Taeniopygia guttata (zebra finch): 100226538
Help
Entry
100226538 CDS
T01082
Name
(RefSeq) fibroin heavy chain-like isoform X1
Organism
tgu
Taeniopygia guttata (zebra finch)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Filament
FKBP15
CCDC39
CLIP1
CENP-F_leu_zip
CC149
KIP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100226538
NCBI-ProteinID:
XP_030115078
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2919 aa
AA seq
DB search
MRRYFSGYGDGSFTSSSAHCGTLGGGDGRFRGFGYGYGSRSLHNLGGFRNVYTGGGYRGE
GVRYGSCLGFGGWRQPERGFGGRGYFVGGFQSGTTGLGGTYRESSGREVLRGGLGIGEQG
AGQGLGQAGVLRGIEEVHVNTNLLRPIQLQVDPEFQRARSDEREQIKALNNKFASFIEKV
QCLERQNQALLAKWELLQQQSSGPKESRNINSFFQSYITNLQRQLETLQSQKEQLDPEAY
NMLQLVEDYKNRFEDEINKRTSKEEEFVELKKELDSAYMGKMEFEVRVDILRQELEFLRC
LYEAELSQLQTVVGNVDVILSMDNQRDLNMDGIIEEVRREYEGMAHRSTAEVDAMYRGRY
QDLQNMWVSQREQLRNSHQEIQELARQIQRLQPEIEITRKRNSSLQDAVKDAEHRGSSAV
RDGQEKLEELENALQQAKDDLSQLVHDYQELLNVKLGLDIEIAMYRSLLEEEENRIQEGS
PATICVIDYNARASGVFGGIQSVQGRMSSGGTSGSGMKGPVSGGGKGGSSGGGGSCSGGG
GSISGGGKGSRYGGGGSSGSGGSICGGGGSSGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGG
GKGSGYGGGGSSGSGGSICGGGGSSGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGGGKGSGY
GGGGSSGSGGSICGGGGSSGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGGGKGSGYGGGGSS
GSGGSICGGGGSSGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGGGKGSGYGGGGSSGSGGSI
CGGGGSSGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGGGKGSGYGGGGSSGSGGSICGGGGS
SGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGGGKGSGYGGGGSSGSGGSICGGGGSSGSGGS
MSKGGSSSGGWGSSSGGGGSMSGGGKGSGYGGGGSSGSGGSMSKGGSSSGGWGSSSGGGG
SMSGGGKGSGSGGGVSSSGSGGSISKGGSSSGGGGSSCGGGKGSGSGGQGSSGSGGSMSG
GGQSSGGYGSGSGRCSPQSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQGSSGGGGSMSGGGQSSGG
HGSGSGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQGSSGSGGSMSGGGQSSGGYGSGSGS
CSSQSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGSGGQGSSGGGGSMSGGGQSSGGHGSGSGSCSSHGGG
MSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQGSSGGGGSMSGGSQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSGGGS
SCGRRGSMSGSGGQGSSGGGGSMSGGSQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGS
MSGSGGQGSSGGGGSMSGGGQSSGGHGSGSGSCSSHGGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQ
GSSGGGGSMSGGSQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGSGGQGSSGGGG
SMSGGSQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGSGGQGSSGGGGSMSGGGQ
SSGGHGSGSGSCSSQSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGQGSSGSGGSMSGGGQSSGGHGSG
SGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQGSSGSGGSMSGGGQSSGGHGSGSGSCSSH
SGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQGSSGSGGSMSGGSQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSG
GGSSCGRRGSMSGGGQGSSGSGGSMSGGGQSSGGYGSGSGRCSSHSGGMSSGGGSSCGRR
GSMSGGGGQGSSGSGGSMSGGGQSSGGHGSGSGRCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGG
GQGSSGSGGSMSGGGQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGSGGQGSSGG
GGSMSGGGQSSGGHGSGSGSCSSHSGGMSSGGGSSCGRRGSMSGGGGQGSSGSGGSMSGG
GQTAGGGGSSSGSCSPHSGGMSSGGWSSSGRRGSMSGGGGSSGYGGSSYGSGGSSYGSGG
CIGGGEGGSRYGGSSSRRGSMSGGGSSSGGYGSGSGSCSPHSGGMSSGGWSSSGRRGSMS
GGGHSSGGYGSGSGSGSCSPHSGGMSSGSWSSSGRRGSMSGEGGSSGHGGSSYGSSGCTG
GREGGSGYGGSSGYGGGSCTRGSMSGGGSSSGGLGSGSGSGGSSSGGGISSGYGGSSGSG
GSSSGCIGGGDGGSGYGGSSSRRGSMSGGGSSSGGYGSGSGSCSPHSGGMSSGGWSSSGR
RGSMSGGGGSSGYGASSYGSGRSIGGGEGGSAGYGGGSSGRRGSISGGGEGGGSYGSGGS
SYGSGGSSYGSGGCTGGGEGGSGYGGTGSSVRRGSMSGGGHSSGGLGSGSGSGGSSSGGG
ISSGYEGSSGSGGSSSGCIGGGDGGSGYGGSSSRRGSISGGGHSSGGYGSGSGSCSPHSG
GMSSGGWSSSGRRGSMSGGGGSSGYGGSSYGSGGSSYGSGGCIGGGEGGSGYGGTGSSGR
RGSMSGGGHSSGGYGSGSGSGSGSSHSGHMSSGSWSGSGRRGSMSGEGGSSGHGGSSYGS
SGCTGGGEGGSGYGGSSGYGGGSCTSGSMSGGGSSSGGLGSGSGSGGSSSGGGISSGYGG
SSGSGGSSSGCIGGGDGGSGYGGSSSRRGSMSGGGSSSGGYGSGSGTGSCSPHSGGMSSG
SWSGSGRRGSMSGGGSSSGGYGSGSGSCSPHSGGMSSGGWSSSGRRGSMSGGGASSGGYG
SGSGSCSPHSGGMSSGSWSSSGRRGSMSGEGGSSGHGGSSYGSSGCIGGGEGGSGYGGSS
SYGGGSGRRGSISGGGEGGGSYGSGGSSYGSGGCTGGGEGGSGYGGGSGYGGFSGYGGGS
AYGGGSSGRRGSISGGRRSSISGVWGSSSAGTCRPGSGGEGGWDCSGGDSCYGGGTCVDA
SCRDATEECRSGEAWSSPSPGSWSAYGSGSVSPGDAAHK
NT seq
8760 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacgatatttctccggatatggggatgggagtttcacttcttcttctgctcactgc
gggaccttgggtggtggagacgggagattcagagggtttgggtatgggtacggtagcagg
agcctccacaaccttggagggttcaggaatgtctatactggtggaggctacagaggagaa
ggagtaagatatgggagctgccttggctttggtggctggagacaacctgagagaggcttt
ggtggaagaggatatttcgtgggaggttttcagagtggtacaacagggcttggtggcacc
tacagagaaagttcaggcagggaggtactcagaggaggccttggcataggggaacaaggg
gctggacagggactgggacaggctggagttctccgaggcattgaggaggtccatgtcaac
accaacctgctgaggccaatacagctccaggtggaccctgagttccagcgagcgcgctca
gatgagagggagcagatcaaagctctcaacaacaaatttgcatcattcatcgagaaggtt
caatgtctggagcggcagaatcaggcactcttggccaagtgggaacttctgcagcagcag
agctctggccccaaggagagcaggaacatcaacagcttcttccagtcctacatcaccaac
ctgcagcggcagcttgagaccctccagagccagaaggagcagctggatcccgaagcctac
aacatgctccagcttgttgaggattataaaaacagattcgaggacgagatcaacaaacgc
acatccaaggaggaggaatttgtggagcttaaaaaggaactggatagtgcctacatggga
aaaatggagtttgaggtccgagtggatatcctgaggcaggagttggagttccttcggtgt
ttatatgaagctgagctgtcccagctgcaaacagttgttggtaacgttgatgttattctg
tccatggacaaccaaagggacctgaacatggatggaatcatcgaggaagtcaggcgggaa
tacgaggggatggcccacaggagcacagctgaagtggatgccatgtaccggggcagatac
caagacctgcagaacatgtgggtgagtcaacgagagcaactgaggaacagtcaccaggaa
atccaggaacttgccaggcagatccaaagactccaaccagaaattgaaatcacaaggaaa
aggaattccagcctccaggacgctgttaaagatgctgagcaccgtgggagctcagcagtc
agggacggccaggaaaagctagaggagctggaaaatgccctccaacaggccaaggatgac
ctttctcagcttgtgcatgattaccaggagctcctgaatgtgaagctgggcctggacatt
gagatagccatgtatcgatcactccttgaagaggaggagaacaggatccaggaaggatca
ccagccacgatctgtgtcattgactacaatgccagagcttctggagtctttggaggcata
caaagtgtgcaggggagaatgagttctggtggtaccagtgggagcggaatgaaagggcca
gtctctggagggggaaaaggtggaagctctggagggggtggatcctgctctggtggaggt
ggttccatctctggaggtggaaaaggctcaagatatggaggaggaggaagctctggcagt
ggaggctccatctgtggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatgtccaagggt
ggcagcagctctggagggtgggggtccagctctggtggtggtggttccatgtctggagga
ggaaaaggttcaggatatggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatctgtgga
ggaggaggaagctctggcagtggaggctccatgtccaagggtggaagcagctctggaggg
tgggggtccagctctggtggtggtggttccatgtctggaggaggaaaaggttcaggatat
ggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatctgtggaggaggaggaagctctggc
agtggaggctccatgtccaagggtggaagcagctctggagggtgggggtccagctctggt
ggtggtggttccatgtctggaggaggaaaaggttcaggatatggaggaggaggaagctct
ggcagtggaggctccatctgtggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatgtcc
aagggtggcagcagctctggagggtgggggtccagctctggtggtggtggttccatgtct
ggaggaggaaaaggttcaggatatggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatc
tgtggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatgtccaagggtggcagcagctct
ggagggtgggggtccagctctggtggtggtggttccatgtctggaggaggaaaaggttca
ggatatggaggaggaggaagctctggcagtggaggctccatctgtggaggaggaggaagc
tctggcagtggaggctccatgtccaagggtggaagcagctctggagggtgggggtccagc
tctggtggtggtggttccatgtctggaggaggaaaaggttcaggatatggaggaggagga
agctctggcagtggaggctccatctgtggaggaggaggaagctctggcagtggaggctcc
atgtccaagggtggcagcagctctggagggtgggggtccagctctggtggtggtggttcc
atgtctggaggaggaaaaggttcaggatatggaggaggaggaagctctggcagtggaggc
tccatgtccaagggtggcagcagctctggagggtgggggtccagctctggtggtggtggt
tccatgtctggaggaggaaaaggttcaggatctggagggggtgtatccagttcaggtagt
ggaggctccatatccaagggcggcagcagctctggaggtggaggatccagctgtggaggt
ggaaaaggctcaggatctggaggacaaggaagctctggcagtggaggttccatgtctgga
ggcggccagagctccggtggttacggatctggctctggaaggtgcagcccccagagtggg
gggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctggaggtgga
ggacaaggaagttctggcggtggaggttccatgtctggaggcggccagagctctggtggc
catggatctggttctggcagttgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtgga
agcagctgtggtaggaggggctccatgtctggaggtggaggacaaggaagttctggcagt
ggaggttccatgtctggaggcggccagagctccggtggttacggatctggttctggcagt
tgcagctcccagagtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggc
tccatgtcaggatctggaggacaaggaagctctggtggtggaggttccatgtctggaggc
ggccagagctctggcggtcatggatctggttctggcagttgcagctcccacggtgggggg
atgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctggaggtggagga
caaggaagctctggaggcggaggttccatgtctggaggcagccagagctctggtggtcat
ggatcaggctctggcagttgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagc
agctgtggcaggaggggctccatgtcaggatctggaggacaaggaagttctggcggtgga
ggttccatgtctggaggcagccagagctctggtggtcatggatctggttctggcagttgc
agctcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctcc
atgtcaggatctggaggacaaggaagctctggtggtggaggttccatgtctggaggcggc
cagagctctggcggtcatggatctggttctggcagttgcagctcccacggtggggggatg
agctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctggaggtggaggacaa
ggaagctctggaggcggaggttccatgtctggaggcagccagagctctggtggtcatgga
tcaggctctggcagttgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagcagc
tgtggcaggaggggctccatgtcaggatctggaggacaaggaagttctggcggtggaggt
tccatgtctggaggcagccagagctctggtggtcatggatctggttctggcagttgcagc
tcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatg
tcaggatctggaggacaaggaagctctggcggtggaggttccatgtctggaggcggccag
agctctggtggccatggatcaggctctggcagttgcagctcccagagtggggggatgagc
tctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctggaggaggacaaggaagc
tctggcagtggaggttccatgtctggaggcggccagagctctggcggtcatggatctggt
tctggaagttgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgtggc
aggaggggctccatgtctggaggtggaggacaaggaagttctggcagtggaggttccatg
tctggaggcggccagagctctggtggtcatggatctggttctggcagttgcagctcccac
agtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctgga
ggtggaggacaaggaagttctggcagtggaggttccatgtctggaggcagccagagctct
ggtggtcatggatctggttctggcagttgcagctcccacagtggggggatgagctctgga
ggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctggaggtggacaaggaagttctggc
agtggaggttccatgtctggaggcggccagagctccggtggttacggatctggctctgga
aggtgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgcggcaggagg
ggctccatgtctggaggtggaggacaaggaagttctggcagtggaggttccatgtcggga
ggcggccagagctctggcggtcatggatctggttctggccgttgcagctcccacagtggg
gggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggctccatgtctggaggtgga
ggacaaggaagttctggcagtggaggttccatgtctggaggcggccagagctctggtggt
catggatctggttctggcagttgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtggg
agcagctgtggcaggaggggctccatgtcaggatctggaggacaaggaagctctggcggt
ggaggttccatgtctggaggcggccagagctctggtggtcatggatctggttctggcagt
tgcagctcccacagtggggggatgagctctggaggtgggagcagctgtggcaggaggggc
tccatgtctggaggtggaggacaaggaagctctggcagtggaggttccatgtctggaggt
ggccaaactgctggaggaggggggtccagctctggcagttgcagcccccacagtgggggg
atgagctctggaggctggagcagttctggcaggagaggctccatgtctggaggtggagga
agctcaggttatggaggatccagttacggcagtggtggatccagttatggcagtggcggc
tgcattggtggaggagaggggggctctaggtatggagggagctcaagcaggagaggctcc
atgtctggaggtggatccagctctggtggatatggatcaggctctggcagttgcagcccc
cacagtggagggatgagctctggaggctggagcagttctggcagaagaggctccatgtct
ggaggtggtcacagctctggtggatatggatcaggctctggtagtggcagttgcagcccc
catagtggggggatgagctctggcagctggagtagctctggcaggagaggctccatgtct
ggagaaggaggaagctcaggtcatggaggatccagttatggcagcagtgggtgcactggt
gggagagaaggaggttcagggtatggagggagctcaggatatggaggtggctcttgcacg
aggggctccatgtctggtggtggttccagctctggagggctgggatcgggatctggcagt
ggtgggagcagctctggaggaggaatcagctctgggtatggaggaagctcaggcagtggt
ggatcaagctctggctgtattggtggtggggatgggggttcagggtatggagggagctca
agcaggagaggctccatgtctgggggtggttccagctcaggtggatatggatcaggctct
ggcagttgcagcccccatagtggggggatgagctctggaggctggagcagttctggcaga
agaggctccatgtctggaggtggaggaagctcaggttatggagcatccagttatggcagt
ggtcggtccattggtgggggagaaggaggaagcgcagggtatggaggaggaagctccggc
aggagaggctccatctctggtggtggggaaggaggaggaagctatggcagtggtggatcc
agttatggcagtggtggatccagttatggcagtggcggctgcactggtggaggagagggg
ggctcagggtacggaggaacaggaagctcagtccgaagaggctccatgtctggaggtggt
cacagctctggagggctgggatcaggatctggcagtggtgggagcagctctggaggagga
atcagctctgggtatgaaggaagctcaggcagtggtggatcaagctctggctgtattggt
ggtggagatgggggttcaggatatggagggagctcaagcaggagaggctccatatctgga
ggtggtcacagctctggtggatatggatcaggctctggcagttgcagcccgcacagtggg
gggatgagctctggaggctggagcagttctggcaggagaggctccatgtctggaggtgga
ggaagctcaggttatggaggatccagttacggcagtggtggatccagttatggcagcggc
ggctgcattggtggaggagaggggggctcagggtacggaggaacaggaagctcaggccga
agaggctccatgtctggaggtggtcacagctcaggtggatatggatcaggctctggcagt
ggcagtggcagctcccatagtgggcatatgagctctggcagctggagtggctctggcagg
agaggctccatgtctggagaaggaggaagctcaggtcatggaggatccagttatggcagc
agtgggtgcactggtgggggagaaggaggttcagggtatggcgggagctcaggatatgga
ggtggctcttgcacgagcggctccatgtctggtggtggttccagctctggagggctggga
tcgggatctggcagtggtgggagcagctctggaggaggaatcagctctgggtatggagga
agctcaggcagtggtggatcaagctctggctgtattggtggtggggatgggggttcaggg
tatggagggagctcaagcaggagaggctccatgtctgggggtggttccagctcaggtgga
tatggatcaggctctggtactggcagttgcagcccccacagtggggggatgagctctggc
agctggagtggctctggcaggaggggctccatgtctggaggtggttccagctctggtgga
tatggatcaggctctggcagttgcagcccgcacagtggggggatgagctctggaggctgg
agcagttctggcaggagaggctccatgtctggaggtggtgccagctcaggtggatatgga
tcaggctctggcagttgcagcccccacagtgggggcatgagctctggcagctggagtagc
tctggcaggagaggctccatgtctggagaaggaggaagctcaggtcatggaggatccagt
tatggcagcagtgggtgcattggtggtggagaaggaggctcagggtatggagggagctca
agctatggaggtggctctgggaggagaggttccatctctggtggtggggaaggaggagga
agttatggcagtggtggatccagttatggcagtggcggctgcactggtggaggagagggg
ggctcaggatacggaggagggtcgggatatgggggattctctggatatggtggaggctca
gcgtatggagggggaagctcaggcaggagaggatcaatctctggaggaagaagaagctcc
atctctggagtttggggatcaagctctgctggcacctgcaggcctggcagtggaggggaa
ggaggttgggattgctctggaggggacagttgttacggaggtgggacctgtgtagatgcc
agctgcagagatgcgactgaggaatgcaggtcgggagaagcgtggtcttctccaagccca
ggttcctggtctgcctatggaagtggctctgtttcccccggagatgctgcccacaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
