KEGG   Thiomicrorhabdus sediminis: FE785_08870
Entry
FE785_08870       CDS       T05983                                 
Name
(GenBank) retention module-containing protein
Organism
thig  Thiomicrorhabdus sediminis
SSDB
Motif
Pfam: Calx-beta LapA
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCU90731
UniProt: A0A4P9K759
LinkDB
Position
complement(1943555..1949284)
AA seq 1909 aa
MEVVMKAVVAMILEIQGEVLARDESGNTRLLDVGAELYEGETLITGVTGRVVLQLPDQQS
VTIAGEQSILLTENILAEKVASVDDNTIQDQSIADVLAVLEAGGDLTEDLEATAAGAGAG
GDGGSMSLRLLSIAEQEGAQYQEEGGVPEVARVVETVTPISYQTDPLSTESIQVTTDASV
ANEVIPSIAIDDVTVIEGNEEQPATAIFTVSLSEAATSTVTVSYTTADGTATAGLDYTAV
SGVLTFAPGETVKQIAVPISPDTIYEGNETFDVNLTNPSNATISDAQGLGTIVDNDAEPT
ITIDDVTVNEDAGTATFTVSLSNPSAFPVSVDYATADGSATAGLDYTAQSGTLNFAAGDT
TETITVPISEDLIYEGNETFDVNLTNPSNATISDAQGLGTIVDNDAEPTITIDDVTVNED
AGTATFTVSLSNPSAFPVSVDYATADGSATAGLDYTAQSGTLNFAAGDTTETITVPISED
LIYEGNETFDVNLTNASNATISDPQGLGTIVDNDAEPTITIDDVTVNEDAGTATFTVSLS
NPSAFPVSVDYATADGSATAGLDYTAQSGTLNFAAGDTTETITVPISEDLIYEGNETFDV
NLTNPSNATISDAQGLGTIVDNDAEPTITIDDVTVNEDAGTATFTVSLSNPSAFPVSVDY
ATADGSATAGLDYTAQSGTLNFAAGDTTETITVPISEDLIYEGNETFDVNLTNPSNATIS
DAQGLGTIVDNDAEPTITIDDVTVNEDAGTATFTVSLSNPSAFPVSVDYATADGSATAGL
DYTAQSGTLNFAAGDTTETITVPISEDLIYEGNETFDVNLTNPSNATISDAQGLGTIVDN
DAEPTITIDDVTVNEDAGTATFTVSLSNPSAFPVSVDYATADGSATAGLDYTAQSGTLNF
AAGDTTETITVPISEDLIYEGNETFDVNLTNPSNATISDAQGLGTIVDNDAEPTITIDDV
TVNEDAGTATFTVSLSNPSAFPVSVDYATADGSATAGLDYTAQSGTLNFAAGDTTETITV
PISEDLIYEGNETFDVNLTNPSNATISDAQGLGTIVDNDAEPTITIDDVTVNEDAGTATF
TVSLSNPSAFPVSVDYATADGSATAGLDYTAQSGTLNFAAGDTTETITVPISEDLIYEGN
ETFDVNLTNPSNATISDAQGLGTIVDNDALTTAVSVDEDDISGASGNAGGTGDITPVTSG
TITYDLNGESVDSIVLSTSVGGANGTGLSALDGTSIITVWDAATNTLIGYKSNAPLGSES
DADYLVFTVAVSSITDSGASYDATLYQPIKHHELVAADDVEGSLSVVISAVISGDGGLST
SGSFDLTINDDTPVDFTATSTVVAPGETDVGIALNFEAGADSANPNGYVLDFSNYSDGGQ
VTTSDGQLLFYGSDFEPIMWSQVSPTQVQGTVSGVGAVFTLTVDGNTGSYTFSAVDGTFY
VQNDITITPSNTDIQAGNDPVYGIVDLAGTETDIVVTGSAGDVNSNSLVFGTGNVYVNNG
QTLTFDFYDDSTLNGGAASYDTSGLTDSEINNFVFNTVSVKSTPTFTVEAFDQNGDPVSV
IVYDDNGTQVSTVVGGDTVVTAVEGAFYQVVGTDLYQQVVITGLTGADTGKNFSVKIDGV
SNISEHDVVLSVDATAIDQDGDSAAGTITVGIDQDDVAGVTIGGQLIDGFVAGLAYTTSS
GLSGFTAENGGFNYHLGDSVSFSIGNVLLGTVDSSRIADVMSDGKLFLQEIADIDLNVMD
NQYVENMAVLLQSLDNNADAYDGIHISEAMHELFSDEQFDLANISGEELAGILESNGLTP
VSVEDAMAHVEDMLIEHGAIDAAEDSLIDFSDDGLDYEVAAAESESDSGAESADIEPVEL
AEVVDDAEGEQVLSEGSDVAALDVPETQVPDETMQQIIDDQLNGDSTDT
NT seq 5730 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaggttgtcatgaaagcagtagttgcaatgattctggaaatacaaggtgaagtgttg
gccagagatgagtcggggaatacccgtttactggatgttggcgcggaattgtatgaaggc
gaaaccctgataaccggcgtgacgggacgagttgtattgcagcttcctgatcaacagagt
gttaccatcgctggagagcaatccattctattaacagaaaatattctcgctgaaaaagtg
gcttctgttgatgataacacgattcaagatcaatccattgcagatgtgttagcggtattg
gaagccggtggtgacttaaccgaagatcttgaagctaccgcagcgggtgcgggtgcgggt
ggagatggcggttccatgagcttgcgtctattgagtattgccgagcaagaaggcgctcaa
tatcaagaagaaggtggtgtgcctgaagttgcacgtgttgtcgaaacggtcacgcctatt
tcatatcaaacagatcctctgtcaacagagagtattcaggttactacagacgcttctgta
gctaatgaagtgataccaagtattgcgattgatgatgtgacagtaatagaaggtaatgaa
gagcaacctgcgacagcgatatttacggttagtttgagtgaggcagcgacttctaccgtt
accgtcagttacacaactgcagatggaacagcgacagctggccttgattacactgctgta
agcggtgttcttacttttgcccctggtgaaacggtaaaacaaattgctgtaccaatcagt
cccgacaccatttatgaaggcaatgaaaccttcgatgtgaaccttaccaacccaagcaat
gcgaccatcagtgatgcgcaaggtctgggtacgattgtcgataacgatgcggaaccgacc
atcacaatcgatgatgtgacggtaaatgaagacgcgggaaccgcgaccttcacggtgagc
ttgtcgaacccaagtgcgttcccggtcagtgtggactatgcgacggcggacggtagtgcg
accgcgggtctggactatacggcacaaagcggtaccttgaacttcgccgccggagacacc
accgaaacgattacggtaccgatcagtgaagacctgatctatgaaggcaatgaaaccttc
gatgtgaaccttaccaacccaagcaatgcgaccatcagtgatgcgcaaggtctgggtacg
attgtcgataacgatgcggaaccaactatcacgattgatgatgtgacggtaaatgaagac
gcgggaaccgcgaccttcacggtgagcttgtcgaacccaagtgcgttcccggtcagtgtg
gactatgcgacggcggacggtagtgcgaccgcgggtctggactatacggcacaaagcggt
accttgaacttcgccgccggagacaccaccgaaacaattacggtaccgatcagtgaagac
ctgatctatgaaggcaatgaaacctttgatgtgaaccttaccaatgccagtaatgcgacc
atcagtgatccgcaaggtctgggtacgattgtcgataacgatgcggaaccgaccatcaca
atcgatgatgtgacggtaaatgaagacgcgggaaccgcgaccttcacggtgagcttgtcg
aacccaagtgcgttcccggtcagtgtggactatgcgacggcggacggtagtgcgaccgcg
ggtctggactatacggcacaaagcggtaccttgaacttcgccgccggagacaccaccgaa
acgattacggtaccgatcagtgaagacctgatctatgaaggcaatgaaaccttcgatgtg
aaccttaccaacccaagcaatgcgaccatcagtgatgcgcaaggtctgggtacgattgtc
gataacgatgcggaaccgaccatcacaatcgatgatgtgacggtaaatgaagacgcggga
accgcgaccttcacggtgagcttgtcgaacccaagtgcgttcccggtcagtgtggactat
gcgacggcggacggtagtgcgaccgcgggtctggactatacggcacaaagcggtaccttg
aacttcgccgccggagacaccaccgaaacgattacggtaccgatcagtgaagacctgatc
tatgaaggcaatgaaaccttcgatgtgaaccttaccaacccaagcaatgcgaccatcagt
gatgcgcaaggtctgggtacgattgtcgataacgatgcggaaccaactatcacgattgat
gatgtgacggtaaatgaagacgcgggaaccgcgaccttcacggtgagcttgtcgaaccca
agtgcgttcccggtcagtgtggactatgcgacggcggacggcagtgcgaccgcgggtctg
gactatacggcacaaagcggtaccttgaacttcgccgccggagacaccaccgaaacgatt
acggtaccgatcagtgaagacctgatctatgaaggcaatgaaaccttcgatgtgaacctt
accaacccaagcaatgcgaccatcagtgatgcgcaaggtctgggtacgattgtcgataac
gatgcggaaccaactatcacgattgatgatgtgacggtaaatgaagacgcgggaaccgcg
accttcacggtgagcttgtcgaacccaagtgcgttcccggtcagtgtggactatgcgacg
gcggacggtagtgcgaccgcgggtctggactatacggcacaaagcggtaccttgaacttc
gccgccggagacaccaccgaaacgattacggtaccgatcagtgaagacctgatctatgaa
ggcaatgaaacctttgatgtgaaccttaccaacccaagcaatgcgaccatcagtgatgcg
caaggtctgggtacgattgtcgataacgatgcggaaccgaccatcacaatcgatgatgtg
acggtaaatgaagacgcgggaaccgcgaccttcacggtgagcttgtcgaacccaagtgcg
ttcccggtcagtgtggactatgcgacggcggacggcagtgcgaccgcgggtctggactat
acggcacaaagcggtaccttgaacttcgccgccggagacaccaccgaaacgattacggta
ccgatcagtgaagacctgatctatgaaggcaatgaaaccttcgatgtgaaccttaccaac
ccaagcaatgcgaccatcagtgatgcgcaaggtctgggtacgattgtcgataacgatgcg
gaaccaactatcacgattgatgatgtgacggtaaatgaagacgcgggaaccgcgaccttc
acggtgagcttgtcgaacccaagtgcgttcccggtcagtgtggactatgcgacggcggac
ggcagtgcgaccgcgggtctggactatacggcacaaagcggtaccttgaacttcgccgcc
ggagacaccaccgaaacgattacggtaccgatcagtgaagacctgatctatgaaggcaat
gaaaccttcgatgtgaaccttaccaacccaagcaatgcgaccatcagtgatgcgcaaggt
ctgggtacgattgtcgataacgatgctttaacaactgcagtttctgtagatgaggatgat
atttctggtgcatctggtaatgcaggaggtactggagatattacacctgtaacttccggc
accattacttatgacttaaacggagagtctgttgacagtattgttctgtcaacaagtgtt
ggcggcgcaaatggtacaggtttaagtgccttggatggtacctctatcatcactgtttgg
gatgctgctaccaacaccttaattggttataaatccaatgcaccattgggttcggaaagc
gatgcagattatctggtattcactgttgcagtttcgtctattactgactctggagcgagt
tatgatgcgaccctttatcagccaattaaacatcatgagctagtcgccgcggatgatgta
gaagggtctctaagcgttgttatcagcgcagttatcagtggagacggaggtctaagtacg
tcaggatcgtttgatttaactatcaacgatgatactcctgttgactttacggctacctct
acagtagttgctcctggtgagacggatgttggcattgccttgaattttgaagctggtgcc
gatagcgcaaatccaaatggttacgtattggatttcagtaattatagcgatggcggtcaa
gttactaccagtgacgggcagctattgttctatggttcagattttgaacctattatgtgg
tctcaagttagtccgactcaagtccaaggtactgtcagcggtgtcggtgcagtcttcacc
ttgactgtcgatggtaatactggcagctataccttttctgctgtagatggtactttctat
gttcaaaacgatattacgattactccgtctaatactgatatccaagcgggtaacgatcct
gtctacggtattgtggatttggcaggtacagaaacggatattgttgtaacaggtagtgct
ggtgatgtgaactccaattcactggtgtttggtaccgggaatgtctatgtaaataatggt
caaactttgacatttgatttttatgacgactctaccttgaatggtggtgccgctagttac
gatacgtctggattgacggatagcgaaattaataatttcgtattcaatactgttagtgtg
aaaagtacgccgacctttactgtggaggcttttgatcagaatggagaccctgtatcagtc
attgtatatgatgataatggaactcaagtcagtacagttgttggtggtgatacggtggtt
accgctgtggaaggggctttctatcaagttgttggtacggatttatatcaacaggttgtt
attacaggtttaaccggtgctgatacaggtaaaaacttttcagtgaaaatcgatggtgtc
agtaatatttctgagcatgatgtagtgctcagtgtagatgctacagctattgatcaagat
ggagattcagctgcaggcactatcacggttggtatcgaccaagacgacgttgccggagtg
acaattgggggtcagctcatcgatgggtttgtcgcgggattggcctatacgacctcatct
ggtctgagtggctttaccgcagagaacggtggctttaattatcatttaggtgatagtgtg
agcttctcgattggtaatgtgttgttaggtacagtggattcatcgagaatcgccgatgtt
atgtctgacggaaaactcttcctgcaagaaattgccgatattgacttgaatgtgatggat
aatcagtatgtcgaaaatatggcagtgttgttacagtccttggacaataatgccgatgct
tacgacggaatccatatcagtgaggctatgcatgaactgttctcagatgagcagtttgat
ttggcaaatatttcaggcgaagagctggctggaattttagagtctaatggtctaacacca
gtatcggttgaagatgccatggctcatgttgaagacatgttgattgagcatggggctatt
gacgctgctgaagattcgcttatcgactttagtgatgatggtcttgactatgaagtcgct
gccgctgagagtgaatcagattctggtgctgaatcagctgatattgagccggtcgagttg
gcagaggtagttgatgatgctgaaggtgagcaagtgttgtctgaaggttcggatgttgct
gccttggatgttcctgaaactcaagtgccagatgaaaccatgcagcagatcattgatgat
cagttaaatggcgatagcactgatacctag

DBGET integrated database retrieval system