Tenacibaculum finnmarkense: PJJ26_09480
Help
Entry
PJJ26_09480 CDS
T08880
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 3 N-terminal domain-containing protein
Organism
tfi
Tenacibaculum finnmarkense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_3
Beta-lactamase
Glyco_hydro_3_C
INCENP_N
B2-adapt-app_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCC41700
LinkDB
All DBs
Position
complement(2080618..2082627)
Genome browser
AA seq
669 aa
AA seq
DB search
MKKILILLTIALVQTLTAQRLIQAPTDPLVAKNVEHQKIWVDSILQNMSIDQKIGQLFMI
QAYSNKGKKHQDFINNMIRKYHVGNLIFMQGTPEKQVRLNNEYQAISKVPLLIGFDGEWG
LDMRLKNTYRFPWNMTLGAIDNDELLTATGKRIGQHCKRVGIHINFAPVVDINTNPKNPI
IGNRSFGENKQNVTRKAIAFTKGMQSVGVLANAKHFPGHGDTATDSHLTLPTVNFDKFRL
DSVELYPYKKMFRQGLASVMTAHLSIPALEPNEKLPTSLSKKVVTTLLQEELGFKGLVIT
DGLNMKGAANYATAADINIAAILAGNDMLLIPQDVPGTIRLIKDALVAGNLSQARLHKSV
EKILKAKYLVGLHKYKSVDTENIASDINSPYDEVLHRKLIKNAITVVKNKEAVLPIKNLK
DKKIAYVSLGDAKGDSFVSMLKNYTNVEVVSAKNITVLLQRLQKYNLVVVGFHKSNKNPW
KGYQFSNKNMVWLQEIAKNKKVILDVFTSPYSLLKIPSFENIEGVVVSYQNSVLSQELSA
QALFGAFDLKGKLPVSINEQIKEGTGVFVKGINVLQYTIPEDAGVSSEKLSIIDKRIDTI
LMKRMAPGGQIFVAKNGKVIYNKSFGHHTSLKRMPVKSSDIYDVASLTKILASLPMIMKA
EEEKNKFIF
NT seq
2010 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagatactgatattactaacaattgcacttgtacaaacgctaacagcccaacga
ttaatacaagcaccaacggatccgttagtggctaaaaatgttgaacatcaaaaaatatgg
gtagatagtattttacaaaatatgtctattgatcaaaaaatagggcagttgtttatgata
caagcctattcgaataaaggtaaaaagcatcaagattttatcaataacatgattcgtaaa
tatcatgtaggaaatttaatttttatgcaaggaactcctgaaaaacaagtccgcttaaat
aatgaatatcaggcaatatcaaaagtgccattgctaatcggttttgatggtgaatggggc
ttagatatgcgtttaaaaaacacctatcgatttccttggaacatgactttaggtgctatt
gataatgatgaattgttaacagcaacaggtaaaagaatagggcagcattgtaaaagagtt
ggtattcatattaattttgcgcccgtagtagatattaatacaaacccaaaaaacccgatt
attggaaaccgttcttttggtgaaaataaacaaaatgttactagaaaagcaatcgctttt
accaaaggaatgcaaagtgttggcgtattggcaaatgccaaacattttcctgggcatggc
gataccgctaccgattcgcatttaacattgccaacggttaattttgataaatttcgttta
gattcggtagagttatatccatataaaaaaatgtttcgccaagggctggcaagtgttatg
acggcacatttaagtattccagcattagagccgaacgaaaaattaccaacctcattatca
aaaaaagtagtgactactttactacaagaagaacttggttttaaaggtttggtaattact
gatggtttaaacatgaaaggagctgctaattatgcaacagcagccgacattaatatagct
gcaattttagcaggtaatgatatgttactgattcctcaagatgttcctggtacaatacgc
ttgataaaagatgccttggtagcaggaaatttaagccaagcacgtttacataaatcagtt
gaaaaaatattaaaagccaaatatttagtaggcttacataaatacaaatctgttgataca
gaaaatattgcttcagatataaattcgccttacgatgaggttttacacagaaaattgatt
aaaaacgccattactgtcgtaaaaaataaggaggctgttttacctattaaaaatttaaaa
gataaaaaaatagcttatgtatctttaggcgatgctaaaggagattcatttgtatcaatg
ttaaaaaattatacaaatgttgaggtggtttctgcaaaaaatataactgttttattacag
agattacaaaaatataacttagttgttgttggttttcataaatcgaataaaaacccttgg
aaaggctatcagttttcaaacaaaaacatggtttggttacaggaaatagcaaaaaataaa
aaagttattttagatgtatttaccagtccgtatagtttgctaaaaataccttcttttgaa
aatatagaaggcgttgtagtttcgtatcaaaacagtgttttatcacaagaattatcggca
caagcattgtttggtgcttttgatttgaaaggaaaattaccggtatctattaatgaacag
attaaagaaggtacgggtgtttttgtaaaaggaattaatgttttacaatacacaatacct
gaagatgcaggggtttcatcagaaaaattatcaataatagataaaagaattgataccatt
ttaatgaaaagaatggcgccaggtggtcaaatatttgtagctaaaaatggaaaagtaatt
tataataaaagcttcgggcatcatacttctttaaaaagaatgcccgtaaaaagttcagat
atttacgatgtagcttctttaacaaaaatactggcttctttaccaatgataatgaaggct
gaggaagaaaaaaataagtttatattctaa
DBGET
integrated database retrieval system