Taeniopygia guttata (zebra finch): 100220189
Help
Entry
100220189 CDS
T01082
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1 isoform X1
Organism
tgu
Taeniopygia guttata (zebra finch)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
fn3
Ig_3
Ig_2
ig
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
C2-set_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100220189
NCBI-ProteinID:
XP_032608964
LinkDB
All DBs
Position
26:3852992..3892292
Genome browser
AA seq
2180 aa
AA seq
DB search
MSSHQTVKIFKKSSIPGVAITQFVNDIPQGCSTPDFEKKPLSLTLQEGKNAIFRAVVKGV
PAPEVKWSRTQKGMDDPAKYEMSFNSATNEFILQIKSLVLDDSDLYRCCAVNAYGEASCS
AGLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELKKTLQNSKKMLRKRAAAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DRRDYEKICMKYGIADFRGMLRKLQEMRKDTESEQDKLIHSLKNFEHIRVDKEGNATFSL
EMELKNSNSNVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRVGRRYYFTVNDVQPEDAGVYQVRVE
DVPVFSTELDAQAIPARFRQPLSDVRCAEAGDAEFQCVLCTPCHQPLWLHKSHPLQASDK
HQISVTPDGLTHKLTVRNVGPSDSGLYTLDAGQGSSSAWLLVEYDKGKRRHDEGEKAVRE
TSEWLKEAMADNERARKLRRQEQAAAEGRSSFSTSSGVEKSGWNRTGQGSSQGRGQVHSV
DSDDGSQIFLGKEGLRKTHLNGEMGSGQFSGAGLDGDSAANDGSIFGLKGLGGRSGLRAV
HGRDSVSGKAGPGGVVGGAGEWNSVDGRGEGLLGTVNIDMDDGEGLDSQHDKDGNLDDAS
YRAAFGGAGRLGGGSSGPDGLDPDSTEVGASVGVLFSRTGPRTGAGGNAAVAGMAGGMRA
QHGQDGHATVGDMIGAGINREGQTETPYGKDGLTPHASGQLGQTGRSGSLYGPGGLPGGD
GATPGTGGNSTGEIEALYGPDGQALRTGAGVVGGAGEGGFGSPYGKDGLPAGAGFGGAGG
PGGLGAPYGKDGLPIGAGAGGAGGHGSLYGKDGLPAGAGGAGAGGFGEALYGPDGRPLGA
AVGVGAGAGGFGVPCGKDGLPLGAGVGGVGVAGIGGIGAPYGKDGLPAGAGAGGAGGFGE
ALYDGRPLGAAVDAGGSGAAAGGFGSPYGKGGLPAGAGGAGLGLGEALYGPDGQPLGAGV
GGSGSTGGLGSLYGKDGHPAGAGFGGVGAGGPGAPYGKDGLPSGAGGAGAGEPGEALSLY
GPDGQPLGGGVDGAGAVSARGAGAPYGKDGLPVGAGAGGVGGAGGVGAPYGKDGLPVGAG
AGVSDAGGVGGPYGKDGVPVGAGVGGTGGEGEVGALYGKDGLPIGTGGGAGGVGGPYGKD
GLLPGAVAGAAHFSPGGEEAMGSGRGMDAALSRAPGYAGGAGGEGFSREGSAMWGAGSPY
GEDRGSAVATAGAGGVGRLGGDEWDSVHGKGGVGPAGGPGGEYGLDTHLGRSLRGETGKG
TASDVRGLGNKGSAGDRGSLSGPGGAWGEGRDFRQLGSFYGTNSAFGEAGSKSHDRSVDG
SSSDGFGQGPLSYGQVSGPFGGPPSANQRNQEPDVDLKANDSLNKTESTAQKRRSVLDDL
KVPRCYLNKQLATVRVLKGEPAELSCTVSKDNVTGTWFKDGLKLTSMDGVVFEKKGLVHK
LIINKAEDIHAGKYRFEGGDVKTEASIFVEDPPQVDKVLLKNLTSVPTVAKAGEGVKLRI
PFEGRGPIRAAWMKDRMELGDDTRIRVDKTDTCTTLSISSCDRRDCGDYKVRLKNDSGVL
EINLKLVVIDKPQPPAGPIKIVDSSANNITIQWKPPKDDGGKPVQRYLVERQQVGRNDWE
ILGETPRSCTSFTMNKVEEEMSYYFRVRAMNAEGVSDALESGEVKAAGKASPGAPDPPEI
ISASRDTITISWKAPCKTGTSQIMGYMVQKRKKGTVTWLPVTNVPVKDKKLKVTSLKKGV
QYEFRVAAVNAAGTGQPSDPSEPAFARDPTKSPGQVQDLKVSSSDSSSVTLTWNKPEVQD
GNDVKGYEVEMRRSNSLSWTKCFTLPAESTSCRVQGLQAREKLFLRVRALSDGGPGEASE
LQACAGAAAAAVVSPRLLIDDTVKSFLVIKAGNPIRVKIPFEGSPEPVVTWLKDGLPLPS
RAAVSTEDGSSQLLLRAAEYSDSGTYTVELGDGLGKRETFSFQVQITDIPQPPGAIRLEE
NVPNTVTVTWDPSASEQWENNLYYTVLKRESQKGLWHVLGDLIYNNKFTFTRVVPGRDYY
FRVVAKNDLGASHPSETVQPWRIWKKKAEFRVKTQKYRGVNQNQHPRFLVPLKSHVVVMG
SECHMSCAVGGHPPPKITWYKDSRDLSRDPNYFCTNDFGVCSLVVLGVTKQDEGEYMVEA
SNEVGRAFSKAFLAIKDSSL
NT seq
6543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagccatcagacagtaaaaatcttcaagaaatcttctatcccaggagttgctatc
actcagtttgtgaatgatattccacaaggatgcagtacacctgattttgagaagaaacca
ctcagtctgacattgcaggaaggcaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtc
ccagctcctgaggtgaaatggtcacgtacgcagaaaggaatggatgatcctgccaaatat
gaaatgtccttcaatagtgctacaaatgaattcattctgcagatcaagagcctggttctg
gatgacagtgatttgtatcgctgctgtgctgtcaatgcctacggagaggcctcgtgctct
gctggcctcaggatcatccaagtcggctttaagaggaaggcaaaatacgttcctgttcat
gctgctgatgagctcaagaagacactccagaactccaagaagatgctgaggaagagggct
gcagcaccaaaaccgaagcctctggacaaagaagctgtgtggcagctgttgctgcatgca
gataggagagattatgagaaaatctgtatgaaatatggaattgctgacttccgtgggatg
ctgaggaagctgcaggagatgaggaaggacacagagagtgagcaagacaagttaattcac
agtctcaaaaactttgaacacatcagagtcgacaaggagggaaatgctactttcagcctg
gagatggaactgaaaaacagcaacagcaacgtttacctgctcaaggacggcgagcggctc
cgctacgggaccggggatgagtacaggaagcactgcctgcggagagttgggaggaggtac
tacttcactgtcaatgatgtgcagccagaggacgcaggggtgtaccaggtcagggtggag
gacgtccctgtcttctcaactgaactggatgctcaagccatcccggcgcggttccggcag
ccgctctccgacgtgcgctgtgccgaggccggggacgccgagttccagtgtgtgctgtgc
acgccctgccaccagcccctgtggctgcacaaaagccaccccctccaggccagtgacaag
caccagatctctgtgacacctgatggcctgacccacaagctgactgtcaggaacgtgggg
ccctcggacagcggcctgtacacgctcgacgcgggacagggctcctccagtgcctggctc
ctcgtggagtatgacaaaggaaagaggagacatgatgaaggagaaaaggctgtaagggag
acatctgagtggctgaaagaagcaatggcagacaatgaaagggcgaggaagcttcgtcgc
caagaacaagctgctgctgaaggtcgttcttccttttccacatcctctggtgtggagaaa
agtggctggaacagaacaggtcaaggcagcagtcaaggcaggggccaagtacactctgtt
gattctgatgatggaagccaaatatttttgggaaaagaagggctacgcaaaacccacttg
aatggagagatggggtctgggcagttttctggagcaggtctagatggagactcggcagcc
aacgacggcagcatctttggactaaaaggcttagggggcagaagtgggttaagggctgtc
catggcagggactctgtgtcaggcaaagcaggtcctggtggtgttgtaggaggggcaggt
gaatggaattctgtggatggcagaggtgaaggtttgctgggtactgttaacattgacatg
gatgatggagaaggtttggactctcagcatgacaaggatgggaatttagatgatgccagt
tacagagctgcttttgggggtgctgggaggttgggtggtggaagttctgggccagatggg
cttgatcctgattcaactgaagtgggagccagtgtgggtgttctgttcagcaggactggt
ccaagaactggagctggagggaatgctgcagttgctggaatggcaggaggaatgagggcc
cagcatggccaggatgggcatgccactgtgggtgatatgatcggagcaggtataaacaga
gagggacaaacagagactccttatggcaaggatggcctgacacctcatgccagtggtcag
ttaggacagacaggaagatctggctcattgtatgggccaggaggccttccaggtggagat
ggggctacacctggtacaggtggcaactccacaggagaaattgaggctttgtatggtcca
gatggtcaggcactgagaacaggtgctggtgttgtgggtggagctggtgaagggggattt
gggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggttttggtggggctggtggt
ccagggggacttggagctccctatgggaaagatggtcttccaattggagcaggtgctggt
ggtgcagggggacatggatctctctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgga
gctggtgcaggaggatttggagaggctttgtatggtccagatggtcgaccacttggagca
gctgttggtgttggtgctggtgcagggggatttggagttccctgtggaaaggatggtctc
ccgcttggagctggtgttggtggagttggtgtagctggtatagggggaattggagctccc
tatgggaaggatggtcttccagctggagcaggtgctggtggtgcaggaggatttggggag
gctttgtatgatggtcggccacttggagctgctgttgatgctggtggtagtggtgctgct
gcagggggatttggatctccctatgggaagggtggtctcccagctggagctggtggagct
ggtctaggacttggagaggctttgtatggtccagatggtcagccacttggagcaggtgtt
ggtgggtctggtagtacagggggacttggatctttgtatggaaaagatggccacccagct
ggggctggttttggtggtgttggtgcagggggacctggagctccctatgggaaggatggt
cttccatctggagctggtggagctggtgcaggagaacctggagaggctttgtctttgtat
ggtccagatggtcagccacttggaggaggtgttgatggtgctggtgctgtgagtgccagg
ggagctggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggtgctggtggtgtt
ggtggtgcagggggtgttggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagcaggt
gctggtgttagtgatgcagggggagttggaggtccttatggaaaggatggtgtcccagtt
ggagcaggtgttggtgggactggtggtgaaggggaagttggagctctttatggaaaggat
ggcctgccaattgggactggtggtggtgcagggggagttgggggtccctacggaaaggat
ggtctcctacctggggcagtggcaggagctgctcatttttctcctggaggtgaggaagcg
atgggatctggccgtggcatggatgccgcactgagcagggctccaggatatgcaggtgga
gcaggaggagagggcttttccagggaaggctctgcaatgtggggtgcagggtctccctat
ggtgaggacagagggtcagctgtagccacagctggtgcaggtggagttgggaggttggga
ggggatgaatgggattcagtccatggtaaaggaggtgtgggacctgctggtggaccaggt
ggtgaatatgggctggatacacatcttggcagatctttgagaggtgagactggaaagggc
actgccagtgatgtgagaggactagggaacaaaggttcagctggtgacagagggtccctg
tctggtccaggaggagcctggggagagggcagagatttcagacagttgggctccttttat
ggcacaaattctgcctttggagaggcagggagtaaatcccatgacagatctgttgacggg
agtagttcagatgggtttggtcaaggtccactgagttatggccaggtgtcaggtcctttt
ggtggacctccttcagcaaaccagagaaaccaggaacctgatgtggatcttaaagcaaat
gattccctgaacaagacggaaagcacagcacaaaagagacggagtgtcctggatgatctc
aaagtcccgcgctgttacctcaacaagcagctggcaactgtgcgggtgctgaagggggag
ccagctgagctgtcctgcactgtcagcaaggacaacgtgacaggaacctggtttaaggat
ggcctaaagttaacaagcatggatggagtcgtgtttgaaaagaaaggtcttgtccacaaa
ctgatcattaacaaggctgaagatattcatgctgggaaatacaggtttgaaggtggagat
gtaaaaactgaagcttcaatttttgttgaagatcctccccaggtggacaaagttctcctc
aagaacttgaccagtgtccccacagtggccaaggccggggagggggtgaagctgcggatc
ccattcgagggtcgggggcccatcagggcggcgtggatgaaggacaggatggagctgggg
gatgacaccaggatccgtgtggacaagacagacacctgcaccacgctgtccatctccagc
tgcgacaggagggactgtggggattacaaagtcaggctcaagaatgacagtggtgtcctg
gagatcaacctaaaactcgtggtgatagacaagccacagcctccagcaggacccatcaaa
attgtagacagctctgccaacaacatcacaatccagtggaagcccccaaaggatgatggg
ggcaaaccagtacaaaggtacctcgtggagaggcagcaggtgggcaggaacgactgggag
atactgggagaaacccccaggagctgcaccagcttcaccatgaacaaagtggaggaagag
atgagctactacttcagggtgagagccatgaatgccgagggagtgagtgatgcgctggag
tcaggggaagtgaaggctgctggtaaagcttcccctggtgcgccagatccccctgagatc
atcagtgccagcagagacaccatcaccatatcctggaaagctccttgtaaaactggcact
tcccaaattatgggatacatggttcagaaacgcaagaagggcactgtgacctggctgcca
gtcaccaacgtgcctgttaaagacaagaaactgaaggtgaccagcctcaagaagggtgtg
cagtatgagttccgcgtggcagctgtcaatgctgctggcacaggacagcccagtgacccc
tcagagcctgcctttgcccgggaccccaccaaatctccaggccaagtgcaggaccttaaa
gtgagcagcagtgacagcagcagtgtcaccttgacatggaacaaacctgaagtacaagat
gggaatgatgtgaaaggctacgaggtggagatgaggcgcagtaacagcctcagctggacc
aagtgcttcacgctccctgcagagagcacctcgtgcagggtgcagggcctgcaggccagg
gagaagctgttcctgcgcgtgagggccctcagcgacggcggccccggggaggcctcggag
ctgcaggcgtgtgctggagctgctgctgctgccgtggtctctcccaggttactgatagat
gacacagtgaaaagcttcctggttataaaagcaggaaatcccatccgggtgaagattccc
tttgagggatctccggagccggtggtaacctggttaaaggatgggctcccccttcccagc
cgggctgccgtgagcacggaggatgggagcagccagctgctgctcagggcagctgagtac
agtgacagcggcacctacaccgtggagcttggggatgggctggggaaaagggaaaccttc
agcttccaggttcaaattacagatatccctcagccccctggagccatccgactggaggag
aatgtgcccaacacggtgacagtgacctgggacccctcagcatctgagcagtgggagaac
aacctgtattacactgtcctgaaacgggaatcccagaagggcctgtggcatgtgctggga
gatctgatctacaacaacaagttcaccttcaccagggtggtcccaggcagggattattac
ttcagggttgtggcaaaaaatgatctgggagccagtcatccatcagagactgtgcagcca
tggaggatctggaaaaaaaaggctgaatttagagtgaaaacacagaaatacagaggagtc
aaccagaaccagcacccgaggttcctggtgccacttaagtcacacgtggtggtgatgggc
agcgagtgtcacatgagctgtgctgttggaggccatcccccaccaaaaatcacatggtac
aaggacagcagagacctctccagagatcccaactacttctgcaccaacgactttggagtg
tgctcgctggtggtgctgggggtcaccaagcaggatgagggggagtacatggtggaagct
agcaacgaagtgggccgtgccttcagcaaagccttccttgccatcaaagactcctccctg
tag
DBGET
integrated database retrieval system
