Tissierella sp. Yu-01: P3962_02365
Help
Entry
P3962_02365 CDS
T08969
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
tis
Tissierella sp. Yu-01
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
TPR_12
Pkinase
AAA_16
SNAP
TPR_MalT
TPR_7
TPR_8
Cas10-Cmr2_palm2
TPR_1
AAA_22
RNase_P_pop3
AAA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WFA09439
LinkDB
All DBs
Position
462521..467893
Genome browser
AA seq
1790 aa
AA seq
DB search
MRLINNRYIIDKMIRKDHVEEIYLVKDLWNKEIRQHMRVLDLNKDKDTISNYMDNFLSIS
QIKHRNLLTSDDFGIIETINLKKTNNKLYYVVSEYTNWPSLNNFNINKKLESRLFIILEI
LNVIDYLHFRGITYKFLCPSHIYHSNENGIKLLNLSSKAIQSLEPLYDYSNEDFFAPEVL
MNSSDIGQKSDNYSIGMIMKYLLLKDNMPDAHGNYLYKDELDVSIDERLFLNKIINNLTK
TLPDDRNLSLRSMIDDIISKFNLNYHYDLVMERDKLFFNTQTIGLSREIKDILLIDNNIE
KTSNYYKGTIIRGSHGVGKTKLLKEVSFRLRMKGRTIYTITDCETLFSLNISNLLKKITS
NTPTEIVNKYKDDFVKLLPEITDNTVMRNNKNQINEKLRLFNRICSFINEISKEDIIYII
IENIDRANSTFIEFIDYLIRNSNSNRFFLFMTYNDGLQRSINVCQFINNWTSYDYVTNLY
LKPLSLEDTGNYIKSLLGISYIPYRFVSTIYNETKGIPSYIDIIIKDLHDEGNLYMHKDG
YWELKTYDISQLKIPSDLNEAIINQLKKYNLIQMKVIKALSIYNIKATKQMLIDMIKIEK
DELEKILKELIEDRIIEESIGDWGYYYSLLSEELERYVYLNIDESERIESHLKVTEIMMN
LYSDNYRLILEELVYHLQKANKPNIAVDIIVKEAGKLDYRDITNAIILWEMAYNISENMS
GDSVDIKLKILDKLTSIYQVKGDSDKADFYLSMLLSETRDLNHIEYYVKAKEYNSESLLK
KNKLSEIYMEIDELEFVSNNFNYLEGKILAILLKAKLLHRSGDLDNVLKLIDDALKLSNK
YNVNKYMGELYNLSGIVNNLKGNIKQAIDDYKKSISYFESSENAYEVVRPINNIGNIYAD
NYGNMEKSLEYYEQCLEISKRYTLTHLMTIFLNNIGEVNIDLLEYKKALDYFLETRRIAD
KSNDIRLVFLSNLNIGYIDLNINQLDKAYKIFIYLDKLNRTSPILDGEIYYEYNNFLGEF
YYHFGRLDLAEKYSFISSDFFKDYNIKGHLSSESRLVYIRYLRNGYIDKEEIFKIINKYN
ESNIVHRKLCFIINMAKLALINSDLELSKTLLEIYDRTNVDFNSNILKYNSEIIRLLLTC
NEESYMEAEHILNTINSDDILGTDIDYRVYLGLQYIESKSYSKALRQFLEALDGLYKIGR
NLPECDLKYSFLESKHPEFIKDKILLVLERGYNKDISEIRKNRTKLRDFDTYFDIRDIID
SLSKDEFYDILYYQDNDCKIMNSMDLLSQMHDNYVENLRLILQYLTKETIAKRGMIIKID
EEMGSLETFISINEDNTLPDEIILLNTLRSKEPFLFNRSIKQFNKTKIGSLLSNQITGVI
CIPICAYAEYNYDKVERRKWGPIQDNKLVGYIYLETDRVLNRFDMERYSLISSLTNLIYL
NIDNERLKKISTTDKVTGTYTRKYFEDKLDKLVEGYNQMDNSFSLLMIDIDKFKNINDTY
GHLKGDEVLSVLGKVILNTIRDTDLVGRYGGEEFLVLLNNTTIDDGLEIANKIRKNIEKT
KFQGIDRPITVSIGISQYPEHSTFKSELIFKADQALYYAKEVLGRNQKALWYSDMVIAPN
KLDKLTGLITGDPLKDNRNMLAIVDISYLAKESKALSEKVFEFLGRIIEIVEGESATLII
YDNNNNPKDKYSRKRKEKSWVSNNYVNQNLINHVLESKTGECFIDLDNIDNQEKVIEDQN
WQAILIVPLIKQGGIKGIVYITVPLKEKEFDFMNLNVCNVLSNIFIGNIN
NT seq
5373 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacttattaataatagatatatcattgataaaatgataagaaaagaccacgtagaa
gaaatatacttggtaaaggatttatggaataaagaaataagacagcatatgagagtatta
gatcttaataaagataaggatactatatcaaactatatggataatttcctgagtatctct
caaattaaacataggaatctcttaactagcgatgattttgggattatagagactataaat
cttaaaaaaactaataataaactatattatgtagtctcagaatatactaattggccatca
ttaaataactttaacattaataaaaaattagaaagtagattgtttataatactagagatc
ttaaatgttattgattacctacattttagaggaataacatataaattcctatgtccttct
catatttaccattccaatgaaaatggtataaaattattgaatttatctagcaaagcaatt
caatcattagaacccctatatgattattcaaatgaagatttttttgcaccagaagtttta
atgaattcttctgatattggtcaaaagtctgataattattcaattggaatgattatgaaa
tacttgctacttaaagataatatgcctgatgctcatggtaattatttatataaagatgag
cttgatgtaagtatagatgaaagattatttttaaataagataattaataatttaacaaag
actttaccagatgatagaaacttgtccttacgttccatgatagatgatataatatctaaa
tttaatttaaattatcattatgatttagttatggaacgtgataaattgttttttaacaca
caaacaataggcttaagtagagagattaaagatatattattaatagataataatatagag
aagacctcaaactattataagggaacgattattagaggtagtcatggagtcggtaagaca
aaactgctgaaagaagtatcatttagattgaggatgaaaggcagaaccatatatacaatt
acagattgtgaaacattatttagcttaaacatatcaaatttacttaagaagataacttct
aatactccaactgaaatagttaacaaatataaagatgactttgtaaaattgttacctgaa
ataaccgataatacagtaatgagaaataataaaaatcaaataaatgaaaagctacgctta
tttaataggatatgtagttttataaatgaaatttccaaggaagacattatatatattata
attgagaatattgacagggctaattctacctttatagaatttatcgattatttaattaga
aactccaatagtaatagattttttttgtttatgacatataatgatggtctacaaagatcc
ataaatgtatgtcaattcattaataattggacaagttatgattatgtaactaatttgtat
ttaaaacctttaagcttagaagatactgggaattacattaagtcgcttttaggaatttct
tatattccatatagatttgtttcaaccatatataatgagactaaaggcatccctagttat
atagacattattattaaagaccttcatgatgagggtaatctatatatgcataaggatggt
tactgggagctaaaaacttatgatatttcacaacttaaaataccttctgaccttaatgaa
gcaataattaatcaattaaagaaatataaccttattcagatgaaagttattaaggcttta
tctatttataatataaaggctacaaaacagatgttgatagatatgattaaaattgaaaaa
gatgagttggaaaaaattctaaaagaactaatagaggacaggattatagaggaaagcata
ggtgattggggttattattatagtttattaagtgaggaactagaaagatatgtatatctt
aatatagatgaaagcgaaagaattgaatctcatcttaaggtaactgagattatgatgaat
ctttatagtgataattataggttaatattggaggaactagtttatcatcttcagaaagcg
aataagcctaatatcgctgtggatataattgtgaaggaagcgggaaaactagattatagg
gatattacaaatgcaattatactttgggaaatggcgtataacatatctgaaaatatgtcg
ggggattcggtagacattaagttaaagattttggacaaacttaccagtatttatcaagtc
aagggagattctgataaggcggatttctatttatcaatgttacttagcgagacccgagac
ttaaatcatatagaatattatgtaaaggcaaaggaatataatagcgaatctttattaaag
aaaaataagttaagcgaaatttatatggaaatagatgagttagaatttgtctcaaataat
tttaattatcttgagggtaaaatactggcaattttacttaaagcaaaactattacataga
agtggtgatttagacaatgtactaaaacttatagatgatgctcttaaattgtcaaataaa
tataatgttaataagtacatgggagaattgtataacttatcaggcatagtaaataattta
aagggaaatatcaaacaagcaatagatgattataaaaaaagtataagctattttgaatca
agtgagaatgcttatgaagttgttagaccgattaataatattggaaatatatatgcagac
aattatgggaacatggaaaaatcactagaatattatgagcagtgtcttgaaatatctaaa
agatacactcttactcatctaatgactatttttctcaataatattggagaagttaatatt
gatttattggaatataagaaggcattagattattttctagaaacgagaaggattgctgat
aagagtaatgatattagattagtattcttaagtaacttgaatataggatatattgattta
aatattaatcaattagacaaagcttataaaatttttatatatttagataaacttaatagg
actagccctatacttgatggagaaatatattatgaatataataatttcttaggggaattt
tattaccattttggtagattagatttggctgaaaagtattcatttatttctagtgacttt
tttaaggattataacataaaaggtcatttaagctcggaatccagacttgtatatataagg
tatcttagaaatggatatattgataaagaggaaattttcaagatcataaataaatataac
gaatcaaatatagtccataggaaactttgcttcattataaatatggctaaattagcatta
attaattctgatttagaactatcaaaaacattacttgaaatatatgatagaacaaatgtt
gattttaactctaatattttaaaatataatagtgaaattataaggcttcttttaacatgt
aatgaagaatcttatatggaagctgaacatattttaaatacaatcaattcagatgacata
ttaggcaccgatatagattatagagtatatttaggtttgcaatatatagaaagtaaaagt
tattcaaaggcattaagacaatttctggaggctttggatggtttgtataaaatagggaga
aatctgcctgaatgcgaccttaaatatagttttctagaatcaaaacatccagagtttata
aaagataaaatacttttagtattagaaagaggttacaataaggacataagtgaaatacgt
aagaatagaacaaaattaagagactttgatacttattttgatatacgagatattatagat
agtttatcaaaagatgaattttatgatatactttattatcaagataatgattgtaagata
atgaattctatggatttactgtctcaaatgcatgataattatgttgaaaatctgagatta
atacttcagtatcttacaaaagaaactattgcaaaacgaggaatgatcattaaaattgat
gaagaaatgggttcgttagaaacatttatatcaattaatgaagacaatactttgcctgac
gagataattctattaaatacattaagaagcaaagagccattcctatttaatcgtagtatt
aaacaatttaataaaactaagatagggagtttgctttctaatcaaattacaggagttatt
tgtataccaatttgcgcatatgcagaatataattatgataaagtggaaagaagaaagtgg
ggacctattcaagacaataagttagttggatatatatatttagagactgatagggtatta
aatagatttgacatggagagatattctttaataagtagcttaacaaatttaatttatctt
aatattgataatgagagacttaaaaagatttcaacaacagataaagttacaggaacctat
acaagaaagtattttgaagataaattagataaactagtagaaggatataatcaaatggat
aattcttttagtttgttaatgatagatatcgataaatttaagaatatcaacgatacttat
ggccatcttaaaggtgacgaagtattgtccgttttaggaaaagttattttgaatacaatc
agagatactgacttagtgggcagatacggtggagaagagtttttggttttacttaacaat
actactatagatgatggattagagattgctaataaaatacgtaagaatattgaaaaaacc
aaattccaaggaatcgatagaccaatcacagttagtataggtatttcccagtatcctgaa
catagtacatttaagagtgaattgatttttaaagctgatcaagccctatattatgcaaaa
gaagttttgggaagaaatcaaaaagctctatggtattctgatatggttatagctcccaat
aaattagataagcttactggtttgataacaggagacccattaaaagataatcgaaacatg
ttagcaatagtggatatatcctatttagctaaagaatccaaagctttaagtgaaaaagtg
tttgagtttctaggtagaattattgaaatagttgaaggtgaatcagcaaccttaataatt
tatgataataataataacccaaaagataaatactccagaaagagaaaagaaaagtcatgg
gttagtaataactatgtaaatcaaaatttaataaaccatgttttggaaagtaaaacaggt
gagtgctttattgatttggataatatagataatcaagaaaaggtaatagaagatcagaat
tggcaagcaattttaatcgttccattgattaaacaaggtggtataaagggaatagtatat
ataacagttccattaaaagaaaaagaatttgattttatgaatttaaatgtttgtaatgta
ttgtccaatatctttattggaaatattaactaa
DBGET
integrated database retrieval system