Thalassotalea fonticola: RI844_18540
Help
Entry
RI844_18540 CDS
T10167
Symbol
rlmD
Name
(GenBank) 23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD
KO
K03215
23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase [EC:
2.1.1.190
]
Organism
tft Thalassotalea fonticola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tft00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
tft03009
]
RI844_18540 (rlmD)
Enzymes [BR:
tft01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.190 23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase
RI844_18540 (rlmD)
Ribosome biogenesis [BR:
tft03009
]
Prokaryotic type
rRNA modification factors
23S rRNA modification factors
RI844_18540 (rlmD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_U5-meth_tr
TRAM
Methyltransf_31
Methyltransf_25
RrnaAD
PCMT
MTS
Methyltransf_11
TRM5-TYW2_MTfase
Methyltransf_15
DOT1
Methyltransf_23
Methyltransf_4
Methyltransf_32
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOH37337
LinkDB
All DBs
Position
4494160..4495491
Genome browser
AA seq
443 aa
AA seq
DB search
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KYLRAKAKKILVAASTRIKPVCKHFYQCGGCDLQHLDYEQQLTFKQQKISDLFRRNSNIE
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RKICLMDMFSHTRHVETMALFCR
NT seq
1332 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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ttttgtcgttga
DBGET
integrated database retrieval system
