Thermoanaerobacter italicus: Thit_0408
Help
Entry
Thit_0408 CDS
T01178
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF214
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
tit
Thermoanaerobacter italicus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tit00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tit02000
]
Thit_0408
Transporters [BR:
tit02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
Thit_0408
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
MacB_PCD
Rho_RNA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADD01715
UniProt:
D3T6Y3
LinkDB
All DBs
Position
446285..448753
Genome browser
AA seq
822 aa
AA seq
DB search
MRALFKLALRNIIAKKVRFFILFLTFILSAVTLMAAIFFRNAAIESREEQLRNNTLNSQI
VILSSNDRDIYFKPEDVLNKIKNIEGIKYTVERCGGVAAYQDEKINVVGVDFNKQSQVYS
FNYINHIQLPASENQIVVSKVFSKKYGLNIGDVILLSTQNNEIKFKVSGIAEDKGIFQEG
NIVFVNIDAAQRLFKKEGMVYSIGITLKNLDSISDVANDIKKAIGSGYIVEERYDIESYK
AYVGTISMALSIFSAFAIFITLFLTYSTFKTVLYERISQIGTLRSLGATKMEIFISTYIE
SFIIITISTIIGLIVGFPFLHFILKLIVEDEIIMKFSILKFMLVFFMLLVTGLLSVILSV
LRIFKISVVDIIKGNVEKHTKKKNILKNYAGAVMIFVSIILLILSEKMDNGIFYLISGII
LFSFSFILLIEFLHILINNTLLKFINLLGPEARLLNKEFKRDFSRSAESIILISIIIGIA
YLSFTLSYLVKESVDKVYKGVDIVINTDSSMGSLDEKLSSISGVDKVVSQLRVKERIRDM
DVEISGIDPEKYKDFSFEIYKNGSIDELFKQLNYGKNIIITNTFAKNTNTKVGDYIQIKS
KTKEKGEKYKVIGVVSSFENMGKVLFISKDNFIKDIGSNDYTLYLLKIKKNYNVSQVENG
ITEMLGEKAYYSINSLEEMKKLNAEDNNRLFLIVNALFLISVFISIFSLNNNLIINVLTQ
VRYFAIKRTVGMSLKQLLFSIIGEGVIIGFEGGIFGLLFGFCLNLFIVKILSYYVGDLSF
GYNYLVYLILLLSSIFIGFISSIYPFIKIRKINIVEAIKGIE
NT seq
2469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagctctttttaaattggctttgcgaaatatcattgctaaaaaagtaaggtttttt
atattatttcttacttttattttatctgccgtaactttaatggcagctatattctttaga
aatgcggctattgaatccagagaagaacagcttagaaataatacattaaatagtcaaata
gtaatactttcttcaaatgatagagatatttattttaagccagaggatgtattaaacaaa
ataaaaaatattgagggtataaaatatactgttgaaagatgtggaggtgttgctgcatat
caagatgaaaaaataaatgtagttggtgtcgactttaataaacaatcacaagtttattca
ttcaattatattaatcacatacaactacctgcttctgaaaatcaaattgttgtgagcaag
gtgttttcaaaaaagtatggattgaatattggagatgttattttattatctactcaaaat
aatgaaataaaatttaaagttagcggaattgcagaggataaaggaatttttcaagaaggt
aatattgtttttgtaaatattgatgctgcacaaagattatttaaaaaagaagggatggtg
tattctattggtattacactaaaaaatctggatagtatttctgatgttgctaatgatata
aaaaaagccattggttctgggtacatagttgaagaaaggtatgatatagaaagttataaa
gcttatgttggaacgataagcatggcattgagtatttttagtgcgtttgctattttcata
actttatttttaacatattctactttcaagacagtactatatgagaggatttcacaaatt
ggtactttaagaagcttaggagcaactaaaatggaaatatttataagtacatatatagaa
agcttcataattattacaatttccactataattggtttaattgtaggttttccttttttg
cattttattcttaaattgatagttgaagatgaaattataatgaaatttagcattctaaag
tttatgttagtattttttatgcttttggttacaggcttattaagtgttattttgtcagtt
ttgaggatatttaaaatttctgtagtagatatcataaaaggtaatgtggaaaaacatacc
aaaaagaaaaatattcttaaaaattatgccggagcagtgatgatatttgtgtctataata
ttattgattttaagtgagaaaatggataatggtattttttatcttatctctggaattatt
ttattttcgttttcatttattttgcttatagagtttttacatattttaattaataatact
ttattaaaatttataaatttactgggaccggaagcaagattgttaaataaagaatttaaa
agagacttttcaagatcagcggaatctataatacttattagtataataattggaatagca
tatcttagttttactttatcatatttggtcaaagaaagtgtagataaggtatataaaggt
gttgatattgttattaatacagattcttcaatggggtccttagatgaaaaattatcctct
atttcaggggttgataaagttgtttcgcagttaagggtaaaggaacgtatcagagatatg
gatgtagaaatttcaggaattgatccagagaaatataaagatttttcttttgaaatatat
aaaaatggttcaatagatgaattatttaagcaattaaattatggaaaaaatatcataatt
acaaatacatttgctaagaacacaaatactaaagttggtgattatattcaaattaaatca
aaaacaaaagagaagggagaaaaatataaagttattggagttgtaagtagttttgagaat
atgggcaaagttctttttatatctaaggacaattttataaaggacattggttctaatgac
tacactttatatttattaaaaatcaaaaagaattacaatgttagccaagtggaaaatggt
ataacagaaatgttgggggaaaaagcttactatagtataaattcacttgaagaaatgaaa
aaattaaatgctgaagataataatagattgtttttaatagtaaatgcattatttttaata
tcggtgtttataagtatttttagtttaaataataatcttattataaatgttttgacgcag
gttagatattttgcaataaaaagaacggttgggatgtccttaaagcaattgttatttagt
ataataggcgagggggttattataggttttgagggaggaatttttggcttattatttgga
ttttgcctgaatctatttattgtgaaaattttgtcttattatgttggagatttatctttt
ggttataattatttagtgtatttaattttattattatcttcgatttttattggttttata
agttcaatttatccttttattaaaattaggaagattaatattgtagaagcaataaaagga
atagaatag
DBGET
integrated database retrieval system