Thermoanaerobacterium sp. RBIITD: SAMN05660242_2088
Help
Entry
SAMN05660242_2088 CDS
T10458
Name
(GenBank) HlyD family secretion protein
Organism
thed Thermoanaerobacterium sp. RBIITD
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HlyD_3
HlyD_D23
Biotin_lipoyl_2
Biotin_lipoyl
CusB_dom_1
Peptidase_M23
DUF7709
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNX54415
UniProt:
A0A285BGU8
LinkDB
All DBs
Position
I:2081078..2082856
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MKKKYIVIISIIIIIIISATIYFERKKSSATTTRTPYIIVTRGNISMHVDGTGNLDTNKR
IITLKGNGVVKKVYHKIGDKVKAGELLYQIEDDDLNQQLQNASINLELAKEQLDNDTKTY
NDAISKQNIVSAYSGIVDSINVKVGQDVNSGTAIAVITDYSNATIKVPFNGSQINNIKVG
QSADIYLYNSYATIKGNVTDVSAQGIPVNGAIYYYVTVGLKNPGALTDGVKAQVTVYTDQ
GPERAIQDGTLSVKNTNTITSSVQGTIASINVKEGQKINAGTLIATLTSNVNDIQIKNDN
LKLQQAQNNYDQIQNQINSLNIYSPIDGILLSQNINEGDKLSGQSSSNYSSNGSASSNSS
NANSGNNSSSSNTTISNLSSVSNQAETAVIVNNDSFSIDVPIDEVDINKIKIGQKASLTT
DDLPGETFDGTVTEISSIPTIQNNVASYDVTVSLPYTDKLKLGQTMNVSIIVAEKNNTLL
LPIEAVQTNVNNKYVVLYDENNSKNNGRTRNNIRQVQTGLYNDKYIEILSGLNEGDKVLI
SGASVTSSTNNRGGFSNGAFGNGGFENRSFGNGSGGAGFMVKQQSSGNRNTK
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaatacatcgtaattattagtatcattataattattattataagtgctact
atatattttgaaagaaaaaaatcttcagctacaacaactcgaacaccatatataatagtc
acacgaggtaatatatcaatgcacgtcgatggaactggtaatcttgatacaaataaaaga
ataataacgttaaaaggtaatggcgttgttaaaaaagtttatcataaaattggagataaa
gtaaaagcaggggaattgctttatcaaattgaagatgatgatttaaatcaacaacttcaa
aatgcttcaatcaatttagagcttgcaaaggaacagcttgataacgatacaaagacatat
aatgacgctatatcaaaacaaaatatagtatcggcatattcaggtattgtagatagcata
aacgtcaaagtaggccaagatgtaaactcaggtacagcaatagccgttataacagattat
tctaatgcaacaattaaggtgccatttaatggttcacaaataaataatataaaagtgggg
caaagtgctgatatttatttatacaattcgtatgcaacaatcaagggaaatgtgacagat
gtttcagcacaaggtataccagtaaatggagcaatatattactatgttacggtgggttta
aagaatcctggagcgctaactgacggggttaaggctcaagtgacagtatatactgatcaa
ggaccagagagagcgattcaagatggtacattaagtgttaaaaatacaaatacaataaca
tcatcagtacaaggtacaattgcaagcataaatgtaaaagaaggacaaaagataaatgca
ggaactcttattgctacattaacaagtaatgtaaatgacattcaaatcaaaaatgacaat
ttaaagttgcaacaggctcagaataattatgatcagattcaaaaccagataaattccctg
aatatttattcgccaattgatggaatattgttatcacaaaatatcaatgaaggtgataag
ctatccggtcaaagtagttcaaattatagttctaatggtagtgctagttctaattccagc
aatgctaattctggcaataatagtagcagtagtaatacaactataagtaatctttcatct
gtttctaatcaagctgagacagcagttatagtcaataatgacagcttttcaatagatgta
cctattgatgaagtagatataaataaaataaagataggacaaaaggcatcactcacaaca
gatgatttgcctggggagacttttgatggcactgtaacagaaatatcatcaataccgaca
atacaaaacaatgtagcatcgtatgatgtaactgtatcactgccgtatacagataaactt
aaacttggtcagactatgaatgtatcaattattgttgctgaaaaaaataatactttgtta
ttgccgattgaagcagttcaaacaaatgtgaataataaatatgtagtattatacgatgaa
aataattctaaaaataatggcagaacaaggaataatataagacaagtgcagactggattg
tataatgataaatacatagaaatattgagcggattaaacgaaggtgataaagtcttaata
tcaggtgctagtgtgacaagtagtacaaataatcgtggtggatttagtaatggagcattc
ggcaatggaggttttgaaaatagaagttttggcaacggatctggtggagctggttttatg
gtaaagcaacaatctagtggaaataggaatacaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system