Candidatus Tyloplasma litorale: TYPL_1050
Help
Entry
TYPL_1050 CDS
T09841
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
tll
Candidatus Tyloplasma litorale
Pathway
tll03030
DNA replication
tll03430
Mismatch repair
tll03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tll00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
TYPL_1050 (dnaE)
03430 Mismatch repair
TYPL_1050 (dnaE)
03440 Homologous recombination
TYPL_1050 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
tll03032
]
TYPL_1050 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tll03400
]
TYPL_1050 (dnaE)
Enzymes [BR:
tll01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
TYPL_1050 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
tll03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
TYPL_1050 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
tll03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
TYPL_1050 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU67452
LinkDB
All DBs
Position
114898..117765
Genome browser
AA seq
955 aa
AA seq
DB search
MKNPNLLTRSSYTFFNSLLKIEDIINFSIKNGFSNAFLIDKNIMYGASKFYELCLKNNIK
PIIGIQIEYENFNEVIIAKNYKGYKELIRISSFIQLKKELVIDYSNLIKPKNYFIPVLYK
KISDVESLKIFHSVSNKEFSEASSHFLNREEFELINGTELLKEVDSIIDEVNLVIPEKIN
VLPSFKVKGKKVDSTKYLEKLLKQSLSKYLKINKNLDRKKYIERTSYEFSIIKKMKFENY
FLIVSDIVNWSKNKGIFVGPGRGSAPGSIISFLLNITIVDPIANNLLFERFLNPERISMP
DIDIDFEDTRRDEVINYIVEKYGKDNVAQIITFQTLKAKMSFKDVARIKKLSALEANNIT
KLLSDKQTLEEAYENKNGAFRRAILKSELLEDIYNTAKLIEGLPRQYSTHAAGIVISDEK
IYKSIPIQEGYGDIIQTQYPMNYMEYNGLLKIDILGLKNLSFINETIHQIEQNNSIKINL
NRDVDFNDEKIYEYLASGKTSGIFQLESPGMRSVLKKINVSKFEEVVASTSLFRPGPSKM
IPEFVARKAKVANIEYLDEKVKKILESTYGIIVYQEQIIELVQIISKFSLAKADILRRAI
GKKDLNAIKSLKEEFFNGGIENNYKEEDVKKIYDLIVEFSNYGFNRSHAFSYTIISCWLT
WLKINYPLEFMNSLLNSVIGNNSKTPEYILECEDMNIEVCEPSIFNSSSNYSIINNKIFM
GFKSIKKIGDSVIKNIINLQSKINKETTTIYDFFIEAAKAGVSFNVLIILIKSNALRELN
FNKQTLLGNLETIEEWLKLITVKNDDETLTYDDSIIPKPKIQIYHSPYEKEYFSEVFGFS
LNSNDLMKRIREVEKNLKNKKIIDDLDEYEQDKVVVFIAEIISIKEITTKNGEKMAFIDL
NNGKNKINATFWPRVYQKFIDKIAISKILLFQGKMDLKRKPGIIINNIKEIENEK
NT seq
2868 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatcctaatctattaactaggtcttcatacactttttttaattcattgttaaaa
attgaagatataataaatttttcaataaaaaatgggttttcaaatgcctttttaattgat
aaaaatataatgtatggagcttctaaattttatgaattatgcttaaaaaataatataaaa
cctattattggtattcaaatagaatatgaaaattttaatgaagttattattgccaaaaat
tataaaggatataaagaattaattagaatttcttctttcattcaattgaaaaaagaactt
gttattgattattcaaatttaataaaaccaaaaaattattttattcctgttttgtataaa
aaaataagcgatgttgaatccttaaaaatatttcattctgtaagtaacaaagaattctca
gaagcttcaagtcattttttaaatagagaagaatttgaattaattaatggcacagaatta
ttaaaagaggtagattcaataatagatgaagttaatttagttattccggaaaaaataaat
gtcttgcctagttttaaggttaagggtaaaaaagttgattctactaaatatttagaaaaa
ttactaaagcaatcactttcaaaatatttaaaaattaataaaaatttagatagaaaaaaa
tatatagaaagaacttcttatgaattttcaattattaaaaaaatgaaatttgaaaattat
tttttaatagtttcagatattgttaattgatctaaaaataaaggaatatttgtaggccca
ggaagaggttcagcacctggatctataatttcatttttattaaacataactattgtagat
cctatagcaaataatttattgtttgaaagatttttgaatcctgaaagaatatcaatgcct
gatattgatattgactttgaagatacaagaagagatgaggttattaattatattgtagaa
aaatatgggaaagataatgttgcacaaataataacttttcaaactttaaaagctaaaatg
tcttttaaagatgttgctagaataaaaaaattatctgctttagaagcaaataacataaca
aaactcctttctgataaacaaactttagaagaagcttatgaaaacaaaaacggagctttt
agaagagctattttaaaatctgaattattagaggatatttataatactgcaaaattaata
gaaggacttccaagacaatattcaacacatgctgcaggaatagtaatttcagatgagaaa
atttataaatcaattccgattcaagaaggctatggtgatataattcagacacaatatcct
atgaattatatggaatataatggtttattaaaaatagatattttaggattaaaaaatctt
tcttttataaatgaaacaattcatcaaattgaacaaaataattcaataaaaatcaattta
aatagagatgttgattttaatgatgaaaaaatttatgaatatttagcctcaggtaaaaca
tctgggatttttcaattagaatcaccaggtatgcgttctgttttaaaaaaaataaatgta
tctaaatttgaagaggttgttgcaagtacttctttatttagaccaggacctagtaaaatg
attcctgaatttgtggcaagaaaagcaaaagtggcaaatatcgaatatcttgatgaaaaa
gtaaaaaaaattttggaatccacctatggaataattgtttatcaagaacaaataattgaa
ttagtacaaattatttctaaatttagtttggctaaagctgatattttaagaagagcaatt
ggtaaaaaggatttaaatgcaattaaatctttaaaagaagaattctttaatggtggcatt
gaaaataattataaagaagaagatgtaaaaaaaatttatgatttaattgttgaattttct
aattatggatttaatagatcgcatgctttttcttatacaattatttcttgttgacttaca
tgattgaaaataaattatccattagaatttatgaattcattattaaattcagttattggc
aataattctaaaactcctgaatatatcttggaatgcgaagatatgaatattgaagtttgt
gaaccatctatatttaattcttcatctaactattcaataataaataataaaatatttatg
ggatttaaatctataaaaaaaataggtgattctgtaataaaaaatataataaatttacaa
tctaaaataaacaaagaaacaacaaccatttatgatttttttattgaagcagcaaaagca
ggagtttcatttaatgtattaattattttaataaaatctaatgctttaagagaattgaat
ttcaataaacaaacacttttaggaaatcttgaaacaatagaggaatgattaaaactaatt
acagtaaagaatgatgatgaaactttaacttatgatgattcaataattccaaaacctaaa
attcaaatatatcattctccttatgaaaaagaatattttagtgaagtttttggattttca
ttaaattctaatgatttaatgaaaagaattagagaagtagaaaaaaatttaaaaaataaa
aaaattatagacgatttagatgaatatgaacaagataaagttgttgtttttattgctgaa
attatttctataaaagaaataactactaaaaatggagaaaaaatggcttttatagattta
aataatggtaaaaataaaattaatgcaactttttgacctagagtatatcaaaaattcatt
gataaaattgcaatttccaaaattctcttatttcaaggaaaaatggatttaaaaagaaag
cctgggataattattaataatataaaggaaatagaaaatgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
