Tissierella sp. Yu-01: P3962_09760
Help
Entry
P3962_09760 CDS
T08969
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
tis
Tissierella sp. Yu-01
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_39
HTH_18
HTH_AraC
AraC_binding
Cupin_2
MannoseP_isomer
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WFA08018
LinkDB
All DBs
Position
complement(1899010..1901556)
Genome browser
AA seq
848 aa
AA seq
DB search
MGDYYYELIIFESGSPLKVYIHSINKVKTHWHGEIEILLVLEGSVNVRVGSNKYLLKEND
LILINSNEIHNADKTHEDNLVLALQIKPAYFDKYLGGFSKKVFACKSFLHKEEQERFDKI
RHYIAKIVWELNKKKEGYQFLVGSEILLLANHLINNFDYYTMKDTNIDMINKDISRINNI
IEYIDNNLQNGITLKDISDNENLNPYYLSHYIKRVMGISFQEYLNYKRLDKATELLVRTD
KTITEIAFESGFPSTKALNTLIKKEYNYTPVEYREKNSNLVKEKNFLSADNEKIKSKSYL
NVERTTSFSKLFTYLKSKTYNETSESHVSEIVKINTNTNTEGTLHNYYWQNLTTFGRAAE
GLRKSWQKQLKELQRDIEFKYIRFHGIFSDEMMIYNLDNNGDVAYNWTYVDELFDFFKDV
NIKPFIELGFMPSEIKKSDETIFWWKGNISQPQNINLWTNLVRAFIKHCINRYGLKEVES
WYFEVWNEPELEYVFWIGGKEDYFKFYRETALTVKSISNKIKIGGPAVTHEALKEGIWLE
DFLKYCQTNDVPLDFVSLHIYPEVFSSDEDARKLVDKEQEEFIQSFPFLKRIYYEENHTY
YTLKSAKEKIQGLLPYNPEIHVVEWSASSSGRNLISDTCFVATFIIYNVLKSIGQVDSLG
YWTFTDIMEEFKLGISHFHGGFGLINKDGLKKPGYFAYYLLSKLGKEIIEQGEEYIVTKD
NNSIQILAFNFTYFDELFINGDTSALTNIDRYSVYKEKPLKEIHIKIEGLSGKYKATDYQ
LNRKYGSVFDEWIKIGAPENMSKEDIAYLNGVARPKISVDNIDIDGIYQKDLHIPVHGVE
LIILEKQL
NT seq
2547 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggtgattattattatgagttaattatatttgaatcagggtcgcctttaaaggtatat
atacattctattaataaggtaaagactcattggcatggagaaattgagattttattagta
ttagaaggatctgtaaatgttagggtaggaagtaataaatatttattaaaggaaaatgat
cttatactaatcaatagtaatgagatacataatgcagataaaactcatgaggataatcta
gtcctagccctgcaaattaaaccggcgtactttgataaatacttaggagggtttagtaaa
aaagtatttgcttgtaaatcatttttacataaagaggagcaggagagatttgataagatt
agacactatatagcaaaaatagtatgggaattaaataagaaaaaggagggatatcagttt
ctagtaggctcagagatacttttattagcaaatcatctgataaataactttgattattat
acaatgaaggatacaaatattgatatgataaataaggacatatctagaattaataatatt
atagagtatatagataataacttgcagaatggtataactcttaaagatatatctgacaat
gaaaatcttaatccctattatttatcccattatataaagagagtaatgggtatctccttc
caagaatatttaaactataagagattagataaggctacagaattacttgtaagaactgat
aaaacaattacagaaatagcctttgaaagcggatttccaagtacaaaagctttaaataca
ctaataaaaaaagagtacaactatacacctgtggagtatagagaaaaaaattcgaatcta
gtaaaagaaaaaaatttcttaagtgctgataatgaaaaaataaaaagcaagtcatattta
aatgtagagagaaccacttctttttcaaagttatttacctatttaaaatcaaagacttat
aacgaaaccagtgaatcccatgttagtgaaattgtaaaaataaatacaaatacaaataca
gagggaactctccataattattattggcaaaacttgactacctttggaagagctgctgaa
ggattgcgaaagtcttggcaaaaacaattgaaagaacttcaaagggatatagagtttaaa
tatattagatttcacggtattttttcagatgaaatgatgatatataatttggataataat
ggggatgtagcgtataattggacttatgtagatgaattatttgacttttttaaggatgta
aacattaagcccttcattgaattggggtttatgccttctgaaataaaaaaatctgatgaa
acgatattttggtggaaaggaaacatatcccaaccccaaaatataaatttatggactaac
ttggtcagggcgtttataaaacattgtatcaacagatatggcttaaaagaagtagaatca
tggtattttgaagtatggaatgagccagagctagagtatgtattttggattggtgggaaa
gaagactattttaaattctatagagaaactgcattaacagttaaatcaatttcaaataaa
ataaaaattggaggacctgctgttacacatgaagcacttaaggagggaatttggcttgaa
gattttttgaagtattgtcagactaatgatgttcctttggattttgtgtctttacacatt
tatccagaagttttttcatctgatgaagatgcaaggaaattagtggataaagaacaagaa
gaattcatacaaagctttccattcttaaaacgaatttactatgaggaaaatcatacctac
tatacattaaaatctgcaaaagagaaaatacaaggcctattaccatataacccggagatt
catgtggtagagtggagtgcatcatctagtggaagaaatttgattagtgatacctgcttt
gttgctacgttcattatttataatgtactaaaatcaattggacaagtagattctttaggg
tattggacctttactgatataatggaagaatttaagcttggtatttctcattttcatggc
ggatttggtctaataaataaagatggattaaaaaagccaggatactttgcttattattta
ctatctaagcttggtaaggaaataatagaacaaggggaagaatatatagttactaaagat
aataatagtattcaaatattagcttttaactttacctattttgatgagttatttataaac
ggtgatacatctgcattaactaatatagatagatattcagtatataaagaaaagcctttg
aaggaaattcatataaaaatagaagggctttcgggaaagtacaaagctacagattaccag
ttaaatagaaaatatggttcagtttttgatgagtggataaaaataggtgctccagaaaat
atgtctaaagaagatatagcttatttaaatggagtagcaagacctaagatatcagtagat
aatatagatattgatggaatatatcaaaaagatcttcatattccagttcatggtgtagaa
ttaatcattctggagaagcaactatag
DBGET
integrated database retrieval system