Thioploca ingrica: THII_2357
Help
Entry
THII_2357 CDS
T03616
Name
(GenBank) hemagglutinin/hemolysin-like protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
tig
Thioploca ingrica
Pathway
tig02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tig00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
THII_2357
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
CshA_repeat
Cadherin_3
HemolysinCabind
FecR
Cupin_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP56654
UniProt:
A0A090AHC0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2858237..2863600)
Genome browser
AA seq
1787 aa
AA seq
DB search
MAVASHIQDISNTDQSLSSQQAITETNVTNSAHSEAIGKIAAVVKGPVTAETTDGQTHTL
KEGDPIHLDETIITAVDSYVKMILNDGTVFQLGPQSRAHLDKYAYDPAVVGGEFESSVSI
GTFRYISGKISGHNQGQHTLIKTPSAHIGIRGSEIDIQVDEQGSTTVVHLSGLISVTSPY
HGGEQIVYEHGTTIHISSESTSAMMVNTLTEPQIEQINQRWEVFGSTDYVIEEKLSQPES
VNPNSSESQPDSSSPPDTSSTPTPDAGARNPFAAATKDVNAGESIDEPISGHETLREYGQ
FTGIAELSRMPSSSSGSAITTRLGTASTSSRFDSGDNLTTTGLTNEIQAQRESVNQEQLI
GNKHTSFVEDEILSLKGDIIQVLPEKPSVPSNHVPITQSDSFVVNDNAPVSIPVATLLAN
DRDSDGDPLQIVAVIDPKSGAVQLVNETEIIFTPQTPFSQGSFNYLVSDGKATTPGEVII
TQSHGPTTQNHVPITQSDSFVVNDNTPVSIPVATLLANDQDSDGEPLQIIAVTDPKSGAV
QLVNETEIIFTPQTPFSQGSFNYLVSDGKATTPGEVIITHNLAPIAHDDQLIIRDLAPLT
IDTSRLLANDSDPNADTLKIISVSQASLNGSVAFNQQGDIVFTPHSNFIENGFGKFTYEV
SDGHDKSAIASVIITLAPTSPTEETPPNPPNQLPVTKNDSIEINHLEPTKITINQLLDND
HDPDNDNLSIISVQDGLNSQVTLNQASGEIVFTPTSTFNNYGQFTYEISDGHDHTATAIV
TLKLNSHPVANPDGPIEINSFEPSKITTSQLLTNDTDPDHDNLSIISVHDGLNSQVTLNQ
DSGEIVFTPTPTFNGSEQFTYELSDGHDHTATATVTVILTDGHTNLDSIAKPDGPFDMAF
QEQISLPIQELLGNDSDPDGDPLTLSRITESAKGTATLDGNGNVIFTRGTDFQGEGGFTY
EITDGKGGLATTQVTLTGSTILVNPLVNPDEGETSKNQTLILPIALLLANDLPKNELIVT
AVNNAIHGEVQLDQANNQVVFKPELNFSGPAHFDYVVANNQGVNVTTFVKIEVINHVPIA
NPDLFDTVSNTPLLIANADLLKNDKDPDGDIDKLTVVSVAAINQSTVTLNGDNILFTPAK
DFEGQAQFSYTITDTSGSPATIPVTVMVERLVHEDHLDTTKNLSITITAKDLLANDKDPN
LTLTAVTPVEQGTVVRDADGNIIFTPAPNFVGEAQFQYSVTDVAGRTDSALVKVMVTNTP
PVAQDDTATTMANQVLTIPITDLLANDHDADPGEKLTLIGVSSANQGEVELKTNEILFTP
AENVTGEASFKYTIMDTSDAQATATVNITVTPPLNLPPVITLPDSQTPLSYQVQNESLLI
DKAATVTDPDSPNFADGTLEVVISPQRSPYDILEIQNQGSINVSSPSGGEITFNGTTIGS
FFTIFSTHILVVKFNENANPDNTEALLQAIAYKNIAPTPLAETLTVKMTLSDGDGGTSEM
VSRDIEITTTNTPPVAEDDSVNLPFNTPTTIAVTDLLQNDKDINPTDILSISEITPISDG
VQAKLVGNEIQLFIDALAAKHFEPVTLDYKVTDGNNGEDSATVTITPDNVIMGTSGDDNL
AGTPKLDIILGQAGNDTFNVSKGSDILLGGEGNDLFILDPTIANSVYINGDSGVNTLSLG
GTDNQILDLITNQRLPLDQQINLDNISKIDLASHSSGHNQLRLSIEDVLDLSDTHQLIIE
GNATSMVNSVSQGWHNEGIDNTGLYNRYTHENAELLVSVDISNQFIS
NT seq
5364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggttgctagtcatatccaagatatcagtaatactgaccaatccttatcatctcaa
caagcgataacagaaaccaatgtcaccaattcggctcattctgaagcaattggtaagatt
gcggcggttgtaaaggggccagtgacagcagaaacaacagatggccaaacacataccctc
aaagaaggtgatccaattcatttagatgaaaccattatcaccgccgtagatagctatgtc
aaaatgattttaaatgatgggacggtattccaattaggtccccaatcacgtgctcactta
gataaatacgcttatgatccggcggtggttgggggcgaatttgaatcttcggtgtctatc
ggtacttttcgctatatcagtggcaagattagtggtcataaccaagggcaacatacgctt
ataaaaacgccttcggctcacattggtattagaggaagtgaaatcgatattcaagtcgat
gaacagggatcgaccaccgttgtccacctgtcaggcttaatcagtgtgacctctccatat
catggtggggaacaaatcgtttatgaacatggtacgacaatacatatctcgagtgaaagt
acttcggcgatgatggttaatactttgacagaacctcagattgaacaaattaatcaaaga
tgggaggtttttggtagcaccgattatgtgattgaggaaaagttatcgcagcccgaaagt
gttaatccaaattcttctgagtcccaaccggattcttcttcaccaccagatacctcttcg
acaccaactcctgatgctggggctagaaatccttttgccgcagccactaaagatgtcaat
gcgggtgaatcgattgatgaacccatttcaggtcatgaaacgcttagagaatatggtcaa
tttaccggtatagcagaattatcacggatgccatcctcttcttcaggatcggcgattacc
acgcgtttaggaacagcgagtacctcaagtcgctttgatagcggtgataatctcactacc
actggattaactaatgaaattcaagcgcaaagggaatcagttaatcaagaacaattaatc
ggtaataaacacacttcatttgttgaagatgagatcctttctttaaagggcgatattatt
caagttcttcccgaaaagccgtcggtccccagtaatcatgtgcccatcactcaaagtgac
tcctttgttgttaatgataatgcaccggtcagtattccagtagcgactttacttgcaaat
gatcgagacagtgatggtgatccgttacagattgttgccgtaatcgatcctaaaagtggt
gccgtccagttggtaaacgaaaccgaaattatcttcaccccgcaaactccttttagccaa
ggcagttttaactacctcgttagcgatggtaaagcaaccacaccaggtgaagtgattatc
actcaaagtcatgggccaacaactcaaaatcatgtccccatcactcaaagtgactccttt
gtggttaatgataatacaccggtcagtattccagtggcgactttacttgcaaatgatcaa
gacagtgatggtgaaccattacagattattgccgtaaccgatcctaaaagtggtgcagtc
cagttagtaaacgaaactgaaattatttttaccccgcaaactccttttagccaaggcagc
tttaactacctcgttagcgatggtaaagcaacgaccccgggtgaagtgattatcactcat
aatttagcaccgattgctcacgatgatcagctaatcattcgagatctcgccccattgact
atagacacaagtcgattattggctaatgatagtgatcccaatgcggatactttaaaaatt
atcagtgtgagtcaagccagtttgaatggcagcgttgcttttaatcaacaaggtgatatt
gtttttactccgcactcgaattttattgaaaacggttttggtaaatttacttatgaagtg
agcgacggtcatgataaatcagcgattgcttcggtcatcattactttagcacccacttct
ccaactgaagagactccgcctaatccaccgaatcaacttccagttaccaaaaatgattca
atagaaattaaccaccttgaaccaaccaagataacaatcaatcagttactagataatgac
catgatccagataacgataacttaagtattatcagcgttcaggatggtttaaatagtcag
gttaccttgaatcaagctagtggtgaaatcgtttttacgccaacatcaacgttcaataat
tatgggcaatttacttatgaaatcagtgatggtcatgatcacacggctaccgctatcgtt
actttaaaactaaattcacacccggtggcgaaccccgatggtcctatagaaattaactca
tttgaaccaagtaagataacaaccagtcagttactaactaatgacactgatccagaccac
gataacttaagtattatcagcgttcatgatggtctaaatagtcaggttaccttgaatcaa
gatagtggtgaaatcgtttttacaccaacaccaacgttcaatggttctgagcaatttact
tatgaactcagtgatggtcatgatcacacggctactgctaccgttaccgttattttaact
gatggacacaccaatttagactcgattgcaaagcccgatggtccttttgacatggctttt
caagagcagatttctcttcctatccaggaattgttaggaaatgattcagatcctgatggt
gatccgcttaccttgagccgtattacggagagtgcgaagggtactgcaacactggatggc
aatggcaatgttatcttcactcgtggtactgatttccaaggagagggaggatttacctat
gaaatcactgatggtaagggtggtttggcgactactcaagtcactctaacgggttcaact
attttagttaatccgttagttaatccggatgaaggggaaacgagtaaaaatcaaacctta
atattgccaatcgctttattattggccaatgatttacctaaaaatgaactgattgttaca
gcagtcaacaatgcgattcatggtgaagttcaactggatcaagcgaataatcaggttgta
tttaaaccagaattaaactttagtggcccagcgcattttgattatgttgttgccaataat
caaggtgttaatgtaaccacttttgtcaagattgaagtcattaatcatgtccctatcgcc
aatcctgatctattcgatacagtaagcaatacgcccttgctcattgccaacgctgacttg
ttaaagaatgataaagatccggatggcgatatcgataagttaacggtggtgagcgtagcg
gcaataaaccagagtacggttaccttgaacggtgataatattctctttacaccggcaaaa
gattttgaaggtcaggctcaatttagctataccattaccgataccagtggcagtccagcg
actatacccgtcaccgtcatggtagaacggcttgtccatgaagatcatctcgacaccact
aaaaacctgagtattacgattacggcaaaagatttattagccaatgataaggatcccaat
ttgactttaacggcggtgactccagtggagcagggcaccgttgtacgagatgctgatggt
aatattattttcacaccggcacctaactttgttggtgaagcgcaattccaatattcggtt
acggatgtcgccggcagaacggatagtgccttagtcaaagtcatggtaaccaacacgccg
ccagttgctcaagatgatacggctaccacaatggcaaatcaggtactgactattcctatc
acggatctattagccaatgatcatgatgccgatcctggtgaaaaattgactctgataggg
gtcagttctgcaaatcaaggtgaggtggaattaaaaacgaatgaaattctatttacccca
gcagaaaatgtgactggtgaagcatcctttaaatacaccataatggataccagtgatgct
caagcgaccgccacggtcaatatcaccgtaacaccacctcttaatttgccaccggtaatt
accttgcccgatagccaaactccccttagctatcaggtacaaaatgaatcattactcatc
gataaagccgctaccgttactgatccagattctcctaactttgcggatggaaccttagaa
gttgttatttcaccccagcgaagtccttatgatatacttgaaattcaaaatcagggttcc
attaatgtctctagtcctagtggtggtgagattaccttcaatggcactacaatcggcagc
ttttttacgattttttctacccatattttggtggtaaaatttaacgagaacgcgaatcca
gataatactgaagccttgttacaagcaatcgcttataaaaatatcgccccgactcctttg
gcagagacgttaacggttaaaatgactctgagcgacggcgacggtggcaccagcgaaatg
gttagtcgtgacattgaaattacaaccactaatacgccaccggtggcagaagatgatagt
gtgaatctgccatttaataccccaacaacgattgcagtcactgacttattacaaaatgat
aaagatattaatccgaccgatattttgagtatctcggaaataaccccgataagtgatggc
gtacaagcgaaattagtgggtaatgaaatccaattgttcattgacgccttagccgctaaa
cattttgaaccggttactttggattacaaggtgactgatggcaataacggtgaagattca
gcgacagttaccattacgcctgacaatgtcatcatgggtacatcaggtgatgataacttg
gctggtacccccaaattagacattattcttggccaagctgggaacgatacctttaacgtt
agcaaaggctcagatattcttctcggcggtgaagggaatgacctatttatccttgaccca
accattgctaatagcgtatatattaatggtgatagtggagttaataccctgagtctgggt
ggcacggacaatcaaattctggatctgatcaccaatcagcggttaccccttgatcaacaa
attaatttagacaacatcagcaaaattgatttagccagtcattccagcgggcataaccaa
ttacgtttaagtattgaggatgtgttggatttgtctgatacccatcaattaattattgaa
ggtaacgcgacgagtatggtaaattcggtttcacaaggttggcacaatgaagggattgat
aatactggcttatataatcgctatactcacgaaaacgcagaactattagtcagtgttgac
attagtaaccaatttatttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system