Tenacibaculum jejuense: TJEJU_1716
Help
Entry
TJEJU_1716 CDS
T05041
Name
(GenBank) Protein of unknown function precursor containing a C-terminal secretion signal
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
tje
Tenacibaculum jejuense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tje00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tje02000
]
TJEJU_1716
Transporters [BR:
tje02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
TJEJU_1716
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Flg_new_2
Flg_new
LRR_4
Por_Secre_tail
LRR_EndoS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNR15434
UniProt:
A0A238UAD6
LinkDB
All DBs
Position
TJEJU:complement(1861368..1865534)
Genome browser
AA seq
1388 aa
AA seq
DB search
MKKIYFSLLFLSITLTINAQIVTIPDANFKAILLANTLINSNGDNEIQVTEAEAYNSGLN
VNNANIADLTGIEAFVNLQQLSCNQNQLTALDVTANTKLTSLSLFGNNVASLDVSQLIEL
TFLDVGFNELISLDISNNTKITSLRCSFNELTSLNLANGNNALMSIDLSSNFELYCAKVD
NVNIATNAAWGRDDILGYSEEDCSTKTSIVLTAFNGSVNINPSSLGNLYTIGSSITLTAT
PATDYEFRSWYGDSNETINPLTITLNEFTRIEALFSRINDPIVNIPDTNFKNALLNHNVN
IDTNRDGEIQVSEAEAYNGELIINNNNISDLTGIEAFTNIITLSFENNNVTNVDLSQNTE
LKNLNCFNNKINSLDLNNNIELTNLRAYSNLITGIDISNCDKLSVIDLRNNLLNTINTNA
QADLFLLDLGSNNLSSIDLTQNTKLQFLSLGQNQNLSTLDVSNTPLLRRLEIRGTGIAAV
DISMLLDLDDLDISRTPITTINIDANTKLTKFEAQIMNDLENISFINNVLLERVTVSSSK
ISEFDLSSNPNLDDLFLSGGNVLTRINIANGNNANISRFYSNPNSNITCIQIDSGFTPPS
SWVKSAAASFSDNCTQYTVNLTSTNGKIDTNPDRNTLVFEEDLEVILTATPDPGYQFDGW
SGDATGNTNPLTITMDADKTITAIFSKIQHTLTTNATNGTITRNPVTPTSGTYDFGTEVE
LTATPNAGYQFDGWSGDATGNTNPLTITMDADKTITALFSKIQHTLTTNATNGTITRNPI
TPTSGTYDFGTDVELTATPNAGYQFDGWSGDATGNTNPLTITMDADKTITAIFSKIQHTL
TTNATNGTITRNPVTPTSGTYDFGTEVELTATPNAGYQFDGWSGDATGNTNLLTITMDAD
KTVTAIFSKIQHTLTTNATNGTITRNPVTPTSGTYDFGTDVELTATPNAGYQFDGWSGDA
TGNTNPLTITMDTDKNITALFSKIQHTLTTNATDGTITRNPVTPTSGTYDFGTEVELTAT
PNAGYQFDGWSDDATGNTNPLTITMDADKTITALFSKTSNLDIEIFATGFTSLEGIGINS
NNEVFVSEYNSGKIFKIDTNGNSTEFASSGFRLNDISFDKNNQLFVAQGFIDDILISDTT
GNLSEYVDAFNKKPNGLTFYDNALYYTSDFGDVYKVDSNKNVTVFANGFFASAGIDFDSN
GNAYIADRSDRKLFKVTQSGIKTEITGGSKIIYGVAVVNDIVYYTSGNKIIKYNPTDNTS
EDYVTTDLNEPGHLEVDLLGNMYIVNRGNGTIVKVFDENLKSTTASINDEEFNNQIVLYP
NPVRDYLTIRSKDFSDIQKVTVVNSIGKEIITTKKTNDIDVTTLAKGLYLIKIKATNNRV
AIKKFIKE
NT seq
4167 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatttacttttcattgctttttttaagcataactttaacgattaacgcacaa
attgtcacgatccctgatgccaactttaaggctatattattggctaatactttgattaat
agcaatggagataatgaaatacaagtaactgaagccgaagcttataattctgggcttaat
gtaaacaatgctaatattgcagatcttacaggaattgaagcatttgtaaatcttcaacaa
ctatcatgtaatcaaaaccaattaacagctttagatgttactgcaaatactaagttaacc
agtttaagtctttttgggaataacgtagccagtttagatgtatcgcaactcatagaatta
acttttcttgatgttgggtttaatgaattgattagtttagatatttctaataatactaaa
atcacaagcttgcgttgttcttttaatgagctaacctcattaaatcttgctaatggtaac
aatgctttaatgagtatagatttatccagtaactttgaattatattgtgcaaaggtggat
aatgtaaatatcgccacaaatgctgcttggggtagagatgatattcttggatatagtgaa
gaagactgtagtacaaaaacaagtatcgttttaacagcttttaatggtagtgtaaatata
aatccaagttcacttggaaatttatacaccattggttctagcattacattaacagcgacc
cctgcaacagattacgaatttagaagttggtatggagattcgaatgaaactataaatccg
ctgacaataactttaaatgaatttacaagaattgaggcattatttagcagaattaatgac
ccgatagttaacattccagatacaaactttaaaaatgcattattgaaccacaatgttaat
atagacacgaatagagatggtgaaattcaagtttcagaagctgaagcttacaatggagaa
ctcattattaataataacaatatttctgatttaacaggtatagaagcttttaccaatatt
ataacattaagttttgaaaataacaatgtaactaatgtcgatttgtcccaaaatacagag
ctaaaaaatctcaattgttttaataataaaatcaattcgttagatctaaataataatatt
gaattaacaaatttaagggcctatagtaaccttattacaggaattgatatttcaaactgt
gacaaactatcggttatagatctcagaaacaatctattaaacaccattaataccaatgca
caagctgatttatttttattggatctaggttcaaataacctgtcatcaatagatttaact
caaaataccaaattacaatttctatccttaggacaaaatcaaaatttaagcactttagat
gttagcaatactcctttgttaagaaggttggaaatacgaggtactggtattgctgctgta
gatattagtatgcttttagatcttgatgatttggatatttctagaactccaataacgact
atcaatattgatgcaaatacaaaactaacaaaatttgaagctcaaatcatgaatgattta
gaaaacatctcattcattaataatgttctattagagagagtaactgtgtctagtagtaaa
atttctgaatttgatctttcttcaaaccctaatctagatgatttatttttgtctggaggt
aatgtattaacacgaattaatatcgccaatggaaataatgcgaatatttccagattttac
agtaatcctaattcaaatatcacatgtattcaaattgatagcggatttacacctcctagt
tcttgggtaaaaagtgctgctgccagttttagtgataattgtactcagtatactgttaat
ttaactagtactaatggaaagatcgatacgaatcctgatcgaaatacacttgtatttgaa
gaagatttagaggtaatattaaccgctactcctgatccaggttaccaatttgatggttgg
tcgggtgatgctactggaaacacgaatccattaactattacaatggatgccgataaaact
ataacagctattttcagtaaaattcagcatacattaactacaaatgcaactaacggaact
atcactagaaatcctgtaactccaacttctggaacttatgattttggaactgaggtagaa
ttaacagcaacaccaaatgctggttatcaatttgatggttggtcgggtgatgctactgga
aacacaaatccattaactattacaatggatgcggataaaactataacagcccttttcagt
aaaattcagcatacattaactacaaatgctacaaacggaacgattaccagaaatcctata
actccaacttctggaacttatgattttggaactgatgtagaattaacagcaacaccaaat
gctggatatcaatttgatggttggtcaggtgatgctactggaaatacaaatccattaact
attacaatggatgccgataaaactataacagctattttcagtaaaattcagcatacatta
actacaaatgcaacgaacggaactatcactagaaatcctgtaactccaacttctggaacc
tatgattttggaactgaggtagaattaacagcaacaccaaatgctggatatcaatttgat
ggttggtcaggtgatgctactggaaatacgaatctgttaactattacaatggatgccgat
aaaactgtaacagctattttcagtaaaattcagcatacattaactacaaatgcaacgaac
ggaactattactagaaatcctgtaactccaacttctggaacttatgattttggaactgat
gtagaattaacagcaacaccgaatgctggatatcaatttgatggttggtctggtgatgct
actggaaatacgaatccattaactattacaatggatactgataaaaatataacagcttta
tttagtaaaattcagcataccttaactacaaatgctacagacggaacgattactagaaat
cctgtaactccaacttctggaacttatgattttggaactgaggtagaattaacagcaaca
ccaaatgctggatatcaatttgatggttggtcggatgatgctacaggaaatacaaatcca
ttaactattacgatggatgcagataaaactataacagctcttttcagtaaaacatctaat
ttagacattgaaatctttgctactggttttacttctttagaaggaattggaattaactct
aataatgaagtatttgtttctgaatataactcagggaaaatttttaaaattgatactaat
ggaaatagtacagaatttgcatcgtctggttttagacttaatgacatttcctttgacaaa
aacaaccagttatttgttgcccaaggctttatagatgatattttaatatctgatacaaca
ggtaatctttctgaatatgtagatgcttttaataaaaaacctaatggattaactttttat
gataatgctttatactacacttctgattttggagatgtgtataaggttgatagtaataaa
aatgtaacagtttttgccaacggtttctttgcttctgctggtatcgattttgattctaat
ggaaatgcatatattgctgatagaagtgatagaaaactttttaaagtaactcaaagcgga
attaaaacagaaattacaggaggtagtaaaattatttatggtgtagctgttgttaatgat
attgtatattacacttcaggaaataaaataattaaatacaatcctacagataatacttct
gaagattatgttactactgatttaaatgaaccagggcatttagaagtagatcttctagga
aatatgtatatcgtaaatagaggtaatggaacgatagttaaagtttttgatgaaaattta
aaatccactacagctagtattaatgatgaagaatttaataatcaaatagtactatatcca
aatcctgttagagattacctaacaattagatctaaagatttttctgatatacaaaaagtt
actgtagttaactcaataggtaaagaaattataactacgaaaaaaactaatgatatagat
gttacaacattggctaaaggtctttatttaataaagataaaagcgactaacaatagagta
gcaattaaaaagtttataaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system