Candidatus Tyloplasma litorale: TYPL_0120
Help
Entry
TYPL_0120 CDS
T09841
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
tll
Candidatus Tyloplasma litorale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tll00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
tll03032
]
TYPL_0120 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tll03400
]
TYPL_0120 (gyrA)
Enzymes [BR:
tll01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
TYPL_0120 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
tll03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
TYPL_0120 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
tll03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
TYPL_0120 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU67359
LinkDB
All DBs
Position
12787..15372
Genome browser
AA seq
861 aa
AA seq
DB search
MDEKLPKQNIQDISISNEMESSFIDYAMSVIVSRAIPDVRDGLKPVHRRILYAMNGLEMT
HNKSFKKSARAVGEVIAKYHPHGDTAVYDSLVRMAQPHSLRYPLVWGQGNFGSIDGDSAA
AMRYTEAKLKKISSLMLEDIKKDTVDFRENYDGSEVEPSVLPGKIPNLLINGSTGIAVGM
ATSIPPHNLNEVLNAAQALLKNPELEVIDLINYVKAPDFPTGGIIVNKNELYSAYKTGHG
RAIVRAKTKIMFDGKKNHGTIIVEEIPYMVNKANLILRIADLVKNKTIESISNIKDESNR
KGIRIVIKLKRGFIPEVELNKLFKLTPLQSNSQFNMLALVNNRPEILNLKSALNYYNQHQ
IDVLVRKTKFELNKLIARKHILDGLHIALKNVDEVIAIIKKSRDNVDAINSLMKRFEFSE
TQAKAVVDMRLGRLTNLETHNLIEELKKIQKLVDDCNLVLNSENEQIKRVIRMFDEIKDS
FGDERRTELSNDSLSSIDDEDLIPNEDVVVTISKKGYVKRLPVDQYRVQNRGGTGSRGAV
VNDGDYIENIIVTNTHTDLMFFTTLGKVFRIRTHKIPESAKNTKGLPVVNLIELDKNRNE
NVSAVISIDDYENSDLLFITENGLVKKTKAIKFKKINRRGKIAISLKKNNLLIGVTTIPS
NENTQIILGNSNGKAIRFNSSDVRHVGRTASGVIGMNVNGGKIVDYSLSNKGKLILSISE
KGFGKLTNIDNYRVTKRGAKGVATINKSKSGELIGLLAVNGNEHLIIITNKGTVIRLKLK
QISNFSRNSKGVKIVKLREEEKIASISIIRSLKEIEEEIEEKTNNDSNNKIDLKEAKEEK
TPEQQIETTLKDIGENFDDEI
NT seq
2586 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaaaaattaccaaaacaaaatattcaagatatatcaatttctaatgaaatggaa
tcttctttcattgattatgcaatgtcagtaattgtttcaagagctattccagatgtaaga
gatggattaaaaccagtgcatagaagaatattatatgcaatgaatggtcttgaaatgact
cataataaatcatttaaaaaatcagcaagagctgttggtgaagtcattgctaaatatcac
ccacatggtgatactgcagtttatgattcattggttagaatggcacagccacattcttta
aggtatccacttgtttgaggacaaggtaactttggttctattgatggagatagtgcagct
gctatgagatatacagaagctaaattaaaaaaaatctcctctttaatgctagaagacatt
aaaaaagacacagttgattttagagaaaattatgatggatctgaagtagaaccctctgtt
ttaccaggaaaaattcctaatttattaattaatggttcaacaggtattgctgttggaatg
gcaacttctatacctccgcataatttaaatgaggttttaaatgctgcacaagctttatta
aaaaatccagaattagaagttattgatttaattaattatgtaaaggctcctgattttcca
acaggtggaataattgttaataaaaatgaactttattcagcttataaaacaggtcatgga
agagcaattgttagagccaaaacaaaaattatgtttgatggtaaaaaaaatcatggaaca
ataattgttgaggaaataccttacatggttaataaagcaaatttaattttaagaattgct
gatttagttaaaaacaaaacaatagaatctatttctaatatcaaggatgaatctaataga
aaaggtattagaattgttattaaacttaaaagaggatttattcctgaggttgaattaaac
aaattatttaaattaactcctttacaatcaaatagtcaatttaatatgttagccttagtt
aataacagaccagaaatactaaatttaaaaagtgcactaaattattacaaccaacaccaa
attgatgttcttgttcgtaaaacaaaatttgaattaaataaattaatagcaagaaagcat
attcttgatggattacatattgctttaaaaaatgttgatgaagttattgcgattattaaa
aaatctagagataatgttgatgcaattaactctttaatgaaaagatttgaattttcagaa
actcaagcaaaagctgtagttgatatgagattaggaagattaactaatttagaaactcat
aatttgattgaagaattaaagaaaattcaaaaattagttgatgattgtaatttagtttta
aatagtgaaaatgaacaaataaaaagagttattagaatgtttgatgaaattaaagattct
tttggtgatgaaagaagaactgaattatctaatgattcactttcatctattgatgatgaa
gatttaatacctaatgaagatgttgttgttacaatttcaaaaaaaggatatgttaaaaga
ttacctgttgatcaatatcgtgtacaaaatagaggtggaactggttcaagaggtgcagtt
gtaaatgatggtgattatattgaaaacatcattgtaacaaacactcatactgatttaatg
ttctttactactttaggtaaagtatttagaattagaactcataaaattcctgaatctgca
aagaacactaagggtttaccagttgttaatttaattgaacttgataaaaatcgtaatgaa
aatgttagtgctgttatttccattgatgattatgaaaatagtgatcttctatttattact
gaaaacggattagttaaaaaaacaaaagcaattaaatttaaaaaaattaatcgtagagga
aaaattgctatttcattaaagaaaaacaatctattaattggtgttactacaattccatca
aatgaaaatacacaaattattttgggaaattcaaatggtaaagcaataagatttaattct
tcagatgttcgtcatgttggaagaacagcttctggtgttattggaatgaatgttaatggt
ggaaaaattgttgattattcattatctaacaagggaaaattaattttatccatttctgaa
aagggatttggtaaattaactaatattgataattatagagttactaaaagaggagctaaa
ggtgtagcgactatcaataaaagtaaatcaggtgaattaattggtttacttgcagttaat
ggaaatgaacatctaattattattactaacaaaggaactgttattagattaaaattaaaa
caaatttctaatttttctagaaattcgaaaggtgtcaaaattgttaaattaagagaagaa
gaaaaaattgcttcaatttcaattattagatcattgaaggaaattgaagaggaaattgaa
gaaaaaactaataatgattctaacaacaaaattgatttaaaagaggcaaaagaagaaaaa
acaccagaacaacaaattgaaacaacattaaaggatattggtgaaaattttgatgatgaa
atttaa
DBGET
integrated database retrieval system
