Tenacibaculum jejuense: TJEJU_3492
Help
Entry
TJEJU_3492 CDS
T05041
Name
(GenBank) Probable lipoprotein precursor containing leucine-rich repeats
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
tje
Tenacibaculum jejuense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5018
LRR_14
LRR_8
DUF5018-rel
LRR_1
LRR_4
DUF6242
LRR_13
Cadherin-like
LRR_LRWD1
LRR_R13L1-DRL21
CSL4_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNR17136
UniProt:
A0A238UDN8
LinkDB
All DBs
Position
TJEJU:complement(3889407..3890948)
Genome browser
AA seq
513 aa
AA seq
DB search
MKFFNLAIAFFSLLLFFGCSEDNERIPPDSNQENLQILSFQFLAANNVSLSNDIEGKINE
DEKDIYLNVPFNTSLTSLIPTITITDGAEIIPDINTVQDFSSPVIYLLSKDGYDLVAYSV
IVTIANTSNEADISNFSFLKENNPSLSDNYEAIIENNEIKLQISEMEDLQSVIPTVEISE
GASISPTIDTGIDFRNDVVFTVTSGNGETQKEYTVKIVTLKSVKDIVKFDVTVDNKTFEA
TIDNDLNKIVLKVPEGTDVTNLTPEILLSEEAKITPLSRTPQDFSNPVTYTITAEDGSEK
EYTVYVSLLSCLELDRLFLEEFYRANERYNTPFTYLDWDLEAPTMENWNGVRVVDGRVSE
LVVAAVNINEVPESIASLDKLRVLTISGRILSSLPTEIGSLETLEVLTLNDNRLTTLPKE
IGSLSSIRGIYLKNNLLEELPNEIGNLPDSFYVLNIKGNNLRELPVEISNIPNLISLNIQ
NNPLTIIPQAICDMTTSNGVGIAIVKDVEDECM
NT seq
1542 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttttcaatttggcgatagcctttttttctttactattattttttggatgctca
gaagataacgaacgtatacctccagattcaaaccaagagaatttacaaattttaagtttt
caatttctagcagccaataatgtttcattatcgaatgatattgaaggaaaaattaatgaa
gatgaaaaagatatttatttaaatgtaccatttaatacatctttaacttcattaatccca
acaataaccattactgatggtgctgaaataattcctgatattaatacagtacaagatttt
tcaagtcctgtaatttatctgctttctaaagacggttatgatcttgtagcttattcagtt
attgtaacaatagcaaacactagtaatgaagcagatatttcaaacttttcttttttaaag
gaaaataatccaagtttatcggataattatgaagctataattgaaaataatgagattaaa
ttacaaatatcagaaatggaagatttacaaagtgttattccaacagtagaaatatcagaa
ggagcttcaatatcaccaacaatcgatactggtatagactttagaaatgatgttgtattt
actgtaacctcaggaaatggtgaaactcaaaaagagtatacagtaaaaatagtaacatta
aaaagtgttaaagacattgttaagtttgatgttacagttgataataaaacatttgaagct
actattgataatgatctaaataagattgttttaaaagttcctgaaggcacagatgttact
aatttaactccagaaattctattgtctgaggaggctaaaatcactcctttaagtagaaca
cctcaagatttttctaatcctgtgacctatacaattactgctgaagatggttcagaaaaa
gaatatactgtttatgtaagccttttaagttgtttagaattagatcgacttttcttagag
gagttttacagagctaatgaacgatataatacaccatttacttatttagattgggattta
gaggctccaacaatggaaaattggaacggagttagagttgttgatggtagagtatctgaa
cttgtagtcgcagcagtaaatattaatgaagttcctgaaagtattgcttctcttgataaa
ttaagagttttaactatttcgggaagaattttatctagtttgccaacagaaataggtagt
ttagaaactctagaggtactaactttaaatgataatagattaactacattaccaaaagaa
ataggaagtttatcatctataagaggtatatatttaaaaaataatcttttagaagaacta
cctaatgaaataggtaatttacctgatagtttttatgttttaaatattaagggtaataat
ttacgagaattacctgttgaaatttctaacataccaaatcttatatcgcttaatatacaa
aacaatccgttaactataataccccaagcaatttgtgatatgactacaagtaacggtgta
ggaatagctattgttaaagatgttgaagatgaatgtatgtag
DBGET
integrated database retrieval system