Thioploca ingrica: THII_3447
Help
Entry
THII_3447 CDS
T03616
Name
(GenBank) PAS domain S-box
Organism
tig
Thioploca ingrica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_9
PAS
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_8
PAS_4
HAMP
PAS_11
HATPase_c_3
AAA-ATPase_like
Cache_3-Cache_2
Mac
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP57744
UniProt:
A0A090AJS5
LinkDB
All DBs
Position
4166803..4170981
Genome browser
AA seq
1392 aa
AA seq
DB search
MQDTTMKLQTKILLIVLPLILTAIFGLGLWSSQQARNSLYGETIHYLELIVKIYAVHLQR
WYRLSKVLNLEHIELARRQYHQRVMKEIEEETASTKTIRPNLFVLHGEGYPLFSSQTSDL
TQLTPWKSLAQQIVAKNSSELFSGYFPQQQVLYVAYRFEPWNWVIFCTVPEREVTSAANI
IYRTTFSVATLYALGTIVLMLFLSHYYLLLPIATLKTAASNIALQQPLIDIPLYRNDELG
QLARDMENMSIAIATYRNQLNEYNSKLEHEITERNQAQAALKQQKEILQTIVDNIPIMIG
LHDAQGQIQWINHEWERVWDCGLEDLKGKDLLKEFYPDQNDAQRVLDYLTLSNPRWCDFK
QISPIGRTLDVSWIHTRLSSGDIISFGQDITERKQAERLLKVYNQTLEHEVLKRTRALRQ
SEEQFRTLTQTTTAGILISNRGKIIYSNPAAQEFLGYTEEQLMNMNGFDIIHPDFRHLAI
QWETEPSHNQVAILHYDLKFIRPDGAERWGNLSVAPFKMNLEPTKLITFIDITEHKRTEA
ALRTTTEQLSLILEQLPIVPYTCEPEGYFVATYMGPTAKTVTGYDPENFTRDSQFWLAHL
HPQDKNNILSEIGNLFVKGYHQHEYRWQVADGSYKWFLDTLRLVNSPENKKKYIIGAWFD
ITERKQMEQALRESEERFNLAMRGTNEGLWDWNLETNQMYYSPRWKQMLGFTEEEMSNQL
QEFTSRLHPDDVEKISITITAYLEKKQTTYEVTFRMQHKQGYYIWILTRGIGIWDSQGTP
LRMIGTHMDLTLQKQAEEALRHSEERLRRYFEQPFIGMATSSLSQGLIQVNDKFCQMLGY
SREELCHMDWAELTHPGDIAADIEQFKRVITREINHYTLDKRYIRKDGQTIYASIAFDCI
RDVDGNVDHFVVLVQDITERKQFEIRLQKAKEAAEVANRAKSQFLANMSHELRTPLNGIL
GYTQILLRHKELNSKQREGLEIIQRSGEYLLTLISDILDLSKIEAGKLTDEPIEFNFTEF
LQSIVDLMKMRAEQKDLQFQYEPLSTLPTFVHADEKKLRQVLLNLLSNAVKFTQQGQIYF
QVSYSNNQANFVVRDTGRGIGAADLTEIFKPFQQAGDQREQIEGTGLGLSISKRLVEIMG
GQLFVESQMEQGSTFWFEIKLPEVQGMVTQPPVSPTIIGYEGNPRQILIVDDQWENRSIL
VHLLDSVGFSLLEANQGKQALRLAYKHLPDAILTDLRMPEMDGFELIRRVRRSAKLNSIV
VIAISATVSEQYQYESLTAGFQAFITKPIHTEHLFKTLKKHLQLNWIYKDYQPTLPLNLT
SGSDREELVGPSPPESVTLYELMMTGNVRQTSAHAMQLAQQDEKLKPFAERVQFLAKNYE
IAKLENLIKHYL
NT seq
4179 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagatacgactatgaagttacaaactaaaattttactcatcgtacttcctttaata
ttaacagctatttttggtttgggattatggtcatcccaacaagctcgaaattcattatac
ggggaaactattcattatctcgagttgattgttaaaatctacgccgttcatttacaacgc
tggtatcgattatccaaagttttaaacttagaacatatcgaattagctcgtcgccaatat
caccaacgcgttatgaaagaaattgaggaagaaacggctagtacgaaaactatacgtccc
aacttattcgttttacacggcgaaggttatcccttattttcttctcaaaccagtgattta
actcaattaactccttggaaaagcctagcccaacaaatcgtggccaaaaattcctcggaa
ttgttttccggttattttcctcaacaacaagtactttatgtggcttaccggtttgaacct
tggaattgggttattttttgtacggttccagagcgagaggttaccagtgcggctaatatc
atctaccgcaccacgttcagtgtggctaccttgtatgcactgggtacaattgtattaatg
ttatttttatctcattattatttactgttacctatcgccactttgaaaaccgctgcctct
aacattgccttacaacaacccttaatagacattccgctttaccgtaatgatgaattaggt
caattagcccgtgatatggagaatatgtccattgccattgcgacttatagaaatcaactc
aatgaatataacagtaaattagaacatgaaatcaccgaacgtaaccaagcacaagccgca
cttaagcaacaaaaagagatattacaaacgattgttgataatattccaattatgatcggg
ttacatgatgctcagggtcagattcaatggattaaccacgaatgggaacgcgtttgggat
tgtggtttagaagacctcaagggcaaagatttattaaaagaattctatcccgatcaaaat
gatgctcaacgggttttagattatctcactttgtctaatccacgttggtgtgattttaag
caaattagccccatcggtcgaactttagatgtttcctggattcatactcgcttatcgagt
ggtgatatcattagctttggacaagatattactgaacgcaaacaagctgagcgcttgtta
aaagtctataatcaaactctggaacatgaagttctcaaaagaactcgcgctctccgccaa
agtgaagaacagttccgaaccctcactcaaaccacgactgcgggcatactcatttctaat
cgtggtaaaattatttattccaaccccgccgcccaagaatttttaggctataccgaagaa
caattaatgaatatgaatggctttgatattattcatccggactttcgccacctcgctatt
cagtgggaaacggagccaagccataatcaagtcgctatactccattatgatcttaaattt
attagacccgatggagcggaacggtggggaaatttatcggtagccccatttaaaatgaac
ctagaaccgactaaactgattacttttatcgatattactgaacataaacgcactgaagcg
gctcttagaaccaccacagaacaattatctctcatcttagaacaattgcctattgtgccg
tatacctgtgaaccggaaggctattttgtggcgacttatatgggaccaacggctaaaaca
gtcaccggttatgatccagaaaatttcacgcgcgactcgcagttttggctagcccatctt
catccacaggataaaaataatatcttgagtgagataggtaatttatttgtaaaaggctat
caccaacacgaatatcgttggcaagtcgcggatggttcctataaatggtttttagatacg
ttacgattagtcaacagtccagaaaataagaaaaaatatattatcggcgcctggtttgat
attactgaacgtaagcagatggaacaagccttacgcgaaagcgaagaacgttttaattta
gccatgcggggaactaacgaaggtttatgggattggaatctagaaaccaatcaaatgtat
tactcaccccgttggaaacagatgctcgggtttacggaagaggaaatgagcaaccaactt
caagaatttacttcccggttacatccagatgatgtggagaaaatctcgatcaccatcacc
gcctatctagaaaaaaaacaaacgacttatgaagtcacttttcggatgcaacataaacag
gggtattatatttggattttaacgcgggggattggcatttgggattcgcaaggaacgccg
ctgcggatgatcggaacccacatggacctaacgctccaaaagcaggcagaagaggcttta
cgtcatagtgaagaaagattacgtcgctattttgaacaaccttttatcggtatggctacc
tcttccctctcccaaggtttgatccaagtgaatgacaaattttgtcaaatgctgggctat
tcacgtgaagaactgtgtcatatggattgggcagaattaacacatccgggagatattgcc
gctgatattgaacaatttaaacgcgtgattacccgagaaattaatcattataccctcgat
aaaaggtatattcgcaaagacgggcaaacgatttatgcgagtattgcgttcgattgtatc
cgtgatgtggatggcaacgtcgatcactttgtcgttttggttcaggatattacggaacgc
aaacaatttgaaattcgcttacaaaaagccaaagaagcggctgaagtagccaatcgagcc
aaaagccaatttttagcgaacatgagccatgaattgcgaacgcctttaaatggtatttta
ggctacacgcaaattttattgcgtcacaaagaattgaatagtaaacaaagagaaggacta
gaaatcattcaacgcagtggcgaatatctgttaactttaattagtgatattctagaccta
tctaaaatcgaagccggtaaattaactgatgagcccattgagtttaatttcacggaattt
ttacaaagcattgtcgatctcatgaaaatgcgcgctgagcaaaaagatttgcaatttcaa
tatgaaccgttatcaactctacctacgtttgtgcatgccgatgaaaaaaaactccggcaa
gtattattgaatttattaagcaatgccgttaaatttactcaacaaggtcagatttatttc
caagtcagttatagtaataaccaagcgaattttgtggtcagagatacggggagagggatt
ggagccgctgatctcaccgaaatttttaaaccctttcaacaagctggtgatcaacgtgaa
caaattgaaggtaccggtttgggtttgtctattagtaagcgacttgtcgagattatgggt
ggacaattattcgtggaaagtcaaatggaacaagggagtactttctggtttgaaattaaa
ctgcccgaagtccagggaatggttacccagccaccggtttcgccaactattattggttat
gaaggtaaccctcgtcaaatccttattgtcgatgatcagtgggaaaatcggtctatttta
gtccatttactggattcagttgggtttagtttgttggaagccaatcagggtaaacaggca
ttacgtttggcttataaacatttacccgatgcgattctgaccgacttacgcatgccagag
atggatggttttgaactgattcgccgggttcggcggtcggctaagcttaactcaatcgtc
gtcattgcgatatcagctaccgtctctgagcaatatcaatatgaaagcctaacagcgggg
ttccaagcctttattactaagccgattcatacggaacacttatttaaaaccttaaaaaaa
catttacaattaaactggatatataaagattaccagccaaccttacctctcaatttaacg
tctggttccgatcgagaggagttagttggcccttcaccaccagaatcggtcactttatat
gaattgatgatgaccggtaatgttcgtcaaaccagtgcccatgccatgcagttggctcaa
caagatgagaagttaaaaccttttgctgagagagtacaatttttggcgaagaattatgaa
attgctaaactagaaaatttaattaaacactatttatag
DBGET
integrated database retrieval system
