Tenacibaculum finnmarkense: PJJ26_04275
Help
Entry
PJJ26_04275 CDS
T08880
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
tfi
Tenacibaculum finnmarkense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_2
TPR_8
TPR_1
TPR_12
TPR_14
TPR_19
TPR_CcmH_CycH
TPR_17
TPR_16
ANAPC3
TPR_11
TPR_7
TPR_15
FAT
TPR_6
ARM_TT21
ARM_TT21_2nd
ARM_TT21_C
TPR_Slam
ChAPs
BTAD
TPR_EMC2
PPTA
jr-ZPR1
Tnp_P_element
HAT_PRP39_N
DUF2225
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCC43046
LinkDB
All DBs
Position
802246..803592
Genome browser
AA seq
448 aa
AA seq
DB search
MLKTNDVYFFDAVEFETIIEHYLNIAKNSLAKKAVALGLEQHPSSIQLKLMKVELLVFDN
ELKEATQLLKNIEAVEPYNDEVFIQKALILSKKELHIEAIAVLKESLSFIEDPADIWSML
GMEYLYLDDYKNARLNFEKCVAFDAEDFSSLYNIVYCFDAEERHIEAIQFLNTYIDKNPY
CEVAWHQLGRKYAEIGMYREALTAFEYSVLIDETFIAGYLEMAKTLEDLNRYEEAIKNYK
ITLELDDPTAFSYIRIGECYEKLENVNAAIHFYKKAVAQDPSLDKAWILLTTICFEDQNY
QKALYYVRKAIKIDEINPFYWRIYSDISLKLNFYEEAVKGLYTCIELGDDEMEVYTDLAD
ILLFLGEFDEALKTLIKAKKLYEDFAEIEYRLCGLFMILDKQAYGLTHLKNALAINFELH
DIINELYPTVFEHEKVQGMVSDYKKALK
NT seq
1347 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaaaaccaacgatgtctatttttttgatgctgttgagtttgaaacaattattgaa
cactatttaaatatagctaaaaattctttagctaaaaaagcggttgccttaggcttagaa
cagcatccgtcatcaattcaattaaaattgatgaaagtagagcttttagtttttgataat
gaactaaaagaagccactcaattactgaaaaatattgaagctgttgagccttataacgat
gaggtttttattcaaaaagcattaattttatctaaaaaggaactgcatattgaagcgatt
gctgtcttaaaagagtccttatcttttatagaagatccagcagatatttggtcaatgtta
ggtatggagtatttgtatttagacgattataaaaatgcccgtttaaattttgaaaaatgt
gtagcttttgatgccgaagatttttcgtctttatataatattgtgtattgttttgatgca
gaagaaaggcatattgaggcgatacaatttttaaacacctatatagataaaaacccttat
tgtgaggtggcttggcatcaattaggtagaaaatatgccgaaataggcatgtatagagag
gcgcttacggcatttgaatattcggtattaatcgatgaaacttttatcgctggttattta
gaaatggcaaaaacactagaggatttaaatcgctatgaagaggctattaaaaactataaa
ataaccttagagttagacgatcctactgctttttcatatataagaataggggagtgttac
gaaaagttagaaaatgttaatgcggcaattcatttttataaaaaagccgttgctcaagat
ccatcgttagacaaagcttggatattattaacaactatttgttttgaagatcagaactat
cagaaagcattgtattatgtgagaaaagcgattaaaatagatgaaataaatcctttttat
tggcgaatatatagcgatataagcttaaaattaaatttttatgaagaggctgtaaaagga
ctttatacttgcattgaattaggcgatgatgaaatggaagtttatactgatttggcagat
attttattgtttttaggtgaatttgatgaagccttaaaaacgttgattaaagcgaagaaa
ttatacgaagactttgccgaaattgaatatcgtttgtgtggtttgtttatgattttagac
aagcaagcctatggtttaacacatttaaaaaatgcgttggcgattaattttgaattgcac
gatattataaatgagttgtatcctactgtttttgagcatgaaaaagttcaagggatggtt
tctgattataaaaaagccttgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
