Tenacibaculum finnmarkense: PJJ26_01850
Help
Entry
PJJ26_01850 CDS
T08880
Name
(GenBank) OmpA family protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
tfi
Tenacibaculum finnmarkense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tfi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tfi02000
]
PJJ26_01850
Transporters [BR:
tfi02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PJJ26_01850
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCC42627
LinkDB
All DBs
Position
277367..278740
Genome browser
AA seq
457 aa
AA seq
DB search
MKQIKLAVIALFTFATLGTANAQDSDNPWVVGFGVNSVDIRGSRKFENLVKDGLGTSDWN
ILPSVSRISAEKYLSDGFTVQVAGSLNKIETFLKKDDSDFLYYAIDANVKYDLDPLVNLI
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FKPGVIANLNRIASIMKEYSKAKFSVQGHTDSQGKAANNLKLSQKRAKAVLDYLAVKAGI
SPSRLSSAGFGEDYPIADNKTRAGRAENRRVEIKLTK
NT seq
1374 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tctccttctagattatcatctgctggatttggtgaagactatccaattgctgataacaaa
actagagctggtagagctgaaaacagacgtgttgagattaaattaacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
