Thioploca ingrica: THII_0636
Help
Entry
THII_0636 CDS
T03616
Name
(GenBank) signal transduction histidine kinase
Organism
tig
Thioploca ingrica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_9
PAS
PAS_4
Response_reg
HATPase_c
PAS_8
HisKA
PAS_11
Hpt
GAF
PSY3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP54933
UniProt:
A0A090ABG0
LinkDB
All DBs
Position
751530..756884
Genome browser
AA seq
1784 aa
AA seq
DB search
MENQHDLFSFPWLMLCFVDFRGQLKQISPDLAKLLGGDTTEKPIQVHDQDPNEPNNYPSL
FDLITPSQRSVIEAAILQLQHHHQHWNFEISVPFQPVAGYIESKWLLWQATAVPEQQGFY
AQITDISAYKQQINTLHQILVSQHAFFEKSQLGAVLLDSDGRLLEANLALEQLLGYHATE
WIEQPLTKFIYPEDLAVYQTAVTTIMNNRDSKQQLELRLIHKNRQLLWCRTTLTWITYTP
WSPASAGSSPVTLEPEHPTPRELLMMMVEDLSDHQLALETLQQALERYHSLFENATFGIF
HSTLDGKLLSANPALARIFGYTSPQDFKNNASCTGEQLYVHPEQRNQIVQLVQANANQML
QFEVEYYRKDRTIIIANLYLNAVRDAQGTVQYLEGIVEDITTRKQVQKRLQQNEEHYRLL
AENATDMLSQLTPTGEFLYVSSACHYLLGYRKEDLLGHNVYEFIYPVDIDNIKNELTQVI
KKDKLQHMAGSLATSLTLTVSGRIRHQSGQYLWFEITSRFIRHPSTGSIQEILAIWRDVN
QRKQIETAVQSTHERLLLVLDSLDALVYVADLESYEILYLNQYGRTIFGDITGKMCWQAF
WHSQRHYGPCPFCHHRVIHDPQQSDLHREIQVSEYYSPVAKRWYAVHDRVIRWVDGRLVR
LEVAYDITERRKVEQSLQLNQERYALAVGAGKTGVWDWTVNSQAIYLDPNLKKLLGYDEV
ELPNQLSTWMSLVHPHDVKPLQKNLKEYLRQRLPQFEVEYRLLNKAGQFRWMIMRGTVVR
DNSGRPSRMIGTNTDITERKQIEERLQEQERLLRGVAQATHTLLTLPDDDKAIQSALEIL
GRIISVDRAYLFENMTVSQPATPIEAEIFINQKFTWVNERYKPYNTPYKLKNLSYGQYLP
GWYDILVKYEPIAGLVKDFSPPIRSLLESYHVISIVIVPLHFNGQFWGFIGLDDCHQERQ
WSPYEIFALKVVGDSIRGTLARKQYKEFLRQSEARFRSIIEHNRDGIFIVDHEGVIRFVN
PAAETLYKALPGAMVGKHLCAPVDVEPKAEFKFADEEGQHHDGELQLSEIEWEGEPLILA
SLRDITARKQAEIELQRNKEMAEAANRFKSLFLAAMSHEIRTPMNGVMGMTQLLRDTPLN
RQQHHYVKQIGNSGQMLLTVINDILDFSRIEAGKGLALNFIEFDLRNLVEEVIGLFAPTA
QSKKLEILCQLPPNLPKILRGDPSRLRQILNNLLGNAIKFTNQGEVLLRLTVRQETSQQV
VLLFQIQDTGIGIEPQAQKNLFQLYFRSEQASQQYQGTGLGLFISRQLVHNMDGEITVDS
QPGQGTTFWVTLPLEKVTSSARNQPKRLELAEQTERLHGLKVLVVDDNATSRQILLDEMN
HWQMQTKAVSTIEAAWQELQQAQAAKTPYQITLLDAEVPTMAAGITLLQQIKADPQLALN
RVVMLTTLQQPLKPHLVQQATNLLNKPILRTELLECLLSTLDKRDLNPVLKVENYEDDLP
PCWRILLAEDNTINQEVIKDMLKRLRCHVQIAINGLEALKSAERQQFDLIFMDCNMPEMD
GFTACNQIRHYEQQHRQIRTPIIAFTADVMPSTRERCLAAGMDDYLTKPVMFEDLKTMLA
SWLKKFPQSTEAILSLEKQSLTSPTPPVINTVPSIPVQIVNQKTIPLGSEQNQEQPLDLK
VLNDMRQNIPTRKFNLLINLYLQELPNYLGALQQAVTSQDGQALYLAAHKFKGASATFGA
KRVVALCKLLENLGRENALNQAKDALEQIQSECEQIKPILIKQQ
NT seq
5355 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggaaaatcaacacgatttattttcatttccttggcttatgctctgttttgtcgacttt
cgtggtcaactaaaacaaataagtcctgacttagccaagttactcggtggtgataccact
gaaaaaccaattcaggttcatgaccaagaccccaatgaacccaataattatccttcgcta
tttgatctaattacaccatcacaacgatcggttatcgaagcagcgatattgcaattgcaa
caccaccatcaacactggaattttgaaatcagtgtcccctttcaacccgtcgctggttat
attgaatccaaatggttgttatggcaggcaaccgcagttccagaacagcaaggtttttat
gcccaaatcacggatatcagtgcttataaacagcaaattaataccttgcatcaaatttta
gtaagccaacacgctttctttgaaaaatcgcaattaggcgcagtattacttgatagcgac
ggacgtttgctagaagctaatttagccttggaacagttattaggttatcacgctaccgaa
tggattgagcagccgctaacgaaatttatttatccggaagatcttgcggtctatcaaacc
gctgttaccacgataatgaataatcgcgattctaaacagcaattagaactccgcttaatc
cataaaaatagacaactcttgtggtgtcggacgaccttgacttggatcacgtatacccct
tggtcacccgctagcgccggttcttcacccgttactctagaaccagagcatccaacacca
agagagctgttgatgatgatggttgaagatcttagcgatcatcaattggcattagaaacc
ttacaacaagctttagaacgctatcatagtctatttgaaaatgcgacttttggtattttt
cactcgaccctggatggcaaattactcagtgctaatccagccttagcgcgcattttcggt
tatacctcgccacaagattttaaaaacaacgccagttgtactggggaacagctttatgtt
catccagaacaacgcaatcaaattgttcaactggtccaagcaaatgctaatcaaatgctc
caatttgaagtggagtattatcgtaaagatcgcacgattattattgctaatctttatttg
aacgcagttcgagatgctcaagggacggtgcagtatttagaaggcattgtggaggatatt
actacccgcaaacaagttcaaaaacgtctccagcaaaatgaagaacactatcgtctgtta
gcagaaaatgccactgatatgttgtctcaactgacaccaacgggtgaatttctctatgtt
tcctctgcttgtcactacttgctaggatatcgtaaagaagatttgctgggacataatgtg
tatgaatttatttatccggttgatattgataatattaaaaatgagttaacccaagtcatt
aagaaagacaagcttcaacacatggccggttctttggcaacctcgctgactttgaccgtc
agtggtcgaattcgtcatcaatccggtcaatatctgtggtttgaaattacgagtcgtttt
attcggcatccaagtaccggttctatccaagaaatcttagcgatttggcgagatgttaat
caacgtaagcaaatagaaaccgcagtacaatcaactcacgagcgattgttattggtactc
gatagtttagatgctttagtgtatgttgctgatctggaaagctatgaaatcttgtattta
aatcaatatggacgcactatttttggcgatatcaccggaaaaatgtgttggcaagctttt
tggcattcccaacgtcattatggaccatgtccattttgtcatcatcgggtcatccatgat
ccccagcaatcggatttacaccgagaaatccaagtttcagaatattacagtccggtggct
aaacgctggtatgcagtacatgatcgcgttattcgctgggtagatggacgcttagttcgt
ttagaagtggcttatgacatcactgagcgtagaaaagtggaacagtcactgcaactgaac
caagaacgttatgcgttggcagtgggtgccgggaaaaccggggtatgggattggaccgtg
aatagccaagccatttacttagatcccaatttaaaaaaattgttgggctatgacgaggtt
gaattacccaaccaattatccacttggatgtctttggtccaccctcatgatgtgaaacca
ttacaaaaaaacctcaaggaatatttacgtcaacggttacctcaatttgaggtggaatat
cggctgctcaataaagccgggcaatttcgctggatgattatgcgtggcaccgtggtacga
gataattccggtcgtccctctcgcatgattggaacgaataccgatatcaccgaacgtaaa
caaattgaagaacgtctgcaagaacaagagcggctcctacgaggcgtagcacaggcaacc
catacccttttgactttaccggatgatgacaaagcgattcaatccgccttagaaatttta
ggtcggattatctcggttgatcgcgcttatctttttgaaaatatgacggtttctcaaccg
gctacgccgatagaagcagaaatatttattaatcaaaaatttacttgggttaatgaacgc
tataaaccctataacaccccctataaattgaaaaatctttcttatggacagtacttgcca
ggttggtatgatattttagtgaaatatgaaccgattgcggggttagttaaagatttttcg
ccaccaattcgttcactcctggaatcctatcatgtgatttccattgtgatcgtaccgctc
cattttaatgggcaattttggggttttattggcttagatgattgtcaccaggaacgacaa
tggtcaccctatgaaatttttgctttaaaagtggttggtgatagcattcgcggtacttta
gcgcgtaaacaatataaagaattcttacgccaaagcgaagctcgatttcgttctatcatt
gaacataaccgggatggtatttttattgttgatcatgaaggtgtcattcgattcgttaat
ccagcggctgaaacactttataaagcactccctggcgctatggttggtaaacatctctgt
gcaccagtcgatgttgaacccaaagccgaatttaaattcgctgatgaagagggacaacac
catgatggtgaattacaattatctgaaatcgaatgggaaggtgaacccctaattctcgct
tcgttacgggatattactgctcgcaagcaagctgaaattgaattacagcgcaataaggaa
atggcagaagccgctaatcggtttaaaagtctatttttagccgcgatgagtcatgaaatt
cgcacgccgatgaatggggtgatggggatgacacaattattgcgtgacaccccattgaat
cgccagcaacatcattatgtaaagcaaatcggtaattctgggcaaatgttgctaaccgtg
atcaatgatattttagatttttctcgaattgaagcgggtaagggcttagcacttaatttt
attgaatttgatttgcgtaatttagttgaagaggtgattggtttatttgcaccgacagct
caaagtaaaaaattagagattctctgccaattaccacccaatttacccaaaatattacgt
ggcgatcccagtcgattgcgacaaatattaaataatttattaggtaatgcgattaaattt
accaaccaaggtgaagtattattacgcctcacggttcgtcaagaaaccagccaacaggtc
gtgttattatttcaaatccaagatactggcattggaattgaaccccaagcccagaaaaat
ttatttcagctttactttcgttccgaacaagccagccagcaatatcaaggtaccggttta
ggcttattcatttctcgccaactcgtccacaatatggatggagaaatcacggtagacagt
caaccgggtcaagggactactttttgggtgacgctacccttagaaaaagtaacgtcgtca
gcgcgtaaccaacccaaacggcttgaattagcagagcaaacggaaagattacacggttta
aaagtacttgtcgttgatgataatgccactagccgccaaattttactggatgaaatgaat
cattggcaaatgcagactaaagcagttagtacgatagaggcagcttggcaggaattacag
caagcgcaagccgctaaaacaccttatcagatcacgttactcgatgccgaagtacccact
atggcagccggaatcaccttattacaacagattaaagcggatccacaattagcgcttaat
cgggtagtgatgttaacgaccttgcaacaacctttaaaaccgcatctcgttcaacaagcc
actaatctgttaaataaaccgattctaagaacagaattattagaatgcttactgtctacc
ctagacaaacgtgatctcaatccggtgctcaaggtagaaaattatgaagatgatttaccc
ccttgttggcggattttactcgcagaagataatacgattaatcaagaagtgataaaagat
atgttaaaacgattgcgttgtcacgttcagattgccattaatggtttagaagcgcttaaa
tctgcggaaagacaacaatttgatctgatttttatggattgcaatatgccagaaatggat
gggtttacggcgtgtaatcaaatccgtcactatgaacaacagcatcggcaaattcgtaca
cccattattgcttttacggcggacgtgatgccatcaactcgggaacgttgtctagccgcc
ggtatggatgattatttaactaaaccggtcatgtttgaagatttaaaaaccatgttagcg
agttggttaaaaaagtttcctcagtctaccgaggctattctcagtctagaaaagcaatca
ctcacttcgcctacaccacccgttatcaacacagttccaagcattccagttcaaatcgtc
aatcagaaaacgataccacttggatctgagcaaaatcaagaacaaccactggatttaaaa
gtattaaatgatatgcgccaaaatatccccacccgaaaatttaatttactgatcaattta
tatttacaagaattacccaattatttaggtgcattacaacaagcggttacttcacaagat
ggtcaagcattatacttagctgcgcataaatttaaaggtgctagtgcgacttttggtgcc
aaacgggtcgtggctttatgtaaactgctagaaaatttaggtcgggaaaatgcacttaat
caagctaaggatgcgttagaacaaatccaaagcgagtgtgagcaaattaaacccatttta
atcaaacaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
