Terrisporobacter glycolicus: L0P85_07130
Help
Entry
L0P85_07130 CDS
T08249
Name
(GenBank) phage tail tape measure protein
Organism
tgc
Terrisporobacter glycolicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
Pilin_PilA
HAMP_2
RnaseA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA31907
LinkDB
All DBs
Position
1429603..1433409
Genome browser
AA seq
1268 aa
AA seq
DB search
MATTVVSTKLNLDIGNFKSKMQDAKKSIEDLQKSFKSAGGKSWDPFKSTNLGKKIEDIKT
KASNLGETFKALPGPVKAGAVIIAVTASLKKLYDLGKQRFFEGLLDIKDTISPVLNGITT
AINTVKQAFTEITGFNFNFTSIITTGVNFEAQMKKVATIAGSIGTELNQLISKARELGAA
TTFSATEVGEAMQYMAMAGWSTSEMLDGVQSTLNLAKIGSTDLGTASDILTDDLTALGMG
ANQAGDFADKLAATITRSNTDVVLFGESMKQTGAVAGALGVSMTDLSTAIGLQANAGIKG
SKAGMSLKNLFTNMANPTDKMTAALEKLGMTADQSGSYLKTTADGCTDLEATVKSLKEGT
EGMTRSQKASLIATVAGKNALPGIMSLINASTEEYNSLSEAVDNSTSTVAMFNENMSVLG
LSGKDATDAIQNMKQVFSDTELSATALGLSSKDLGFSISLLGDDSKVTKDNVEDLLDVID
NMNNASGKTDTAWRNLGNAENLDLNKYIDYNSTLGEIDNSIVGLSGSQKDHVKSLIKENM
TVSEANKVLKQYGLSAKQVSLSTMTTSEKMDYLRNSLNGMSDEQMKSELSNLGLADSFEE
VNEIVDMSDDKYSKYKKNLETIQGLSDRMAKSIDETTKSAFFALSSAMEDTLLGAFDRLK
PALLSGSEALTDFFSTWRGQDGNYSFSGFEQGLNDLESKVEQASNNIPSLMDNMFSGMNR
FINGGALDSFLNMGTDIVQNIAKGIINNKENITESISGLIEKICNWINTNGPAIQEAGAT
IIDSIKTGIAKNANNVDSAVDTVFNVVNSFLIAKQDLLQSTGSIVGATFIKGMVKGIAIE
GVNSIGNSIFAIVNTIGSFVGDIGNAGISLATGFVDGFMGFMLDCGFWNDIKEKIMEFDA
WLGEFKLGQGEGITTKLEDAGFNGTKQFGDGAQKGLQESKTQTDATASQIGQGISDNILN
KLETMDASQLKTLEDELRRLQSTTGEVASGIGTNFGKIRESVRTNLMAVTNIGRNQFVNL
SNIVRSQCVNQANIVRNQFTSISNVVRNQSQNARNSATTSFISMSKVISTQCTNARTAVV
SKMMSINAVVNTQAWKARDNATRAFMSLAAVVRTQMSNALTSVRNAMSQIASATNRTLTT
KVNISKTITTTNVAKSIQAKPQTFSFSAVRSIQPRSFSLAATRSLGGINSLATSSYGSPV
ALASESSKVSSGSTTYGGTKGTTKTNSKPTYFEIPLVVDGREMARASAKYMDGELKIINN
RNSRKKGV
NT seq
3807 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacaacagttgtaagcacaaagttaaatctagatataggtaatttcaaaagtaaa
atgcaagatgctaaaaaatctattgaagatttgcagaaaagttttaagtctgcaggtggt
aagagttgggatccttttaagtctactaatttaggtaaaaagatagaagatattaaaaca
aaagcaagtaatttaggtgaaacattcaaagcattacctggtccagttaaagctggtgcg
gttataattgcagttacagcatcattaaaaaagctatatgatttagggaaacaaagattc
tttgaaggtttattagatataaaggatactatatcaccagtcctcaatggtattactaca
gcgataaatacagttaaacaagcatttacagaaattacaggctttaattttaattttact
tcaataattacaacgggtgtaaattttgaagcacaaatgaaaaaagttgccactatagca
ggttctattggtacagaattaaatcaattaatttcaaaagctagagaattaggagcagca
actacttttagtgctacagaggttggagaagctatgcaatatatggccatggctggctgg
tcaacatcagaaatgctggatggagtacaatcaacacttaatttagctaaaattggttct
actgatttaggaacagcatcggatattttaactgatgatttaactgcacttggaatgggt
gctaatcaagctggagatttcgcagataaattagcagcaactattacaagaagtaataca
gatgttgtactatttggggagtcaatgaaacaaacaggagcggttgcaggtgctcttggt
gtatctatgactgatttatcaactgcaattggacttcaagctaacgcaggtataaaaggt
tcaaaagcaggtatgtcattaaaaaacttgtttacaaacatggccaaccctacagacaaa
atgactgcagcacttgaaaaattaggtatgactgcagaccaatcaggctcatacttaaaa
actacagctgatggatgcacagacttggaagctactgttaaatcattaaaagaaggaaca
gaaggaatgacaagaagtcaaaaggcttctttaatagctactgtagctgggaaaaatgca
ttaccgggtattatgagtttgataaatgcttctacagaagaatataacagtttatctgaa
gctgtagataattcaacttctacagttgcaatgtttaatgaaaatatgagtgtacttgga
cttagtggaaaagatgcaacagatgcaatacaaaatatgaaacaagtattttcagataca
gaactaagcgctactgccttagggctatctagtaaagacttaggattctctatatcatta
ttaggtgatgatagtaaagtcactaaagataatgtagaagatttattagatgtaattgat
aatatgaataatgcgagtggaaaaactgatactgcatggagaaatcttggaaatgctgaa
aacttagatttaaataaatatatagattataactctacattaggtgagatagataattct
atagtaggattaagtggttctcaaaaagaccatgtaaaatcgttaattaaagaaaatatg
actgtaagtgaagctaacaaagtattaaaacaatatggattatcagctaaacaagtatct
ttatcaacaatgacaacatctgaaaaaatggattatttaagaaattcgctaaatggtatg
tcagatgaacaaatgaaatctgaactaagcaacctaggtttagcagatagctttgaagaa
gttaacgaaatagtagatatgtcagatgataaatattctaagtataaaaagaatcttgaa
actattcaaggtctatcagatagaatggctaaaagcatagatgaaactacaaaatcggca
ttcttcgctctatctagtgccatggaagatactttattaggcgcttttgatagattaaag
ccagcactacttagtggaagtgaagctttaacagatttctttagtacatggagaggtcaa
gatggtaattatagttttagtggatttgaacaagggttaaatgatctagaaagtaaagtt
gaacaagcatctaataacattccttcactaatggataacatgtttagtggaatgaatagg
tttatcaatggcggagcattagatagtttccttaatatgggaacagatatagttcaaaat
attgcaaaaggaataataaataacaaagaaaatataacggaatcaattagtggacttatt
gaaaaaatttgcaactggataaatacaaatgggccagcaatacaagaagcaggagcaact
attatagattctattaaaacaggaatagctaaaaatgctaataatgttgatagtgcagta
gatacagtatttaatgtagtaaattcattcttaatagctaaacaagatttgctacaaagt
acaggttctattgtgggagccacttttataaagggaatggtaaaaggaatagctatagaa
ggtgttaatagcataggtaatagtatatttgcaatagttaatacaataggttcttttgta
ggagatataggaaatgctggtattagtttagctactggatttgtagatgggttcatgggt
ttcatgcttgattgtgggttctggaatgatataaaagagaaaataatggagtttgatgca
tggctaggagagttcaaattaggtcaaggtgaaggaataactacaaagttagaagatgca
gggtttaatggtactaaacaattcggagacggtgcccaaaaaggcttacaagaaagtaaa
actcaaacagatgctacagctagtcagataggacaaggaatcagtgataatattctcaac
aagcttgaaactatggatgcaagtcaattaaaaactttagaggatgaattgagacgttta
caatcaacaactggtgaagtagcaagtggaataggcacgaactttggaaagataagagaa
agtgttagaactaatcttatggcagttaccaatattggaagaaatcaatttgtaaacttg
tctaatatagtaagaagtcaatgtgtaaatcaagcgaatatagttcgtaatcaatttact
agtatatctaatgtagttcgcaatcaatcacaaaatgctagaaactcagctacaacaagc
tttataagtatgagcaaagtaatatcaactcaatgcacaaatgctagaactgcggttgta
tctaaaatgatgagtattaatgcagttgtaaatactcaagcgtggaaagctagagataat
gcaactagagcatttatgagtttagcagcagttgttagaactcaaatgtcaaatgctttg
acttctgttagaaatgcaatgagtcaaattgcatctgcgactaatagaactttaactact
aaagttaatatatctaagactattacaactacaaatgtagctaaaagtattcaagctaaa
ccacaaacatttagcttttctgcagttagaagcattcaaccacgatcattcagtttagct
gcaactagatccttaggaggaattaactcattagctacttctagttatggttcacctgta
gctttagctagtgaaagtagtaaggtatcttctggaagtacaacttatggaggaactaaa
ggaactactaaaacaaatagtaagcctacatattttgaaatacctttagttgtagatgga
agggaaatggctagggcatctgctaagtatatggatggagaattaaagatcataaacaat
agaaatagtagaaagaaaggagtgtag
DBGET
integrated database retrieval system