Thioploca ingrica: THII_1485
Help
Entry
THII_1485 CDS
T03616
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
tig
Thioploca ingrica
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP55782
UniProt:
A0A090AJR2
LinkDB
All DBs
Position
1770027..1772939
Genome browser
AA seq
970 aa
AA seq
DB search
MAKLCAEVTATYKNSAMRTVLQDFLASLDKWGKIALERYIRINYDEKRVLIWPSQRRGIE
RLVQGNSFALCTPTGSGKTTVAKLAIIQSLFNQANPNFDEKIAPLAIYLVSSRALAVEVE
IKFNRVFRRIHKPNVQVTGLYGGTDWGPTDAWLTTEEPTVLICTYEKAEALIRFLGVPFL
YRVSLIIVDEAHSVQFNGQSDQLQQSESRSLRLESLINRLLTHLERKSRVIALSAVAAGA
EDTIAQWITGHPEVQVTQIHYRSTRQLVGRLECLPHREFQIYYDLLDNASLQFEDSDHKG
SPFVPKPFPACPPAPNLEEDGIEKQLRPYLFWAAMHLAAPDDQGQQRAVLISVTQGIWGY
AKDLLQLIEETWNNIEEPTLFKELSNKENIEKPTFFKEPTDKNKLNLWRKCLQACKDYYS
ERSREYRLLQKGIVVHHGKMPGLMARLLIEVIQERIVHLVLATSTLSEGVNLPFETVLIP
TLRRGQKNISVQEFNNLIGRTGRPGFGTEGRGLVLLHPQSSEWNINNSRDLYFKFIKELK
ERKAITDDTNAKSPLAELLILIKEKWQELTKSTDENEFMMWLETTAPLTLEEQEISPAVE
SLDTLDSILLSNLVEIEQISNSILTSDELEDALRRVWQKSYAYYATQQEIKWENIFIRRG
KSLNTNIYPNFTERKRLYHTNLPPRAGKQLLNKYQDIVNLLKQGEEYALYDDDKKFEYIS
TVVNSIKELPKFNFSKEEIGKSSWKQILRWWLNPSKSKWPSETKVSDWHQYISQNLIYRF
NWGLGSVIALAMDDAHKDIIIPLSFSLDDWPQTGLPWIVFWLKELITWGTLEPVAAYLLA
KGIKFTRADAQTAAQEYYKQVQAQPPNEQLDARTIRNWTIDFYKDKKIANDFKKLSKDIK
VELLRDFSKTTKQFFRVIPIEKDNKVCWLDPGGFPLAICDKTNGWDSNYLNIFDFKLDPI
KKLVLTESYI
NT seq
2913 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggctaaattatgtgctgaagttactgcaacttataaaaacagtgctatgcgaactgtt
ttgcaagattttttagcaagtttagataaatggggtaaaatagcactagaacgttatatt
cgcattaattatgacgagaaaagggtattaatttggccttcacaaagaagaggtattgag
cgtttagttcaaggaaattcattcgcactttgtacgccgactggctccggtaaaacgaca
gtagccaaacttgctataatccaaagtctttttaatcaagccaatcctaattttgatgaa
aaaattgcaccactggcaatatatctcgtttcaagtcgagccttagccgtcgaagttgag
ataaaattcaatcgggtttttcgacgtattcacaagccaaatgttcaggtaacgggttta
tatggaggaaccgactggggtccaaccgatgcttggttaactactgaagaacccactgtt
cttatttgcacttatgagaaagcagaagcattgataaggtttctaggtgtaccttttcta
taccgagtctcactaattatcgttgatgaagcgcattctgtccaatttaatggtcaatcg
gaccaattacaacaatctgaaagtcggtctttacgtcttgaatcattgattaatcgttta
ttaactcaccttgagcgaaaaagtcgagtcatcgcgttatcagcggttgcggcaggagca
gaagataccattgcccaatggataacaggtcatcctgaagttcaggtaactcagattcat
tatcgtagtacccgtcaattggtcggtcgtcttgaatgtttaccccatcgggagtttcaa
atttattatgatttgctcgacaatgccagtttacagtttgaagacagtgatcataaaggt
tccccttttgttccaaaaccatttcctgcctgtccgccggctccaaatttagaagaggat
ggcatagaaaaacaacttcgtccctatcttttttgggctgctatgcaccttgccgcacct
gatgatcaagggcaacaacgagcggttcttatctctgtgactcaaggaatttggggttat
gctaaagatctgctccaattaatagaagaaacctggaataatattgaggaacccactctt
ttcaaggaattgagtaataaagagaacattgagaaacccacttttttcaaagaaccaact
gataaaaataagttgaatctctggagaaaatgtttgcaagcctgtaaagattattacagt
gagagatcacgcgaatatagattattacaaaaaggaatcgtagttcatcatggaaaaatg
ccgggtttaatggcaagactattaattgaagtcattcaagaaagaattgtacacttagtt
ttggccacctcaaccttatcagaaggagtcaatctaccgtttgaaacagtcctgattcca
actttaagacgaggtcaaaaaaatattagcgttcaagaatttaacaatttgattggtaga
actgggcggccaggatttggtacagaaggtcgagggttggtgttgttacatcctcaatct
tcagaatggaatattaataatagccgtgatttatactttaaatttattaaggagttgaaa
gaacgaaaagcaataactgatgatacaaatgctaaaagtccgctagcagaactgttgatt
ttaataaaagaaaaatggcaagaattaacaaaatcaacagatgaaaacgaatttatgatg
tggttagaaacaaccgcccccctcactttagaagaacaagaaatctctccagcagttgaa
tctcttgatactttggatagtattttactctctaatcttgtcgagattgaacaaataagc
aactcaatattaacttctgatgaattagaagatgctttacgcagagtttggcaaaaaagc
tatgcgtattatgcaacgcagcaagaaataaaatgggagaatatttttatccggcgaggg
aaatcactcaacacgaacatttatccaaattttacagaacgtaaacgactttatcacacc
aacttaccgccacgcgccggcaaacaacttttaaataaatatcaagatattgtcaactta
ttaaagcaaggtgaggaatatgctctctatgatgatgataaaaaatttgagtatatttcc
actgtagtgaattctataaaagagttacctaaatttaattttagtaaagaagaaataggt
aaatcatcatggaagcaaatattacgttggtggctcaatccatccaagtcaaagtggcct
tctgaaacaaaagtttctgactggcatcaatacatttctcaaaatttaatttaccgattt
aactggggattaggaagtgttattgcattagcaatggatgacgcacacaaggatataatt
atacctttatctttttctctcgatgattggccacaaaccggattgccttggatcgttttt
tggttaaaggaactgattacctggggtacgcttgaaccagtggcggcttatttattggcg
aaagggataaaatttactcgcgctgatgcacaaactgctgcacaggaatattataagcag
gtgcaagcccaaccgcctaatgaacaattagatgcaagaacaatacgaaactggacaata
gatttttataaagataaaaaaatagctaatgactttaaaaagttatctaaagatataaaa
gttgaattattgagagattttagtaaaacaactaaacagttttttagggttattcctatt
gaaaaggataataaagtttgttggcttgatcctggtggttttcctttagcaatttgtgat
aaaactaacggttgggatagtaattatttaaatatatttgattttaaactagatcctatt
aagaaattagtactaacagaaagttatatttag
DBGET
integrated database retrieval system