcaacaagggcaagtgtg
caaaaagaaattttttcgatggctgaggttcaagaagtatttatttcaacgccttggcaa
gcgcataatattcatatgttggcaagtgcatcaaaattatggaataccgagcaaggaaaa
gctattgaatttggaaatttgattcatgaaatgatggcgaaaattatgactcaaaaagat
attgcaagagtggtacgtcaatatgaacagcaaggagttattgataagcgacaagctgta
catattgaagcggatattaataaaattgtaagtcatcctgagttgcaagaatattttgcc
gaaaatgcaacggtatataatgagcgtgaaattgtagatgttgataatcaaattttgatt
cctgatagattggtgctttctaaagataatgaagtaacaattttggattataaaacagga
aaaccctctaaaagttatcatcagcaattattaaaatatgagcgtgttttaaaatcgatt
cattataaggtctcaaaaaagctattgatatatattaatgaagaaattttggttgaagag
gtttaa

DBGET integrated database retrieval system