Thalassotalea fonticola: RI844_01220
Help
Entry
RI844_01220 CDS
T10167
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
tft Thalassotalea fonticola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tft00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
tft03036
]
RI844_01220 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
tft03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
RI844_01220 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_21
AAA_15
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
SMC_hinge
DUF6154
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOH37885
LinkDB
All DBs
Position
280871..284359
Genome browser
AA seq
1162 aa
AA seq
DB search
MRLKQIKLAGFKSFVDVTSVPFPQEMTAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVLGESSAKNLRGDS
MTDVIFNGSSARKPVGQASVELIFDNTDQRIQGSMADRSEISIRRVVNRDSQNTYYLNGS
KCRRKDITDIFLGTGLGPRSYAIIEQGMISKLIESKPKDLRVFIEEAAGVSKYKERRRET
EVRIRHTRDNLLRLADIRQELAIQIERLHGQSQAAVRFKELKGQERTLKAELTAIKWRQC
RDELEKFKQHELKIELKLDQLVAKQREAELAIVNARDTQDEGANKIAVLQQHKLTLTTEI
TRLEQNIKHAKQRKISLAEDRKRLTDDIQRNSEYLNQELKKQHDLKKVIAQILPELNEND
ARVELLTEQLQDIQHRQHAWQLHWDNFVKKQSEHNNAINVIANKVQSTSDLMRKTEQRIE
SIKQQLATYKLELLKNKLGQSHEHAVEQNIMCEQLHLDVEQLSDEYQNSIISEQSIKAQF
DNISSELQALKSKQRTLNEINQQRADWQVKQNKFLQSLGFSAEHNLSEQLSITPGWETAI
EMVLGQWLSASCLEIIPEHLDIDVALLIKHDENQQSVPIVPDSLAQFIQGKHPFVTLLNS
VKVAHSETQAQQIGKQLTDNNDSVICPQGLWLGGSWLKKGVVEQQSGQLKRNNELLELSV
TINEAQAEFSRFKQDFTAINEKNTNLKSKLEQRNQQHQQSKQLLIEKEQEAKLLNQEFMF
KQTHQQSLQDELLKQEAALNEELKVYENELAQQNALANSAGDDSDIGDTLQHERNSLMQQ
LQDVQLTLKQVTNEQQQQSLVIEKAKTELDSVGTVLERVQEQLLILKQQKQEMATTQQEN
DQPIIKQQEQLQHLLLQSSENDLQQQHINAQLTESHQNIELFNSNQQNLLMLIEEQRSKL
SQLHIDAQTYNVRAKSAVEQLAEMQQTLTVVLDNLPVEAKESQWQIQLARVSKDISRLGA
INLAAIEEFELQSQRKEFLDTQNQDLESALHTLESAIDKIDTETRQKFKETFDQVNNDLK
ILFPKVFGGGSAYLELVGEDLLETGVTIMARPPGKKNSTIHLLSGGEKALTALSLVFAIF
RLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCKLVEEMSETVQFIYISHNKIAMEMASHLTGVTMH
EPGVSRMVAVDIDEAVAMAEAV
NT seq
3489 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcttaaaacaaatcaaattagctggatttaaatcttttgtcgatgtcacgagtgtg
ccatttccacaagaaatgacggctatcgtcggcccaaatggttgtggtaaatctaatata
atcgatgctgttcgttgggttttgggcgagagttcggccaagaatttacgcggcgatagc
atgaccgatgttatttttaatggttctagtgctagaaaaccggttggtcaagcgagtgtt
gagctcatattcgacaatactgatcaacgaattcaagggtcgatggctgaccgaagtgag
atatctatacgccgtgttgttaatcgggactctcaaaatacttattatttaaacggcagt
aaatgccggcgtaaagacattactgacatctttttgggcactggccttggcccaagaagt
tacgcaataattgaacaaggcatgatctcaaagttaattgagtctaaaccaaaagattta
cgggtgtttattgaagaagccgcaggcgtatctaagtataaagaacgtcggcgtgaaacc
gaagttcgtattcgccacactcgagataatttattacgactagctgatatcagacaagag
ttggcaatacaaatagaacggctgcatggtcagtcacaagccgctgttcggtttaaagaa
ttaaaaggccaagagcgtaccttaaaagctgaattaaccgcgataaagtggcgtcaatgc
agagatgaattagaaaagtttaaacagcatgaattaaaaatagagcttaaacttgatcaa
ttagttgccaagcaaagagaagcagagcttgccattgttaatgcccgagatactcaagat
gaaggagctaataaaattgctgttttgcaacagcataaattaaccttaaccaccgagatt
acccgtttagagcagaatattaagcatgcaaaacagcgcaagataagtctcgcagaagat
agaaaacgattgactgatgatattcagcgcaacagtgaatacttaaatcaagagcttaaa
aaacaacacgacttaaaaaaagtgatagcacaaatattgcctgagcttaatgaaaatgat
gctcgagttgaactattaactgagcaattgcaagacatacagcatcgccaacatgcttgg
cagttacactgggataactttgtaaaaaaacaatctgaacataataatgccattaatgta
attgccaacaaagtacagtcgaccagcgatttaatgagaaaaacagagcaacgaatagag
tcgattaaacaacaattagcaacgtataaattggagttattaaaaaacaagcttgggcaa
agtcatgagcatgctgttgaacaaaatataatgtgtgagcaattacacttagatgttgaa
cagcttagtgatgaatatcagaattctattattagtgagcaaagcatcaaagcccagttt
gataacatatccagtgagttgcaagctttgaaatcgaagcaacgaacattaaatgaaatt
aaccagcaacgtgcagattggcaggtaaagcaaaataagtttttgcagtcgctaggtttt
agtgcagagcataacttaagcgaacaactatcgataacgccaggctgggaaacagcaata
gaaatggttttaggtcaatggttaagtgcctcttgtctagaaattattccagagcatcta
gatattgatgtagctctgctgattaaacatgacgaaaatcaacaatcagtaccgattgta
ccagatagtttggcacagtttattcaaggtaaacatccatttgttacattattaaactcg
gtcaaagttgctcattcagaaactcaagcacaacaaatcggaaaacagttgactgacaat
aacgactccgtaatttgcccacaaggtctttggcttggcggttcatggcttaaaaaaggc
gtggtagaacaacaaagtggccagttaaaacgaaataacgaattgctcgagttgtcagtc
actataaatgaggcacaagctgagttctctcgattcaaacaagactttacagcaattaat
gaaaagaatacgaacctgaaaagtaaacttgagcaacgaaatcaacaacatcaacaaagt
aagcaattgctgattgaaaaagagcaagaagcgaagttacttaaccaagagtttatgttc
aagcaaactcatcaacaaagtttgcaagatgaactgttaaagcaagaagcggcgcttaat
gaagagttgaaagtatacgaaaacgaactagctcagcagaacgctttggctaattctgct
ggtgatgacagcgacattggtgacaccttacaacatgagcgaaatagcctcatgcaacaa
ctgcaagatgtgcaattaactttaaagcaagtaactaatgagcaacaacaacaaagttta
gtcattgaaaaagccaagacagaattagattctgttggcactgtgctcgagcgagtacag
gagcaattattaatactgaaacagcaaaagcaagaaatggctacaactcagcaagaaaat
gatcaaccgattataaagcagcaagagcagttacaacatttgttattacaaagctcagaa
aatgatcttcagcagcagcatattaatgctcaactaactgaatctcatcaaaatattgag
ctttttaatagtaatcaacaaaatttattgatgttaattgaagagcaaaggagtaagcta
tcgcagcttcatatcgatgctcaaacttataatgtacgtgccaaatctgctgttgagcaa
ttagctgaaatgcagcaaacattaaccgttgtattagataatttacctgttgaggcgaaa
gagtcgcaatggcaaattcaacttgctcgcgtgagcaaagatatttcaagacttggcgcg
attaatttagctgccattgaagaatttgaattacaatcacagcgcaaagagtttttagat
acacaaaatcaagatttagagtcggcattacatactcttgaatcggcaattgataaaata
gatacagaaacacggcaaaaatttaaagaaacctttgaccaagtcaataatgacttgaaa
atattgtttccaaaagtgtttggtggcggtagtgcataccttgaattagttggggaagac
ctactcgaaactggggtaactatcatggcaagaccgccaggcaaaaaaaatagtacaatt
cacttactttctggtggagaaaaagcgctaaccgcattatcattagtatttgcaatattt
aggttaaatccagcgccgttttgtatgttggatgaagtggatgcaccacttgatgacgcg
aatgttggccgattttgtaaattggttgaagaaatgtctgaaaccgtgcaatttatttat
ataagtcataataaaatagccatggaaatggcttctcatttaaccggtgttaccatgcat
gaaccaggagtgtcgcgtatggttgccgttgatattgatgaagcagttgctatggcagaa
gcagtataa
DBGET
integrated database retrieval system