Tenacibaculum jejuense: TJEJU_2784
Help
Entry
TJEJU_2784 CDS
T05041
Name
(GenBank) SusC-like TonB-dependent outer membrane receptor precursor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
tje
Tenacibaculum jejuense
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tje00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tje02000
]
TJEJU_2784
Transporters [BR:
tje02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
TJEJU_2784
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNR16458
UniProt:
A0A238UD00
LinkDB
All DBs
Position
TJEJU:complement(3079728..3082910)
Genome browser
AA seq
1060 aa
AA seq
DB search
MRKLFTLFSMFCLSFISLAQNVEVKGKVLDEVTKEPIPGVFVLLRESSVTAETEFDGSYS
INAAIGKVLEFNYPGYVKKTVVVTSSLIDVELKIDTEESFLNEVIIIGYGEKRKELVSGA
YSTIKPEEIERNNPQRIEQALQGRTAGVQVSSNSGSPGSSYNIRIRGVTTNGDNSPLVLV
DGVQIGPDLSIIDPNDIEKIDVIKDASTAIYGVRGANGVILITTKSGKNNTETKFTYSTS
VALQETTKKLDLLKGVEYAALVNETIAADGGTPPFQLQNINTDTDWQDALFETTPMTTHH
IGATGGGETYNFNVSASLLDQKGIIAPGRSNYARWTLRSNLGLNLTDKLKLNTLILYTNS
TRRAIPEGNRGSVLYYANNASPLTPIFDGTDGTGPSRGFSYIGTEQGNEIVNPFAVIDNT
FNKTRVNRFTGKIELVYDFLKNFEFTSRNSFNYSNVYSRAYFPLQYYGENKVVNTVRLDP
VSGQFNLDRNGDGDRDLYSRVNENDQNFFSFISENFVNYNFTIGEYHNFQTTLGFSLTTE
QSRGIFGSGFLTANDSWENAFLFNTQSFIIDDDDIGTNDIRETVNSDSFSIEDRYTSIFG
RLQYDFNERYLFSAILRRDASTRFGPNNRVAYLPSFSAGWVVHNEDFLSDTSISNLKLRG
SWGIVGNDKIGAYRWLGFLQGVNGDATYPFGDVLSFGNAIGVLSNENLQWETTIQTNIGF
DLGFYDNNLNITFDYYKKRTEDLLVVPEISGLIGGAAPGSGAPVVNAGIVENKGVEFDID
YTHYFSDDISLALNYNLTTINNKVIDVNNAAGFIPGGLFGLNQQPSRMQNGLPIGVFYGL
KTDGVFQTQAEIDALAVDRDGDGSLDEYQPGAAPGDLKYVDVDGNGYIEFGSENDLTVLG
DPIPDFTMGGGFNFKFYNFDFGASFYASLGNEIVRSYERFLTYSNKLSLYNGRWTGPGTS
NEIPRASTNAANNQLFSSFYVEDGSFLRIQNVQLGYTLNSEQIKGIDFIRLYFSVNNLYT
FTKYRGYDPDISNASAIGAGVDLGQYPQPRMFITGIKVSF
NT seq
3183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaactatttacattatttagtatgttttgtctttcctttatttcattagctcaa
aatgtagaagtaaaaggtaaagtgttagatgaagttacaaaagaaccaattcctggggta
tttgttttattgcgagaatcttctgttacggctgaaacagagtttgatggaagttattcg
attaatgcagcaattggtaaagttttagagtttaactatcccgggtatgtaaagaaaacg
gtagtagtaactagttctttaattgatgttgaattaaaaattgacactgaggaaagcttt
ttaaacgaagtaattattattggttatggtgaaaaacgtaaagaattagtttctggagct
tatagcactattaaaccagaggaaattgaaagaaataaccctcaaagaatagagcaagcc
ttacaaggaagaactgctggagttcaagtgagttcaaattcaggatcaccagggtcttct
tataacattagaattagaggtgtaacaaccaatggagataattcacctttagttttagta
gatggtgttcaaataggaccagatttaagtattatcgatcctaatgatatagagaaaata
gatgtaattaaagatgcaagtactgctatttatggggttagaggagcaaacggagtaatt
ttaataactacaaaatctggtaaaaataatactgaaacaaaatttacatacagtacttct
gttgcgttacaagaaacaactaaaaagttagatttgttaaaaggagtagagtatgcagct
ttagtgaatgaaaccatagcagcagacggaggaactcctccttttcaattacaaaatata
aataccgatacggattggcaagatgcattatttgaaactactccaatgactacacatcat
attggtgcaacaggtggaggagaaacatacaattttaatgtaagtgcaagtttattagat
caaaaaggaattatagctccaggaagatcaaattatgcacgatggacattaagaagcaat
ctagggttaaacttaacagataaattaaaattaaatactttaattctatataccaatagt
acaagacgtgctattcctgaaggaaatagaggttctgtattgtattatgcaaataacgca
tcacctttaactccaatttttgacggaacagacggaacagggccatcaagaggtttttct
tatatcggaactgaacaaggaaacgaaattgtaaatccttttgctgtaatagataatacg
tttaataaaactagagtaaatcgattcacaggaaaaattgaattggtatatgatttccta
aaaaactttgaatttacttctcgaaatagttttaattattcaaatgtatattccagagca
tattttccgcttcaatactatggagaaaataaagtggtgaatacggttcgtttagatcct
gtttctggtcaatttaatctcgatagaaatggagatggagatcgtgatttgtatagtaga
gtaaatgaaaatgatcagaattttttctcatttatttcagaaaattttgtgaattacaat
ttcacaattggcgagtatcataattttcaaacaaccttaggtttttccttaacaactgaa
caaagtagaggtattttcggatcaggatttttaactgctaatgattcttgggaaaatgca
tttttatttaatactcagtcttttattatcgatgacgatgatataggaacgaatgatatt
agagaaacagtaaattcagattctttttcaattgaagatcgttatacctctatcttcgga
agattacaatacgattttaatgaaagatacttattttctgcaatcttacgtcgagatgct
tccacaagattcgggcctaacaatagggttgcatacttaccttctttctctgcaggttgg
gtagttcataacgaagattttttaagtgatacaagtatttctaatcttaaactaagagga
agttggggtattgtcggaaacgataaaattggagcttacagatggttaggttttttacaa
ggtgtaaatggagatgcgacctatccttttggagatgtgttgtcttttggaaatgcaata
ggagttttatcgaatgaaaatttacaatgggaaacaactattcaaacaaatataggtttc
gatttaggtttttatgataacaatttaaatatcacgttcgattattataaaaaacgaaca
gaagatttacttgtggttccagaaatttctgggctcataggaggagctgcaccaggaagc
ggtgctcctgtagtaaacgcaggtatagtagaaaataaaggagtagagtttgatatcgac
tacacgcattatttttcagatgatatttctttggctttaaactataatttaactacaatc
aataataaagttattgatgtaaataatgcagcaggttttatacctggaggtttatttggc
ttgaatcagcagccttctagaatgcaaaacggtttaccaattggtgttttttacggatta
aaaactgatggtgtttttcaaacacaggcagagattgatgctttagcagttgatagagat
ggagacggaagtttagatgagtatcaacctggtgcagctcctggagatttaaaatatgta
gatgtagatggaaacggatatatagagttcggtagcgaaaatgatttaactgtattaggt
gatcctattccagattttaccatgggtggcggattcaacttcaagttttataatttcgat
tttggagcttctttttatgcttcattaggaaacgaaatcgtaagaagttacgaacgtttt
ttaacatatagtaacaaattatcattgtacaatggaagatggacaggtcctggtacttcc
aacgaaattccaagagcttcaacaaatgctgcaaataatcagttgttttcttctttttat
gttgaagatggttcattcttgagaattcaaaatgtacaattggggtacacattaaattca
gaacaaatcaaaggaatagattttataagactttatttttcagtaaataatctatacact
tttacaaaatacagaggttacgatccagatatttctaatgcaagtgcgattggagctgga
gtagatttaggtcaatatccacagccaagaatgtttattacaggaattaaagtatcattt
taa
DBGET
integrated database retrieval system