KEGG   Thiomicrorhabdus lithotrophica: NR989_10285
Entry
NR989_10285       CDS       T09486                                 
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel
  KO
K05802  potassium-dependent mechanosensitive channel
Organism
tlh  Thiomicrorhabdus lithotrophica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tlh00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:tlh02000]
    NR989_10285
Transporters [BR:tlh02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   NR989_10285
SSDB
Motif
Pfam: MscS_TM MS_channel_2nd MS_channel_3rd MS_channel_1st
Other DBs
NCBI-ProteinID: WEJ62394
UniProt: A0ABY8C8U4
LinkDB
Position
2191741..2195163
AA seq 1140 aa
MNKITFFLLLFTLAFSNNSFAIEAQNTATNIESTTQNISIKEVKSLQQAVTQSETLAETD
KSKLTIQLTQIESWINSANQALLTLKQQQNDTSNLNRREIEVKSILKNLESELQTTQNLT
KNASTISTFPTILNAAQTDLDRANQNYLKWDATLNQFQILALDGAKQKITLENALKKLTP
INQDALITNQQDLTVKIEKITRQSRLQLLDAQLQLLQFQLDNLGVLSKHAQIERDFWLSN
KTLQLKIVSHIQGIVQTQKTEQAESELEQTVNTLIDASSPLYPIQAKLIQIQQDKTNLTR
QEKQIQQKINATIETNNMLQADYARDKQIIELEGSREIVAQVLHKRVETLSTIRIQQSTV
LRIKDQLNQAVLAQMLLTEGLRQATHQSPDMLVNALLSKNLQSTEFNRQELEDSILEIQS
KYIEAAKELQNLYPSFISRLSELNSVYLQQQQQIQEYTQFLHNHLLWLPNVQAQSLLSID
ALRASLEWFFAPQNYNALFSDINETISTQKAGIALWLLGIILLLSLRPRFKQSLELSSAK
IASIRTDSIIYTLKAFGFTFLLTILVPFVFVGAASLFNDLNTPSEYTQRLTNSLINAGIL
TFILGGLQQICRPSGLAEKHLHWSISTVKSLYKELKWAVPFGALLIIIIGLNTDSVGPSD
RQLIGRLGFVALMAGLMILIYRLWSYKSDIMRMVNNQTNQRSWAQLHFIWFPLLLLIPVF
LIWSTLSGYYYSSLVIAERLNLTAGLLLIIYMFRELLLRSLYLSERKLHFSERVKQQEIL
ATARQNSDENNSKQSSELPNIEEPEVNYDKLNNQVRQTVNLGYFLSLVIAIWFLWSDIFL
ALNLINDSTLPLLKSQVVDGVIQQVPLTLGDLIQGLTIGAVTLLVAKNLPGILEFTLLKY
LPISNAARYAVSSLSQYVVAIIGFILIFRALGIEWSNIQWLVAALSVGLGFGLQEIVANF
VSGIILLFEQPLRVGDIVTVDGVTGKVSKIRIRATTIVNWDRQELVIPNKQIITGQLINW
SLSDPINRVKIDVGIAYGSDVRLAMKLLLETAQENSKVLKDPEPTVIFDSFGDNSLGLVL
RGFTDDLESLIIIKSELRNAINDKLNEAGIVVSFPQRDVHLDTSSPLEIYLTKAQADKKE
NT seq 3423 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacaaaataactttttttctactgctatttaccctggctttcagtaataactcattt
gcaattgaggctcaaaacactgctacaaatatagaaagtacaacgcagaacatatcaatt
aaagaagtaaaatcattacaacaagccgttacccaatctgaaaccttagctgaaacagat
aaaagcaaactgaccattcagttaacacaaatagaaagttggataaattcagctaaccag
gccttgttaaccttaaaacaacaacaaaacgacacctcaaacctcaatagacgagaaatt
gaagttaagtcgattctaaaaaacctagaatcggaattacaaaccacccaaaatctcacc
aaaaacgcttctacgattagtactttcccaaccattcttaacgcagctcaaaccgattta
gacagggcaaaccaaaattatctaaagtgggatgccacgctaaatcagtttcaaattcta
gctttagatggagctaaacagaaaatcacccttgaaaatgctttgaaaaagcttacccca
atcaatcaagacgctctcatcacaaaccaacaagaccttactgtaaaaattgaaaaaatt
acgagacaatcgcgtttacaactacttgatgcacaattacaactactacaatttcaactc
gataatttaggtgttttaagtaagcatgctcaaatagaacgtgatttttggctaagcaac
aaaacattacaacttaaaattgtcagccacattcaaggcattgtgcaaacccaaaaaact
gaacaagctgaaagcgaattagaacaaacagttaatactctaatagatgctagtagtccg
ctttacccaatacaagctaaattgattcaaattcaacaagataaaacaaaccttactcgt
caagaaaagcagattcagcaaaaaataaatgccactatcgaaaccaacaatatgttgcaa
gctgattacgcgagagacaaacaaattatcgagttagaaggttcacgcgaaattgttgct
caagttttgcataaacgtgttgagaccttatctactattagaattcaacaatccaccgtg
ttaagaattaaagatcagttaaaccaggctgtattagcgcaaatgttactcactgaaggt
ttacgacaagcgacacaccaatcacctgatatgttggtaaatgcactgctttcaaaaaac
cttcaaagcacagaattcaatagacaagagttagaagacagtattttagaaattcaaagt
aaatatatagaagcggcaaaagagttgcaaaacctttaccccagttttattagcaggtta
tctgaacttaattctgtctatttacaacagcaacaacaaattcaagaatatacacagttc
ttacataaccacctgctatggctgcctaatgtacaagcgcaatcacttctttcaattgat
gctttacgtgcaagcttagaatggttttttgcgccacaaaattacaatgcactattttca
gacataaatgaaactataagcacacaaaaagcaggaattgccttgtggttattgggtatt
attttattactgtctttacgcccgcgttttaaacaatcattagagctaagttccgcaaaa
atcgcttcaattcgaactgattctattatttataccttaaaagcgtttggcttcaccttt
ttattaaccatactcgtcccctttgtatttgtcggtgccgctagtttatttaatgactta
aacacaccttcggaatacactcaacgcttaaccaatagcttaataaatgcggggattctg
acttttatattaggcggccttcagcaaatctgtagacccagtggtttagcagaaaaacat
ttacactggagcattagcaccgttaaatctctttacaaagagcttaaatgggctgtgcca
ttcggagcattattaatcatcattattggactaaatacagattcagttggaccatctgat
cgccaactaattggccgtttaggctttgttgcgcttatggctggtttgatgattttgatt
tatcgtctttggtcgtacaagagcgacattatgcgaatggtcaacaatcaaactaatcaa
cgtagctgggcacaattgcacttcatttggttcccgttattacttcttattcctgtgttt
ttaatttggagcacgctttctggatattactattcatcactcgtcatcgccgagcgccta
aatttaacagcaggcctactattaatcatctatatgtttagagagttattgcttagaagc
ctctatttatcagaacgaaagttgcatttttctgaacgtgttaaacagcaagaaattcta
gctaccgcccgtcagaactcagatgaaaacaactcaaaacaatccagtgagctgcctaat
attgaagaacccgaggtcaactacgacaaactcaacaaccaagtcagacaaaccgtaaac
ttaggttactttttatcgcttgtgattgctatctggtttttatggagcgatatttttctt
gccttaaacctaattaatgacagcacgctacctcttttaaaatcccaagtggttgatggc
gttattcaacaagttccgcttaccttaggagatttaattcaaggcttaaccattggtgcg
gtcacgctattggttgccaaaaatctacctgggattttagagtttactttactaaaatat
ttacccattagtaacgctgcacgttatgccgttagctctttaagtcaatatgttgtggcg
attattggatttattctaatctttagagcacttggaattgaatggtcaaatattcaatgg
cttgtagccgccctttcggttggtttaggttttggcttgcaagaaattgtcgctaacttt
gttagcggtattattctattatttgagcagccgttacgtgtaggcgatattgttacggta
gatggtgttacgggcaaagtatcaaaaattcgcataagagccacaaccattgtgaattgg
gacagacaagagttagtgattccaaacaagcagattattactggccaacttattaactgg
tctttatctgacccaattaaccgtgtcaaaattgatgtcggtatcgcttatggaagtgat
gtgagacttgccatgaagttattattagaaacggcacaagaaaacagtaaggtcttgaaa
gacccagaaccaaccgttatttttgatagttttggtgacaactcactaggattggttcta
cgaggttttactgacgacttagaaagcttaattatcattaaatctgaattacgtaatgcc
attaacgataagctcaatgaagctggtattgttgtgtcattcccacaaagagatgtgcac
ttagatacctcaagcccattagaaatttatctgaccaaagcacaagcagacaaaaaagaa
taa

DBGET integrated database retrieval system